Definition Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence.
Accession NC_008508
Length 3,614,446

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The map label for this gene is 116329537

Identifier: 116329537

GI number: 116329537

Start: 3589566

End: 3592742

Strand: Direct

Name: 116329537

Synonym: LBL_3014

Alternate gene names: NA

Gene position: 3589566-3592742 (Clockwise)

Preceding gene: 116329536

Following gene: 116329541

Centisome position: 99.31

GC content: 35.91

Gene sequence:

>3177_bases
ATGAGCGAAAGTGTATTCGTCTCAAACAACGTGTTTTTAAATTATTATTCTTTTGGGAGTTTGTTACTGTTCTTAACTTC
CATGCTCATTTCCGGTGTATTTCTTTTTATTGATCAAAAAGTATCGAGTACGAAACACTTGGCAATTGGGACTTTTTTTC
TCGGAATATTCCAATTTGGTTATGTTATCTCTACGTTTCTTTATCATCCTTTCGCGGCATATCATCGCTGGATTACGGTA
GGTTTCATTCTTCCCGCAATTTTGCACATCGGACAGTTTATCGCACGTTATCCCGAAAACGATTTTCCGAAGTTCAATCG
AATAACTATGATTATGTTGTGGTCGATTGCCTTGTTTTCAATCGGTTATTTCTGTTTTTCCACTTGGAACGCTTCCGTGA
AATATTATTTCACGGCGCATCGTTGGGATTTTAACGCGGAAGACGTAAATAGTAAAATTGCGATCATCGTATTTAGTTAC
ATGTTTATTAATTTCCTTGCAATTCCGATTTGGAGAATGATCCATCTTCGCGGAAAAACGCGATGGGTCGTCTTCACATT
TATGATGTCTTTTTTGATAGGGGGAACGGCTCTGGTAATTGCGAATCTTTTGGGTAATGACGGCTATCTAGAGAGATCGA
TTTATTTTACTTCGATTGTTTTTTTGTTTATGATAGCATTCTTTATTATTCTCATTCTATATCTAAACTTTTCGGTCGAA
AAAACCTCTTTCATGCTTGAGATCGTTGGGATTACATTCGTTACCGTCCTGATCGTCATGCAAATTTTAATTTATATTTC
TAACGAGGATAAAGAGTTCGAATATGATACTCTGAGTCGGATTCGTGTCGAAAAAGCGTTGGAAGGTGAAAGTGTTAAAG
GAGGGATTTCTTACGTATTCAAATGGAATAATGTCGAAAATTCTTTTGATAAAGAAAGGTACGATCCTAAAGTCCATCCG
GATCAAGAACAAATTGAAATTGATTTTAAGAATACGTTATTGTACGAGGAAATGTTTAATCTTTCTGAAAATGGTTTTAG
AGAATCTCTTCTAGAACTTATGGATCATTCCCACGAAAATTTCGGGGGATATAAATATTTTATCGTAAATTTCTTAGCCG
AACATCCAAACCTGGAAGATAAGAATCTCAAACTTGAGTTGAGTAAAGAATTATCCAGGTTGAACCTTCATGTAATTACG
GCCTCAAATAAACTCGATAATATCTTTGTGGAAGATTTTTGTACGAAAGGAAAAAATTTTTTAGAAAATTATAAAATACT
AAAAATGTTTCAAATTTTTTTGGAATATCATTGGAGCTTTTGCAAATCGGATGGTGAATATATAAGCCCGACCGCATTTA
AAGAAAAAATTCTAAATTATTTCCGCCCTTTCGTTCCTTCTCTTACGAGATATTATCGTGTAAAAAGCGTGGGAGATTAT
AACTTTCACTATATAGGATTTATTAAGTATGATCGTGAAAGGAATGATATAAGTGAAGTAGGATTTTCTTATAGAGCCTA
TCGCGAATTTGTACATCCGACTGCATTAAAACAAATCATTGTTCTCAGCGCGGTGATCGTTACGATTGTTTTTCTATTTC
CTTTTTTCTTTCGAGCAAGTCTTTTTTCTCCGTTAAAGGATCTATTGAGTGGGGTTGAAGCAGTGAATGGTGGAAATTTG
GAAGTGCAAGTTCCGATCCGAACCAAAGACGAAATCGGATTTCTGGCAAGTTCGTTTAACAATATGGTTTTTTTGATTTG
CAATGCAAGAAAAGAACTCCGGGATTACGCGAATTATCTTGCTGCAAAGGTGCGCTTTAGAACAGAAGAATTATCCGAGA
AGATCGAGGAACTGCAAAATCTCAAAATTCAACAAGACGGGGACTATTTTTTAACTTCTCTTCTTGCAAAACCTTTGAAT
TACAACGCGAACAAATCCACTCGGATTTCCACTCAATTTTTACTCAGGCAAAAAAAGCAGTTCGAATTTAAGGGGAAACA
AGCTGATTTGGGAGGAGACATTTGTATTACCGGAAATCTGCGTTTAGGAACTTCTTCTGATTATAAACGATATGTCTTTG
CAATGAACGGTGATGCGATGGGTAAATCTATGCAGGGTGCAGGGGGTGCTCTAGTTATAGGAGTTATAGTCAATTCGATT
CTGACCCGTTCCGCCGCAGATGATCGGATTCTGGATATTTCTCCGGAACAATGGCTTACGGAAATGTATGAGGAATTAAA
CTCTGTATTCAAATCTTTTGATGGAAGTATGGTAGTTTCAGCTTCTTTTTTTCTAATCGAAGAAAATTCCGGTAAAACGT
ATTATTTTAATGCGGAACATCCTTTTACAGTTTTATATAGAGGAGAAAGAGCTGTCTTTTTGGAGTCTTCTTTAACACTT
CGTAAGATCGGTTTAGAATCGGAATATGCCTTTCAAGTTTTTACGACGACTTTAAGAGAAGGAGATGTTCTTATCGTTGG
TTCAGACGGTAAGGATGATCTGAATCTTACTCCCAATAAAGATGTAAGATCAATCAACGAAGATGAGACTCTCTTTTTAA
AAATTGTGGAGGCTGGAAAAGGAGATATCGAACAAATCGAAGAACTGATTTGTAAGAAAGGGGAAATTATCGACGATCTT
TCTCTTTTAAGAATCGAGTACGGAGTTCCTCGGTTAAATCCAGAGAAAAATTGTTTAGGAACCGAGAGTAAGGGAATTTC
CGATTGGAATATATCTTATTCTCATGCGCGTCAATTATATAGAAATGGAAATGTAAAAGAAGCAATCGATGAACTTATGG
ATCTTTATTCTAAAACGCCGGAGGATTCAAAGGTAATTAAGTTACTCGGGCTTTTGAGTTTTAAGGATAAAGACTACGTC
ACAGCTGTGGAGACTTTAGGAAAGTATCTTGAACTGAATTCCGAATTAAGCGAGTATTGGTATTATTTTTCCATCGCTAA
TAAAAAGTTAGGAAGGTTTTCTGAAGCGATTTCTGCCTCGGAAAAGGTCGCCATAAAACAACCGAATAATATAAACAATC
TTGTCAATCTTTCTGATTTGTACCGACTTCAACGTGAGTATGTGCGGGCTAAAGAGGTTGCGATTAAGATTCTAGATTTA
GATCCTCAAAACGAAAACGCAAAAAAAATTCTTAAGGAAGTAGAAAATAAAATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGGATTCCTACGGTTAAAGTAACGTCTGTTCTAAAAGATAAAAAAACCGATTCTTTCGGAATCGATTAAAATTTTTTAA
AAGAAAGGTTTATTGAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAGAAACTCTCCGTTGAATTTATTCGGAGAGTTTTTAATTTTGCAAAAAAAAGATCTTTTATTGATTCCTTTGATGGAA
AAGTTTAGAGGCTTTATTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1058; Mature: 1057

Protein sequence:

>1058_residues
MSESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFGYVISTFLYHPFAAYHRWITV
GFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFSIGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSY
MFINFLAIPIWRMIHLRGKTRWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVE
KTSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVFKWNNVENSFDKERYDPKVHP
DQEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHENFGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVIT
ASNKLDNIFVEDFCTKGKNFLENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDY
NFHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRASLFSPLKDLLSGVEAVNGGNL
EVQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYLAAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLN
YNANKSTRISTQFLLRQKKQFEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSI
LTRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEHPFTVLYRGERAVFLESSLTL
RKIGLESEYAFQVFTTTLREGDVLIVGSDGKDDLNLTPNKDVRSINEDETLFLKIVEAGKGDIEQIEELICKKGEIIDDL
SLLRIEYGVPRLNPEKNCLGTESKGISDWNISYSHARQLYRNGNVKEAIDELMDLYSKTPEDSKVIKLLGLLSFKDKDYV
TAVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDLYRLQREYVRAKEVAIKILDL
DPQNENAKKILKEVENKI

Sequences:

>Translated_1058_residues
MSESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFGYVISTFLYHPFAAYHRWITV
GFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFSIGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSY
MFINFLAIPIWRMIHLRGKTRWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVE
KTSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVFKWNNVENSFDKERYDPKVHP
DQEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHENFGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVIT
ASNKLDNIFVEDFCTKGKNFLENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDY
NFHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRASLFSPLKDLLSGVEAVNGGNL
EVQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYLAAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLN
YNANKSTRISTQFLLRQKKQFEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSI
LTRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEHPFTVLYRGERAVFLESSLTL
RKIGLESEYAFQVFTTTLREGDVLIVGSDGKDDLNLTPNKDVRSINEDETLFLKIVEAGKGDIEQIEELICKKGEIIDDL
SLLRIEYGVPRLNPEKNCLGTESKGISDWNISYSHARQLYRNGNVKEAIDELMDLYSKTPEDSKVIKLLGLLSFKDKDYV
TAVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDLYRLQREYVRAKEVAIKILDL
DPQNENAKKILKEVENKI
>Mature_1057_residues
SESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFGYVISTFLYHPFAAYHRWITVG
FILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFSIGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSYM
FINFLAIPIWRMIHLRGKTRWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVEK
TSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVFKWNNVENSFDKERYDPKVHPD
QEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHENFGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVITA
SNKLDNIFVEDFCTKGKNFLENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDYN
FHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRASLFSPLKDLLSGVEAVNGGNLE
VQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYLAAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLNY
NANKSTRISTQFLLRQKKQFEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSIL
TRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEHPFTVLYRGERAVFLESSLTLR
KIGLESEYAFQVFTTTLREGDVLIVGSDGKDDLNLTPNKDVRSINEDETLFLKIVEAGKGDIEQIEELICKKGEIIDDLS
LLRIEYGVPRLNPEKNCLGTESKGISDWNISYSHARQLYRNGNVKEAIDELMDLYSKTPEDSKVIKLLGLLSFKDKDYVT
AVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDLYRLQREYVRAKEVAIKILDLD
PQNENAKKILKEVENKI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 122180; Mature: 122049

Theoretical pI: Translated: 5.95; Mature: 5.95

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFG
CCCCEEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YVISTFLYHPFAAYHRWITVGFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSYMFINFLAIPIWRMIHLRGKT
HHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
RWVVFTFMMSFLIGGTALVIANLLGNDGYLERSIYFTSIVFLFMIAFFIILILYLNFSVE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KTSFMLEIVGITFVTVLIVMQILIYISNEDKEFEYDTLSRIRVEKALEGESVKGGISYVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEE
KWNNVENSFDKERYDPKVHPDQEQIEIDFKNTLLYEEMFNLSENGFRESLLELMDHSHEN
EECCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
FGGYKYFIVNFLAEHPNLEDKNLKLELSKELSRLNLHVITASNKLDNIFVEDFCTKGKNF
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCHHH
LENYKILKMFQIFLEYHWSFCKSDGEYISPTAFKEKILNYFRPFVPSLTRYYRVKSVGDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NFHYIGFIKYDRERNDISEVGFSYRAYREFVHPTALKQIIVLSAVIVTIVFLFPFFFRAS
CEEEEEEEEECCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFSPLKDLLSGVEAVNGGNLEVQVPIRTKDEIGFLASSFNNMVFLICNARKELRDYANYL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHH
AAKVRFRTEELSEKIEELQNLKIQQDGDYFLTSLLAKPLNYNANKSTRISTQFLLRQKKQ
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FEFKGKQADLGGDICITGNLRLGTSSDYKRYVFAMNGDAMGKSMQGAGGALVIGVIVNSI
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LTRSAADDRILDISPEQWLTEMYEELNSVFKSFDGSMVVSASFFLIEENSGKTYYFNAEH
HHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCC
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CEEEEEECCEEEEEECCCEEEHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCC
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TAVETLGKYLELNSELSEYWYYFSIANKKLGRFSEAISASEKVAIKQPNNINNLVNLSDL
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YRLQREYVRAKEVAIKILDLDPQNENAKKILKEVENKI
HHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SESVFVSNNVFLNYYSFGSLLLFLTSMLISGVFLFIDQKVSSTKHLAIGTFFLGIFQFG
CCCEEEECCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YVISTFLYHPFAAYHRWITVGFILPAILHIGQFIARYPENDFPKFNRITMIMLWSIALFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IGYFCFSTWNASVKYYFTAHRWDFNAEDVNSKIAIIVFSYMFINFLAIPIWRMIHLRGKT
HHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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HHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCC
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CEEEEEECCEEEEEECCCEEEHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCC
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HHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHEECCCCCCCCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
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HHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHCCHHHH
YRLQREYVRAKEVAIKILDLDPQNENAKKILKEVENKI
HHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA