| Definition | Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008508 |
| Length | 3,614,446 |
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The map label for this gene is 116329537
Identifier: 116329537
GI number: 116329537
Start: 3589566
End: 3592742
Strand: Direct
Name: 116329537
Synonym: LBL_3014
Alternate gene names: NA
Gene position: 3589566-3592742 (Clockwise)
Preceding gene: 116329536
Following gene: 116329541
Centisome position: 99.31
GC content: 35.91
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1058; Mature: 1057
Protein sequence:
>1058_residues MSESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFGYVISTFLYHPFAAYHRWITV GFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFSIGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSY MFINFLAIPIWRMIHLRGKTRWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVE KTSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVFKWNNVENSFDKERYDPKVHP DQEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHENFGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVIT ASNKLDNIFVEDFCTKGKNFLENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDY NFHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRASLFSPLKDLLSGVEAVNGGNL EVQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYLAAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLN YNANKSTRISTQFLLRQKKQFEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSI LTRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEHPFTVLYRGERAVFLESSLTL RKIGLESEYAFQVFTTTLREGDVLIVGSDGKDDLNLTPNKDVRSINEDETLFLKIVEAGKGDIEQIEELICKKGEIIDDL SLLRIEYGVPRLNPEKNCLGTESKGISDWNISYSHARQLYRNGNVKEAIDELMDLYSKTPEDSKVIKLLGLLSFKDKDYV TAVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDLYRLQREYVRAKEVAIKILDL DPQNENAKKILKEVENKI
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 122180; Mature: 122049
Theoretical pI: Translated: 5.95; Mature: 5.95
Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFG CCCCEEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YVISTFLYHPFAAYHRWITVGFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSYMFINFLAIPIWRMIHLRGKT HHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC RWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVE HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC KTSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE KWNNVENSFDKERYDPKVHPDQEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHEN EECCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC FGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVITASNKLDNIFVEDFCTKGKNF CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHH LENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NFHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRAS CEEEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFSPLKDLLSGVEAVNGGNLEVQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHH AAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLNYNANKSTRISTQFLLRQKKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH FEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSI HHCCCCCCCCCCCEEEECCEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHH LTRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEH HHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCC PFTVLYRGERAVFLESSLTLRKIGLESEYAFQVFTTTLREGDVLIVGSDGKDDLNLTPNK CEEEEEECCEEEEEECCCEEEHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCC DVRSINEDETLFLKIVEAGKGDIEQIEELICKKGEIIDDLSLLRIEYGVPRLNPEKNCLG HHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCCCCCCCCC TESKGISDWNISYSHARQLYRNGNVKEAIDELMDLYSKTPEDSKVIKLLGLLSFKDKDYV CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH TAVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHCCHHHH YRLQREYVRAKEVAIKILDLDPQNENAKKILKEVENKI HHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFG CCCEEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YVISTFLYHPFAAYHRWITVGFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSYMFINFLAIPIWRMIHLRGKT HHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC RWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVE HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC KTSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE KWNNVENSFDKERYDPKVHPDQEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHEN EECCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC FGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVITASNKLDNIFVEDFCTKGKNF CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHH LENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NFHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRAS CEEEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFSPLKDLLSGVEAVNGGNLEVQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHH AAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLNYNANKSTRISTQFLLRQKKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH FEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSI HHCCCCCCCCCCCEEEECCEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHH LTRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEH HHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCC PFTVLYRGERAVFLESSLTLRKIGLESEYAFQVFTTTLREGDVLIVGSDGKDDLNLTPNK CEEEEEECCEEEEEECCCEEEHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCC DVRSINEDETLFLKIVEAGKGDIEQIEELICKKGEIIDDLSLLRIEYGVPRLNPEKNCLG HHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCCCCCCCCC TESKGISDWNISYSHARQLYRNGNVKEAIDELMDLYSKTPEDSKVIKLLGLLSFKDKDYV CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH TAVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDL HHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHCCHHHH YRLQREYVRAKEVAIKILDLDPQNENAKKILKEVENKI HHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA