Definition Psychromonas ingrahamii 37, complete genome.
Accession NC_008709
Length 4,559,598

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The map label for this gene is 119943811

Identifier: 119943811

GI number: 119943811

Start: 22981

End: 26403

Strand: Direct

Name: 119943811

Synonym: Ping_0017

Alternate gene names: NA

Gene position: 22981-26403 (Clockwise)

Preceding gene: 119943810

Following gene: 119943812

Centisome position: 0.5

GC content: 34.68

Gene sequence:

>3423_bases
ATGAAAAAATTCCTTAAGTTTTTACTCGTCGTTTTCATTTGGTTAGTCATATTTGGTGTTTGTGTGGCTGGATCTTTATT
GTTAGGTGCCACTGAAGTTGAAGGTATACAAGTTTTCTTGGCTATTTTCATCGCCTGGTATGCTATTAAGTTTTGCATCT
ACCTTTATAAGCGCTGGCAAGCAAAACAACGAGTTGAAAAATTAATTAATATTGATGCGTCAACAAAGGAGAAAACAAAA
TTATCATTTTTTCAATTCTTATTTCCTAAATCCATTGATAAGCATATTAAACGCGTCCTAAAGAGAATTAACCACAACGT
CAGTAGCGATGAAAATCAGCAGGAAGCTGATTTTATTATGCATATTAAAATGGATAATAAACATGCTGACTGGTTATACA
CTGAAACAGTCAATAGACCTCAAATAGCCGATCCAATTTTCAGTGAATATAAATATCTTCAATGGATTGTGCTAAATGAT
CTTGTGATTCTAGATGTTGACTCTTATTTAATTAAAAATGCTGATTCTGCCGCTAACAGTGAATGGCTGCAATTACTCAA
TGGCTTAGCATCAAGCGAAAAATCAAAATCCTTAGACGGATTATTAATATCGATTCATGTTGCTGATTTAGTTGATCCTG
CAACGAGAAGCCAGATTGCAGATCAACTTCGAAAAAAATATGAAGAAATTAAAGAGTATTGTGGTGTAGAAGTTCCTGTG
AATATTTCACTTCTTGGATTAGAAGAGCGAAAAGGAGTTGATGACTGGCTAGGACAACTGAGTAATGATTGGAAAAAGCA
AACCTTAGGCGTTATTAACCAACAAAAAGAGCCGGTGAAAAATATTATCCAAAGCTGTTTTTCGAAAATTCAAGCTATTT
TTAAACAAGGATCTTTAGATTATATTGTTAATCAAGGGTTCGATGAAACCGTTGCCAATCTGCCTCATAAAATCAAAGAT
ATTCAAGACTCTGTCGAGTTATTCTGCTCGCGTTTATTTTCAAGCAATAGTTTTCAAGGCAAACCTGTTTGTTCAGGTCT
GTTTCTTGTTATGGCAGAAAAGAACAAAGCTGTATTTGTTGATGATCTGTTAGAGCAATCAGCTTTATGTTGGTTGCCTG
CTATATCAATGAATAAAAATACTGCCAGTGATATTGAAAAAAACAAACGGTTATGGACTTATTTATCTGCAACAACAGTG
CTAGTTATTCTGTTGGGGACTTTGTATAACTCCGATAAAAATAATATTGAGCAAATATATCAAGATTACGAATCGCAACT
TTCAAAGTCTGAAGATCAAGTCAAAGTTAGGGACAATCTTGAGAGTAGATATCAATTAATTACCAAACTAAATGACGTTA
ATATAAGTTATTGGCTACCCCTTTCAGAGAGTGTTTTTAATATACCTACATTAAAAGCTGAACTGGCTAATGATATTCAG
GATGTTTTAATTTCTCCGGTCGATAAGTACTTTGAAGATAATATTAAACAATTATCGAATAAGAATATTGATAGTAAAGT
TGATTATTTAAACATATTAATGCGCAGAATAAATGTGCTAAGTGCAGCAAGTAAAGGGGCTTCATTAACAGATTTAGCTG
AATTGCCTCAGCCCTTTGACAGCGCGTATATTGATAACATGTCACCAGATATGATTGATGGATTAAACAGTTTATATATT
AAAAGCTTGTTTATGATAAAGGATGCAAATGACGCAAGCTATCTCAAAAACTGGCAGCAGCAAATAACAAAATATCGTAA
TGATATTTCTACCTTATTATTATCTTCTAATGGAACAATGGACTGGTTAATTGACTGGGTTAATCATAATGGAAAAGTTG
ATTCGGTACAGCTGAGTGACTACTGGCAAGGTTCTAGGCATATCCAATCACCTATCTTAATTGAAGGTGCCTATACGTTA
GCAGGTAAAACAATTATTGATGATTTTTCAGAGCAAATTTTATATGCTCTAGGAGAGGAACACCCGTTTTTGTTAAAATT
TTTACCTGTATTTCAACAGCAATATCAGCATAATTATGTCGCAAAATGGGGGGCTTTCTTAAAAAATTTCCATACAGGAA
CGGCAACATTGAGTAGCCGATCAGAATGGTTAAATGTTATTAATAATTTGACCACCGGACGAAATATTTTTTTCAAGTTA
TTAAATGATGCGGATTACCAATTAGCTCCTTTTAATGATTTAGAGGATAAGCCCGATTGGTTTGATTTTTCCCTTTATTA
CCAAGATATGCTGGCCCTAGGTGAAGATGAAGCCCAATCTAACCCTGCAAAGAACAAAGTATTTACCAAGTTAGCGTTAA
AGGTGGTGGGATCATTAGGTCCTGTTGGTAAGGCTATTTCAGGTTCTGGGAAAAAGGCGTTGAAAACCAAGAAAAAATTG
GATAAAGCCAGTGGTTCTGGTCCAGGCCCTTCAGAAAGAGCGTTAAATTTACAAGAAGCCGGCAAAGGCTTGGATGAATA
TAAAGGGCTGATTGCGGATTTAGTGTTCAATATTGAACAGCAAAAAGAGTCGCACAAAAGCATTCGCGCATTTTTTGAGT
TTGAAAATAACCCGATAGACGAAGGCACTGTTTTAGCAAATGCGAAACTTAACATCATGAACCTGCAGGGGTTAATAGGT
AAAGCGGGTAATTCCACGGCATCATTTTGGAATGTGTACATTGGATCTATTTTAGTGCTAGAAAACTTTATGCTTGAAGA
AAGTGCATGTTTGCTTGAAAAATCATGGGAAGAAGATTTTCTCTATGAATTAGAAGGGGTACCGGCCTATAAGCTAGATG
AGTTTGCTTATGGGGAATCAGGTGTTTTATGGTCATTTTTTGATAAAACCTTACAACCTTTTATTCAAAATAAGCGCGGA
GGGGGTTATAGTTTCAAAAAAGTGGTGGAGAAAAAAATTCCTTTGTCACCGGATTTATTAGATTACTTAATTCGAGCTAA
AGACTTAAAAACACGTCAGAAGTTTAAATCCTTTGATTTATTTATGACGGCAAAACCAACAGATACAAATGCAAACTCAC
TATTATATGTATCAGAAACCGATATCAGCCTGATTTGTGAAGCAGAAACACAAACACTGGTAAATAAGAATTATATCGTC
AATAAGCTTTTTAAATGGGATGAAACATGTCGTTCTGTTAGTTTAAAGCTAAAAGTGGGTAACAAGATACTTGAGAAAGT
TTACAGTGGTGATGACGGTGTATTCAATTTCTTGGATGATTTTAAATCTGGTGTTAAACGCTTTGAATTGGAAGAGTTTC
CCGTATATTTTTATGAATTAAACAGTTATCGAATTGAATACTTTGACGTTAAATTAAATATCAAAGGTGCCGATAGGTTA
AGACAAGCGTTATCTATCAAACCACCACAACCGCCTGAATCAATCGCGCAATGTTGGATGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTCCAATAGGAGTTCTTCTTTTGTCGTATTTTTTATTGAGAAGCAATATTCTTGATAGTGTTTCCCAAATCTTAAGCCAG
ATATAAGTGGTATTCTAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTATGCTTGATGTCAAAAATATTTCGTTTTTGCCAAAGCAGGGAGGGACGGTTCCTTTTAAAACATTAATCCTTGCTCC
GCTTGGTGGCCATAATGCCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1140; Mature: 1140

Protein sequence:

>1140_residues
MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQAKQRVEKLINIDASTKEKTK
LSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIMHIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLND
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LVILLGTLYNSDKNNIEQIYQDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ
DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFDSAYIDNMSPDMIDGLNSLYI
KSLFMIKDANDASYLKNWQQQITKYRNDISTLLLSSNGTMDWLIDWVNHNGKVDSVQLSDYWQGSRHIQSPILIEGAYTL
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GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSETDISLICEAETQTLVNKNYIV
NKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDDFKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRL
RQALSIKPPQPPESIAQCWM

Sequences:

>Translated_1140_residues
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LSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIMHIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLND
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IQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFVDDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTV
LVILLGTLYNSDKNNIEQIYQDYESQLSKSEDQVKVRDNLESRYQLITKLNDVNISYWLPLSESVFNIPTLKAELANDIQ
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NKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDDFKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRL
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>Mature_1140_residues
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LSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIMHIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLND
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IQDSVELFCSRLFSSNSFQGKPVCSGLFLVMAEKNKAVFVDDLLEQSALCWLPAISMNKNTASDIEKNKRLWTYLSATTV
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DVLISPVDKYFEDNIKQLSNKNIDSKVDYLNILMRRINVLSAASKGASLTDLAELPQPFDSAYIDNMSPDMIDGLNSLYI
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KAGNSTASFWNVYIGSILVLENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG
GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSETDISLICEAETQTLVNKNYIV
NKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDDFKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRL
RQALSIKPPQPPESIAQCWM

Specific function: Unknown

COG id: COG3523

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 130004; Mature: 130004

Theoretical pI: Translated: 5.45; Mature: 5.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKFLKFLLVVFIWLVIFGVCVAGSLLLGATEVEGIQVFLAIFIAWYAIKFCIYLYKRWQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKQRVEKLINIDASTKEKTKLSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIM
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HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
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EEEEEECHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHH
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LNDADYQLAPFNDLEDKPDWFDFSLYYQDMLALGEDEAQSNPAKNKVFTKLALKVVGSLG
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CEEEEEECHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHCCHHHCCEEEEEECCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKQRVEKLINIDASTKEKTKLSFFQFLFPKSIDKHIKRVLKRINHNVSSDENQQEADFIM
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HIKMDNKHADWLYTETVNRPQIADPIFSEYKYLQWIVLNDLVILDVDSYLIKNADSAANS
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HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHCCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHH
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HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCH
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CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKESHKSIRAFFEFENNPIDEGTVLANAKLNIMNLQGLIGKAGNSTASFWNVYIGSILVL
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ENFMLEESACLLEKSWEEDFLYELEGVPAYKLDEFAYGESGVLWSFFDKTLQPFIQNKRG
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GGYSFKKVVEKKIPLSPDLLDYLIRAKDLKTRQKFKSFDLFMTAKPTDTNANSLLYVSET
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DISLICEAETQTLVNKNYIVNKLFKWDETCRSVSLKLKVGNKILEKVYSGDDGVFNFLDD
CEEEEEECHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
FKSGVKRFELEEFPVYFYELNSYRIEYFDVKLNIKGADRLRQALSIKPPQPPESIAQCWM
HHHHHHHCCHHHCCEEEEEECCEEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA