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The map label for this gene is hlyB [H]

Identifier: 120597723

GI number: 120597723

Start: 1014219

End: 1015883

Strand: Direct

Name: hlyB [H]

Synonym: Sputw3181_0893

Alternate gene names: 120597723

Gene position: 1014219-1015883 (Clockwise)

Preceding gene: 120597722

Following gene: 120597725

Centisome position: 21.54

GC content: 44.14

Gene sequence:

>1665_bases
ATGTCGAATTTTAGTTTGCGCAATAAATTACTATTGTTATCTCTGTTTCCCCTGATCTTAACTTTACTGATATTGATGTC
TGTTTCTTACTATGTCGAGAAAGAGGCACTTGATGATGAAGTGGTTACCTTTAAAACTAAACTCGTTGGTGAACGTAAAC
AACAAATAAAAGAAGCGACGGAAATTGCCGCAGGAATAGTGCAGTACCAGATATCTTTAAAAGATCAAGGTAATGTCAAT
CAAGCCCTGCGGGATATTCGTTTTGGTAGCGCAGGGTATTTCTTTATATACGACTCTAAAGGTAAAAATATTTTCCATGC
CCTGCTACCCGCACTGGAAGGGCAAGATAAAATTGACATGACAGACCCCCGCGGAACCAAAATTATTGTCGGTTTGCTTA
ATGCTGCACAGCGAGGTGATGGTCACTTTTCCTATTACTATCAAAAGCCTAATACTAACGAACAAATTGAGAAACTCAGT
TATGTGACTATGGTGCCCGGCACGGATTGGATGTTAGGAACGGGGGCTTATATTGATGATATCGAAGCGGTAGTCGAAGA
TTATCGCATCACAGTGACAGAGCAAATGGTGGATAAATCCTATGGGCTGCTACTCATTGCACTGTTACTCACGGGGTTTA
CAGCCTTTATCATCATGATAGCCGCACACCGTATGGTGGTGCCCATTCAAAAAATGGCTGAAAATCTAAATGATATTGCT
AAGGGTGAAGGCGATTTAACTAAGCGCCTTCTCGTAAAAGGCGAAGATGAAATTGCCCAATTAGGCCAATCCTTTAACCT
CTTTGTTGATAAACTGCAGACTATTATTGGGGATGTAGCGAGTGCGACCACGAAAGTAAAAGAGGCGGCGAATGCGATTC
ACGATCAAACGAAAGTGATGTCAAGCCAGCTTATCAGCCATAACAATGAAACCGATCAAGTGGTGACAGCCATCACTGAG
ATGTCTTCCACTGCCAGTGAAGTTGCGCAAAATACCACGCAAGTGGCAGAAGCGACTCAAGCTGCCACGGGGGATGTTGC
TAATGCTCAACGCTGTGTTGATGCTTCCCTAGAAGAAATCGCAGGTTTGATGGAGCAAATTAATCACGCGGCGGGCAGCA
TTCAATCTTTAAGTGAGCAATCCCAGAAGATTAACAGTGTGCTTTCGGTCATTGGTGGTATTGCTGAACAAACCAACCTG
TTAGCATTAAACGCGGCAATTGAAGCGGCCCGTGCAGGTGAGCAGGGTAGAGGTTTTGCGGTGGTGGCCGATGAAGTGCG
TAATCTCGCCAGCCGTACTCAGGCTAGCACTTTAGAAATTAACGAGATGTTATCTGCGCTGCATAAACTTGTCGCCCAAG
CGGTGAAAACGATGGAGGACAGCCAACAAAGTTGTGTGCGTTCGGTAGCGTCTTCCCGTGCTATCTCTGAAAGTTTAGGT
TCTGTGACTTCAGCGGTAACGGCCATTAATGATATGAGTACTCAAATTGCGACTGCGGCTACTGAGCAAAGCTCTGTTAC
CGAGGAAATTAATCGCAATGTATATGCTATTCAAGAAATTGTGAACGAGTTACTCCATTCTAGCCAAGATGCGGCCAGAA
TTAGTCAAACCGTATCGCAGGAGGGGACTAACTTAGGTAAATTAGTCGGACAGTTTAAGATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGTAGATTTGTTATCTTCGACGCTTAGAAATTGCCCAGTTTTGGCTATACTTCGCACATACAACAATTATAAGTTTTA
TCCCCCCGGAGTAATTAAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCTTCAGTCAATTGATAAGCATAAAAACGGGAGACATCTTATCTCCCGTTTTTTATTCGGCGCTTAAAATTGATTTAGC
CGCAACTCGTTACCTTTTCT

Product: methyl-accepting chemotaxis sensory transducer

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 554; Mature: 553

Protein sequence:

>554_residues
MSNFSLRNKLLLLSLFPLILTLLILMSVSYYVEKEALDDEVVTFKTKLVGERKQQIKEATEIAAGIVQYQISLKDQGNVN
QALRDIRFGSAGYFFIYDSKGKNIFHALLPALEGQDKIDMTDPRGTKIIVGLLNAAQRGDGHFSYYYQKPNTNEQIEKLS
YVTMVPGTDWMLGTGAYIDDIEAVVEDYRITVTEQMVDKSYGLLLIALLLTGFTAFIIMIAAHRMVVPIQKMAENLNDIA
KGEGDLTKRLLVKGEDEIAQLGQSFNLFVDKLQTIIGDVASATTKVKEAANAIHDQTKVMSSQLISHNNETDQVVTAITE
MSSTASEVAQNTTQVAEATQAATGDVANAQRCVDASLEEIAGLMEQINHAAGSIQSLSEQSQKINSVLSVIGGIAEQTNL
LALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRNLASRTQASTLEINEMLSALHKLVAQAVKTMEDSQQSCVRSVASSRAISESLG
SVTSAVTAINDMSTQIATAATEQSSVTEEINRNVYAIQEIVNELLHSSQDAARISQTVSQEGTNLGKLVGQFKI

Sequences:

>Translated_554_residues
MSNFSLRNKLLLLSLFPLILTLLILMSVSYYVEKEALDDEVVTFKTKLVGERKQQIKEATEIAAGIVQYQISLKDQGNVN
QALRDIRFGSAGYFFIYDSKGKNIFHALLPALEGQDKIDMTDPRGTKIIVGLLNAAQRGDGHFSYYYQKPNTNEQIEKLS
YVTMVPGTDWMLGTGAYIDDIEAVVEDYRITVTEQMVDKSYGLLLIALLLTGFTAFIIMIAAHRMVVPIQKMAENLNDIA
KGEGDLTKRLLVKGEDEIAQLGQSFNLFVDKLQTIIGDVASATTKVKEAANAIHDQTKVMSSQLISHNNETDQVVTAITE
MSSTASEVAQNTTQVAEATQAATGDVANAQRCVDASLEEIAGLMEQINHAAGSIQSLSEQSQKINSVLSVIGGIAEQTNL
LALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRNLASRTQASTLEINEMLSALHKLVAQAVKTMEDSQQSCVRSVASSRAISESLG
SVTSAVTAINDMSTQIATAATEQSSVTEEINRNVYAIQEIVNELLHSSQDAARISQTVSQEGTNLGKLVGQFKI
>Mature_553_residues
SNFSLRNKLLLLSLFPLILTLLILMSVSYYVEKEALDDEVVTFKTKLVGERKQQIKEATEIAAGIVQYQISLKDQGNVNQ
ALRDIRFGSAGYFFIYDSKGKNIFHALLPALEGQDKIDMTDPRGTKIIVGLLNAAQRGDGHFSYYYQKPNTNEQIEKLSY
VTMVPGTDWMLGTGAYIDDIEAVVEDYRITVTEQMVDKSYGLLLIALLLTGFTAFIIMIAAHRMVVPIQKMAENLNDIAK
GEGDLTKRLLVKGEDEIAQLGQSFNLFVDKLQTIIGDVASATTKVKEAANAIHDQTKVMSSQLISHNNETDQVVTAITEM
SSTASEVAQNTTQVAEATQAATGDVANAQRCVDASLEEIAGLMEQINHAAGSIQSLSEQSQKINSVLSVIGGIAEQTNLL
ALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRNLASRTQASTLEINEMLSALHKLVAQAVKTMEDSQQSCVRSVASSRAISESLGS
VTSAVTAINDMSTQIATAATEQSSVTEEINRNVYAIQEIVNELLHSSQDAARISQTVSQEGTNLGKLVGQFKI

Specific function: May form a pore through which the hemolysin can be exported [H]

COG id: COG0840

COG function: function code NT; Methyl-accepting chemotaxis protein

Gene ontology:

Cell location: Cell outer membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 methyl-accepting transducer domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI2367378, Length=307, Percent_Identity=30.2931596091205, Blast_Score=127, Evalue=2e-30,
Organism=Escherichia coli, GI1788195, Length=293, Percent_Identity=31.0580204778157, Blast_Score=121, Evalue=9e-29,
Organism=Escherichia coli, GI1788194, Length=338, Percent_Identity=28.4023668639053, Blast_Score=111, Evalue=1e-25,
Organism=Escherichia coli, GI1787690, Length=345, Percent_Identity=29.2753623188406, Blast_Score=107, Evalue=2e-24,
Organism=Escherichia coli, GI1789453, Length=338, Percent_Identity=27.2189349112426, Blast_Score=94, Evalue=2e-20,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004090
- InterPro:   IPR004089
- InterPro:   IPR003660
- InterPro:   IPR000727 [H]

Pfam domain/function: PF00672 HAMP; PF00015 MCPsignal [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60053; Mature: 59922

Theoretical pI: Translated: 4.63; Mature: 4.63

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50111 CHEMOTAXIS_TRANSDUC_2 ; PS50192 T_SNARE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNFSLRNKLLLLSLFPLILTLLILMSVSYYVEKEALDDEVVTFKTKLVGERKQQIKEAT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIAAGIVQYQISLKDQGNVNQALRDIRFGSAGYFFIYDSKGKNIFHALLPALEGQDKIDM
HHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
TDPRGTKIIVGLLNAAQRGDGHFSYYYQKPNTNEQIEKLSYVTMVPGTDWMLGTGAYIDD
CCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCEEECCCHHHH
IEAVVEDYRITVTEQMVDKSYGLLLIALLLTGFTAFIIMIAAHRMVVPIQKMAENLNDIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGEGDLTKRLLVKGEDEIAQLGQSFNLFVDKLQTIIGDVASATTKVKEAANAIHDQTKVM
CCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSQLISHNNETDQVVTAITEMSSTASEVAQNTTQVAEATQAATGDVANAQRCVDASLEEI
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AGLMEQINHAAGSIQSLSEQSQKINSVLSVIGGIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
VVADEVRNLASRTQASTLEINEMLSALHKLVAQAVKTMEDSQQSCVRSVASSRAISESLG
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVTSAVTAINDMSTQIATAATEQSSVTEEINRNVYAIQEIVNELLHSSQDAARISQTVSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
EGTNLGKLVGQFKI
CCCHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SNFSLRNKLLLLSLFPLILTLLILMSVSYYVEKEALDDEVVTFKTKLVGERKQQIKEAT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIAAGIVQYQISLKDQGNVNQALRDIRFGSAGYFFIYDSKGKNIFHALLPALEGQDKIDM
HHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
TDPRGTKIIVGLLNAAQRGDGHFSYYYQKPNTNEQIEKLSYVTMVPGTDWMLGTGAYIDD
CCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCEEECCCHHHH
IEAVVEDYRITVTEQMVDKSYGLLLIALLLTGFTAFIIMIAAHRMVVPIQKMAENLNDIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KGEGDLTKRLLVKGEDEIAQLGQSFNLFVDKLQTIIGDVASATTKVKEAANAIHDQTKVM
CCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSQLISHNNETDQVVTAITEMSSTASEVAQNTTQVAEATQAATGDVANAQRCVDASLEEI
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AGLMEQINHAAGSIQSLSEQSQKINSVLSVIGGIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
VVADEVRNLASRTQASTLEINEMLSALHKLVAQAVKTMEDSQQSCVRSVASSRAISESLG
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVTSAVTAINDMSTQIATAATEQSSVTEEINRNVYAIQEIVNELLHSSQDAARISQTVSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
EGTNLGKLVGQFKI
CCCHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2162464; 10952301 [H]