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The map label for this gene is 117921511

Identifier: 117921511

GI number: 117921511

Start: 3685305

End: 3686615

Strand: Direct

Name: 117921511

Synonym: Shewana3_3073

Alternate gene names: NA

Gene position: 3685305-3686615 (Clockwise)

Preceding gene: 117921509

Following gene: 117921514

Centisome position: 74.12

GC content: 46.99

Gene sequence:

>1311_bases
ATGCCACTCAATAGCTCGCCCTTGGCTTGCCACGACATTAAAACAGCAGTTGGAATTGCAGTTATGTTATATACCTTTCT
GATCATACTGGCGGTGCTCGCATTGCTCAGTATTATTTTCGAAGAAGTCACCCACCTTAATAAAGCAAAAACCACCTTAT
TCTTTGGCTGTATTTCCTGGGTAGCACTGTTTATGGCTGCCGGAGACGCCAACCATGAGAAATTGGTTGCCCATCAACTC
AATGAAAACTTGCTCGAAATTGCCACCCTGTGGCTGTTTTTGATGTCGACAATGACCTTTGTGGCCTATCTTAACGCCAA
AGGTATGATCCAAATCATGGTGCAGAAGCTGTTCCCGCAGAAGGTCTCTGTACGCTTGTTAATGATCCAAGTGGCCTTAT
TCGCGCTTATCCTGTCGGCTTTCTGTGATAACGTCACCGCGACCTTAGTATCTTTAGGCTTGTTAACGACCTTTAAGCTC
GAAAAGCAAATGCGCCGCAGAATGGCGGTGTTGATTATTTTCGCCGTGAACTCTGGCGGTGTGGCTCTGATCACCGGTGA
CGTTACCACCCTGATGATCTTCTTAGGCGGCCACGTACATATCTCCGAACTGTTGATGCTGTTTATCCCATCTGCCGTGA
GTGTGATTTTACTGGCGACGCTGTTCTCATTGAAGGCTGAAGGCGTGGTGTCCACCACCCCGATTAAGCACAGCTATCAA
ACCGTGGATCTGCTAATTGCCTTAGTGTTCTTCTGCACGATCCTGATGACCATGCTGCTGAACATTCTCTTCGGTATTCC
ACCGGTACTGACCTTCTTAACCGGTCTGTCGATTATGTTCCTTATCGGCCACACCACTCGCAGTGATAAAGAAGAAATCA
AGATCCTCGAATATATTCGCCAAGTCGAATACGACACTCTGTTGTTCTTCTTAGGAATTTTACTGCTGGTGGGTATGCTT
AAAGAAATCGGCACCTTAGATATGCTGACCGAAGCTTACAGCCTGTTTAATCCAAACATCTCTAACTTCGTTACAGGTAT
GGGTTCTGCCCTTATCGATAACGTGCCATTGACAGCTGCGCTGCTTAAAGCAGAGCCAGTGCTCAACACCCCTGAATGGT
TAGGTTTAACCTACAGTGTGGGCGTGGGTGGTTCGTTGTTAGTGATTGGTTCGGCTGCGGGTATCGTCGCCATGAGCAAA
GTAAAAGAGCTGACTTTCGTAAGCTACCTGAAATATGTGCCAGCCCTGTTCCTATGCTACAGCGTGGGTTACGCCCTGAC
CTTATTTTTGGCTTACAACTTCTTCGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATGACGCAAAACCGAGTTACAGCTAACAGTTGCGTTATTCACCCCATTATGTTCTGATCCGCACGCATTAACACGGCA
AGCTTAATTTAGCCTTGATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTGATTTTAAGCGATAAAAAAGGCGCCCATCGGCGCCTTTTTTGTTTGTAATATAACAAGTTAAATCGCTGGCACCC
TAAACTGCGTGCCTTGGATT

Product: citrate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 436; Mature: 435

Protein sequence:

>436_residues
MPLNSSPLACHDIKTAVGIAVMLYTFLIILAVLALLSIIFEEVTHLNKAKTTLFFGCISWVALFMAAGDANHEKLVAHQL
NENLLEIATLWLFLMSTMTFVAYLNAKGMIQIMVQKLFPQKVSVRLLMIQVALFALILSAFCDNVTATLVSLGLLTTFKL
EKQMRRRMAVLIIFAVNSGGVALITGDVTTLMIFLGGHVHISELLMLFIPSAVSVILLATLFSLKAEGVVSTTPIKHSYQ
TVDLLIALVFFCTILMTMLLNILFGIPPVLTFLTGLSIMFLIGHTTRSDKEEIKILEYIRQVEYDTLLFFLGILLLVGML
KEIGTLDMLTEAYSLFNPNISNFVTGMGSALIDNVPLTAALLKAEPVLNTPEWLGLTYSVGVGGSLLVIGSAAGIVAMSK
VKELTFVSYLKYVPALFLCYSVGYALTLFLAYNFFA

Sequences:

>Translated_436_residues
MPLNSSPLACHDIKTAVGIAVMLYTFLIILAVLALLSIIFEEVTHLNKAKTTLFFGCISWVALFMAAGDANHEKLVAHQL
NENLLEIATLWLFLMSTMTFVAYLNAKGMIQIMVQKLFPQKVSVRLLMIQVALFALILSAFCDNVTATLVSLGLLTTFKL
EKQMRRRMAVLIIFAVNSGGVALITGDVTTLMIFLGGHVHISELLMLFIPSAVSVILLATLFSLKAEGVVSTTPIKHSYQ
TVDLLIALVFFCTILMTMLLNILFGIPPVLTFLTGLSIMFLIGHTTRSDKEEIKILEYIRQVEYDTLLFFLGILLLVGML
KEIGTLDMLTEAYSLFNPNISNFVTGMGSALIDNVPLTAALLKAEPVLNTPEWLGLTYSVGVGGSLLVIGSAAGIVAMSK
VKELTFVSYLKYVPALFLCYSVGYALTLFLAYNFFA
>Mature_435_residues
PLNSSPLACHDIKTAVGIAVMLYTFLIILAVLALLSIIFEEVTHLNKAKTTLFFGCISWVALFMAAGDANHEKLVAHQLN
ENLLEIATLWLFLMSTMTFVAYLNAKGMIQIMVQKLFPQKVSVRLLMIQVALFALILSAFCDNVTATLVSLGLLTTFKLE
KQMRRRMAVLIIFAVNSGGVALITGDVTTLMIFLGGHVHISELLMLFIPSAVSVILLATLFSLKAEGVVSTTPIKHSYQT
VDLLIALVFFCTILMTMLLNILFGIPPVLTFLTGLSIMFLIGHTTRSDKEEIKILEYIRQVEYDTLLFFLGILLLVGMLK
EIGTLDMLTEAYSLFNPNISNFVTGMGSALIDNVPLTAALLKAEPVLNTPEWLGLTYSVGVGGSLLVIGSAAGIVAMSKV
KELTFVSYLKYVPALFLCYSVGYALTLFLAYNFFA

Specific function: Unknown

COG id: COG1055

COG function: function code P; Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permeases

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CitM (TC 2.A.11) transporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000802
- InterPro:   IPR004680 [H]

Pfam domain/function: PF03600 CitMHS [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47768; Mature: 47637

Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPLNSSPLACHDIKTAVGIAVMLYTFLIILAVLALLSIIFEEVTHLNKAKTTLFFGCISW
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALFMAAGDANHEKLVAHQLNENLLEIATLWLFLMSTMTFVAYLNAKGMIQIMVQKLFPQ
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCH
KVSVRLLMIQVALFALILSAFCDNVTATLVSLGLLTTFKLEKQMRRRMAVLIIFAVNSGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCC
VALITGDVTTLMIFLGGHVHISELLMLFIPSAVSVILLATLFSLKAEGVVSTTPIKHSYQ
EEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHH
TVDLLIALVFFCTILMTMLLNILFGIPPVLTFLTGLSIMFLIGHTTRSDKEEIKILEYIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
QVEYDTLLFFLGILLLVGMLKEIGTLDMLTEAYSLFNPNISNFVTGMGSALIDNVPLTAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LLKAEPVLNTPEWLGLTYSVGVGGSLLVIGSAAGIVAMSKVKELTFVSYLKYVPALFLCY
HHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVGYALTLFLAYNFFA
HHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
PLNSSPLACHDIKTAVGIAVMLYTFLIILAVLALLSIIFEEVTHLNKAKTTLFFGCISW
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VALFMAAGDANHEKLVAHQLNENLLEIATLWLFLMSTMTFVAYLNAKGMIQIMVQKLFPQ
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCH
KVSVRLLMIQVALFALILSAFCDNVTATLVSLGLLTTFKLEKQMRRRMAVLIIFAVNSGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCC
VALITGDVTTLMIFLGGHVHISELLMLFIPSAVSVILLATLFSLKAEGVVSTTPIKHSYQ
EEEEECHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHH
TVDLLIALVFFCTILMTMLLNILFGIPPVLTFLTGLSIMFLIGHTTRSDKEEIKILEYIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
QVEYDTLLFFLGILLLVGMLKEIGTLDMLTEAYSLFNPNISNFVTGMGSALIDNVPLTAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
LLKAEPVLNTPEWLGLTYSVGVGGSLLVIGSAAGIVAMSKVKELTFVSYLKYVPALFLCY
HHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVGYALTLFLAYNFFA
HHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]