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Definition Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334, complete genome.
Accession NC_008555
Length 2,814,130

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The map label for this gene is 116872474

Identifier: 116872474

GI number: 116872474

Start: 1076951

End: 1079047

Strand: Direct

Name: 116872474

Synonym: lwe1058

Alternate gene names: NA

Gene position: 1076951-1079047 (Clockwise)

Preceding gene: 116872473

Following gene: 116872476

Centisome position: 38.27

GC content: 26.9

Gene sequence:

>2097_bases
ATTAAAAAAAATTTAGGTTTTGTATTTTATGGAGTATTCATTTTTATATTTGGTTATTTGTTAGTAAGAAGTATAATTAA
TCCATTAAATGTTGATTACAGTAATTTTTTTATACTTTTATTATTTAGTATAACTATTTTATTTATTATGTTAGCTTTTT
TTCAATTATTTAGTCGTCTTAATCGTAGAAGTGATATATTAGTGACGGCAATTTTAATAATAACATTGGTCTCAATACAA
GTTTACTTAATGTTTGCGCTTCAAATGGATGCTTTTGCTGACAGTTTTGGTATAAAAGGTCAAGCAGTACAAATGCTACA
AAACGGTGGAATGTTCACAGGAGACAGTTATTTTCTTGTATATCCGAATAATGTTTTAACTACAATAATCAGATATGGAT
TATATAATTTCGGAGCAGGTATAGGTATCACTAATACTTATCTCCTTGAATGTGGTTTTGTTATTTTATGTATGAATATC
ACTTTCTTTACATTGTTTTATATTATTCGAAAAGAAGTTGGTATAAAATATAGCAACATTTACTTATTGATAATATTGTT
TTGTGTTCCTTTTTATGGGTATTTGAGTTATTTTTATTCAGATACACTTGTGCTACCTTTTGCTGCACTAATTCTATTGT
TTTATTATTTTTATACAAAAAATAATAAATGGTTTTATTTTATAATTATTGGAGTCTTATTTGCTATTGGGTATCATATA
AAACCAAATTTAATAATTATGTTACCAGCGATTATTATTCATTTGTGTTTCATAAGAAATTGGCGAAAAACATTATTAAA
TTCAGCTATCATCTTAATTGTTTTTGCAGGTGTGAACACACTCTATAATCCATTAACAGAAAGATATGGTTTTGAACGTG
ATAATAGTTTAGAGTTTCCTCAATCGCATTGGGTTATGATGGGGTTAAAGGGGCCAGCAGGGAGATATAATAGTTCAGAA
TTTCTTTATACGAAGCAATTTGATACAAAAGAAAAAAAACAAGAAGCTAATAAAAAAATAATAAAGGAAAGAATAACATC
ATATGGGCCTGTAAAGTTATTAAAACTTTATAATATGAAAATGTTATCTACTTGGACAGATGGCACAAGAGCATATAGTT
GGTATGTTAATTCCGCTAAAGAATACCCAGCTGCATATGATTTTTTATTCGGTGATAAAAAAGTATTTGCAGATGCGTTT
TCTCAGATATTCCATATTATTAATTTAATACTAATTATTTTAGGCGCGCTAAGGTTTTACAAAAAGCAAGAATTTGATTT
ATCTTTTTTAATTAATATTACTTTAATTGGTGTTTGGCTATTTCATCTATTATGGGAGGCTAATCAAAGGTATATTCTTT
TTGTTACACCTCTTATGATTATGTCGGCTATGTACGGTTTTAAATTCTTAGTAGAACTACTTTATACAAAAGACAAAATT
CCTGTTATTAAACAAACGACTAGAAAACCATTTTTAATAGTATGTTTTGTTGTGTTCATATTGAGTATAGTCACTATTAT
TTATGGAGTTAAGCCAATAGCTGTTGATAAACAAAACACCAACCATTATTTAGTAAACCAAAGCTATGCATATTTACAAG
TACCAGTTGATTCGAAAAATGCTGTTTCACAAACTTTTAAAGCAGATGAAAAATTTAATAATGTTGGTATTTATGTTTTA
AAAGCTCCAAATAAAAATAATAAATATAAAATTAGAATAACCAACAAAGATGAAAATAAAATAATTTCTGAGAAAGTGTA
TTCTTCTTCTTCCTTTAAATCAGGGAAATATTTCCCAATCGAAGTAAATGAAAAGCCAAAAAAGAATACAGAGTACAGTA
TACAAATTTTAGCAACAAACGGTAACAAAGGTGAAGCTTTAATGTTAGGTAAGTATCAACAAAAAGGGTTTGATCTATAT
AGTGATGGAGCAATGTATATAAATGGAAAAAATCAAGTTAATGAAGATATTGGGTTTGTCGTATCTGAAAATACTAAATC
GCCATTGATTCCATGGTATAGCTATTCACTTATTATAATTATTTTTGTTGGTGTTTTATCATTAAGTTTCTTAACTTTTA
AACAGAGAAATGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAGGTTAAGGCAAGACCTCGTTTTACTATTGAAGATAATTTATTTGAAGAAAAATATAAAGCTGAAAATTTAAAATA
AGTAGGGGAAAAAAGTGCAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAAATAAAAAGGATATACACTTAGCTGTTAAGCTAAATGTATATCCTTTTATTTTTTATCCTTCGAGTGAATTTCTG
CATAAAGCTGATCTACCAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 698; Mature: 698

Protein sequence:

>698_residues
MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRLNRRSDILVTAILIITLVSIQ
VYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLVYPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNI
TFFTLFYIIRKEVGIKYSNIYLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI
KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFPQSHWVMMGLKGPAGRYNSSE
FLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMKMLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAF
SQIFHIINLILIILGALRFYKKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI
PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKNAVSQTFKADEKFNNVGIYVL
KAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPIEVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLY
SDGAMYINGKNQVNEDIGFVVSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND

Sequences:

>Translated_698_residues
MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRLNRRSDILVTAILIITLVSIQ
VYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLVYPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNI
TFFTLFYIIRKEVGIKYSNIYLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI
KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFPQSHWVMMGLKGPAGRYNSSE
FLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMKMLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAF
SQIFHIINLILIILGALRFYKKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI
PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKNAVSQTFKADEKFNNVGIYVL
KAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPIEVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLY
SDGAMYINGKNQVNEDIGFVVSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND
>Mature_698_residues
MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRLNRRSDILVTAILIITLVSIQ
VYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLVYPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNI
TFFTLFYIIRKEVGIKYSNIYLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI
KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFPQSHWVMMGLKGPAGRYNSSE
FLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMKMLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAF
SQIFHIINLILIILGALRFYKKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI
PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKNAVSQTFKADEKFNNVGIYVL
KAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPIEVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLY
SDGAMYINGKNQVNEDIGFVVSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80884; Mature: 80884

Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRRSDILVTAILIITLVSIQVYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCEEEE
YPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNITFFTLFYIIRKEVGIKYSNI
ECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHH
YLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCC
KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
QSHWVMMGLKGPAGRYNSSEFLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMK
CCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCH
MLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAFSQIFHIINLILIILGALRFY
HEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKN
CHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCH
AVSQTFKADEKFNNVGIYVLKAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPI
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE
EVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLYSDGAMYINGKNQVNEDIGFV
ECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEECHHHCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCCCEE
VSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND
EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKNLGFVFYGVFIFIFGYLLVRSIINPLNVDYSNFFILLLFSITILFIMLAFFQLFSRL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRRSDILVTAILIITLVSIQVYLMFALQMDAFADSFGIKGQAVQMLQNGGMFTGDSYFLV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCEEEE
YPNNVLTTIIRYGLYNFGAGIGITNTYLLECGFVILCMNITFFTLFYIIRKEVGIKYSNI
ECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEHHH
YLLIILFCVPFYGYLSYFYSDTLVLPFAALILLFYYFYTKNNKWFYFIIIGVLFAIGYHI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCC
KPNLIIMLPAIIIHLCFIRNWRKTLLNSAIILIVFAGVNTLYNPLTERYGFERDNSLEFP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
QSHWVMMGLKGPAGRYNSSEFLYTKQFDTKEKKQEANKKIIKERITSYGPVKLLKLYNMK
CCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCH
MLSTWTDGTRAYSWYVNSAKEYPAAYDFLFGDKKVFADAFSQIFHIINLILIILGALRFY
HEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KKQEFDLSFLINITLIGVWLFHLLWEANQRYILFVTPLMIMSAMYGFKFLVELLYTKDKI
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PVIKQTTRKPFLIVCFVVFILSIVTIIYGVKPIAVDKQNTNHYLVNQSYAYLQVPVDSKN
CHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCH
AVSQTFKADEKFNNVGIYVLKAPNKNNKYKIRITNKDENKIISEKVYSSSSFKSGKYFPI
HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE
EVNEKPKKNTEYSIQILATNGNKGEALMLGKYQQKGFDLYSDGAMYINGKNQVNEDIGFV
ECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEECHHHCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCCCEE
VSENTKSPLIPWYSYSLIIIIFVGVLSLSFLTFKQRND
EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA