| Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008709 |
| Length | 4,559,598 |
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The map label for this gene is 119943811
Identifier: 119943811
GI number: 119943811
Start: 22981
End: 26403
Strand: Direct
Name: 119943811
Synonym: Ping_0017
Alternate gene names: NA
Gene position: 22981-26403 (Clockwise)
Preceding gene: 119943810
Following gene: 119943812
Centisome position: 0.5
GC content: 34.68
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AGTATGCTTGATGTCAAAAATATTTCGTTTTTGCCAAAGCAGGGAGGGACGGTTCCTTTTAAAACATTAATCCTTGCTCC GCTTGGTGGCCATAATGCCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1140; Mature: 1140
Protein sequence:
>1140_residues MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQAKQRVEKLINIDASTKEKTK LSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIMHIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLND LVILDVDSYLIKNADSAANSEWLQLLNGLASSEKSKSLDGLLISIHVADLVDPATRSQIADQLRKKYEEIKEYCGVEVPV NISLLGLEERKGVDDWLGQLSNDWKKQTLGVINQQKEPVKNIIQSCFSKIQAIFKQGSLDYIVNQGFDETVANLPHKIKD IQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFVDDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTV LVILLGTLYNSDKNNIEQIYQDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFDSAYIDNMSPDMIDGLNSLYI KSLFMIKDANDASYLKNWQQQITKYRNDISTLLLSSNGTMDWLIDWVNHNGKVDSVQLSDYWQGSRHIQSPILIEGAYTL AGKTIIDDFSEQILYALGEEHPFLLKFLPVFQQQYQHNYVAKWGAFLKNFHTGTATLSSRSEWLNVINNLTTGRNIFFKL LNDADYQLAPFNDLEDKPDWFDFSLYYQDMLALGEDEAQSNPAKNKVFTKLALKVVGSLGPVGKAISGSGKKALKTKKKL DKASGSGPGPSERALNLQEAGKGLDEYKGLIADLVFNIEQQKESHKSIRAFFEFENNPIDEGTVLANAKLNIMNLQGLIG KAGNSTASFWNVYIGSILVLENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSETDISLICEAETQTLVNKNYIV NKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDDFKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRL RQALSIKPPQPPESIAQCWM
Sequences:
>Translated_1140_residues MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQAKQRVEKLINIDASTKEKTK LSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIMHIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLND LVILDVDSYLIKNADSAANSEWLQLLNGLASSEKSKSLDGLLISIHVADLVDPATRSQIADQLRKKYEEIKEYCGVEVPV NISLLGLEERKGVDDWLGQLSNDWKKQTLGVINQQKEPVKNIIQSCFSKIQAIFKQGSLDYIVNQGFDETVANLPHKIKD IQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFVDDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTV LVILLGTLYNSDKNNIEQIYQDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFDSAYIDNMSPDMIDGLNSLYI KSLFMIKDANDASYLKNWQQQITKYRNDISTLLLSSNGTMDWLIDWVNHNGKVDSVQLSDYWQGSRHIQSPILIEGAYTL AGKTIIDDFSEQILYALGEEHPFLLKFLPVFQQQYQHNYVAKWGAFLKNFHTGTATLSSRSEWLNVINNLTTGRNIFFKL LNDADYQLAPFNDLEDKPDWFDFSLYYQDMLALGEDEAQSNPAKNKVFTKLALKVVGSLGPVGKAISGSGKKALKTKKKL DKASGSGPGPSERALNLQEAGKGLDEYKGLIADLVFNIEQQKESHKSIRAFFEFENNPIDEGTVLANAKLNIMNLQGLIG KAGNSTASFWNVYIGSILVLENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSETDISLICEAETQTLVNKNYIV NKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDDFKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRL RQALSIKPPQPPESIAQCWM >Mature_1140_residues MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQAKQRVEKLINIDASTKEKTK LSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIMHIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLND LVILDVDSYLIKNADSAANSEWLQLLNGLASSEKSKSLDGLLISIHVADLVDPATRSQIADQLRKKYEEIKEYCGVEVPV NISLLGLEERKGVDDWLGQLSNDWKKQTLGVINQQKEPVKNIIQSCFSKIQAIFKQGSLDYIVNQGFDETVANLPHKIKD IQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFVDDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTV LVILLGTLYNSDKNNIEQIYQDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFDSAYIDNMSPDMIDGLNSLYI KSLFMIKDANDASYLKNWQQQITKYRNDISTLLLSSNGTMDWLIDWVNHNGKVDSVQLSDYWQGSRHIQSPILIEGAYTL AGKTIIDDFSEQILYALGEEHPFLLKFLPVFQQQYQHNYVAKWGAFLKNFHTGTATLSSRSEWLNVINNLTTGRNIFFKL LNDADYQLAPFNDLEDKPDWFDFSLYYQDMLALGEDEAQSNPAKNKVFTKLALKVVGSLGPVGKAISGSGKKALKTKKKL DKASGSGPGPSERALNLQEAGKGLDEYKGLIADLVFNIEQQKESHKSIRAFFEFENNPIDEGTVLANAKLNIMNLQGLIG KAGNSTASFWNVYIGSILVLENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSETDISLICEAETQTLVNKNYIV NKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDDFKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRL RQALSIKPPQPPESIAQCWM
Specific function: Unknown
COG id: COG3523
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 130004; Mature: 130004
Theoretical pI: Translated: 5.45; Mature: 5.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.3 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKQRVEKLINIDASTKEKTKLSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIM HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE HIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLNDLVILDVDSYLIKNADSAANS EEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHCCCCCCCH EWLQLLNGLASSEKSKSLDGLLISIHVADLVDPATRSQIADQLRKKYEEIKEYCGVEVPV HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NISLLGLEERKGVDDWLGQLSNDWKKQTLGVINQQKEPVKNIIQSCFSKIQAIFKQGSLD EEEEEECHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH YIVNQGFDETVANLPHKIKDIQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFV HHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCEEEEEECCCCEEEH DDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTVLVILLGTLYNSDKNNIEQIY HHHHCCCHHHEECCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH QDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHCCCCHHHHHHHHHH DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHH SAYIDNMSPDMIDGLNSLYIKSLFMIKDANDASYLKNWQQQITKYRNDISTLLLSSNGTM HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCH DWLIDWVNHNGKVDSVQLSDYWQGSRHIQSPILIEGAYTLAGKTIIDDFSEQILYALGEE HHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC HPFLLKFLPVFQQQYQHNYVAKWGAFLKNFHTGTATLSSRSEWLNVINNLTTGRNIFFKL CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LNDADYQLAPFNDLEDKPDWFDFSLYYQDMLALGEDEAQSNPAKNKVFTKLALKVVGSLG HCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC PVGKAISGSGKKALKTKKKLDKASGSGPGPSERALNLQEAGKGLDEYKGLIADLVFNIEQ CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH QKESHKSIRAFFEFENNPIDEGTVLANAKLNIMNLQGLIGKAGNSTASFWNVYIGSILVL HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCEEEEEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSET CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECC DISLICEAETQTLVNKNYIVNKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDD CEEEEEECHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH FKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRLRQALSIKPPQPPESIAQCWM HHHHHHHCCHHHCCEEEEEECCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKQRVEKLINIDASTKEKTKLSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIM HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEE HIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLNDLVILDVDSYLIKNADSAANS EEEECCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHCCCCCCCH EWLQLLNGLASSEKSKSLDGLLISIHVADLVDPATRSQIADQLRKKYEEIKEYCGVEVPV HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NISLLGLEERKGVDDWLGQLSNDWKKQTLGVINQQKEPVKNIIQSCFSKIQAIFKQGSLD EEEEEECHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH YIVNQGFDETVANLPHKIKDIQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFV HHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHCCEEEEEECCCCEEEH DDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTVLVILLGTLYNSDKNNIEQIY HHHHCCCHHHEECCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH QDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHCCCCHHHHHHHHHH DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHH SAYIDNMSPDMIDGLNSLYIKSLFMIKDANDASYLKNWQQQITKYRNDISTLLLSSNGTM HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCH DWLIDWVNHNGKVDSVQLSDYWQGSRHIQSPILIEGAYTLAGKTIIDDFSEQILYALGEE HHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHCCCCCCCCCCEEEECCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC HPFLLKFLPVFQQQYQHNYVAKWGAFLKNFHTGTATLSSRSEWLNVINNLTTGRNIFFKL CCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LNDADYQLAPFNDLEDKPDWFDFSLYYQDMLALGEDEAQSNPAKNKVFTKLALKVVGSLG HCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC PVGKAISGSGKKALKTKKKLDKASGSGPGPSERALNLQEAGKGLDEYKGLIADLVFNIEQ CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH QKESHKSIRAFFEFENNPIDEGTVLANAKLNIMNLQGLIGKAGNSTASFWNVYIGSILVL HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCEEEEEEHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSET CCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCEEEEEECC DISLICEAETQTLVNKNYIVNKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDD CEEEEEECHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH FKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRLRQALSIKPPQPPESIAQCWM HHHHHHHCCHHHCCEEEEEECCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA