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The map label for this gene is pfaA [H]

Identifier: 119945395

GI number: 119945395

Start: 2043053

End: 2051038

Strand: Direct

Name: pfaA [H]

Synonym: Ping_1684

Alternate gene names: 119945395

Gene position: 2043053-2051038 (Clockwise)

Preceding gene: 119945394

Following gene: 119945396

Centisome position: 44.81

GC content: 45.13

Gene sequence:

>7986_bases
ATGTCTACAGAGCAAAGCCCGAACAACCACGATATGGCAGAAGAAGAGCAGTTAAGTTCACGCATGCAGGAATGTCCTAT
CGCGATTGTTGGTATGTCTTCGGTGTTTGCAGAGAGCAAAAATCTTGACCAATTTTGGGATAACATTGTTGAGTCAGTGA
ACGGCATTCGGGATATACCGGAAGATCGTTGGGCGATTGATGATTATTATTCTGCCGATAAAAAAGCGGCGGATAAAACC
TACTGCAAACGCGGCGGTTTTTTACCTGAAATTGATTTTGATCCGATGGAATTTGGTTTGCCGCCCAATTTGTTAGAACT
GACCGATATTACCCAGTTGATGTCTTTGGTGGTTGCGCGCGATGTACTGGCCGATGCCGGCATCTCCGATGAAAACAGTT
ATGATCGTGATAAAATTGGAATCACTCTGGGGGTTGGCGGAGGTCAGAAACATATCTCGCCTTTAACCTCCCGTCTGCAG
GGCCCAGTGTTAGATAAGGTATTAAAAGCATCGGGTGTGGATGCAGCCGATCGTAATATGATCATTGAAAAATTCAAAAA
AGCCTATATTCCCTGGGAAGAAAATTCATTCCCGGGTATGTTGGGCAATGTTATTGCTGGACGTATTGCCAACCGTTTCG
ATTTTGGTGGTACTAACTGTGTGGTTGATGCTGCCTGCGCAAGCTCCTTAGCGGCGATTAAAATGGCGGTCTCAGATTTA
CTTGAGTATCGTTCGGAAATGATGATCACGGGCGGGGTCTGTTGTGATAACTCCCCCTTTATGTATATGTCATTCTCAAA
AACCCCCGCTTTTACCGATGGACAAAATATTCGTCCCTTTGATGACCAGTCCAACGGCATGATGATTGGTGAAGGTGTGG
GCATGATTGCACTGAAACGTTTAGCCGATGCCGAGCGAGATGGCGATAAAATTTATTCTGTTATTAAAGGCATAGGCAGT
TCATCCGACGGTCGTTACAAATCTATTTATGCGCCAAGTCCTGCGGGGCAAGTAAAAGCGCTTAAACGTGCGTATGCTGA
TGCCGGTTTTGATCCCTTAACCTGCGGTTTGATTGAAGCGCATGGTACCGGCACAAAGGCGGGAGATGCCGCTGAGTTTG
CCGGTTTAAGTGCGCTCTTTAGTGAAAACAATGCGCAAAAACAACATATCGCCTTAGGATCGGTTAAATCACAAATTGGC
CATACTAAAGCCGCGGCCGGCACTGCGGGGATAATTAAAGCGTCTTTAGCGCTTTACCATAAAGTGCTGCCGGCAACGAT
TAATGTGGAGCAGCCGAATAAAAACCTGGATATTGATAATAGCCCTCTGTATATCAATAGTGAAACCCGGCCCTGGATGC
CGCGTGCCGATGCGATTAAGCGTCGTGCCGGGATCAGTTCCTTTGGTTTTGGTGGTACTAATTTTCATATCGTCCTTGAA
GAATACCAAAGCAAGCAAAGCGGCCAATACCGTTTAAATGAAGTACCGCAAACGATTGTTATCAGCGCGGCAGACAAAGA
AGCTCTACAACAAAGTTTAACCACCTGGCGCACTAAACTTGCGGTGACCAATGATTTACAGGCCTATGCATTTAATGCTT
TAGTGGTTGAAAATCCATTATCAACACCGCAGCAGAAGCTCGCACGTTGCGGCTTTGTGGCTAAAAATGCGCAGCAAGCA
CTGCAATTAATTGAACAGATAATAAAAGAATTTTCCCTGAATGACGCGCCCGCATGGTCTACACCAACGGGCATCTATTA
CCGCGAAAGCGGGCTTAAAACACAAGGGAAAGTGGTTGCGCTGTTCTCAGGGCAAGGTTCTCAATATGTTAATATGGGGC
GTGATTTAAGCTGCAACTTCCCCTCAATATTAGACACTCATGCTTTGATGGATACCCAGTTTAGTGATAATGGTTTACCG
CAGTTATCTAAAGTGACTTATCCGATTCCTGCCTTTACGGCTGAAAAACGTGCTGCACAGGAAGAAAGCTTACGCTTAAC
CCAGCACGCCCAACCTGCGATTGGTGCTTTTAGCGCAGGACTATATAAAACCTTCCTGCAGGCTGGCTTTAAAGCTGATT
TTACTGCAGGTCATAGTTTCGGTGAATTAACCGCTTTATGGGCCGCGGGCGTGTTATCTGAGCATGATTATATGCTACTT
GCCCGCAGCCGGGGTCAGGCAATGGCTGCGCCCGAGGATGAAAACTTTGATGCCGGTACTATGATCGCCGTGATCGGTGA
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TCTGCAGCTTTTCATACAGCATTGGTAGGACACGCACAAAAGCCCTTTGCTGATGTTATCGACCGTGTTGAATTTAAATC
GCCCTCTATTCCTGTCTTTTCCAATGGCAGTGCAGTAGCCCATTCAACACAACCTGAGGTGATCAAGGCCAGCCTGAAAA
AACATATTTTAGAACCGGTTCATTTTAATGATGAAATTGATAATTTATATGCCGCTGGTGGGCGACTCTTTATTGAATTT
GGTCCTAAAAATGGCTTAACAGGCTTAGTTGATAATATCCTTAAGGATAAATCCGATGTGACTACTATTGCGGTCAACGC
TAATCCTAAAAAATCAGCTGATTTGCAACTGCGTTTAGCCGCCGTTGAAATGGCTGTGTTAGGGGTGCAGTTGAATAATA
TTGACCCCTATAACGGGTTACAACGTCCCACAATTCCCGCTAAAAAATCACCTCTGGCAATGAAATTATCCGGTGCTGCT
TATGTGAGTGAAAAAACTAAAAAAGTGTTTACGGATGCTTTAAATGATGGTCAAAAAATCAATACTCAACCAGCCAATAC
TGAGCAAAGCAGGGGCATTGAAAAGCAGCTGCCCGTTGAGAAAGAGGTGATTGTTGAGAAAGAGGTGATTGTTGAAAAAA
TTGTGGAGAAAATTGTCTACCTCAATCCCGATGGTACGGCCTTTGATCATCAAGCTGTCAATATGGCCAGCGTCAATATG
CCGCCTGACAATAGCACCGCGTTAGTTGCCTCTATTGAACAAAGTGTCGGCCAGGTTGTGCAGCATCAAGCACAACTATT
AAGTGTGCATGAAGAGTATCTGCAGGGCCCGAAAGAGTACGCAAAAACATTTCAGGCAGTATTAGCCTCTCACGCGGGTG
CGGCGCAATTGCCTGAGAGTTTGGACAAAACATTAACGATGTACCATGACTTTCAGTCTGAAACATTACGCGTTCACGAA
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TGCCGTCCAACAGAACGTTGCTGTTAACAGTGTTGCGGCCATCAAAGCGGTAAAACCTGCAACCTCTGCGCCAGTCCAAC
AGAATAAAACCAAGGTTGCTACTCCTGCCGTCTCGACTCCAGTGCCAACAGCTGCCATTGATTTAAATGAAATTCAAAAT
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AGGTATAGATTCGATTAAACGGGTAGAAATTTTAGGCGCAGTGCAGGATCAGATAAGCGACTTGCCGGAATTAAATCCGG
AAGCGCTCACTGAGCTGCGCACTTTGGGTGAAATAGTTGACTATATGCAGGCACAGGCGCCGGTTGCAGGACGTGAGAAT
AATAATGTGCCTCTCGATAATATTGCATCACTTGACAATAATGTCCCTGAGATTGATTTATCCGCTATTCGGACTGTGAT
GCTGGATGTGGTTGCCGATAAAACCGGTTATCCTGTTGAAATGCTCGAACTTGGCATGGACATGGAGTCGGATTTAGGCA
TAGATTCAATTAAGCGGGTGGAAATTTTAGGCGCGGTGCAGGATGAGATAAGCGACTTGCCGGAATTAAATCCGGAAGCG
CTCACTGAGCTGCGCACTTTGGGTGAAATAGTTGACTATATGCAGGCACAGGCGCCGGCAGCTTCTATCGTTGCAACAGA
GAATGAAAGCGAGCAGGCAAAAACACAGAACAGCCAATCTGCACTCTTACCCATTGATCTGACGCATATTATGCTGGCAG
TGGTTGCCGATAAAACCGGTTATCCCGTTGAAATGCTCGAACTTGGCATGGACATGGAGTCGGATTTAGGCATAGATTCG
ATTAAACGGGTAGAGATTTTAGGTGCGGTGCAGGATCAAGTTAGCGACTTGCCAGAATTAAATCCGGAAGCACTCGCTGA
GCTGCGCACTTTGGGTGAAATAGTTGACTATATGCAGTCACAGGCAGCTTCTATTGTTGCAACAGAAAATGAAAGCGAGC
AGGTAAAAACACAGAACAGCCAATCTGCACCCTTACCCATTGATCTGACCCATATTATGCTGGCAGTGGTTGCCGATAAA
ACCGGTTATCCCGTTGAAATGCTCGAACTTGGCATGGACATGGAAGCGGATTTAGGCATAGATTCGATTAAACGGGTAGA
AATTTTAGGCGCAGTGCAGGATGAGATAAGTGACTTGCCAGAATTAAACCCGGAAGCGCTCGCTGAGCTGCGCACTTTGG
GTGAAATTGTTGACTATATGCAATCGCAGGCGCCGGCGGCTTCTATTGTTGCAACAGAGAATGAAACCGAGCAGGAAACA
CAGTTAAAAATACAGGATAGCCAGCCAGCTGCGTCAGTAACAGCTCTGTTGGATATTAAAAATATAATGCTGGATGTGGT
GGCAGATAAAACCGGTTATCCCGTTGAAATGCTCGAACTTGGCATGGATATGGAAGCGGATTTAGGCATAGATTCGATTA
AGCGGGTGGAAATTTTAGGTGCGGTGCAGGATAAAGTTAGCGACTTGCCGGAATTAAATCCGGAAGCCTTAGCCGAGCTG
CGCACCTTAGGTGAAATTGTGACTTATATGCAGTCGCAGGCAGCGCCTCTGAATAATGCCGTGCCTATTGTTCCGGTGCT
GGGGTCAGCGCCTGTTGATTTAACCCTGATTGAAACAGTTATGCTTGACGTGGTTGCCGATAAAACCGGTTATCCCGTTG
AGATGCTCGAACTTGGCATGGACATGGAAGCGGATTTAGGCATAGATTCGATTAAACGGGTGGAAATTCTAGGCGCGGTG
CAGGATGAGATAAGCTCGCTGCCGGAATTAAATCCAGAAGCACTCGCTGAGCTGCGCACTTTGGGCAACATTGTTGATTA
TATGGTCAATCTCACGGGCACGAGCCAGGCTGACGTCATAAAGTCTGCTGAGCCGGTTGATTCAGTTGAACCGGTGGCAA
GTTTCGAACCCGCGCCAAGTGCAACTGTAGTGATAAAGCACCTTAATGTGATTGAAAAAATCGCCATGGATGTCAACGGT
GAAAATCTTTTATTAGTGGATGACGGTCAAGGTTGTGCAGTCCGTTTGGCCGATAAATTAAGCAAGCTGGGTTGGTCTGT
GACTGTTATCAAACCAAGCTGGGTAAACTCCGATAGCGATAAAACATTTTCTAAGAAGGTTAATGTTTTTGAATTAAATG
CGCTTAATGAGCAGGAAATAAACACGATTTTAGACACCCAATCTGTTTGGACAAGTGTTGTTTATCTGCATCCTAAAACC
ACTATCACTGCTATTGAATATCCGCAGGCAAGCAAACAGGGGTTAATGCTGGCATTTTTATTAGCCAAACTGTCAGATTT
GGCAGCACCGCAAAACAATATTAAAACCCGAGCATCATTTGTTGTATTAACCCGCCAGGGTGGGGCTTTTGGGGTGGAAG
ATAATGAACTTGAATCTGACCTTGTGCAGACGGGACTTACCGGGCTGGTTAAAACTATTTCTCATGAATGGCCTGGGGTA
TTTTGTCGTGCCGTTGATCTGGCCAGTCAATTGTCTGCCGATAAAGTTGCTAATATTATTGTGGATGAGTTAAATGATAA
AAATGTTAAACCCGTAGAAGTGGGTTTTAACCATAATGGCCGTTTAACGCTAGTGGCTGAAAAAACAGACAGTTACACTC
TGCAATCCGGCAGCAGTATAGATCAAGATTCAGTGTTTTTAGTCAGTGGCGGCGGCCGAGGGGTGACCGCTGAGTGTGTT
ATCCGTTTAGCAAAGGAGTATAAATCTAAGTTTATTCTTTTGGGGCGTTCTGATTACAAAAGTGATCAACCCCGCTGGGC
AATCGGAATCAATGATCAAGCTGCGCTTAAAAAAGCGGCTATGCAGGCATTGCAGGCCAAGGGTAAAAAACCCACGCCCG
CCTCCATTTCAGCATTGGTTGGCTCAATACTCAGCAATCGTGAAATCAAACAAACCTTGGCGTTAATAGATGATGCCGGT
GGTATTGGCGAATATATTTGCGCGGATGTCACCGATTCAAATGCGGTGTTGAATGCGCTAACACCGATCACCTCTCTCTG
GGGAGAGGTTAGCGGGATTATTCATGGTGCGGGTGTGTTGGCCGATAACTTTATCGAGCAAAAAACAGTCGTGGAATTTG
AGGCAGTTTATAACACTAAGATAGAGGGCTTGTTATCCTTGTTAGCTTGTTGCCAGCAGGACAAACTTAAGCAACTTGTT
TTATTCTCATCGGCGGCCGGTTTTTATGGTAATCCCGGGCAGTCTGATTATGCCATTGCCAACGATATTTTAAACAAAAC
GGCTTATCGTTTTAAAGCCCTGCACCCGGCAGCCCAGGTACTGAGTTTTAACTGGGGGCCCTGGGATGGAGGCATGGTGA
CACCTGAACTGAAAAAAATGTTTAAGGATCTTGGGGTTTATATTATTCCTTTAGCAGCCGGGGCTGAGTTATTACTTAAT
GAACTGGCTGCCGATAGTAATCGTTGTCCGCAAATTTTGGTGGGCAACGATATGGGCGGGCAATTACCAGAAGATGATGT
TTTAGATGAGAAAGTTTTAGAGGACCATGTTTTAAAGGACGATATATTAGAGGGGAAAGTATTAGAGGATACAAGCGTAA
AAAAGCCATTAGTTAGTCGCTTAGCAAAAAGATTTTTAGCGGCTAACAATCCTTTTTTGGCTGATCATAAGATAGGTGAA
AATCAGGTACTGCCAACTGTCTGTGCCATTGCCTGGATGGTCGAAGCCGCAGCTGTTAGCTATCCAGATTTTGTCTACCA
GGGGCTTAAAAATTATCAACTTTTTAAAGGAATTGTCTTTGATGGTAAACAGGCCAGCGATTATTTTATTGATCTTAATA
CTGTGGAAAAAAAACCGGGTGGTTTAGCCATTGAGGTTAAAATATCCGGTGAAAAATCCGATGGCAGTCTGAATTTTCAT
TATGCGGCTACCTTATTAATGAGCAAAGAAAATCAAGCCGCGCCGCTGTACAGTTCTGAACTGCCTGATTTAGTCTTAAG
TAAACAAGAAAATGCCGATGCACTTTATCAGGATGGCACCTTATTTCACGGGAGCAGTTTGCAGGGGATACAATCCCTGC
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CAGGAAAACAATATTTTCGCCAATGATTTAGTCTACCAGGCGTTATTAATTTGGGCGCGTAAACAGTTAGGTTTGGGCAG
TTTACCCGGCAGTACATTATCCTGGATTGTCTATGGTGAAGTTAAGGTTAATCAAGCCTTTTATTTAAAGCTCTCGGTGC
GTGAGCAGCAGGCAAATAAAGTCGTTGCCGATATTATTCTGATTGATCGAGATAAACAGATTCTGGCAGAGATATCGGGC
GCTGAAGTCACCTGCAGTGCCAGTTTAAACAAATTGTTTAAACTGGCCGTTGAAGTTGATGGCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGGTCACTGCGCCATAAAATAATCCGTTTTCTATGTGCAGAAAAGAGTGACAGATAATAATAATGACTAACGCAACAGG
TTTTTAACCGGAGTAATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAACAGAGGGCTTGATACCCTTAATGCCAGGCTTGCTATTATCGGAATAGATGCGCAGTTTGAAGGATTGCCTAATATCG
ATTATGTTGAGTCAGCTTTA

Product: polyunsaturated fatty acid synthase PfaA

Products: [acyl carrier protein]; acetoacetyl-ACP; CO2; [acyl carrier protein]; beta-ketoacyl-ACP [C]

Alternate protein names: PKS [H]

Number of amino acids: Translated: 2661; Mature: 2660

Protein sequence:

>2661_residues
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Sequences:

>Translated_2661_residues
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>Mature_2660_residues
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QVLPTVCAIAWMVEAAAVSYPDFVYQGLKNYQLFKGIVFDGKQASDYFIDLNTVEKKPGGLAIEVKISGEKSDGSLNFHY
AATLLMSKENQAAPLYSSELPDLVLSKQENADALYQDGTLFHGSSLQGIQSLLECDAKGLLLSCLIPESVKSKQGEFDLQ
ENNIFANDLVYQALLIWARKQLGLGSLPGSTLSWIVYGEVKVNQAFYLKLSVREQQANKVVADIILIDRDKQILAEISGA
EVTCSASLNKLFKLAVEVDG

Specific function: Involved in some intermediate steps for the synthesis of the antibiotic polyketide bacillaene which is involved in secondary metabolism [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 5 acyl carrier domains [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI41872631, Length=840, Percent_Identity=24.4047619047619, Blast_Score=187, Evalue=2e-46,
Organism=Homo sapiens, GI8923559, Length=284, Percent_Identity=30.6338028169014, Blast_Score=122, Evalue=4e-27,
Organism=Homo sapiens, GI223972627, Length=156, Percent_Identity=33.974358974359, Blast_Score=74, Evalue=2e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1787337, Length=289, Percent_Identity=29.0657439446367, Blast_Score=115, Evalue=5e-26,
Organism=Escherichia coli, GI1787334, Length=325, Percent_Identity=31.3846153846154, Blast_Score=112, Evalue=2e-25,
Organism=Escherichia coli, GI1788663, Length=372, Percent_Identity=27.6881720430108, Blast_Score=100, Evalue=2e-21,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI212642053, Length=975, Percent_Identity=23.3846153846154, Blast_Score=166, Evalue=2e-40,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI17550940, Length=958, Percent_Identity=21.5031315240083, Blast_Score=153, Evalue=1e-36,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71983541, Length=288, Percent_Identity=32.2916666666667, Blast_Score=137, Evalue=7e-32,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71983535, Length=261, Percent_Identity=32.9501915708812, Blast_Score=127, Evalue=6e-29,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71984332, Length=299, Percent_Identity=26.7558528428094, Blast_Score=70, Evalue=1e-11,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320904, Length=473, Percent_Identity=23.0443974630021, Blast_Score=98, Evalue=2e-20,
Organism=Drosophila melanogaster, GI221330659, Length=909, Percent_Identity=23.982398239824, Blast_Score=180, Evalue=1e-44,
Organism=Drosophila melanogaster, GI19920632, Length=909, Percent_Identity=23.982398239824, Blast_Score=180, Evalue=1e-44,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24581345, Length=898, Percent_Identity=22.71714922049, Blast_Score=157, Evalue=1e-37,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24644341, Length=293, Percent_Identity=30.3754266211604, Blast_Score=112, Evalue=4e-24,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24665753, Length=323, Percent_Identity=30.030959752322, Blast_Score=85, Evalue=6e-16,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR009081
- InterPro:   IPR000794
- InterPro:   IPR018201
- InterPro:   IPR014031
- InterPro:   IPR014030
- InterPro:   IPR016040
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- InterPro:   IPR011254
- InterPro:   IPR016039
- InterPro:   IPR016038 [H]

Pfam domain/function: PF00109 ketoacyl-synt; PF02801 Ketoacyl-synt_C; PF08659 KR; PF00550 PP-binding [H]

EC number: 2.3.1.41 [C]

Molecular weight: Translated: 287678; Mature: 287547

Theoretical pI: Translated: 4.40; Mature: 4.40

Prosite motif: PS50075 ACP_DOMAIN ; PS00606 B_KETOACYL_SYNTHASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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>Mature Secondary Structure 
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AEVTCSASLNKLFKLAVEVDG
CEEEEHHHHHHHEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: None [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): 0.04 {acetyl-ACP}} 0.031 {acetyl-ACP}} 0.138 {cis-9-hexadecenoyl-ACP}} 0.017 {cis-9-hexadecenoyl-ACP}} 0.012 {cis-3-decenoyl-ACP}} [C]

Substrates: acetyl-ACP; malonyl-ACP; acyl-ACP [C]

Specific reaction: acetyl-ACP + malonyl-ACP = [acyl carrier protein] + acetoacetyl-ACP + CO2 acyl-ACP + malonyl-ACP = [acyl carrier protein] + beta-ketoacyl-ACP + CO2 [C]

General reaction: Acyl group transfer [C]

Inhibitor: Acetyl-CoA; Acyl-CoA; Iodoacetamide; N-Ethyl maleimide acyl -ACP-derivatives protect, malonyl-ACP-decarboxylation, Cerulenin [C]

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8344529; 9384377; 10568751 [H]