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The map label for this gene is 119945297

Identifier: 119945297

GI number: 119945297

Start: 1929871

End: 1932312

Strand: Direct

Name: 119945297

Synonym: Ping_1579

Alternate gene names: NA

Gene position: 1929871-1932312 (Clockwise)

Preceding gene: 119945296

Following gene: 119945298

Centisome position: 42.33

GC content: 38.74

Gene sequence:

>2442_bases
GTGGCTTTCTTAATTCCCCAAATGGTTACTCCAGTCGCTAAAATTAAAAAATGGTTTAACCAAGATCTTTATTTGGTATT
AAAAACCCAAGTTGCAGAATACAAAAACAAACCACTCCTACACCTTGCCTTTATACTCAGTTTAGCAATAGCAACCAGTA
CATTGTTATCTGTTTTGGTGTTAAATCATGCCAGTAGAGAGCAATATCAACAAGCAAATTCTTTGTTAAAAAATCCCGTG
GGTTTTCATATTATTGCCCAGCAGGGAAGTAAACTGAAGAAAGAAGATTTTTTCAGCTTAAGAAAAAAAGGTTTTACCCA
AATAACCCCAGTGCTAACCTTTCGTAAAAAACTGACTAACGGCAAATATACTACCTTCACCGCGATCGATTTATTGGCAC
TCAGTTTGATAAAAGCAGAGCACTTTAATAGCCAAAGTGTATCACTGACGGAGGAGTACGCTAGATCCCTATTATTATTC
AATGGGGGAAGTAAAAATCAGGATAAACAATTTTTTTTAGCTGACAATCGCGCTATCCCCTTCAGCATTAGACCAGCAGG
ACAATGGCAAGATCAAGCATTACTCGATATAACCCTTGCTTGGAAACTATTTCCAGAAGAGGGGGATTTTAGTTATCTAC
TGGTTGCACCCTTGAGTGAGCAAAGTAAAGAAATACTGGAATCTGTTTTACCGACACATTTATCTTTATATAAACCATGG
TCAGTAGAAGAACGTCAAGGTTTTGCAGATGCACTGCATCTCAATCTCAATGCGCTGGCTATTTTAGGTTTTATTGTCAG
TTTATTTATTGCTTTTCAGGCGGCTAACCAGGCATGGCGAAAACGCGCTCAATTAACAGCACAGTTACGCTTATTAGGCG
TGCAGTTGTTTACCATAAAAATTGCAGTGATAATTGAAGCATTATTTTTAGTTACCATGGCCACTGTACTAGGGATTTTA
CTGGCCATCGGCTTAGTTTCTATTTTACTCCCCCTATTAGGTTTAACCCTTAAACAATTATATTCCCTAAACAGCAGTGG
GCATTTTATATGGCAGTGGTCGTATAATTTATGGGCATTTTTCATTTCATCGCTTGCAGTCCTGCTGGCATTAATGAAGC
AGTTTAAGCTGCTCTCCAGTAAATATATCGCTCGTTCTGCTCACTTGCAACGTGAGCTATTCTCTGCTCGAAAACACCTC
ATAGCAACGTTTCTGCTGTTAGCTTTATTTATACTTTGGCCAAATAATAACTGGTTACAGTTAATGATTAAATACGGTTT
GTTATTGATGGCAAGTATTGTTTTTTTGCCTGTTTTTTTACAATTAACCCTTTTTTTAGGTGCTAACTTAGGTAAATCGT
TCCGCTTTAAGTTCCTTATTAAAGATGCGTATCAGCAGATAAAACGGCGTTATTTACCGCTTGCGTCTTTTTATTTGGCG
CTAACGGCCAGTATTGCTGCGGCGTTATTGGTCAATAGCTTTGAAAGCGCTTTTGTACGCTATCTTGATCAGCAATTAAA
TGCAGACATTTTTATTCGCCACAAGGCTTGGCAAAAAGAAACTATAGAGGATTGGTTAGGGACTCAATCCGCACTAAAAG
AATATACTCTGTTTCAGCATACTTGGGCAAAAATAGAAACCGAGTCAGTTAAGCTAGTCAATCACCAATCCTTGCGCCAG
TTGGAATCACTGCTGCTTAAATCGTCTGACCATAGTGATGAAGAGGGTTGTTATATCAATGAGCAGCTGGCCTTGAAAAA
AAAGCTAAACATAGGGGGGGAAATAAAAATAACACAAGGCAAACAAGTTTATCAATGCAATGTAAAAGGAGTCTACTACG
AGTATGGATACCCGGGTTATTCTGTTACCGTTGACAATGCGCCATTAACCACTCATTTTAGTGGCTGGGCCGATACAGGA
TTTGGTTTGTTTTTTGAATCGGGGCAGTTGATTACAAAACAAGAGATTATAACGGCATTAAAACTCGATTCTCAACAGGT
ATATCAACCGCAGCAGATTAAAATTTTGGCTCTGGAAATTTTTTCGCAAACCTTTATTCTGATCCAGGCTATTACAGCGG
TTTTATTATTGGTCGCCTGTTTTGGTTTATTTTTGTCCGCACAGAGTTTGGAGTTGGCTCGTAAAAGCGATTTATATATT
CTTTACAGTTTGGGATATGACAAAAAGGCGCTGTTTACCCACATGTTGGTGCAATGGTTATTGCTTGTTTTATGCTCTAT
TATATTGAGCTGGCCGATTGCAACGCTTCTGGCTAATGCATTAGTCACAGAGGTTTTACCGGCATCTTTTGGCTGGTCTA
TGCCGTTGATGATCAATATTGCCCCCTTTGTTGTCAGCAGTTTGCTCGGTTTACTCTTATTAATTCCGGCGGTAAGTATT
CCCCTGCTTAAACTGAATGTCAGGAAAAATTTATGTCCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTATTGCTGGTTACTCACAGTGTTAATGTCGCACAGAAAATGGATAAAATATATCACTTGGCAAAAGGTAAATTATCT
CTAGTTAAGGGAGCGTTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGTTAATAAATACAATGGTATTTCATCTAAAAAAATATTGGTTATATTATTCATTGTCTTTTTTTTATTCTTATTG
AGTATTGCTCTTTTAAGCAA

Product: ABC-type transporter protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 813; Mature: 812

Protein sequence:

>813_residues
MAFLIPQMVTPVAKIKKWFNQDLYLVLKTQVAEYKNKPLLHLAFILSLAIATSTLLSVLVLNHASREQYQQANSLLKNPV
GFHIIAQQGSKLKKEDFFSLRKKGFTQITPVLTFRKKLTNGKYTTFTAIDLLALSLIKAEHFNSQSVSLTEEYARSLLLF
NGGSKNQDKQFFLADNRAIPFSIRPAGQWQDQALLDITLAWKLFPEEGDFSYLLVAPLSEQSKEILESVLPTHLSLYKPW
SVEERQGFADALHLNLNALAILGFIVSLFIAFQAANQAWRKRAQLTAQLRLLGVQLFTIKIAVIIEALFLVTMATVLGIL
LAIGLVSILLPLLGLTLKQLYSLNSSGHFIWQWSYNLWAFFISSLAVLLALMKQFKLLSSKYIARSAHLQRELFSARKHL
IATFLLLALFILWPNNNWLQLMIKYGLLLMASIVFLPVFLQLTLFLGANLGKSFRFKFLIKDAYQQIKRRYLPLASFYLA
LTASIAAALLVNSFESAFVRYLDQQLNADIFIRHKAWQKETIEDWLGTQSALKEYTLFQHTWAKIETESVKLVNHQSLRQ
LESLLLKSSDHSDEEGCYINEQLALKKKLNIGGEIKITQGKQVYQCNVKGVYYEYGYPGYSVTVDNAPLTTHFSGWADTG
FGLFFESGQLITKQEIITALKLDSQQVYQPQQIKILALEIFSQTFILIQAITAVLLLVACFGLFLSAQSLELARKSDLYI
LYSLGYDKKALFTHMLVQWLLLVLCSIILSWPIATLLANALVTEVLPASFGWSMPLMINIAPFVVSSLLGLLLLIPAVSI
PLLKLNVRKNLCP

Sequences:

>Translated_813_residues
MAFLIPQMVTPVAKIKKWFNQDLYLVLKTQVAEYKNKPLLHLAFILSLAIATSTLLSVLVLNHASREQYQQANSLLKNPV
GFHIIAQQGSKLKKEDFFSLRKKGFTQITPVLTFRKKLTNGKYTTFTAIDLLALSLIKAEHFNSQSVSLTEEYARSLLLF
NGGSKNQDKQFFLADNRAIPFSIRPAGQWQDQALLDITLAWKLFPEEGDFSYLLVAPLSEQSKEILESVLPTHLSLYKPW
SVEERQGFADALHLNLNALAILGFIVSLFIAFQAANQAWRKRAQLTAQLRLLGVQLFTIKIAVIIEALFLVTMATVLGIL
LAIGLVSILLPLLGLTLKQLYSLNSSGHFIWQWSYNLWAFFISSLAVLLALMKQFKLLSSKYIARSAHLQRELFSARKHL
IATFLLLALFILWPNNNWLQLMIKYGLLLMASIVFLPVFLQLTLFLGANLGKSFRFKFLIKDAYQQIKRRYLPLASFYLA
LTASIAAALLVNSFESAFVRYLDQQLNADIFIRHKAWQKETIEDWLGTQSALKEYTLFQHTWAKIETESVKLVNHQSLRQ
LESLLLKSSDHSDEEGCYINEQLALKKKLNIGGEIKITQGKQVYQCNVKGVYYEYGYPGYSVTVDNAPLTTHFSGWADTG
FGLFFESGQLITKQEIITALKLDSQQVYQPQQIKILALEIFSQTFILIQAITAVLLLVACFGLFLSAQSLELARKSDLYI
LYSLGYDKKALFTHMLVQWLLLVLCSIILSWPIATLLANALVTEVLPASFGWSMPLMINIAPFVVSSLLGLLLLIPAVSI
PLLKLNVRKNLCP
>Mature_812_residues
AFLIPQMVTPVAKIKKWFNQDLYLVLKTQVAEYKNKPLLHLAFILSLAIATSTLLSVLVLNHASREQYQQANSLLKNPVG
FHIIAQQGSKLKKEDFFSLRKKGFTQITPVLTFRKKLTNGKYTTFTAIDLLALSLIKAEHFNSQSVSLTEEYARSLLLFN
GGSKNQDKQFFLADNRAIPFSIRPAGQWQDQALLDITLAWKLFPEEGDFSYLLVAPLSEQSKEILESVLPTHLSLYKPWS
VEERQGFADALHLNLNALAILGFIVSLFIAFQAANQAWRKRAQLTAQLRLLGVQLFTIKIAVIIEALFLVTMATVLGILL
AIGLVSILLPLLGLTLKQLYSLNSSGHFIWQWSYNLWAFFISSLAVLLALMKQFKLLSSKYIARSAHLQRELFSARKHLI
ATFLLLALFILWPNNNWLQLMIKYGLLLMASIVFLPVFLQLTLFLGANLGKSFRFKFLIKDAYQQIKRRYLPLASFYLAL
TASIAAALLVNSFESAFVRYLDQQLNADIFIRHKAWQKETIEDWLGTQSALKEYTLFQHTWAKIETESVKLVNHQSLRQL
ESLLLKSSDHSDEEGCYINEQLALKKKLNIGGEIKITQGKQVYQCNVKGVYYEYGYPGYSVTVDNAPLTTHFSGWADTGF
GLFFESGQLITKQEIITALKLDSQQVYQPQQIKILALEIFSQTFILIQAITAVLLLVACFGLFLSAQSLELARKSDLYIL
YSLGYDKKALFTHMLVQWLLLVLCSIILSWPIATLLANALVTEVLPASFGWSMPLMINIAPFVVSSLLGLLLLIPAVSIP
LLKLNVRKNLCP

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91898; Mature: 91766

Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAFLIPQMVTPVAKIKKWFNQDLYLVLKTQVAEYKNKPLLHLAFILSLAIATSTLLSVLV
CCEECHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNHASREQYQQANSLLKNPVGFHIIAQQGSKLKKEDFFSLRKKGFTQITPVLTFRKKLTN
HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCC
GKYTTFTAIDLLALSLIKAEHFNSQSVSLTEEYARSLLLFNGGSKNQDKQFFLADNRAIP
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCC
FSIRPAGQWQDQALLDITLAWKLFPEEGDFSYLLVAPLSEQSKEILESVLPTHLSLYKPW
EEECCCCCCCCCHHEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SVEERQGFADALHLNLNALAILGFIVSLFIAFQAANQAWRKRAQLTAQLRLLGVQLFTIK
CCHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAVIIEALFLVTMATVLGILLAIGLVSILLPLLGLTLKQLYSLNSSGHFIWQWSYNLWAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHH
FISSLAVLLALMKQFKLLSSKYIARSAHLQRELFSARKHLIATFLLLALFILWPNNNWLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LMIKYGLLLMASIVFLPVFLQLTLFLGANLGKSFRFKFLIKDAYQQIKRRYLPLASFYLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LTASIAAALLVNSFESAFVRYLDQQLNADIFIRHKAWQKETIEDWLGTQSALKEYTLFQH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TWAKIETESVKLVNHQSLRQLESLLLKSSDHSDEEGCYINEQLALKKKLNIGGEIKITQG
HHHHHECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCEEEEECC
KQVYQCNVKGVYYEYGYPGYSVTVDNAPLTTHFSGWADTGFGLFFESGQLITKQEIITAL
CEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCEEHHHHHHHHH
KLDSQQVYQPQQIKILALEIFSQTFILIQAITAVLLLVACFGLFLSAQSLELARKSDLYI
HCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
LYSLGYDKKALFTHMLVQWLLLVLCSIILSWPIATLLANALVTEVLPASFGWSMPLMINI
EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEE
APFVVSSLLGLLLLIPAVSIPLLKLNVRKNLCP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
AFLIPQMVTPVAKIKKWFNQDLYLVLKTQVAEYKNKPLLHLAFILSLAIATSTLLSVLV
CEECHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNHASREQYQQANSLLKNPVGFHIIAQQGSKLKKEDFFSLRKKGFTQITPVLTFRKKLTN
HHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCC
GKYTTFTAIDLLALSLIKAEHFNSQSVSLTEEYARSLLLFNGGSKNQDKQFFLADNRAIP
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCC
FSIRPAGQWQDQALLDITLAWKLFPEEGDFSYLLVAPLSEQSKEILESVLPTHLSLYKPW
EEECCCCCCCCCHHEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SVEERQGFADALHLNLNALAILGFIVSLFIAFQAANQAWRKRAQLTAQLRLLGVQLFTIK
CCHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAVIIEALFLVTMATVLGILLAIGLVSILLPLLGLTLKQLYSLNSSGHFIWQWSYNLWAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHH
FISSLAVLLALMKQFKLLSSKYIARSAHLQRELFSARKHLIATFLLLALFILWPNNNWLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LMIKYGLLLMASIVFLPVFLQLTLFLGANLGKSFRFKFLIKDAYQQIKRRYLPLASFYLA
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LTASIAAALLVNSFESAFVRYLDQQLNADIFIRHKAWQKETIEDWLGTQSALKEYTLFQH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TWAKIETESVKLVNHQSLRQLESLLLKSSDHSDEEGCYINEQLALKKKLNIGGEIKITQG
HHHHHECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECHHHHHHHHCCCCCEEEEECC
KQVYQCNVKGVYYEYGYPGYSVTVDNAPLTTHFSGWADTGFGLFFESGQLITKQEIITAL
CEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCEEHHHHHHHHH
KLDSQQVYQPQQIKILALEIFSQTFILIQAITAVLLLVACFGLFLSAQSLELARKSDLYI
HCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
LYSLGYDKKALFTHMLVQWLLLVLCSIILSWPIATLLANALVTEVLPASFGWSMPLMINI
EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEE
APFVVSSLLGLLLLIPAVSIPLLKLNVRKNLCP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA