Definition Pediococcus pentosaceus ATCC 25745, complete genome.
Accession NC_008525
Length 1,832,387

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The map label for this gene is 116492565

Identifier: 116492565

GI number: 116492565

Start: 805855

End: 808875

Strand: Direct

Name: 116492565

Synonym: PEPE_0797

Alternate gene names: NA

Gene position: 805855-808875 (Clockwise)

Preceding gene: 116492564

Following gene: 116492566

Centisome position: 43.98

GC content: 38.89

Gene sequence:

>3021_bases
ATGGGCGAAACGTATAGTGTTACAGCAATGTTAAGCGCAGTTGATAAAAATTTTAGTTCGGTTATGCAAAAAGCAGCAAG
CCAGACTGCTTCGTTTTCCGAAAAAGTCAAAGCAACAACTAGCGGTGTGGGTAAAAGCATGCTAGCTATAGGTGGTGCTA
CCACAGCTCTAGGAGTTAAATCTATTAAATCTTTTGGTAATTTCCAAGCTTCACTAAACAAAGCAGCAGTTACCGCTGGT
GGAACTTCTAAGGATATTTCTGGATTGGCAGATGTTGCTAACAAAATGGGTGCCGATTTGCCTTTGAGCGCTCAAGATTC
AGCTGATGCCATGATTGAAATGGCGCAAGCTGGTGCAGACGTAGGCCAAATCAAACAACAATTTCCAGCTATTGCACAAG
CTTCAACAGCAGCAGGATCCGATTTAATCCAAACTGCCGGTGTTGTTCAAAACGCTATGAACATTTGGGGTGATAGTCTT
AAGTCTCCTAATCAAGCTGCAGCAGCATTAGTTACTACGGCAAATGCAAGTAATGCTTCAGTGGAAGATATGCAACAAGC
TTTAGCAACTATTGGTGGTACTGCGAAGGCGTCGGGAATGTCACTACAAGAAACTTCGACAGCAATAGGGTTACTAACCA
ACCGTGGGTTTAGTGCTGCGCAATCTTCGCAGGATTTAAATCACGCTATTTTACAAATGCAAGCCCCTAGCAAAGTAGCA
CAAAAGGCAATGCATAGTTTGGGTATTAGTTATACAGATGCTCAAGGTAATATGAAATCATTCCCATCAATACTTCAAGA
AATTAGTCAATCAATGGATGGTATGACTTCAGCTGAAAAGCAAAAGAATTTGAAAGCTTTATTTGGTACTGCTGGTATGC
AAGCGATAGGTCCATTGCTTGATTCTATTAACGATAAATCTGGAAGTACTCAAAAATCGTGGGATGGAATGTTTAATTCT
ATTCAAAAGAGTTCCTCAATTTCATCAGCTGCTGCTAAAACTTTAAGTACTCAAGCTTCAGAAATGCAAAAAAATGTTGG
ATCGAAAGTGGAACAAGTTGGTGGTAATTGGGAAGCTCTTCGCAACAAAGCAATGGATAGTAAAAATTCTATTACTGGTG
GAATGCTAGATATGATTAATAAGACTATAACTTGGGCTGAAAATTCCAATAATGGGATAGCAAAGGTTATACGTGGTTTT
ATTGGATTATCTCCAGTTTTAGGACCAGCCATTGCAATTTTTGGTGGATTATTAATTGTTACAGCTAAAGTAGGTTCAGC
AGTTGGCACCCTTGCCAAAGGATTCTTAGCGGTTGGTAAAGGTGTTGTGGGATTAGTTAGCAAACTAATTGGTGTTGCTA
CTGGTAATACTGCCGTAGGAGCAACCTCAGCTGGAGCAGCGACTGGTGAGAAAGCTGTTGGTAAAAGTGCCGAAAAAAGT
GCCGGACAATTAATTGCCATGGGATTAGCCGTACTTGAAATAGGAGCTGGAATTGCCTTGGTACTTGGTGGCTTAGCATT
ATTAGTATTAAGTATCACCCAACTTGCTAAACAGGGGATGAACGGTGTAATTGCTATGGCGACATTTGGAGCTACAGTTG
CTATATTAGCCGGTGTATTTGCATTGTTAGGGCCAGTTTTAACAGCTAGTGCAGTCGGGATGCTTGCTTTTGGTGTCGCT
ATTATTGCCGCCGGGGCAGGGGTTGCTTTATTTGGTACCGGTGTCCTAGCTATGGGAGCCGGATTAGCCTTAGCTGGTCA
AGGAGTAACGGTTTTAGTTAACGCTTTTATTTTGCTAGGCAATAACATCGGGTTAATTATCCCGATTATGTCTTCAATTG
GAGCTGGATTCAGCGCTCTTTTATCAGGAATATTGAATGCAGTGATTACAAATATACCTATAATTGGACAAATGTTTATT
GCATTAGGTCAAACAATTTTAAATGTGATTAATACGTTATCACCTCAGATTATTCAAACAGTGATGAATTTATTACTGTT
ATTAGTAAATACGATTGTGACGTATACACCAATTTTTACCGCTAAAATAGCGCAATTAATCATTTCAATTTTAAATACTA
TTACTACTTATTTACCACAGATAATTTTAGCCGGAACTAACTTAATAGTGGCTCTGCTGAATGGAATTGCTCAAGCAATG
CCAAGAATTATTACAGCTGCAGTAAATGTGATTGTTGCGTTTATTAATGGTATTGCTAATAATCTTGGAAGAATTATAAA
TGCCGGCATTAACTTACTCGCTAAATTCATCATGGGAATTGTTAATGCAATTCCTCGCCTTGCTAGCATTGCTGTACAAG
CAGTGATGAAATTTGTATATGGTGTTGGTAATGCATTAGGCCAAGTGTTAGGGTCTGGGCAAAAACTCATCAATATGTTT
GTCAAAGGTATTATGGATGGATTTGGTAAATCACAAAGTTCAGGTAAAGAAAATGCTAACAAGGTTGATAGCGGGATCAG
AAGTGTGTCGTTATTAGATGTTGGTAAATTTTTAATTCAAGGATTTATCAATGGAATGGGCTCTATGGGTGGCGCTCTAT
GGGATGCAGCAGTTGGAATTGCTAATAAAGCAAAAAATGCTATTAAAAATGCATTAGGTATACACTCCCCATCAAGAGTT
ATGAAAAATGAAGTTGGTAAATGGATTCCAGCAGGTATTGCTGTTGGTATGAATAAAAATATCAGTTGGATTACATCAGC
TGCTAAGAACATGGTTAGTGCTGCAACTATTTCAATTCCTTCTCCAGAATTTGAAGATTTTAGGAAAGGATTCAATCGTA
TTCAATCACTTTCGTCATCCGCTTTTAGTGGAAGTGTAAATGGATCAATGACATTGAACGCTTCAACCATGGATCAGCAA
AATAACGCCTTACTACGCCGTATTGCTGATAAAAATACTAATCTTTACATGGATAGCGATACATTGGTTGGCACTACATC
TGATAAATTCAACGGACAATTAGGAGCAACTTCCAATAACAACGAAAGGTGGAGCTGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAGGATTACCAGTTAAGGAAAAGAAAGCAGATATTAACGAATTAACAGCTAGTCGTTGGGATGAATGGAAAAAAATACA
AAAGGGAAGGAGGAAGAGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCAGTACGGTTTTAGGGATTTACAGCCAACTAATAAAATTGAATATGAAGATATTCCCACCGAGGGCTTTGTTTTTGGG
GGATTTGACAGTCGTAAAGT

Product: minor tail protein gp26-like

Products: NA

Alternate protein names: Phage Protein; Minor Tail -Like; Tail Tape Measure Protein; Phage-Related Tail Protein; Prophage Pi3 Protein; Phage Tape Measure Protein; Phage Tail Like Protein; Truncated PhiSLT; Bacteriophage Minor Tail Subunit; Phage Tail Tape Measure Protein Family; Tail Length Tape Measure Protein; Prophage LambdaSa1 PblA Protein InteRNAl Deletion; Bacteriophage-Related Protein; Phage Related Protein; Phage Tail Tape Measure Protein Family Core Region; TMP Repeat Family; Phage Tail Length Tape-Measure Protein; Tape Measure Protein Tmp; Tape Measure Protein; Minor Tail Protein Gp; Phage Protein Tail Length Tape Measure Protein; Phage-Related Protein Gp; Tail Protein; Phage-Related Minor Tail Protein; Mu-Like Phage Minor Tail Protein; Phage-Like Protein; Phage Tale Measure Protein; Phage Tail Tape Mesure Protein; Phage Minor Tail Protein; Phage Tail Tape Measure Protein TMP; TMP Repeat Protein

Number of amino acids: Translated: 1006; Mature: 1005

Protein sequence:

>1006_residues
MGETYSVTAMLSAVDKNFSSVMQKAASQTASFSEKVKATTSGVGKSMLAIGGATTALGVKSIKSFGNFQASLNKAAVTAG
GTSKDISGLADVANKMGADLPLSAQDSADAMIEMAQAGADVGQIKQQFPAIAQASTAAGSDLIQTAGVVQNAMNIWGDSL
KSPNQAAAALVTTANASNASVEDMQQALATIGGTAKASGMSLQETSTAIGLLTNRGFSAAQSSQDLNHAILQMQAPSKVA
QKAMHSLGISYTDAQGNMKSFPSILQEISQSMDGMTSAEKQKNLKALFGTAGMQAIGPLLDSINDKSGSTQKSWDGMFNS
IQKSSSISSAAAKTLSTQASEMQKNVGSKVEQVGGNWEALRNKAMDSKNSITGGMLDMINKTITWAENSNNGIAKVIRGF
IGLSPVLGPAIAIFGGLLIVTAKVGSAVGTLAKGFLAVGKGVVGLVSKLIGVATGNTAVGATSAGAATGEKAVGKSAEKS
AGQLIAMGLAVLEIGAGIALVLGGLALLVLSITQLAKQGMNGVIAMATFGATVAILAGVFALLGPVLTASAVGMLAFGVA
IIAAGAGVALFGTGVLAMGAGLALAGQGVTVLVNAFILLGNNIGLIIPIMSSIGAGFSALLSGILNAVITNIPIIGQMFI
ALGQTILNVINTLSPQIIQTVMNLLLLLVNTIVTYTPIFTAKIAQLIISILNTITTYLPQIILAGTNLIVALLNGIAQAM
PRIITAAVNVIVAFINGIANNLGRIINAGINLLAKFIMGIVNAIPRLASIAVQAVMKFVYGVGNALGQVLGSGQKLINMF
VKGIMDGFGKSQSSGKENANKVDSGIRSVSLLDVGKFLIQGFINGMGSMGGALWDAAVGIANKAKNAIKNALGIHSPSRV
MKNEVGKWIPAGIAVGMNKNISWITSAAKNMVSAATISIPSPEFEDFRKGFNRIQSLSSSAFSGSVNGSMTLNASTMDQQ
NNALLRRIADKNTNLYMDSDTLVGTTSDKFNGQLGATSNNNERWSW

Sequences:

>Translated_1006_residues
MGETYSVTAMLSAVDKNFSSVMQKAASQTASFSEKVKATTSGVGKSMLAIGGATTALGVKSIKSFGNFQASLNKAAVTAG
GTSKDISGLADVANKMGADLPLSAQDSADAMIEMAQAGADVGQIKQQFPAIAQASTAAGSDLIQTAGVVQNAMNIWGDSL
KSPNQAAAALVTTANASNASVEDMQQALATIGGTAKASGMSLQETSTAIGLLTNRGFSAAQSSQDLNHAILQMQAPSKVA
QKAMHSLGISYTDAQGNMKSFPSILQEISQSMDGMTSAEKQKNLKALFGTAGMQAIGPLLDSINDKSGSTQKSWDGMFNS
IQKSSSISSAAAKTLSTQASEMQKNVGSKVEQVGGNWEALRNKAMDSKNSITGGMLDMINKTITWAENSNNGIAKVIRGF
IGLSPVLGPAIAIFGGLLIVTAKVGSAVGTLAKGFLAVGKGVVGLVSKLIGVATGNTAVGATSAGAATGEKAVGKSAEKS
AGQLIAMGLAVLEIGAGIALVLGGLALLVLSITQLAKQGMNGVIAMATFGATVAILAGVFALLGPVLTASAVGMLAFGVA
IIAAGAGVALFGTGVLAMGAGLALAGQGVTVLVNAFILLGNNIGLIIPIMSSIGAGFSALLSGILNAVITNIPIIGQMFI
ALGQTILNVINTLSPQIIQTVMNLLLLLVNTIVTYTPIFTAKIAQLIISILNTITTYLPQIILAGTNLIVALLNGIAQAM
PRIITAAVNVIVAFINGIANNLGRIINAGINLLAKFIMGIVNAIPRLASIAVQAVMKFVYGVGNALGQVLGSGQKLINMF
VKGIMDGFGKSQSSGKENANKVDSGIRSVSLLDVGKFLIQGFINGMGSMGGALWDAAVGIANKAKNAIKNALGIHSPSRV
MKNEVGKWIPAGIAVGMNKNISWITSAAKNMVSAATISIPSPEFEDFRKGFNRIQSLSSSAFSGSVNGSMTLNASTMDQQ
NNALLRRIADKNTNLYMDSDTLVGTTSDKFNGQLGATSNNNERWSW
>Mature_1005_residues
GETYSVTAMLSAVDKNFSSVMQKAASQTASFSEKVKATTSGVGKSMLAIGGATTALGVKSIKSFGNFQASLNKAAVTAGG
TSKDISGLADVANKMGADLPLSAQDSADAMIEMAQAGADVGQIKQQFPAIAQASTAAGSDLIQTAGVVQNAMNIWGDSLK
SPNQAAAALVTTANASNASVEDMQQALATIGGTAKASGMSLQETSTAIGLLTNRGFSAAQSSQDLNHAILQMQAPSKVAQ
KAMHSLGISYTDAQGNMKSFPSILQEISQSMDGMTSAEKQKNLKALFGTAGMQAIGPLLDSINDKSGSTQKSWDGMFNSI
QKSSSISSAAAKTLSTQASEMQKNVGSKVEQVGGNWEALRNKAMDSKNSITGGMLDMINKTITWAENSNNGIAKVIRGFI
GLSPVLGPAIAIFGGLLIVTAKVGSAVGTLAKGFLAVGKGVVGLVSKLIGVATGNTAVGATSAGAATGEKAVGKSAEKSA
GQLIAMGLAVLEIGAGIALVLGGLALLVLSITQLAKQGMNGVIAMATFGATVAILAGVFALLGPVLTASAVGMLAFGVAI
IAAGAGVALFGTGVLAMGAGLALAGQGVTVLVNAFILLGNNIGLIIPIMSSIGAGFSALLSGILNAVITNIPIIGQMFIA
LGQTILNVINTLSPQIIQTVMNLLLLLVNTIVTYTPIFTAKIAQLIISILNTITTYLPQIILAGTNLIVALLNGIAQAMP
RIITAAVNVIVAFINGIANNLGRIINAGINLLAKFIMGIVNAIPRLASIAVQAVMKFVYGVGNALGQVLGSGQKLINMFV
KGIMDGFGKSQSSGKENANKVDSGIRSVSLLDVGKFLIQGFINGMGSMGGALWDAAVGIANKAKNAIKNALGIHSPSRVM
KNEVGKWIPAGIAVGMNKNISWITSAAKNMVSAATISIPSPEFEDFRKGFNRIQSLSSSAFSGSVNGSMTLNASTMDQQN
NALLRRIADKNTNLYMDSDTLVGTTSDKFNGQLGATSNNNERWSW

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 102595; Mature: 102464

Theoretical pI: Translated: 10.43; Mature: 10.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGETYSVTAMLSAVDKNFSSVMQKAASQTASFSEKVKATTSGVGKSMLAIGGATTALGVK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHH
SIKSFGNFQASLNKAAVTAGGTSKDISGLADVANKMGADLPLSAQDSADAMIEMAQAGAD
HHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
VGQIKQQFPAIAQASTAAGSDLIQTAGVVQNAMNIWGDSLKSPNQAAAALVTTANASNAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCCCCCC
VEDMQQALATIGGTAKASGMSLQETSTAIGLLTNRGFSAAQSSQDLNHAILQMQAPSKVA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
QKAMHSLGISYTDAQGNMKSFPSILQEISQSMDGMTSAEKQKNLKALFGTAGMQAIGPLL
HHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
DSINDKSGSTQKSWDGMFNSIQKSSSISSAAAKTLSTQASEMQKNVGSKVEQVGGNWEAL
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RNKAMDSKNSITGGMLDMINKTITWAENSNNGIAKVIRGFIGLSPVLGPAIAIFGGLLIV
HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
TAKVGSAVGTLAKGFLAVGKGVVGLVSKLIGVATGNTAVGATSAGAATGEKAVGKSAEKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHH
AGQLIAMGLAVLEIGAGIALVLGGLALLVLSITQLAKQGMNGVIAMATFGATVAILAGVF
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHH
ALLGPVLTASAVGMLAFGVAIIAAGAGVALFGTGVLAMGAGLALAGQGVTVLVNAFILLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHC
NNIGLIIPIMSSIGAGFSALLSGILNAVITNIPIIGQMFIALGQTILNVINTLSPQIIQT
CCCCEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
VMNLLLLLVNTIVTYTPIFTAKIAQLIISILNTITTYLPQIILAGTNLIVALLNGIAQAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PRIITAAVNVIVAFINGIANNLGRIINAGINLLAKFIMGIVNAIPRLASIAVQAVMKFVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVGNALGQVLGSGQKLINMFVKGIMDGFGKSQSSGKENANKVDSGIRSVSLLDVGKFLIQ
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFINGMGSMGGALWDAAVGIANKAKNAIKNALGIHSPSRVMKNEVGKWIPAGIAVGMNKN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCC
ISWITSAAKNMVSAATISIPSPEFEDFRKGFNRIQSLSSSAFSGSVNGSMTLNASTMDQQ
HHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHCHH
NNALLRRIADKNTNLYMDSDTLVGTTSDKFNGQLGATSNNNERWSW
HHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GETYSVTAMLSAVDKNFSSVMQKAASQTASFSEKVKATTSGVGKSMLAIGGATTALGVK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHH
SIKSFGNFQASLNKAAVTAGGTSKDISGLADVANKMGADLPLSAQDSADAMIEMAQAGAD
HHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
VGQIKQQFPAIAQASTAAGSDLIQTAGVVQNAMNIWGDSLKSPNQAAAALVTTANASNAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCCCCCC
VEDMQQALATIGGTAKASGMSLQETSTAIGLLTNRGFSAAQSSQDLNHAILQMQAPSKVA
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
QKAMHSLGISYTDAQGNMKSFPSILQEISQSMDGMTSAEKQKNLKALFGTAGMQAIGPLL
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DSINDKSGSTQKSWDGMFNSIQKSSSISSAAAKTLSTQASEMQKNVGSKVEQVGGNWEAL
HHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RNKAMDSKNSITGGMLDMINKTITWAENSNNGIAKVIRGFIGLSPVLGPAIAIFGGLLIV
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CCCCEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
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HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCC
ISWITSAAKNMVSAATISIPSPEFEDFRKGFNRIQSLSSSAFSGSVNGSMTLNASTMDQQ
HHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHCHH
NNALLRRIADKNTNLYMDSDTLVGTTSDKFNGQLGATSNNNERWSW
HHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA