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The map label for this gene is betT [H]

Identifier: 93005905

GI number: 93005905

Start: 1296658

End: 1298706

Strand: Direct

Name: betT [H]

Synonym: Pcryo_1077

Alternate gene names: 93005905

Gene position: 1296658-1298706 (Clockwise)

Preceding gene: 93005904

Following gene: 93005906

Centisome position: 42.38

GC content: 43.24

Gene sequence:

>2049_bases
ATGAAGAACAAATCCTCCCGTTCCACTATTCTTTTGCCCGTCTTCGTGCCGGCAGCAGCCATTATGCTGCTATTAGTGAT
TGGTACTGCCATTAATCCTGAGTCTGCTGGGGAACTATTTAGCACCGTTCTGAATTTTACCACTGAGACTTTCGGCTGGT
TCTATATGTTAGCAGTCGCTATATTTTTGATGTTTATCCTTGTCTTGGCGTTTTCGTCTTATGGCAGTATTAAACTGGGA
CCAGATCATGCTCAGGCTGAGTATAATTTTCTTGAGTGGTTTGCCATGCTGTTTTCTGCAGGGTATGGGATTGCTTTACT
ATTTTACGGCGTAGCAGAGCCAGTCATACACTTTGCCAGTCCGCCACTCTCAACGCCGCAGACTATTGAGGCCGCAAAAG
AAGCAATGCAAATTGCCTATTTTCACTGGGGTTTTCATATTTGGGCGATCTATGGCGTGGTTGGTCTGTCACTGGCATAT
TTCTCTTTTCGTCATGGCTTGCCCTTGTCAATGCGCTCAACACTATATCCACTCATTGGTGATAAAATTTATGGTCCGAT
TGGACATACTGTTGATGTGTTTGCCATTGTGGGCACGATGTTTGGTATCGCAACCAGTTTGGGGATTTCTGTATCACAGA
TCAATGCCGGGTTAAATTATCTATTACCAAATACGATACCTGTTAGTATTACAGTTCAGGTGATTATCATTGCGCTGGTG
ACACTAGCAGCTTTGGCATCTGTTCTCGCTGGCATGGATAAAGGGGTAAAGCGACTCTCAATTTTGAACATGATGTTAGC
AACGGGGCTGATGCTGTTTGTTTTTATCGTGGGTCCAACCATCTTTATTCTAAACGCCTTTATGGAAAACACGGGCAGCT
ATTTAGGCAATATTGTTGAGCGTACTTTTAGTTTACAGGCTTATCAATCGAGTGATTGGATCGGCAGTTGGACACTCTTT
ATCTTTGCATGGACGATTGCTTGGGCACCCTTTGTCGGATTGTTTATTGCCAAGATTAGTCGGGGTCGTACTATCCGTGA
GTTTGTATTAGGCGTGATGTTAGTACCAACCTTCTTTACATTCTTTTGGTTCGCGGTTTTTGGTGATACAGCGCTCCATA
TGATTATGGTTGATGGCTACGATGCACTCATTACTGAAGTGCAGAACAACCAAGCAATTGCGTTATTTAAATTATTAGAG
AACTTGCCTTTTACTCAGATAGTGTCGTCATTAACAGTACTATTAATTATTACCTTTTTTGTGACCTCATCAGATTCAGG
GTCGTTGGTGATTGACTCTCTTGCAGCGGGTGGACGCAGTGATACGCCATGGTGGCAACGTACCTTTTGGGTAGTGACTG
AAGGGGCAGTTGCCGCGGCTTTACTGGTAGCTGGTGGACTGACAGCATTGCAGACTGCTGCTATTATCAGCGCCTTACCC
TTTGCCGTTATTATATTGATTTCGATATTTGGCATGTGGCGAGCGCTACGTATTGAAGGTCATCGTAACCAGAGTTTAGG
TAACGATAACCATTTGCCGCCGCATCTACTGAAACTAGAGGCTTGGCGCGAGCGTATTGATTATATGACTGAGCAGCCAA
CACGCGATAAAGTGCTTAGTTATATCAGAGGAACAATTTTATCTTCTATGAACGAAGTGGCTGAGAAGTTCGCCGATACA
GGTTGGTTACCTGATGTGAATTATGATGAGATCAATAACCGCGCTGTATTAGAATTGAGAAGTGGCGATAATGTGGAGTT
CTGGTACGAGGTTCGCTTATCAGAGCATGATATTCCTGATTATTATACGGAAGATATGGCAAACAAATTGCCGCAAGAGC
ACCATTACCGTGCTGAAGTGTATTTGCGCCGTGGTGGTCAGACCTATGATTTATATGGTTATGAATCAGTGTCGATTATT
AATGACATTATCGATCAGTTTGAGAAATATCTACACTTTGTCAATGTTTCACCAGATATTCTACCGTGGCGTATGCAAGA
GCATGATGAAGATATAACGCTTGAGCAGGGCAGTGTGTTTGATAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTTCAAGTAATGTGACAAATGGGCAGCAATACTGGGGTTAGTAATCGGTTTGTGGTAAACATTAAGTCTACTTGATC
GTTAATATAAGAATCTGCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATATTAAACAGGACATTCAATGTTGATAAACTTTATGAGCTGAGCAAATGATTACGTAATCCCTTGCAATATGCGCAC
GAATCCTTAGAATAACGGCT

Product: choline/carnitine/betaine transport protein

Products: Proton [Cytoplasm]; choline [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 682; Mature: 682

Protein sequence:

>682_residues
MKNKSSRSTILLPVFVPAAAIMLLLVIGTAINPESAGELFSTVLNFTTETFGWFYMLAVAIFLMFILVLAFSSYGSIKLG
PDHAQAEYNFLEWFAMLFSAGYGIALLFYGVAEPVIHFASPPLSTPQTIEAAKEAMQIAYFHWGFHIWAIYGVVGLSLAY
FSFRHGLPLSMRSTLYPLIGDKIYGPIGHTVDVFAIVGTMFGIATSLGISVSQINAGLNYLLPNTIPVSITVQVIIIALV
TLAALASVLAGMDKGVKRLSILNMMLATGLMLFVFIVGPTIFILNAFMENTGSYLGNIVERTFSLQAYQSSDWIGSWTLF
IFAWTIAWAPFVGLFIAKISRGRTIREFVLGVMLVPTFFTFFWFAVFGDTALHMIMVDGYDALITEVQNNQAIALFKLLE
NLPFTQIVSSLTVLLIITFFVTSSDSGSLVIDSLAAGGRSDTPWWQRTFWVVTEGAVAAALLVAGGLTALQTAAIISALP
FAVIILISIFGMWRALRIEGHRNQSLGNDNHLPPHLLKLEAWRERIDYMTEQPTRDKVLSYIRGTILSSMNEVAEKFADT
GWLPDVNYDEINNRAVLELRSGDNVEFWYEVRLSEHDIPDYYTEDMANKLPQEHHYRAEVYLRRGGQTYDLYGYESVSII
NDIIDQFEKYLHFVNVSPDILPWRMQEHDEDITLEQGSVFDK

Sequences:

>Translated_682_residues
MKNKSSRSTILLPVFVPAAAIMLLLVIGTAINPESAGELFSTVLNFTTETFGWFYMLAVAIFLMFILVLAFSSYGSIKLG
PDHAQAEYNFLEWFAMLFSAGYGIALLFYGVAEPVIHFASPPLSTPQTIEAAKEAMQIAYFHWGFHIWAIYGVVGLSLAY
FSFRHGLPLSMRSTLYPLIGDKIYGPIGHTVDVFAIVGTMFGIATSLGISVSQINAGLNYLLPNTIPVSITVQVIIIALV
TLAALASVLAGMDKGVKRLSILNMMLATGLMLFVFIVGPTIFILNAFMENTGSYLGNIVERTFSLQAYQSSDWIGSWTLF
IFAWTIAWAPFVGLFIAKISRGRTIREFVLGVMLVPTFFTFFWFAVFGDTALHMIMVDGYDALITEVQNNQAIALFKLLE
NLPFTQIVSSLTVLLIITFFVTSSDSGSLVIDSLAAGGRSDTPWWQRTFWVVTEGAVAAALLVAGGLTALQTAAIISALP
FAVIILISIFGMWRALRIEGHRNQSLGNDNHLPPHLLKLEAWRERIDYMTEQPTRDKVLSYIRGTILSSMNEVAEKFADT
GWLPDVNYDEINNRAVLELRSGDNVEFWYEVRLSEHDIPDYYTEDMANKLPQEHHYRAEVYLRRGGQTYDLYGYESVSII
NDIIDQFEKYLHFVNVSPDILPWRMQEHDEDITLEQGSVFDK
>Mature_682_residues
MKNKSSRSTILLPVFVPAAAIMLLLVIGTAINPESAGELFSTVLNFTTETFGWFYMLAVAIFLMFILVLAFSSYGSIKLG
PDHAQAEYNFLEWFAMLFSAGYGIALLFYGVAEPVIHFASPPLSTPQTIEAAKEAMQIAYFHWGFHIWAIYGVVGLSLAY
FSFRHGLPLSMRSTLYPLIGDKIYGPIGHTVDVFAIVGTMFGIATSLGISVSQINAGLNYLLPNTIPVSITVQVIIIALV
TLAALASVLAGMDKGVKRLSILNMMLATGLMLFVFIVGPTIFILNAFMENTGSYLGNIVERTFSLQAYQSSDWIGSWTLF
IFAWTIAWAPFVGLFIAKISRGRTIREFVLGVMLVPTFFTFFWFAVFGDTALHMIMVDGYDALITEVQNNQAIALFKLLE
NLPFTQIVSSLTVLLIITFFVTSSDSGSLVIDSLAAGGRSDTPWWQRTFWVVTEGAVAAALLVAGGLTALQTAAIISALP
FAVIILISIFGMWRALRIEGHRNQSLGNDNHLPPHLLKLEAWRERIDYMTEQPTRDKVLSYIRGTILSSMNEVAEKFADT
GWLPDVNYDEINNRAVLELRSGDNVEFWYEVRLSEHDIPDYYTEDMANKLPQEHHYRAEVYLRRGGQTYDLYGYESVSII
NDIIDQFEKYLHFVNVSPDILPWRMQEHDEDITLEQGSVFDK

Specific function: High-affinity uptake of choline driven by a proton- motive force [H]

COG id: COG1292

COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=656, Percent_Identity=37.3475609756098, Blast_Score=466, Evalue=1e-132,
Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=445, Percent_Identity=28.9887640449438, Blast_Score=172, Evalue=8e-44,
Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=504, Percent_Identity=28.5714285714286, Blast_Score=165, Evalue=9e-42,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000060
- InterPro:   IPR018093 [H]

Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76191; Mature: 76191

Theoretical pI: Translated: 4.88; Mature: 4.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNKSSRSTILLPVFVPAAAIMLLLVIGTAINPESAGELFSTVLNFTTETFGWFYMLAVA
CCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLMFILVLAFSSYGSIKLGPDHAQAEYNFLEWFAMLFSAGYGIALLFYGVAEPVIHFAS
HHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PPLSTPQTIEAAKEAMQIAYFHWGFHIWAIYGVVGLSLAYFSFRHGLPLSMRSTLYPLIG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC
DKIYGPIGHTVDVFAIVGTMFGIATSLGISVSQINAGLNYLLPNTIPVSITVQVIIIALV
CHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
TLAALASVLAGMDKGVKRLSILNMMLATGLMLFVFIVGPTIFILNAFMENTGSYLGNIVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTFSLQAYQSSDWIGSWTLFIFAWTIAWAPFVGLFIAKISRGRTIREFVLGVMLVPTFFT
HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFWFAVFGDTALHMIMVDGYDALITEVQNNQAIALFKLLENLPFTQIVSSLTVLLIITFF
HHHHHHHCCHHEEEEEECCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTSSDSGSLVIDSLAAGGRSDTPWWQRTFWVVTEGAVAAALLVAGGLTALQTAAIISALP
HCCCCCCCEEEEHHHCCCCCCCCHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
FAVIILISIFGMWRALRIEGHRNQSLGNDNHLPPHLLKLEAWRERIDYMTEQPTRDKVLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YIRGTILSSMNEVAEKFADTGWLPDVNYDEINNRAVLELRSGDNVEFWYEVRLSEHDIPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCC
YYTEDMANKLPQEHHYRAEVYLRRGGQTYDLYGYESVSIINDIIDQFEKYLHFVNVSPDI
HHHHHHHHHCCHHHCCHHHEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LPWRMQEHDEDITLEQGSVFDK
CCCCHHCCCCCCEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNKSSRSTILLPVFVPAAAIMLLLVIGTAINPESAGELFSTVLNFTTETFGWFYMLAVA
CCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLMFILVLAFSSYGSIKLGPDHAQAEYNFLEWFAMLFSAGYGIALLFYGVAEPVIHFAS
HHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PPLSTPQTIEAAKEAMQIAYFHWGFHIWAIYGVVGLSLAYFSFRHGLPLSMRSTLYPLIG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHC
DKIYGPIGHTVDVFAIVGTMFGIATSLGISVSQINAGLNYLLPNTIPVSITVQVIIIALV
CHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
TLAALASVLAGMDKGVKRLSILNMMLATGLMLFVFIVGPTIFILNAFMENTGSYLGNIVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTFSLQAYQSSDWIGSWTLFIFAWTIAWAPFVGLFIAKISRGRTIREFVLGVMLVPTFFT
HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFWFAVFGDTALHMIMVDGYDALITEVQNNQAIALFKLLENLPFTQIVSSLTVLLIITFF
HHHHHHHCCHHEEEEEECCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTSSDSGSLVIDSLAAGGRSDTPWWQRTFWVVTEGAVAAALLVAGGLTALQTAAIISALP
HCCCCCCCEEEEHHHCCCCCCCCHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
FAVIILISIFGMWRALRIEGHRNQSLGNDNHLPPHLLKLEAWRERIDYMTEQPTRDKVLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YIRGTILSSMNEVAEKFADTGWLPDVNYDEINNRAVLELRSGDNVEFWYEVRLSEHDIPD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCC
YYTEDMANKLPQEHHYRAEVYLRRGGQTYDLYGYESVSIINDIIDQFEKYLHFVNVSPDI
HHHHHHHHHCCHHHCCHHHEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LPWRMQEHDEDITLEQGSVFDK
CCCCHHCCCCCCEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; choline [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + choline [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + choline [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]