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The map label for this gene is 116493123

Identifier: 116493123

GI number: 116493123

Start: 1366612

End: 1368468

Strand: Reverse

Name: 116493123

Synonym: PEPE_1378

Alternate gene names: NA

Gene position: 1368468-1366612 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116493127

Following gene: 116493121

Centisome position: 74.68

GC content: 34.84

Gene sequence:

>1857_bases
TTGGCGTTAATCGGATTGATCATTTTTATAATTGCTCAGCTAGGTTATGCTGGGTCAATTAGAATGGTAGGGGTTAATAA
ATACATGGCATGGATTACTTCAATGATAATCCAAACCCTTCTTCTATACATAATGGCGATGTTAAACTGGTTAAGGTTTG
GGCTTCGCGCGGTTGTTATTTTGGGCTGTATTTTATTCTTGGTACGTATGGTAATGGCAATCTTCAAGATTCAAAAAATA
CCATTTGAAGGTTTTCATTATTTTGATTTGTGGATGATTGTGATTGGACTTTCACTAGGAACGACTTTATATAGCAGTCC
TTTGCTTCACTATGATAATTATTCCCACTGGGCTTTAATTGTTAAATATTTAGTGTTACAAGGACACTTACCAATTGCTT
CAGATGCAATCATTTCGTTTACTTCATATCCTCCGGCAACGGCTTTATTTATCACTCAATTTGTAACTTGGGTTGGATTC
AGTAGTGGTGCAATGTTAGTAGGACAATTTTTACTAATTTGGGCGGGACTTTATGCTGTTTTTGCGGTATTAAGAGATTA
TACAAGGTCAACCAATGCTTTTATTTTATGTCTCACCATTTCACTCATTAATGTGTTCAACATTGCCATTCGGATGAACA
ATCTATTAGTTGATTTTATCCTTCCGGTAGTTGCAGCGGCTGGCATTGCCGGTGTCTATGTGTATCGACATCAACCATGG
TTGCAATGTGTTACAGCCTTTTTGTTCGGTTCAGAGTTGTTTTTAATTAAAAATTCTGGAACCATGTATGTGGTTATGAT
TGGTTTTTACTTATTATATTTGTTAATGAAGAACTCTAAAGAAATTAAGTGGTTTAAGCGCTTTGGAAAAAGTTTGGGTC
TAACAGCCCTTACGATGGTGGGGAGTTACCTATCATTTTTCTGGTGGAATCAGCATGTCCATGCCACTTTTAGCACCGTT
TCTAAGCATCAAATTAGTACATCTGCATATAAAAATCAATTAGCTAGTGAAAGTTCAAAAGTAATAATGAAGATTGGTAA
TAAGTTTTTACATCAAATTTTCAGTTTGGATTCACTATCAACTAGGGGTTTTTTACTGGTTAATTTAACGCTGATAACCG
CGTGGGTTGTTATTCGCTTGTATCTCAAGAAACCTAATAATTTACTCAAAGTCCTACTAGCTTTAGATGCTAGTTTTGTT
GCATACTATCTCAGTGTCTTTGCGATGTATATTGTATCAATGCCTTATTCAGAAGCAATTAATTTAGAGGGTTCTGAACG
TTATTTATCTAGTATGGTAATTTTAAACATGTTGTTAGCCACGATGGCACTCGTCGTAGCGATGGACCGAGCGATGTATG
AGCCTGATGTAAGTAAACGTGGAATACGAAGTTTCAAAAATATTATTACAAAAAATACTTACCAATTATCTGCCTTAGTT
TTAGCTTTATTTTCAACCATTCTGATGTTCTCAGAAATTAACGGGATTAAGTATCGGAGCACAATTGGAAAAGAAGAGTT
ACCGGTGGAACTTAATCATATTGCCAAACAAGATATGAAATACAATCATACTAAAGTATTGGTAGTTGATCCGCACACAG
CTGACGTTAATGACTACTATGCTGGATATGTTGGTAAATACTATTTCTTCTCTGATAAAGTAGATGGACGCGAAAACTTT
ATGTTGTCCAATTCAGACTTTAAAAAAGTTGTTCAAAGATACCAATATGTGGCATTACCGGAATGGCACCGAACTTTCAC
AACAATGTTGAGAAAAACATATCACGAAGATTATAAGGTAGGCTTATATAAAGTTACCTCAAAAGGTTTACAAAAAGTTA
ATCAAATTAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAAAGAATTTAGGACACGTTGTAGTTAAAGATGTAGAATAATCTAAGTGTCTTTATAAGAGATAAGTTAAATAGAATG
GAAATGGTGGGTGGATCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAACTTGATACGTAGCAATAATAACAACTCTAGGGAGTCTATTAAAATTACTATGTACCAAGTTTTTTAGTAACCACG
AGTTAAATCAACAATATTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 618; Mature: 617

Protein sequence:

>618_residues
MALIGLIIFIIAQLGYAGSIRMVGVNKYMAWITSMIIQTLLLYIMAMLNWLRFGLRAVVILGCILFLVRMVMAIFKIQKI
PFEGFHYFDLWMIVIGLSLGTTLYSSPLLHYDNYSHWALIVKYLVLQGHLPIASDAIISFTSYPPATALFITQFVTWVGF
SSGAMLVGQFLLIWAGLYAVFAVLRDYTRSTNAFILCLTISLINVFNIAIRMNNLLVDFILPVVAAAGIAGVYVYRHQPW
LQCVTAFLFGSELFLIKNSGTMYVVMIGFYLLYLLMKNSKEIKWFKRFGKSLGLTALTMVGSYLSFFWWNQHVHATFSTV
SKHQISTSAYKNQLASESSKVIMKIGNKFLHQIFSLDSLSTRGFLLVNLTLITAWVVIRLYLKKPNNLLKVLLALDASFV
AYYLSVFAMYIVSMPYSEAINLEGSERYLSSMVILNMLLATMALVVAMDRAMYEPDVSKRGIRSFKNIITKNTYQLSALV
LALFSTILMFSEINGIKYRSTIGKEELPVELNHIAKQDMKYNHTKVLVVDPHTADVNDYYAGYVGKYYFFSDKVDGRENF
MLSNSDFKKVVQRYQYVALPEWHRTFTTMLRKTYHEDYKVGLYKVTSKGLQKVNQIKN

Sequences:

>Translated_618_residues
MALIGLIIFIIAQLGYAGSIRMVGVNKYMAWITSMIIQTLLLYIMAMLNWLRFGLRAVVILGCILFLVRMVMAIFKIQKI
PFEGFHYFDLWMIVIGLSLGTTLYSSPLLHYDNYSHWALIVKYLVLQGHLPIASDAIISFTSYPPATALFITQFVTWVGF
SSGAMLVGQFLLIWAGLYAVFAVLRDYTRSTNAFILCLTISLINVFNIAIRMNNLLVDFILPVVAAAGIAGVYVYRHQPW
LQCVTAFLFGSELFLIKNSGTMYVVMIGFYLLYLLMKNSKEIKWFKRFGKSLGLTALTMVGSYLSFFWWNQHVHATFSTV
SKHQISTSAYKNQLASESSKVIMKIGNKFLHQIFSLDSLSTRGFLLVNLTLITAWVVIRLYLKKPNNLLKVLLALDASFV
AYYLSVFAMYIVSMPYSEAINLEGSERYLSSMVILNMLLATMALVVAMDRAMYEPDVSKRGIRSFKNIITKNTYQLSALV
LALFSTILMFSEINGIKYRSTIGKEELPVELNHIAKQDMKYNHTKVLVVDPHTADVNDYYAGYVGKYYFFSDKVDGRENF
MLSNSDFKKVVQRYQYVALPEWHRTFTTMLRKTYHEDYKVGLYKVTSKGLQKVNQIKN
>Mature_617_residues
ALIGLIIFIIAQLGYAGSIRMVGVNKYMAWITSMIIQTLLLYIMAMLNWLRFGLRAVVILGCILFLVRMVMAIFKIQKIP
FEGFHYFDLWMIVIGLSLGTTLYSSPLLHYDNYSHWALIVKYLVLQGHLPIASDAIISFTSYPPATALFITQFVTWVGFS
SGAMLVGQFLLIWAGLYAVFAVLRDYTRSTNAFILCLTISLINVFNIAIRMNNLLVDFILPVVAAAGIAGVYVYRHQPWL
QCVTAFLFGSELFLIKNSGTMYVVMIGFYLLYLLMKNSKEIKWFKRFGKSLGLTALTMVGSYLSFFWWNQHVHATFSTVS
KHQISTSAYKNQLASESSKVIMKIGNKFLHQIFSLDSLSTRGFLLVNLTLITAWVVIRLYLKKPNNLLKVLLALDASFVA
YYLSVFAMYIVSMPYSEAINLEGSERYLSSMVILNMLLATMALVVAMDRAMYEPDVSKRGIRSFKNIITKNTYQLSALVL
ALFSTILMFSEINGIKYRSTIGKEELPVELNHIAKQDMKYNHTKVLVVDPHTADVNDYYAGYVGKYYFFSDKVDGRENFM
LSNSDFKKVVQRYQYVALPEWHRTFTTMLRKTYHEDYKVGLYKVTSKGLQKVNQIKN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70587; Mature: 70456

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MALIGLIIFIIAQLGYAGSIRMVGVNKYMAWITSMIIQTLLLYIMAMLNWLRFGLRAVVI
CHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGCILFLVRMVMAIFKIQKIPFEGFHYFDLWMIVIGLSLGTTLYSSPLLHYDNYSHWALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHH
VKYLVLQGHLPIASDAIISFTSYPPATALFITQFVTWVGFSSGAMLVGQFLLIWAGLYAV
HHHHHHHCCCCCCCCHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAVLRDYTRSTNAFILCLTISLINVFNIAIRMNNLLVDFILPVVAAAGIAGVYVYRHQPW
HHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHH
LQCVTAFLFGSELFLIKNSGTMYVVMIGFYLLYLLMKNSKEIKWFKRFGKSLGLTALTMV
HHHHHHHHHCCEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHCCHHHHHHH
GSYLSFFWWNQHVHATFSTVSKHQISTSAYKNQLASESSKVIMKIGNKFLHQIFSLDSLS
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TRGFLLVNLTLITAWVVIRLYLKKPNNLLKVLLALDASFVAYYLSVFAMYIVSMPYSEAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC
NLEGSERYLSSMVILNMLLATMALVVAMDRAMYEPDVSKRGIRSFKNIITKNTYQLSALV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LALFSTILMFSEINGIKYRSTIGKEELPVELNHIAKQDMKYNHTKVLVVDPHTADVNDYY
HHHHHHHHHHHHCCCCEEHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHH
AGYVGKYYFFSDKVDGRENFMLSNSDFKKVVQRYQYVALPEWHRTFTTMLRKTYHEDYKV
HHHHEEEEEECCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
GLYKVTSKGLQKVNQIKN
HHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
ALIGLIIFIIAQLGYAGSIRMVGVNKYMAWITSMIIQTLLLYIMAMLNWLRFGLRAVVI
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGCILFLVRMVMAIFKIQKIPFEGFHYFDLWMIVIGLSLGTTLYSSPLLHYDNYSHWALI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHH
VKYLVLQGHLPIASDAIISFTSYPPATALFITQFVTWVGFSSGAMLVGQFLLIWAGLYAV
HHHHHHHCCCCCCCCHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FAVLRDYTRSTNAFILCLTISLINVFNIAIRMNNLLVDFILPVVAAAGIAGVYVYRHQPW
HHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCHH
LQCVTAFLFGSELFLIKNSGTMYVVMIGFYLLYLLMKNSKEIKWFKRFGKSLGLTALTMV
HHHHHHHHHCCEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCHHCCHHHHHHH
GSYLSFFWWNQHVHATFSTVSKHQISTSAYKNQLASESSKVIMKIGNKFLHQIFSLDSLS
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
TRGFLLVNLTLITAWVVIRLYLKKPNNLLKVLLALDASFVAYYLSVFAMYIVSMPYSEAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC
NLEGSERYLSSMVILNMLLATMALVVAMDRAMYEPDVSKRGIRSFKNIITKNTYQLSALV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
LALFSTILMFSEINGIKYRSTIGKEELPVELNHIAKQDMKYNHTKVLVVDPHTADVNDYY
HHHHHHHHHHHHCCCCEEHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHH
AGYVGKYYFFSDKVDGRENFMLSNSDFKKVVQRYQYVALPEWHRTFTTMLRKTYHEDYKV
HHHHEEEEEECCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
GLYKVTSKGLQKVNQIKN
HHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA