| Definition | Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007969 |
| Length | 3,059,876 |
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The map label for this gene is 93006432
Identifier: 93006432
GI number: 93006432
Start: 1975909
End: 1979457
Strand: Reverse
Name: 93006432
Synonym: Pcryo_1608
Alternate gene names: NA
Gene position: 1979457-1975909 (Counterclockwise)
Preceding gene: 93006433
Following gene: 93006431
Centisome position: 64.69
GC content: 39.48
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GAGCTTGGATAGAGAACGAGACCGATGTAGAGCGTTATCTAGAGGCGATGAGTGAGGCACTGCTCAGCGAAATACGTAAA GGTAAAAGGATCTATATCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATGATCGCATCATCAACGCATTACAGCAGCTCTTTAAAAAACATCGTATTGTTTTTTGGTACGATGCCAAGCATGAG CTGCGTGATGATTTTGACAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1182; Mature: 1182
Protein sequence:
>1182_residues METTKLKKFAQQARVTLIEQVATKLKFVRAEESLARRENPIAVKKLEELIKQQSEQEIVERIAYIWFNRFCALRFMDMNR YNRSLVVSAAADDTQPEVLALAKAGDIDERVVSEPVREQILNLLNGRAPSQNPEAEVYRLLLVAYCNQWHESMPFLFQRI DDYTELLMPDDLLSSSSVLTDMREAMPASACKDVEVIGWLYQFYISDKKDDVFARLKKNEKVTPENIPAATQLFTPHWIV RYLVENSLGRLWLLNHPESKLADSMEYYIKPADDNDDSDYLKVARPEDLKICDPACGSGHMLTYAFDLLYAIYEEQGYGA ADIPSLILTHNLYGIEIDERAGELAAFALTMKARDRHRRFFNTDVRPNICVLEPISFDDDELDEYMDFIGRDIFTADLEE TLRQFDEVDNFGSLIRPKLKNVAEILEQLEATDVSGQLFLGHTHQKVLKLLKQADYLSPQYHVVVANPPYMGGSGMNNRL KAWAKKEFPNSKSDLFAMFIERSLDLVCNQGLVAMITMHSWMFLSSFKELREQLLNQVTITSMAHLGSRAFDSIGGEVVQ TTAFIMKKLSDLDYKGNYLRLVDGNSEFQKNRMILEISEEKKFNNLYQSSANDFKKIPGRPITYWISKPYIDCYDNGELI KDVFPAKLGMRTGDNAKWLRLWYETSLIKCSFSDLNSDQDIQLPKSWFPYNKGGEFRRWYGNNEFLVFWENDGYDIKEET LIKYPQLSWDNLGWKITNESDFFKKSLTWSFISSNSFGVRCSLGGAIFDVGGSSIFPEGDNYYLAAGYLCSKICFEFLKA TNPTLNFQVVNINNLPWIQLDEENCKRVNELVKKLVEYSKFDWDSYETSWDFTTLTLLEEKYRKSNLADTYKGLRTHWQQ MTNDMQHLEEENNRIFIDAYGLQDELTPDVPLKEMTLTSNPYYRYGGVKTDDELEALLLADTMRELISYAVGCMFGRYSL DKPGLILANQGDKIEQYFEQIPDPSFMPDKNNVIPILDDGWFSDDIVERFRKFIKVAFGEEQYESNMQFIEQSLGKNDKP RDIRDYFLKDFYDDHVKRYKKRPIYWLFTSGNFSALIYMHRYQPDTVSIVLNDYLREFRTKLNAYKDQLDTIKISSSQSQ SEKTKAIKKLETTTKMITEMEEYERDVLYPLATKQIDIDLDDGVKVNYPKFGKALKKVTGLS
Sequences:
>Translated_1182_residues METTKLKKFAQQARVTLIEQVATKLKFVRAEESLARRENPIAVKKLEELIKQQSEQEIVERIAYIWFNRFCALRFMDMNR YNRSLVVSAAADDTQPEVLALAKAGDIDERVVSEPVREQILNLLNGRAPSQNPEAEVYRLLLVAYCNQWHESMPFLFQRI DDYTELLMPDDLLSSSSVLTDMREAMPASACKDVEVIGWLYQFYISDKKDDVFARLKKNEKVTPENIPAATQLFTPHWIV RYLVENSLGRLWLLNHPESKLADSMEYYIKPADDNDDSDYLKVARPEDLKICDPACGSGHMLTYAFDLLYAIYEEQGYGA ADIPSLILTHNLYGIEIDERAGELAAFALTMKARDRHRRFFNTDVRPNICVLEPISFDDDELDEYMDFIGRDIFTADLEE TLRQFDEVDNFGSLIRPKLKNVAEILEQLEATDVSGQLFLGHTHQKVLKLLKQADYLSPQYHVVVANPPYMGGSGMNNRL KAWAKKEFPNSKSDLFAMFIERSLDLVCNQGLVAMITMHSWMFLSSFKELREQLLNQVTITSMAHLGSRAFDSIGGEVVQ TTAFIMKKLSDLDYKGNYLRLVDGNSEFQKNRMILEISEEKKFNNLYQSSANDFKKIPGRPITYWISKPYIDCYDNGELI KDVFPAKLGMRTGDNAKWLRLWYETSLIKCSFSDLNSDQDIQLPKSWFPYNKGGEFRRWYGNNEFLVFWENDGYDIKEET LIKYPQLSWDNLGWKITNESDFFKKSLTWSFISSNSFGVRCSLGGAIFDVGGSSIFPEGDNYYLAAGYLCSKICFEFLKA TNPTLNFQVVNINNLPWIQLDEENCKRVNELVKKLVEYSKFDWDSYETSWDFTTLTLLEEKYRKSNLADTYKGLRTHWQQ MTNDMQHLEEENNRIFIDAYGLQDELTPDVPLKEMTLTSNPYYRYGGVKTDDELEALLLADTMRELISYAVGCMFGRYSL DKPGLILANQGDKIEQYFEQIPDPSFMPDKNNVIPILDDGWFSDDIVERFRKFIKVAFGEEQYESNMQFIEQSLGKNDKP RDIRDYFLKDFYDDHVKRYKKRPIYWLFTSGNFSALIYMHRYQPDTVSIVLNDYLREFRTKLNAYKDQLDTIKISSSQSQ SEKTKAIKKLETTTKMITEMEEYERDVLYPLATKQIDIDLDDGVKVNYPKFGKALKKVTGLS >Mature_1182_residues METTKLKKFAQQARVTLIEQVATKLKFVRAEESLARRENPIAVKKLEELIKQQSEQEIVERIAYIWFNRFCALRFMDMNR YNRSLVVSAAADDTQPEVLALAKAGDIDERVVSEPVREQILNLLNGRAPSQNPEAEVYRLLLVAYCNQWHESMPFLFQRI DDYTELLMPDDLLSSSSVLTDMREAMPASACKDVEVIGWLYQFYISDKKDDVFARLKKNEKVTPENIPAATQLFTPHWIV RYLVENSLGRLWLLNHPESKLADSMEYYIKPADDNDDSDYLKVARPEDLKICDPACGSGHMLTYAFDLLYAIYEEQGYGA ADIPSLILTHNLYGIEIDERAGELAAFALTMKARDRHRRFFNTDVRPNICVLEPISFDDDELDEYMDFIGRDIFTADLEE TLRQFDEVDNFGSLIRPKLKNVAEILEQLEATDVSGQLFLGHTHQKVLKLLKQADYLSPQYHVVVANPPYMGGSGMNNRL KAWAKKEFPNSKSDLFAMFIERSLDLVCNQGLVAMITMHSWMFLSSFKELREQLLNQVTITSMAHLGSRAFDSIGGEVVQ TTAFIMKKLSDLDYKGNYLRLVDGNSEFQKNRMILEISEEKKFNNLYQSSANDFKKIPGRPITYWISKPYIDCYDNGELI KDVFPAKLGMRTGDNAKWLRLWYETSLIKCSFSDLNSDQDIQLPKSWFPYNKGGEFRRWYGNNEFLVFWENDGYDIKEET LIKYPQLSWDNLGWKITNESDFFKKSLTWSFISSNSFGVRCSLGGAIFDVGGSSIFPEGDNYYLAAGYLCSKICFEFLKA TNPTLNFQVVNINNLPWIQLDEENCKRVNELVKKLVEYSKFDWDSYETSWDFTTLTLLEEKYRKSNLADTYKGLRTHWQQ MTNDMQHLEEENNRIFIDAYGLQDELTPDVPLKEMTLTSNPYYRYGGVKTDDELEALLLADTMRELISYAVGCMFGRYSL DKPGLILANQGDKIEQYFEQIPDPSFMPDKNNVIPILDDGWFSDDIVERFRKFIKVAFGEEQYESNMQFIEQSLGKNDKP RDIRDYFLKDFYDDHVKRYKKRPIYWLFTSGNFSALIYMHRYQPDTVSIVLNDYLREFRTKLNAYKDQLDTIKISSSQSQ SEKTKAIKKLETTTKMITEMEEYERDVLYPLATKQIDIDLDDGVKVNYPKFGKALKKVTGLS
Specific function: Unknown
COG id: COG1002
COG function: function code V; Type II restriction enzyme, methylase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 137186; Mature: 137186
Theoretical pI: Translated: 4.84; Mature: 4.84
Prosite motif: PS00092 N6_MTASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure METTKLKKFAQQARVTLIEQVATKLKFVRAEESLARRENPIAVKKLEELIKQQSEQEIVE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RIAYIWFNRFCALRFMDMNRYNRSLVVSAAADDTQPEVLALAKAGDIDERVVSEPVREQI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH LNLLNGRAPSQNPEAEVYRLLLVAYCNQWHESMPFLFQRIDDYTELLMPDDLLSSSSVLT HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHH DMREAMPASACKDVEVIGWLYQFYISDKKDDVFARLKKNEKVTPENIPAATQLFTPHWIV HHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHH RYLVENSLGRLWLLNHPESKLADSMEYYIKPADDNDDSDYLKVARPEDLKICDPACGSGH HHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHCHHEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCEEECCCCCCCC MLTYAFDLLYAIYEEQGYGAADIPSLILTHNLYGIEIDERAGELAAFALTMKARDRHRRF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FNTDVRPNICVLEPISFDDDELDEYMDFIGRDIFTADLEETLRQFDEVDNFGSLIRPKLK CCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NVAEILEQLEATDVSGQLFLGHTHQKVLKLLKQADYLSPQYHVVVANPPYMGGSGMNNRL HHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHH KAWAKKEFPNSKSDLFAMFIERSLDLVCNQGLVAMITMHSWMFLSSFKELREQLLNQVTI HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSMAHLGSRAFDSIGGEVVQTTAFIMKKLSDLDYKGNYLRLVDGNSEFQKNRMILEISEE HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHCCEEEEECCH KKFNNLYQSSANDFKKIPGRPITYWISKPYIDCYDNGELIKDVFPAKLGMRTGDNAKWLR HHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEE LWYETSLIKCSFSDLNSDQDIQLPKSWFPYNKGGEFRRWYGNNEFLVFWENDGYDIKEET EEEECCEEEEEHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHH LIKYPQLSWDNLGWKITNESDFFKKSLTWSFISSNSFGVRCSLGGAIFDVGGSSIFPEGD HHCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCC NYYLAAGYLCSKICFEFLKATNPTLNFQVVNINNLPWIQLDEENCKRVNELVKKLVEYSK CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHC FDWDSYETSWDFTTLTLLEEKYRKSNLADTYKGLRTHWQQMTNDMQHLEEENNRIFIDAY CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE GLQDELTPDVPLKEMTLTSNPYYRYGGVKTDDELEALLLADTMRELISYAVGCMFGRYSL CCCCCCCCCCCCHHEEECCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DKPGLILANQGDKIEQYFEQIPDPSFMPDKNNVIPILDDGWFSDDIVERFRKFIKVAFGE CCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCH EQYESNMQFIEQSLGKNDKPRDIRDYFLKDFYDDHVKRYKKRPIYWLFTSGNFSALIYMH HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEEEE RYQPDTVSIVLNDYLREFRTKLNAYKDQLDTIKISSSQSQSEKTKAIKKLETTTKMITEM ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEYERDVLYPLATKQIDIDLDDGVKVNYPKFGKALKKVTGLS HHHHHHHCCEECCCEEEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure METTKLKKFAQQARVTLIEQVATKLKFVRAEESLARRENPIAVKKLEELIKQQSEQEIVE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RIAYIWFNRFCALRFMDMNRYNRSLVVSAAADDTQPEVLALAKAGDIDERVVSEPVREQI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH LNLLNGRAPSQNPEAEVYRLLLVAYCNQWHESMPFLFQRIDDYTELLMPDDLLSSSSVLT HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHH DMREAMPASACKDVEVIGWLYQFYISDKKDDVFARLKKNEKVTPENIPAATQLFTPHWIV HHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHH RYLVENSLGRLWLLNHPESKLADSMEYYIKPADDNDDSDYLKVARPEDLKICDPACGSGH HHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHCHHEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCEEECCCCCCCC MLTYAFDLLYAIYEEQGYGAADIPSLILTHNLYGIEIDERAGELAAFALTMKARDRHRRF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH FNTDVRPNICVLEPISFDDDELDEYMDFIGRDIFTADLEETLRQFDEVDNFGSLIRPKLK CCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NVAEILEQLEATDVSGQLFLGHTHQKVLKLLKQADYLSPQYHVVVANPPYMGGSGMNNRL HHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHH KAWAKKEFPNSKSDLFAMFIERSLDLVCNQGLVAMITMHSWMFLSSFKELREQLLNQVTI HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSMAHLGSRAFDSIGGEVVQTTAFIMKKLSDLDYKGNYLRLVDGNSEFQKNRMILEISEE HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHCCEEEEECCH KKFNNLYQSSANDFKKIPGRPITYWISKPYIDCYDNGELIKDVFPAKLGMRTGDNAKWLR HHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEE LWYETSLIKCSFSDLNSDQDIQLPKSWFPYNKGGEFRRWYGNNEFLVFWENDGYDIKEET EEEECCEEEEEHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHH LIKYPQLSWDNLGWKITNESDFFKKSLTWSFISSNSFGVRCSLGGAIFDVGGSSIFPEGD HHCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHCEEEEECCCCCEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCC NYYLAAGYLCSKICFEFLKATNPTLNFQVVNINNLPWIQLDEENCKRVNELVKKLVEYSK CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHC FDWDSYETSWDFTTLTLLEEKYRKSNLADTYKGLRTHWQQMTNDMQHLEEENNRIFIDAY CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE GLQDELTPDVPLKEMTLTSNPYYRYGGVKTDDELEALLLADTMRELISYAVGCMFGRYSL CCCCCCCCCCCCHHEEECCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DKPGLILANQGDKIEQYFEQIPDPSFMPDKNNVIPILDDGWFSDDIVERFRKFIKVAFGE CCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCH EQYESNMQFIEQSLGKNDKPRDIRDYFLKDFYDDHVKRYKKRPIYWLFTSGNFSALIYMH HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEEEE RYQPDTVSIVLNDYLREFRTKLNAYKDQLDTIKISSSQSQSEKTKAIKKLETTTKMITEM ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEYERDVLYPLATKQIDIDLDDGVKVNYPKFGKALKKVTGLS HHHHHHHCCEECCCEEEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA