| Definition | Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007969 |
| Length | 3,059,876 |
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The map label for this gene is 93006433
Identifier: 93006433
GI number: 93006433
Start: 1979457
End: 1983062
Strand: Reverse
Name: 93006433
Synonym: Pcryo_1609
Alternate gene names: NA
Gene position: 1983062-1979457 (Counterclockwise)
Preceding gene: 93006434
Following gene: 93006432
Centisome position: 64.81
GC content: 39.66
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGGAAACGACCAAACTCAAAAAATTTGCTCAACAGGCACGTGTCACTTTGATTGAGCAAGTCGCTACTAAGCTCAAATTT GTACGCGCAGAAGAAAGTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1201; Mature: 1200
Protein sequence:
>1201_residues MTALKTIFQKPVNRPIEGVIKADDEASLRLELEEYVLTDEVENRLISFFDAYNDYQVANGVWLSGFFGSGKSHLLKMLAL LLENRQIDSTSALELFLPKCGDNDVLSSGIKNAVAIPSKSILFNIDQKADVISKTQVDALLAVFVKVFDEMCGYYGKQGH IAQFERDLDSRKLYGSFKEAYESIANKPWEKGREQAILEAKNIAQAYSQVTGEDQALAIGILDKYRSQYHVSIEDFASQV DDYIERQIKEHGYTEFRLNFFVDEVGQYIAENVKLMTNLQTIAESLATKSRGRSWIIVTAQEDMGTVVGEMGKQQSNDFS KIQARFANRMKLTSANVAEVIQKRLLVKTDEGAQLLSGIYDNQSNNFKTLFDFADGSQTYRNFKDKEHFINSYPFIPYQF SLFQSAIADLSLHNAFEGKHSSVGERSMLGVFQQVAIKVGDHDIGQLATFDLMFEGIRTALKSNIQRAVINAETHLDNKF AVQVLKALFLVKYVDGFKSTIRNICVLMLSSFGEDVAILRQRVEEALNLLEDETYVQRTGDMYEYLTDEEKDIEEEIKNT EVEAADVASELESIIFDQVIKSRKIRYSSGASGSQGQDYSFSRKLDDKLYGREYEIGINVISPFYEHAENEEMMSNKSNF SSDELFVILPADSRLMSDITMYKRTEKYVRQNYSIAQQETVKRILGEKGQQNTKRQAELLQRIKSLMSQAKLLVAGTELN VSSEDAQLRIEKGFNELVSRSYPHLRMLRDASYTEADVAKILDSTQQDMLGADISTLAEPERDVLSFIQRNASAAIRTTV KGLLEQFEKKPYGWSYAAVLSTLAKLCVNGKVEVRMDGNILEDSELARALVNSQRQSNLVLEPQVEFSSSQVRHLKEFYE DFFAKPASNNEAKALGNETIDAFKEMLQDLEGWYAQSARYPFLSALDPAIQQIKKLSKSSYAWFLTDLNEDIEDELLKIK EQLIDPIYNFMNGSQREIYDNTQNFLKDQSANFDYIEREQVRVLEASLNDTSIYKGSKIQQVKVLLGSLKDKVNDALQEA RSQSIEALKQMQSRMQEMDEYKKLPDIRQAELDAPYTQLIDKVNEEKLIAVINDRLRYFEDKGYATLLQKMVVMATPKPP PTPAKVSTNNGDKSDKDQSQVSALSEPKQVSEPKNEYINSNKIRVDYDRAWIENETDVERYLEAMSEALLSEIRKGKRIY I
Sequences:
>Translated_1201_residues MTALKTIFQKPVNRPIEGVIKADDEASLRLELEEYVLTDEVENRLISFFDAYNDYQVANGVWLSGFFGSGKSHLLKMLAL LLENRQIDSTSALELFLPKCGDNDVLSSGIKNAVAIPSKSILFNIDQKADVISKTQVDALLAVFVKVFDEMCGYYGKQGH IAQFERDLDSRKLYGSFKEAYESIANKPWEKGREQAILEAKNIAQAYSQVTGEDQALAIGILDKYRSQYHVSIEDFASQV DDYIERQIKEHGYTEFRLNFFVDEVGQYIAENVKLMTNLQTIAESLATKSRGRSWIIVTAQEDMGTVVGEMGKQQSNDFS KIQARFANRMKLTSANVAEVIQKRLLVKTDEGAQLLSGIYDNQSNNFKTLFDFADGSQTYRNFKDKEHFINSYPFIPYQF SLFQSAIADLSLHNAFEGKHSSVGERSMLGVFQQVAIKVGDHDIGQLATFDLMFEGIRTALKSNIQRAVINAETHLDNKF AVQVLKALFLVKYVDGFKSTIRNICVLMLSSFGEDVAILRQRVEEALNLLEDETYVQRTGDMYEYLTDEEKDIEEEIKNT EVEAADVASELESIIFDQVIKSRKIRYSSGASGSQGQDYSFSRKLDDKLYGREYEIGINVISPFYEHAENEEMMSNKSNF SSDELFVILPADSRLMSDITMYKRTEKYVRQNYSIAQQETVKRILGEKGQQNTKRQAELLQRIKSLMSQAKLLVAGTELN VSSEDAQLRIEKGFNELVSRSYPHLRMLRDASYTEADVAKILDSTQQDMLGADISTLAEPERDVLSFIQRNASAAIRTTV KGLLEQFEKKPYGWSYAAVLSTLAKLCVNGKVEVRMDGNILEDSELARALVNSQRQSNLVLEPQVEFSSSQVRHLKEFYE DFFAKPASNNEAKALGNETIDAFKEMLQDLEGWYAQSARYPFLSALDPAIQQIKKLSKSSYAWFLTDLNEDIEDELLKIK EQLIDPIYNFMNGSQREIYDNTQNFLKDQSANFDYIEREQVRVLEASLNDTSIYKGSKIQQVKVLLGSLKDKVNDALQEA RSQSIEALKQMQSRMQEMDEYKKLPDIRQAELDAPYTQLIDKVNEEKLIAVINDRLRYFEDKGYATLLQKMVVMATPKPP PTPAKVSTNNGDKSDKDQSQVSALSEPKQVSEPKNEYINSNKIRVDYDRAWIENETDVERYLEAMSEALLSEIRKGKRIY I >Mature_1200_residues TALKTIFQKPVNRPIEGVIKADDEASLRLELEEYVLTDEVENRLISFFDAYNDYQVANGVWLSGFFGSGKSHLLKMLALL LENRQIDSTSALELFLPKCGDNDVLSSGIKNAVAIPSKSILFNIDQKADVISKTQVDALLAVFVKVFDEMCGYYGKQGHI AQFERDLDSRKLYGSFKEAYESIANKPWEKGREQAILEAKNIAQAYSQVTGEDQALAIGILDKYRSQYHVSIEDFASQVD DYIERQIKEHGYTEFRLNFFVDEVGQYIAENVKLMTNLQTIAESLATKSRGRSWIIVTAQEDMGTVVGEMGKQQSNDFSK IQARFANRMKLTSANVAEVIQKRLLVKTDEGAQLLSGIYDNQSNNFKTLFDFADGSQTYRNFKDKEHFINSYPFIPYQFS LFQSAIADLSLHNAFEGKHSSVGERSMLGVFQQVAIKVGDHDIGQLATFDLMFEGIRTALKSNIQRAVINAETHLDNKFA VQVLKALFLVKYVDGFKSTIRNICVLMLSSFGEDVAILRQRVEEALNLLEDETYVQRTGDMYEYLTDEEKDIEEEIKNTE VEAADVASELESIIFDQVIKSRKIRYSSGASGSQGQDYSFSRKLDDKLYGREYEIGINVISPFYEHAENEEMMSNKSNFS SDELFVILPADSRLMSDITMYKRTEKYVRQNYSIAQQETVKRILGEKGQQNTKRQAELLQRIKSLMSQAKLLVAGTELNV SSEDAQLRIEKGFNELVSRSYPHLRMLRDASYTEADVAKILDSTQQDMLGADISTLAEPERDVLSFIQRNASAAIRTTVK GLLEQFEKKPYGWSYAAVLSTLAKLCVNGKVEVRMDGNILEDSELARALVNSQRQSNLVLEPQVEFSSSQVRHLKEFYED FFAKPASNNEAKALGNETIDAFKEMLQDLEGWYAQSARYPFLSALDPAIQQIKKLSKSSYAWFLTDLNEDIEDELLKIKE QLIDPIYNFMNGSQREIYDNTQNFLKDQSANFDYIEREQVRVLEASLNDTSIYKGSKIQQVKVLLGSLKDKVNDALQEAR SQSIEALKQMQSRMQEMDEYKKLPDIRQAELDAPYTQLIDKVNEEKLIAVINDRLRYFEDKGYATLLQKMVVMATPKPPP TPAKVSTNNGDKSDKDQSQVSALSEPKQVSEPKNEYINSNKIRVDYDRAWIENETDVERYLEAMSEALLSEIRKGKRIYI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 136693; Mature: 136562
Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTALKTIFQKPVNRPIEGVIKADDEASLRLELEEYVLTDEVENRLISFFDAYNDYQVANG CHHHHHHHHHHCCCCCHHHEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC VWLSGFFGSGKSHLLKMLALLLENRQIDSTSALELFLPKCGDNDVLSSGIKNAVAIPSKS EEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC ILFNIDQKADVISKTQVDALLAVFVKVFDEMCGYYGKQGHIAQFERDLDSRKLYGSFKEA EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH YESIANKPWEKGREQAILEAKNIAQAYSQVTGEDQALAIGILDKYRSQYHVSIEDFASQV HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHH DDYIERQIKEHGYTEFRLNFFVDEVGQYIAENVKLMTNLQTIAESLATKSRGRSWIIVTA HHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE QEDMGTVVGEMGKQQSNDFSKIQARFANRMKLTSANVAEVIQKRLLVKTDEGAQLLSGIY CHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH DNQSNNFKTLFDFADGSQTYRNFKDKEHFINSYPFIPYQFSLFQSAIADLSLHNAFEGKH CCCCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SSVGERSMLGVFQQVAIKVGDHDIGQLATFDLMFEGIRTALKSNIQRAVINAETHLDNKF CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH AVQVLKALFLVKYVDGFKSTIRNICVLMLSSFGEDVAILRQRVEEALNLLEDETYVQRTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC DMYEYLTDEEKDIEEEIKNTEVEAADVASELESIIFDQVIKSRKIRYSSGASGSQGQDYS HHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC FSRKLDDKLYGREYEIGINVISPFYEHAENEEMMSNKSNFSSDELFVILPADSRLMSDIT HHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHH MYKRTEKYVRQNYSIAQQETVKRILGEKGQQNTKRQAELLQRIKSLMSQAKLLVAGTELN HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCC VSSEDAQLRIEKGFNELVSRSYPHLRMLRDASYTEADVAKILDSTQQDMLGADISTLAEP CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCC ERDVLSFIQRNASAAIRTTVKGLLEQFEKKPYGWSYAAVLSTLAKLCVNGKVEVRMDGNI HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC LEDSELARALVNSQRQSNLVLEPQVEFSSSQVRHLKEFYEDFFAKPASNNEAKALGNETI CCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCHHHH DAFKEMLQDLEGWYAQSARYPFLSALDPAIQQIKKLSKSSYAWFLTDLNEDIEDELLKIK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHH EQLIDPIYNFMNGSQREIYDNTQNFLKDQSANFDYIEREQVRVLEASLNDTSIYKGSKIQ HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH QVKVLLGSLKDKVNDALQEARSQSIEALKQMQSRMQEMDEYKKLPDIRQAELDAPYTQLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHH DKVNEEKLIAVINDRLRYFEDKGYATLLQKMVVMATPKPPPTPAKVSTNNGDKSDKDQSQ HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHH VSALSEPKQVSEPKNEYINSNKIRVDYDRAWIENETDVERYLEAMSEALLSEIRKGKRIY HHHHCCCHHHCCCHHHHCCCCCEEEEECHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC I C >Mature Secondary Structure TALKTIFQKPVNRPIEGVIKADDEASLRLELEEYVLTDEVENRLISFFDAYNDYQVANG HHHHHHHHHHCCCCCHHHEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC VWLSGFFGSGKSHLLKMLALLLENRQIDSTSALELFLPKCGDNDVLSSGIKNAVAIPSKS EEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC ILFNIDQKADVISKTQVDALLAVFVKVFDEMCGYYGKQGHIAQFERDLDSRKLYGSFKEA EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH YESIANKPWEKGREQAILEAKNIAQAYSQVTGEDQALAIGILDKYRSQYHVSIEDFASQV HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHH DDYIERQIKEHGYTEFRLNFFVDEVGQYIAENVKLMTNLQTIAESLATKSRGRSWIIVTA HHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE QEDMGTVVGEMGKQQSNDFSKIQARFANRMKLTSANVAEVIQKRLLVKTDEGAQLLSGIY CHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH DNQSNNFKTLFDFADGSQTYRNFKDKEHFINSYPFIPYQFSLFQSAIADLSLHNAFEGKH CCCCCCCEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC SSVGERSMLGVFQQVAIKVGDHDIGQLATFDLMFEGIRTALKSNIQRAVINAETHLDNKF CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH AVQVLKALFLVKYVDGFKSTIRNICVLMLSSFGEDVAILRQRVEEALNLLEDETYVQRTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC DMYEYLTDEEKDIEEEIKNTEVEAADVASELESIIFDQVIKSRKIRYSSGASGSQGQDYS HHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC FSRKLDDKLYGREYEIGINVISPFYEHAENEEMMSNKSNFSSDELFVILPADSRLMSDIT HHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHH MYKRTEKYVRQNYSIAQQETVKRILGEKGQQNTKRQAELLQRIKSLMSQAKLLVAGTELN HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCC VSSEDAQLRIEKGFNELVSRSYPHLRMLRDASYTEADVAKILDSTQQDMLGADISTLAEP CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCC ERDVLSFIQRNASAAIRTTVKGLLEQFEKKPYGWSYAAVLSTLAKLCVNGKVEVRMDGNI HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC LEDSELARALVNSQRQSNLVLEPQVEFSSSQVRHLKEFYEDFFAKPASNNEAKALGNETI CCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCHHHH DAFKEMLQDLEGWYAQSARYPFLSALDPAIQQIKKLSKSSYAWFLTDLNEDIEDELLKIK HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHH EQLIDPIYNFMNGSQREIYDNTQNFLKDQSANFDYIEREQVRVLEASLNDTSIYKGSKIQ HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHH QVKVLLGSLKDKVNDALQEARSQSIEALKQMQSRMQEMDEYKKLPDIRQAELDAPYTQLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHH DKVNEEKLIAVINDRLRYFEDKGYATLLQKMVVMATPKPPPTPAKVSTNNGDKSDKDQSQ HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHH VSALSEPKQVSEPKNEYINSNKIRVDYDRAWIENETDVERYLEAMSEALLSEIRKGKRIY HHHHCCCHHHCCCHHHHCCCCCEEEEECHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC I C
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA