| Definition | Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008555 |
| Length | 2,814,130 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 116872037
GI number: 116872037
Start: 654582
End: 657272
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: lwe0617
Alternate gene names: 116872037
Gene position: 654582-657272 (Clockwise)
Preceding gene: 116872036
Following gene: 116872038
Centisome position: 23.26
GC content: 35.97
Gene sequence:
>2691_bases ATGCGGAAAGTATATGAAATTTTTATTTTAGACTGGCGCCGTCTCTTTAAAGCGCCTTTAGCATTATTATTAGTAATTGC ATTAATTATTTTGCCATCATTATATGCTTGGTTTAATATTGAAGCACTTTGGGACCCTTACTCGAATACTTCGGGAATCA AAGTGGCAGTTTCGATTGATGATGAAGGGGCTGAAGTAGACGTTCCTGGGAAAAAGCCTGAGAAAGTGAATGTCGGCAAT CAACTGAAGAAAACGCTAGAAAAAAATAAAAAACTTGGCTGGACATTTGTAAGTGAAGAGGAAGCAAAAAAAGGAGTGAA AAGCGGTAAATACTATGCCTCTATTCACATTCCAAAAGATTTTTCGGAAGACATGGTTTCTGTTGTAAATGATAATGTCA AAAAACCAACGATTGATTACTCTGTTAATGAAAAAATCAATGCCATCGCACCAAAAATGACGGAGAGTGGCGCAACGACG ATTGTAAATCAAATAAGCTCAGAGTTTGTTGGGACAGTAAGTAAATCAGTTTTAGAAGAGTTTAATAAAGCAGGAATTGA CCTTGAAAATGAATTACCGACAATCCGCCGCTTAAAAACGAAAGTATTCCAAGTACAAGATGCTTTACCAGAACTTAAAA AAATGGGTGGCGAGGCTGTGAAAATTGAAGCCAAACTCCCTGAACTAAAAGCTAAAGCAAACCAAGTAGTGGAACTAAAT GAAAAAATTCCAGAGTTAAATAAAGCAACAGAAAACGTCTTGTTAGTAGAACAACAACTACCAAAAATCGACCAACTTGG CCAAGATATTCTAGTTTTACAAAAGAAAATACCAGAAATCAAGCAAATTGCAGACTCAGTAAAAGAAGTGGACGAAAACT TTGGAACGATTAAGAAAACTGTTAATGATGCAGTAAATGAATCGGGTAAGGCGCTCGATGTGATTGATACGGCGATGACG GCGATACCAACTGTAGAAAAAATCGCCCAAAACGGCAGTGGCTATGTGGACAAAGTGTCCGATTTTACGGATGAAATTAA TAAATCATTTGATACGTTAGCGCCTGCTATTAAACAGAATTTAACACTAATGAAGCAAATGGCAGACAACATTTATCAAG TCACAGAAGCAATTAAAAATGGTTCTATAAACTCCGAACAAGCGATTGCGGAATTGAAGAAAATGGAACAAGATATTGAT TCTTTACAACAAATGATTACAAAACAAACCGCCACATTGGAAAGTTTAAATGAAACGTTGCCTAATAAGCCTTTTACTGA TTTAATCAAGAATTTAAAAGCCATTAATAGTCAGTTAAGTACACAAAAAGAAACAGTGACAAAAGTTCGCACAGCACTTG AAAACGGGGAAAAACCAGCGGAAGAATTACTCAATCAACTAAATGCACAAGCAAAAAATATTAGTGCAAAATTGGATCAA ATTTTAGCGAATTATGATTCGGAAATTGTCCCAGCAATCAAAACCGGTTTAAACCAAATTCAAGGGGATTTAAAAGATAG CCAACAATTATTAAAAACGTTGCAATCGAAAATCCCAGAAATTACGCAGGTATTAAAAGACTCAAAAGAAACACTTCAAA CTGGACAAACCTATTTAAAAGAGTTCCAACAGCGTTTGCCAGAAATCCAGAAAACACTGGATGAAGCCACTAAAGTAATT AATACCAAATTGGATACTATTATTGCTGGGATTAACGAAGCAGCAAGCTTTTACCAAAATGATTATCCAAATGTAAAAGC GAACATTAAAAAAGCGGCCAATTTTATCCGCGATGATTTGCCTGGACTTGAAAAAGAAATAAACCAAGCCTCCAATCTTA TTCAAGAAAAAATGCCAGAATTCGAAAAAGCGATTAAAATTGCAGCAAACCTTTCCCGAGAAGAACTGCCGGAATTTGAG AAAGCAATTAATAATGCCGCCAATAAAATTACTGATTTCGACAAGAATTATGATTTACAAAGTATTATTAAAATGCTCCG TAATGATGCCGATAAGGATAGTTCTTTTATTGCAAACCCAGTTAATTTAAAAGAAACAAGTTATTATCCGATTCCAAATT ACGGCTCGGCAAGCTCGCCATTTTACACGGCGCTTTGTCTATGGGTTGGCGCTCTCTTGCTTATTTCATTACTTCGGGTT GATGTAGAAGTACCAGCTGGTATTTTTAGTCATTACCATCGCTATTTTGGACGCTTGCTGACATTCTTATCTATTGGCTT GATGCAGGCGCTCATCGTGACACTTGGAAATATATTCTTACTTGGTGTTTCGATTGCAGAACCTTTGCTCCATGTTCTTT TTAGTATGTTTATTAGTGTTGTATTTATGACAATTGTATACACACTTGTATCCTTATTTAATAATGTCGGAAAAGGAATC GCGATTATTTTGCTAGTGCTACAAATTTCAGGAGCCGGCGGAAACTTTCCTATTCAAGTTTCGCCACCATTTTTCCAAGC AATTTATCCGTTTTTACCATTCACTTATGCTGTTAGTTTAATCAGGGAAAGTGTTGGGGGATTATATATGCCAACTGTTT GGCTTGATATGAGTGTACTTGCTGGATTTGCGATTTTGTTTATTGCATTAGGTCTTTTACTCAAAAAACCACTCGACAAA GTTGTACCGAAATTATCGGAAAAAGCGAAACGAAGCAAGCTGATTCATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGCAAAAGAGGTAATACAAAAATTGATGAATTTGTATATTATCCGTACATTTAGATAGTATTTCTAAAATGATTTGCTT AAAAAAAGGAGGTGCTTTTG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATAGTATATAATTATTAGCGAAGAGGGGTGAGCATTATCACAAATAAGTATAAAACCTTAGATAAAATGGTTTATAAT TTACTTCTTGAAAAAATTAA
Product: phage infection protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896
Protein sequence:
>896_residues MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSIDDEGAEVDVPGKKPEKVNVGN QLKKTLEKNKKLGWTFVSEEEAKKGVKSGKYYASIHIPKDFSEDMVSVVNDNVKKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATT IVNQISSEFVGTVSKSVLEEFNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGGEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIADSVKEVDENFGTIKKTVNDAVNESGKALDVIDTAMT AIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFTDEINKSFDTLAPAIKQNLTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSINSEQAIAELKKMEQDID SLQQMITKQTATLESLNETLPNKPFTDLIKNLKAINSQLSTQKETVTKVRTALENGEKPAEELLNQLNAQAKNISAKLDQ ILANYDSEIVPAIKTGLNQIQGDLKDSQQLLKTLQSKIPEITQVLKDSKETLQTGQTYLKEFQQRLPEIQKTLDEATKVI NTKLDTIIAGINEAASFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDLPGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAANLSREELPEFE KAINNAANKITDFDKNYDLQSIIKMLRNDADKDSSFIANPVNLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISVVFMTIVYTLVSLFNNVGKGI AIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSLIRESVGGLYMPTVWLDMSVLAGFAILFIALGLLLKKPLDK VVPKLSEKAKRSKLIH
Sequences:
>Translated_896_residues MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSIDDEGAEVDVPGKKPEKVNVGN QLKKTLEKNKKLGWTFVSEEEAKKGVKSGKYYASIHIPKDFSEDMVSVVNDNVKKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATT IVNQISSEFVGTVSKSVLEEFNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGGEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIADSVKEVDENFGTIKKTVNDAVNESGKALDVIDTAMT AIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFTDEINKSFDTLAPAIKQNLTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSINSEQAIAELKKMEQDID SLQQMITKQTATLESLNETLPNKPFTDLIKNLKAINSQLSTQKETVTKVRTALENGEKPAEELLNQLNAQAKNISAKLDQ ILANYDSEIVPAIKTGLNQIQGDLKDSQQLLKTLQSKIPEITQVLKDSKETLQTGQTYLKEFQQRLPEIQKTLDEATKVI NTKLDTIIAGINEAASFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDLPGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAANLSREELPEFE KAINNAANKITDFDKNYDLQSIIKMLRNDADKDSSFIANPVNLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISVVFMTIVYTLVSLFNNVGKGI AIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSLIRESVGGLYMPTVWLDMSVLAGFAILFIALGLLLKKPLDK VVPKLSEKAKRSKLIH >Mature_896_residues MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSIDDEGAEVDVPGKKPEKVNVGN QLKKTLEKNKKLGWTFVSEEEAKKGVKSGKYYASIHIPKDFSEDMVSVVNDNVKKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATT IVNQISSEFVGTVSKSVLEEFNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGGEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIADSVKEVDENFGTIKKTVNDAVNESGKALDVIDTAMT AIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFTDEINKSFDTLAPAIKQNLTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSINSEQAIAELKKMEQDID SLQQMITKQTATLESLNETLPNKPFTDLIKNLKAINSQLSTQKETVTKVRTALENGEKPAEELLNQLNAQAKNISAKLDQ ILANYDSEIVPAIKTGLNQIQGDLKDSQQLLKTLQSKIPEITQVLKDSKETLQTGQTYLKEFQQRLPEIQKTLDEATKVI NTKLDTIIAGINEAASFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDLPGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAANLSREELPEFE KAINNAANKITDFDKNYDLQSIIKMLRNDADKDSSFIANPVNLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISVVFMTIVYTLVSLFNNVGKGI AIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSLIRESVGGLYMPTVWLDMSVLAGFAILFIALGLLLKKPLDK VVPKLSEKAKRSKLIH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99646; Mature: 99646
Theoretical pI: Translated: 5.80; Mature: 5.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSID CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEC DEGAEVDVPGKKPEKVNVGNQLKKTLEKNKKLGWTFVSEEEAKKGVKSGKYYASIHIPKD CCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC FSEDMVSVVNDNVKKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATTIVNQISSEFVGTVSKSVLEE HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGGEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIADSVKEVDENFGTIKKT HHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNDAVNESGKALDVIDTAMTAIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFTDEINKSFDTLAPAIKQN HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSINSEQAIAELKKMEQDIDSLQQMITKQTATLESLNETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PNKPFTDLIKNLKAINSQLSTQKETVTKVRTALENGEKPAEELLNQLNAQAKNISAKLDQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILANYDSEIVPAIKTGLNQIQGDLKDSQQLLKTLQSKIPEITQVLKDSKETLQTGQTYLK HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH EFQQRLPEIQKTLDEATKVINTKLDTIIAGINEAASFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC PGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAANLSREELPEFEKAINNAANKITDFDKNYDLQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH SIIKMLRNDADKDSSFIANPVNLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISV HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFMTIVYTLVSLFNNVGKGIAIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSL HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRESVGGLYMPTVWLDMSVLAGFAILFIALGLLLKKPLDKVVPKLSEKAKRSKLIH HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MRKVYEIFILDWRRLFKAPLALLLVIALIILPSLYAWFNIEALWDPYSNTSGIKVAVSID CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEC DEGAEVDVPGKKPEKVNVGNQLKKTLEKNKKLGWTFVSEEEAKKGVKSGKYYASIHIPKD CCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCC FSEDMVSVVNDNVKKPTIDYSVNEKINAIAPKMTESGATTIVNQISSEFVGTVSKSVLEE HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FNKAGIDLENELPTIRRLKTKVFQVQDALPELKKMGGEAVKIEAKLPELKAKANQVVELN HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH EKIPELNKATENVLLVEQQLPKIDQLGQDILVLQKKIPEIKQIADSVKEVDENFGTIKKT HHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VNDAVNESGKALDVIDTAMTAIPTVEKIAQNGSGYVDKVSDFTDEINKSFDTLAPAIKQN HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTLMKQMADNIYQVTEAIKNGSINSEQAIAELKKMEQDIDSLQQMITKQTATLESLNETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PNKPFTDLIKNLKAINSQLSTQKETVTKVRTALENGEKPAEELLNQLNAQAKNISAKLDQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILANYDSEIVPAIKTGLNQIQGDLKDSQQLLKTLQSKIPEITQVLKDSKETLQTGQTYLK HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH EFQQRLPEIQKTLDEATKVINTKLDTIIAGINEAASFYQNDYPNVKANIKKAANFIRDDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC PGLEKEINQASNLIQEKMPEFEKAIKIAANLSREELPEFEKAINNAANKITDFDKNYDLQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH SIIKMLRNDADKDSSFIANPVNLKETSYYPIPNYGSASSPFYTALCLWVGALLLISLLRV HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVEVPAGIFSHYHRYFGRLLTFLSIGLMQALIVTLGNIFLLGVSIAEPLLHVLFSMFISV HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFMTIVYTLVSLFNNVGKGIAIILLVLQISGAGGNFPIQVSPPFFQAIYPFLPFTYAVSL HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRESVGGLYMPTVWLDMSVLAGFAILFIALGLLLKKPLDKVVPKLSEKAKRSKLIH HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]