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Definition Chlamydophila felis Fe/C-56, complete genome.
Accession NC_007899
Length 1,166,239

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The map label for this gene is 89898797

Identifier: 89898797

GI number: 89898797

Start: 1139645

End: 1142239

Strand: Direct

Name: 89898797

Synonym: CF0990

Alternate gene names: NA

Gene position: 1139645-1142239 (Clockwise)

Preceding gene: 89898794

Following gene: 89898801

Centisome position: 97.72

GC content: 38.23

Gene sequence:

>2595_bases
ATGTCTTCTTTTTACATACAAAATAGGCCTAAAACAGTTTCCGGTGACGGTTTATTTACTATTAAATTAGATCATAAGTT
TTCTAATTTTGACCCTAAAACGCAGCCGGCTATAGACATAGAAGCCCTAAATTCTGGGTTGTATGTTTTAAAACGTTTAG
CATCTGTTATAGAAGCTGGAAACATCCAAACTTCTATGTTATTAAATCCTAATAACACAATATTCCCCCCGCCACCAGCA
GCTCCTAAATCTCCCAAAAGAAGCAGCCCTGCAGCAGATCCGAAAACAACCCAAACTATTCCCAATATTCAGGAAAAAAC
AGCTGTGGCTTTAGTTCCTCTAGTTCTTGATGGTTTAACAACCTTCATGGATTCAACCCCAGATGTTAAATTAGGACAAA
TTGCTTCCGTGATTCTTGCTGTAACTTTGGTTAATTCTCTCAAGAATAAACCCTCTCTTACTGCTCAAGAACAGACAAGA
TTATTTAGCAACTGCTACCAACCATCTAAGCAAAATATTCTTGATCAAATCAAAAAAGAACAAGCTACTGAAATTAAAAA
GGGTCAGGATAAATTATCAGAAAAACTTCAGTCTGCTGGAGCTACTGAAGAAGTTATTAAACAAGCTCTTAGCCAATATG
AAGACACCTTTGTATCCGACTTTTTTGATGCTCATGTGAAAGAACAGTTCATGACTTATCGATCACTTATCGGGGGAGAA
ATTTCCAAAATGGCGACAGAGATGAAAACTCTCGAAGCAAAAATCCCCGATCCAACGAAAGACAACGTTCAAAGTGTCAA
TGGCCAAACGATGTTGCAAGCTGTGTTTAACGGCCTCACAGATGCTGTGAACAAAGTTCCAGCACTGGGAGGAGAGCAGG
ATGTTTTTCAAACATTATTAGCTCTAAGCAATCTTCTGACTCAAACCACATTTGATACTGAAGCTTTAAAAAAGATTTAC
GATGCTACAGACCTACCCAGCCAAGCCTCTCTAGATTTATATTTGAAATCTCGAGACGCCGCTATATACCGAGAAGGAGT
TACCAGTGCGTATCAGACTGCTGTACAAAATCTAACCTCGGTTCGCTTTTCTATAGAAAATGAAAAACAGACCCTAGAAA
ATCAACTCTCAGCATTTCAGCAAGCAGTAAGCTGTTTTACAGAATGGGTCAATGGATCTAAAAACATAAAAGACGGTAAC
ACATATACTTCTGTGCTTGTAACGTCAGCAATGGAAGCTGTTGCGGGATTAACCTGTTTATCTCAAATGCTGGGGAACCT
TACTCAAGAAGAACAGACTATAGTCAAAAAATATGTCCCCAACTACCTCCAACTTGCTATAGGAAACGGCACCACATTAA
CTAGATTCATTGCAGAAATGAGTTCTTTTCAAGAAATTGCAGAATATACTCTAAATAACGCTATCACTACCACTGCCGCT
GTAACACAATTCCTAGCAGGCAAAGGAGGCGCTATTGCCACTTTTCCCCTTTTCTCTGAGGTCGGTCAAACAATAGGGAC
AATTGCCTATGCTTTGAGTAATTATATTAAAACAGAAAACGGGCTACAGATCCCTAATTTTGATACTTTTGTAAAAAATG
AGTTAAAAGTTGCGAATATCGATGGTAATTTCGTCAATCAAGCCACTTCAGTATTAACAAATTTCACAACAGAAGCAAAT
CAACATATTCAAAAACTCCAGCAACAAATAGATGCTTTAGATAAAAAATACAGCGAATATAATCCGGCAAATGCTAGTTT
TACTAACGATCGCAAAAAAGCTGTTGAAAGTTGGTTAAATTCTGAAAGCCTCGGATCTGCGTTTATTTATCTAATATTAA
ACTCACAGCTGCCCAAGCAATCAGCCTTCCTAAATCCTTTAATCGAAGAAATTAACTTTAATAACCTTGCTGCAAACGCT
ATTAATGATCTTTTAAAAATCACCAATCACTTTTCAACGACCTCTGTATATTACAACTTCTCCTCCTATCTTATTCAAAG
TAAAGAAGGCACAGATCTATTCTGCGGTGATTATTTTGAAACCTACCTTGCCCTATCCAGAGAAAAAGAATACATAGCGC
GTGATGCAGACCGTTGTAGACGCGCCCAAGCCATGGTAGAAGCTTTATTAAAGAAAATAGAAGCTTTGCCTGGAGCAAGC
TCGTCTCAAAGATCTGAGATGCTCAATGCAACTTCTAACTATAAGTATGCCCTCACAATTACATTTAACCAGCTGAATCT
TTTAAACTCTCTGTTGTCTAACCTGAACATTCAGGAACAAAAGAACAACGACGGCAAATACAAAAGCACCGTATTTAAAA
TCACTGGTCCAACAGATTGGATTCCAACTCTGGCTTCTTTGGAAGGTTTTATTTCCAATGGATTTCCTAACATAACTCCT
ACTGGAGGGCTAGGGCCTCTATTTACTCAGATTCAATCTGACCAACAGGACTATACCACGCAAGGACAAACCCAACAGTT
AAACCTGCAAAATCAGATGACTAACGTACAACAAGAATGGACATTGGTATCGACATCAATGCAGGTGCTTAACCAAATTC
TCTCGAGACTTATTGGAGAAATTTACCCTAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACAACATTATAAGAAAAATAAAAATTTTTAGTTAAAAAGCAGGATAGAAAAAAACTTCATAAAATAAGAAAATAAAATA
AAAAATTAAAAGCAATTTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAACTAGTTGAAATGGGGAGCCTAAAGGTTCCTCCATTTCTTCCCCCTTTCTTCTGTTATATCCCAAACAACCGCACAA
TATATTTTTGCTTCTTAACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 864; Mature: 863

Protein sequence:

>864_residues
MSSFYIQNRPKTVSGDGLFTIKLDHKFSNFDPKTQPAIDIEALNSGLYVLKRLASVIEAGNIQTSMLLNPNNTIFPPPPA
APKSPKRSSPAADPKTTQTIPNIQEKTAVALVPLVLDGLTTFMDSTPDVKLGQIASVILAVTLVNSLKNKPSLTAQEQTR
LFSNCYQPSKQNILDQIKKEQATEIKKGQDKLSEKLQSAGATEEVIKQALSQYEDTFVSDFFDAHVKEQFMTYRSLIGGE
ISKMATEMKTLEAKIPDPTKDNVQSVNGQTMLQAVFNGLTDAVNKVPALGGEQDVFQTLLALSNLLTQTTFDTEALKKIY
DATDLPSQASLDLYLKSRDAAIYREGVTSAYQTAVQNLTSVRFSIENEKQTLENQLSAFQQAVSCFTEWVNGSKNIKDGN
TYTSVLVTSAMEAVAGLTCLSQMLGNLTQEEQTIVKKYVPNYLQLAIGNGTTLTRFIAEMSSFQEIAEYTLNNAITTTAA
VTQFLAGKGGAIATFPLFSEVGQTIGTIAYALSNYIKTENGLQIPNFDTFVKNELKVANIDGNFVNQATSVLTNFTTEAN
QHIQKLQQQIDALDKKYSEYNPANASFTNDRKKAVESWLNSESLGSAFIYLILNSQLPKQSAFLNPLIEEINFNNLAANA
INDLLKITNHFSTTSVYYNFSSYLIQSKEGTDLFCGDYFETYLALSREKEYIARDADRCRRAQAMVEALLKKIEALPGAS
SSQRSEMLNATSNYKYALTITFNQLNLLNSLLSNLNIQEQKNNDGKYKSTVFKITGPTDWIPTLASLEGFISNGFPNITP
TGGLGPLFTQIQSDQQDYTTQGQTQQLNLQNQMTNVQQEWTLVSTSMQVLNQILSRLIGEIYPN

Sequences:

>Translated_864_residues
MSSFYIQNRPKTVSGDGLFTIKLDHKFSNFDPKTQPAIDIEALNSGLYVLKRLASVIEAGNIQTSMLLNPNNTIFPPPPA
APKSPKRSSPAADPKTTQTIPNIQEKTAVALVPLVLDGLTTFMDSTPDVKLGQIASVILAVTLVNSLKNKPSLTAQEQTR
LFSNCYQPSKQNILDQIKKEQATEIKKGQDKLSEKLQSAGATEEVIKQALSQYEDTFVSDFFDAHVKEQFMTYRSLIGGE
ISKMATEMKTLEAKIPDPTKDNVQSVNGQTMLQAVFNGLTDAVNKVPALGGEQDVFQTLLALSNLLTQTTFDTEALKKIY
DATDLPSQASLDLYLKSRDAAIYREGVTSAYQTAVQNLTSVRFSIENEKQTLENQLSAFQQAVSCFTEWVNGSKNIKDGN
TYTSVLVTSAMEAVAGLTCLSQMLGNLTQEEQTIVKKYVPNYLQLAIGNGTTLTRFIAEMSSFQEIAEYTLNNAITTTAA
VTQFLAGKGGAIATFPLFSEVGQTIGTIAYALSNYIKTENGLQIPNFDTFVKNELKVANIDGNFVNQATSVLTNFTTEAN
QHIQKLQQQIDALDKKYSEYNPANASFTNDRKKAVESWLNSESLGSAFIYLILNSQLPKQSAFLNPLIEEINFNNLAANA
INDLLKITNHFSTTSVYYNFSSYLIQSKEGTDLFCGDYFETYLALSREKEYIARDADRCRRAQAMVEALLKKIEALPGAS
SSQRSEMLNATSNYKYALTITFNQLNLLNSLLSNLNIQEQKNNDGKYKSTVFKITGPTDWIPTLASLEGFISNGFPNITP
TGGLGPLFTQIQSDQQDYTTQGQTQQLNLQNQMTNVQQEWTLVSTSMQVLNQILSRLIGEIYPN
>Mature_863_residues
SSFYIQNRPKTVSGDGLFTIKLDHKFSNFDPKTQPAIDIEALNSGLYVLKRLASVIEAGNIQTSMLLNPNNTIFPPPPAA
PKSPKRSSPAADPKTTQTIPNIQEKTAVALVPLVLDGLTTFMDSTPDVKLGQIASVILAVTLVNSLKNKPSLTAQEQTRL
FSNCYQPSKQNILDQIKKEQATEIKKGQDKLSEKLQSAGATEEVIKQALSQYEDTFVSDFFDAHVKEQFMTYRSLIGGEI
SKMATEMKTLEAKIPDPTKDNVQSVNGQTMLQAVFNGLTDAVNKVPALGGEQDVFQTLLALSNLLTQTTFDTEALKKIYD
ATDLPSQASLDLYLKSRDAAIYREGVTSAYQTAVQNLTSVRFSIENEKQTLENQLSAFQQAVSCFTEWVNGSKNIKDGNT
YTSVLVTSAMEAVAGLTCLSQMLGNLTQEEQTIVKKYVPNYLQLAIGNGTTLTRFIAEMSSFQEIAEYTLNNAITTTAAV
TQFLAGKGGAIATFPLFSEVGQTIGTIAYALSNYIKTENGLQIPNFDTFVKNELKVANIDGNFVNQATSVLTNFTTEANQ
HIQKLQQQIDALDKKYSEYNPANASFTNDRKKAVESWLNSESLGSAFIYLILNSQLPKQSAFLNPLIEEINFNNLAANAI
NDLLKITNHFSTTSVYYNFSSYLIQSKEGTDLFCGDYFETYLALSREKEYIARDADRCRRAQAMVEALLKKIEALPGASS
SQRSEMLNATSNYKYALTITFNQLNLLNSLLSNLNIQEQKNNDGKYKSTVFKITGPTDWIPTLASLEGFISNGFPNITPT
GGLGPLFTQIQSDQQDYTTQGQTQQLNLQNQMTNVQQEWTLVSTSMQVLNQILSRLIGEIYPN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95426; Mature: 95295

Theoretical pI: Translated: 4.94; Mature: 4.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSFYIQNRPKTVSGDGLFTIKLDHKFSNFDPKTQPAIDIEALNSGLYVLKRLASVIEAG
CCCCEECCCCCEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC
NIQTSMLLNPNNTIFPPPPAAPKSPKRSSPAADPKTTQTIPNIQEKTAVALVPLVLDGLT
CCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFMDSTPDVKLGQIASVILAVTLVNSLKNKPSLTAQEQTRLFSNCYQPSKQNILDQIKKE
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
QATEIKKGQDKLSEKLQSAGATEEVIKQALSQYEDTFVSDFFDAHVKEQFMTYRSLIGGE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
ISKMATEMKTLEAKIPDPTKDNVQSVNGQTMLQAVFNGLTDAVNKVPALGGEQDVFQTLL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
ALSNLLTQTTFDTEALKKIYDATDLPSQASLDLYLKSRDAAIYREGVTSAYQTAVQNLTS
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VRFSIENEKQTLENQLSAFQQAVSCFTEWVNGSKNIKDGNTYTSVLVTSAMEAVAGLTCL
HHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQMLGNLTQEEQTIVKKYVPNYLQLAIGNGTTLTRFIAEMSSFQEIAEYTLNNAITTTAA
HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTQFLAGKGGAIATFPLFSEVGQTIGTIAYALSNYIKTENGLQIPNFDTFVKNELKVANI
HHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCEEEEC
DGNFVNQATSVLTNFTTEANQHIQKLQQQIDALDKKYSEYNPANASFTNDRKKAVESWLN
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
SESLGSAFIYLILNSQLPKQSAFLNPLIEEINFNNLAANAINDLLKITNHFSTTSVYYNF
CCHHHHEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEH
SSYLIQSKEGTDLFCGDYFETYLALSREKEYIARDADRCRRAQAMVEALLKKIEALPGAS
HHHHEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SSQRSEMLNATSNYKYALTITFNQLNLLNSLLSNLNIQEQKNNDGKYKSTVFKITGPTDW
CHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCH
IPTLASLEGFISNGFPNITPTGGLGPLFTQIQSDQQDYTTQGQTQQLNLQNQMTNVQQEW
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHH
TLVSTSMQVLNQILSRLIGEIYPN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SSFYIQNRPKTVSGDGLFTIKLDHKFSNFDPKTQPAIDIEALNSGLYVLKRLASVIEAG
CCCEECCCCCEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC
NIQTSMLLNPNNTIFPPPPAAPKSPKRSSPAADPKTTQTIPNIQEKTAVALVPLVLDGLT
CCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFMDSTPDVKLGQIASVILAVTLVNSLKNKPSLTAQEQTRLFSNCYQPSKQNILDQIKKE
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
QATEIKKGQDKLSEKLQSAGATEEVIKQALSQYEDTFVSDFFDAHVKEQFMTYRSLIGGE
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ALSNLLTQTTFDTEALKKIYDATDLPSQASLDLYLKSRDAAIYREGVTSAYQTAVQNLTS
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VRFSIENEKQTLENQLSAFQQAVSCFTEWVNGSKNIKDGNTYTSVLVTSAMEAVAGLTCL
HHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCH
IPTLASLEGFISNGFPNITPTGGLGPLFTQIQSDQQDYTTQGQTQQLNLQNQMTNVQQEW
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHH
TLVSTSMQVLNQILSRLIGEIYPN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA