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Definition Jannaschia sp. CCS1 chromosome, complete genome.
Accession NC_007802
Length 4,317,977

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The map label for this gene is 89054023

Identifier: 89054023

GI number: 89054023

Start: 1501318

End: 1504317

Strand: Direct

Name: 89054023

Synonym: Jann_1532

Alternate gene names: NA

Gene position: 1501318-1504317 (Clockwise)

Preceding gene: 89054021

Following gene: 89054024

Centisome position: 34.77

GC content: 48.1

Gene sequence:

>3000_bases
TTGGGTCGCAAATTGAAGTGGGTGCCAAACAACTTGACTGAGCAAAACGCCATAAGCCTGTTCGCCATTCGGAATAAGGC
TGTGAGGAATATCTTACGCGGCATCCTGGCGGCCGATAAGCCTTCTGTTTCCCGTCAAGCGATGCGGCGGTTGAAAAAAG
AGGCGAGCAGTCTTGATCTTGAAAAAGCATTCCAATTCTTGATTACAAGTCCAACCTCCCAACATGTGTCTATAGCTCCA
ATTTTTCCTGCAAACATCGAGGATTGTACATCTGCTCCCTATCTGGGTGACAGTCGCGTAGAAGCTGAGCTGGCAATACA
AAAGGCACGCTTTGGAGCCTCAGAGCAGGAACTGTTGCGAGCGATCTCTTCCGTTAAGCAGATCAATGAAGCGGTTTTTG
AGCGAGATGGTGTTCGTGTCTCCCAACTGCTTCAGGAACATGCGGACGACTTTGGAATCTCGCTCTTCATGATGAGAAAG
GCGCTGAGCCTCAGGCATACAGAATTCTCGAAAGAGGGTAGCTTGCGGCTTAGTGCGGTAATCGACCCATTTCTTTCTAA
ACGCCGTCATATACTTGCAGTCGCATTCGAAGACAGCGTTGACGAACAGCTTAGCTACATTCGAGTCCGTCGGACGTTTC
TTTCCCACGTGAAGAATGCGCGGATTGCCAGAGCAATAAGCCCAGTTTTGCAAGACTTTTTATCACCTGTTTCTTGGCCG
CCTGAGCAGATTTTGACCCCGCTGGAAGCATACTCTCGTTGGGGTGTGCTCGACTCACTAGAGTTCTTAGAGCGATGTTT
GAGCGATCAGAATCCTAGGTTCAGAGAAGACGTAGCAAAGAAAATTCACGGTGTCATACCGGAAAATGTCCACAGAGCAT
GGATTGATGCTTTCGGGGAAATCCGCTTCAACGAAGTTGTCAATCTTTTGCAAGGTGATCAAGATTTTCTCGAATACCGA
GTGTTCCGCCACTCTCTAGCGTGGTCGGAAGTCAATGATGTGATGGATTATAGGCGAAGAATCGAGATCGGGTTTGGTCA
TCGCCTAGACGGGGTCTTCCGGGATCGTGAAATCGATCAAACGTTAGTAGAATCAGGTATTTCTAGAGTAGATCATCTAT
TGCCATCCGGTGGATTGTCGGATCTTCCTGAACTGCCAATTAATACGCGAACTTGCGGAACTTTTCACCGGACCTTGGCG
CTTACAGGAGCTCTGAGCGCTAACGGATCAACTTTGGAGGTTGCTGGCGGCAAAAACCTTCTTAAGCTTTTGGACCGAAC
GATGGACGTTTCTCAACTGTTGTCGCTTCCAGAGCTAACAAAGTTCATACCAATTAGTTCTGGCGACAGACTCTACGAGT
ATTTGCGAACGGCGTTGAGGTTTGATGCCGAAGAAAATCGCGTTTCAGATCATGCATTTAGAAGAGCTACTCAGGACGTA
GTCGGTCAAGACTTTAGCGGAGACATTGTCAAATTTGCTCAGTATCTTGATGGTGGAGCTCCGAATGTTGCGGAACATCT
GTTCGTGATCTGCAATGAATATTTTCTAACAGAACTCTATCTTCTATTTGAGGATTCGAATGCCGTTATAGACGCACAAG
CTGATCTTCTGGAGTGGTATGGTGAGAGCCGCGAAGATGAAGACGCTGCACTTCGAGCTAAATCTCACCGGCTAAACCTT
AGGCTCCGCAAAGTCAGAGGAAGCATCGACGACACCAGGATCTATGTTGATCAACTGAAGTTTCAATACTGGGCTACGGA
AACAATAGCTTCTTCGCTTCGTGAACTCGCAAGTATTGGTGATGCGATCTCTAAACTTGATGAAGCAACTCCAAATTTAA
ACGATCCTATCGCAGCAGTTGAAGACCCGAGAGCAAGGCTGTTTCAGGTGTTAAATTTGGCCTATAAAGAGTTCTGCACA
AATGAGTTCTACGGCGTCGATTCTTACATAGGCAGGCGGATCAGGCATGGAACACTTCACGGTGTTTTGGTTGCTGAGCT
CAAAGAACCGGTTGACGCGATTGCTGATCAATTTGCCGCATCATCCCCTGAGTTCTCGAGCTTTGTCCGGTTGTGGCATA
AAGAAGTTGAAACCGTCGTAAAAACCTTCGGCCTTGAGCTGTTGAGAGTAAGGTCAAGCGAGCGCAAAGCGGGTCTCATC
ATCCCAACGATAGGTGACAGCGACAAGCGAAACACTGCTCTAAACATGCTGAACTCGGTGGCTACCGCTCTTGCGGAAGA
TCGCGGCGCAGGTGTTGCGATCAGCTACATTTATGACTTCTGTTGGTTGCTTCTAGAGATCGACCTCAAGAGATTGAGAG
CAGCGGCGTTGGCGGCACAGCATGAGCTAGTAATCAGGCCCAAACAGCACATTTCGGGCAGTGGCAGCGAACTAGAAGCT
CAGATTCTGGATGCAGCGCGTCACCTCAACACAGAACTTCAGCAGAGATTTGAGCAACTTGTTGGTTGGCTGACTCGACC
ATCAAACGTGAGTCCATCAGCAACATTGTCTCTTCTTTTCCACGCAGTGATACTTGAGGTGCAAGGACGTTATTCCGGCT
TTTTTCCAAAGTGGGTTGAACTGGGTGAAACCGGTATCGACATGTTTGGTCATCGATTCCACACATTCTATGACGTCCTC
TTTGTGCTAGTGGACAACGCTGCAAAGCATGGCGACAGGGCGGGTGAAGTTCAATTTGAAGTTCAGTCAAACTCCGTGTC
GCCCAGTACCTCTGAAATCACGATGAGTGTCACTTCAAGCCTTAGATCTGGACAAGACGAGTCTAGCAATCAAGCCATCA
CGGCAGCAATGAACTCGGATATCGGCGCTGCCATGTTGGAAGACAAAAACAGTGGGTTGAGAAAGATCCGAGTTCTGGTT
GAAGATGTCGATGAGCTGAGTGATTTCACTGTCAATTTTGGTGAAGGCAGAGTCACGTTTTCGGTCGTTATGAGCCTTGT
AATGACAGGTACTGAACAAAGGACTGAGGCTGCCGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTAGATACAATAGCTAGTCGATATCGACATCTCGGTACAAGATGTGCTAGCTCTTAAGTTCCTTTGCGGAGCAAGCGT
CTGAGCCAACTTCGATTGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGTACTTCTTGTCGAGGATGATGAGTATAAGCAGACCAAGGTTGAGGCTGCCCTAAGAAGCGTTGCTTCCGAACTGGAC
CTTGTAGTAGCAAAAACTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 999; Mature: 998

Protein sequence:

>999_residues
MGRKLKWVPNNLTEQNAISLFAIRNKAVRNILRGILAADKPSVSRQAMRRLKKEASSLDLEKAFQFLITSPTSQHVSIAP
IFPANIEDCTSAPYLGDSRVEAELAIQKARFGASEQELLRAISSVKQINEAVFERDGVRVSQLLQEHADDFGISLFMMRK
ALSLRHTEFSKEGSLRLSAVIDPFLSKRRHILAVAFEDSVDEQLSYIRVRRTFLSHVKNARIARAISPVLQDFLSPVSWP
PEQILTPLEAYSRWGVLDSLEFLERCLSDQNPRFREDVAKKIHGVIPENVHRAWIDAFGEIRFNEVVNLLQGDQDFLEYR
VFRHSLAWSEVNDVMDYRRRIEIGFGHRLDGVFRDREIDQTLVESGISRVDHLLPSGGLSDLPELPINTRTCGTFHRTLA
LTGALSANGSTLEVAGGKNLLKLLDRTMDVSQLLSLPELTKFIPISSGDRLYEYLRTALRFDAEENRVSDHAFRRATQDV
VGQDFSGDIVKFAQYLDGGAPNVAEHLFVICNEYFLTELYLLFEDSNAVIDAQADLLEWYGESREDEDAALRAKSHRLNL
RLRKVRGSIDDTRIYVDQLKFQYWATETIASSLRELASIGDAISKLDEATPNLNDPIAAVEDPRARLFQVLNLAYKEFCT
NEFYGVDSYIGRRIRHGTLHGVLVAELKEPVDAIADQFAASSPEFSSFVRLWHKEVETVVKTFGLELLRVRSSERKAGLI
IPTIGDSDKRNTALNMLNSVATALAEDRGAGVAISYIYDFCWLLLEIDLKRLRAAALAAQHELVIRPKQHISGSGSELEA
QILDAARHLNTELQQRFEQLVGWLTRPSNVSPSATLSLLFHAVILEVQGRYSGFFPKWVELGETGIDMFGHRFHTFYDVL
FVLVDNAAKHGDRAGEVQFEVQSNSVSPSTSEITMSVTSSLRSGQDESSNQAITAAMNSDIGAAMLEDKNSGLRKIRVLV
EDVDELSDFTVNFGEGRVTFSVVMSLVMTGTEQRTEAAE

Sequences:

>Translated_999_residues
MGRKLKWVPNNLTEQNAISLFAIRNKAVRNILRGILAADKPSVSRQAMRRLKKEASSLDLEKAFQFLITSPTSQHVSIAP
IFPANIEDCTSAPYLGDSRVEAELAIQKARFGASEQELLRAISSVKQINEAVFERDGVRVSQLLQEHADDFGISLFMMRK
ALSLRHTEFSKEGSLRLSAVIDPFLSKRRHILAVAFEDSVDEQLSYIRVRRTFLSHVKNARIARAISPVLQDFLSPVSWP
PEQILTPLEAYSRWGVLDSLEFLERCLSDQNPRFREDVAKKIHGVIPENVHRAWIDAFGEIRFNEVVNLLQGDQDFLEYR
VFRHSLAWSEVNDVMDYRRRIEIGFGHRLDGVFRDREIDQTLVESGISRVDHLLPSGGLSDLPELPINTRTCGTFHRTLA
LTGALSANGSTLEVAGGKNLLKLLDRTMDVSQLLSLPELTKFIPISSGDRLYEYLRTALRFDAEENRVSDHAFRRATQDV
VGQDFSGDIVKFAQYLDGGAPNVAEHLFVICNEYFLTELYLLFEDSNAVIDAQADLLEWYGESREDEDAALRAKSHRLNL
RLRKVRGSIDDTRIYVDQLKFQYWATETIASSLRELASIGDAISKLDEATPNLNDPIAAVEDPRARLFQVLNLAYKEFCT
NEFYGVDSYIGRRIRHGTLHGVLVAELKEPVDAIADQFAASSPEFSSFVRLWHKEVETVVKTFGLELLRVRSSERKAGLI
IPTIGDSDKRNTALNMLNSVATALAEDRGAGVAISYIYDFCWLLLEIDLKRLRAAALAAQHELVIRPKQHISGSGSELEA
QILDAARHLNTELQQRFEQLVGWLTRPSNVSPSATLSLLFHAVILEVQGRYSGFFPKWVELGETGIDMFGHRFHTFYDVL
FVLVDNAAKHGDRAGEVQFEVQSNSVSPSTSEITMSVTSSLRSGQDESSNQAITAAMNSDIGAAMLEDKNSGLRKIRVLV
EDVDELSDFTVNFGEGRVTFSVVMSLVMTGTEQRTEAAE
>Mature_998_residues
GRKLKWVPNNLTEQNAISLFAIRNKAVRNILRGILAADKPSVSRQAMRRLKKEASSLDLEKAFQFLITSPTSQHVSIAPI
FPANIEDCTSAPYLGDSRVEAELAIQKARFGASEQELLRAISSVKQINEAVFERDGVRVSQLLQEHADDFGISLFMMRKA
LSLRHTEFSKEGSLRLSAVIDPFLSKRRHILAVAFEDSVDEQLSYIRVRRTFLSHVKNARIARAISPVLQDFLSPVSWPP
EQILTPLEAYSRWGVLDSLEFLERCLSDQNPRFREDVAKKIHGVIPENVHRAWIDAFGEIRFNEVVNLLQGDQDFLEYRV
FRHSLAWSEVNDVMDYRRRIEIGFGHRLDGVFRDREIDQTLVESGISRVDHLLPSGGLSDLPELPINTRTCGTFHRTLAL
TGALSANGSTLEVAGGKNLLKLLDRTMDVSQLLSLPELTKFIPISSGDRLYEYLRTALRFDAEENRVSDHAFRRATQDVV
GQDFSGDIVKFAQYLDGGAPNVAEHLFVICNEYFLTELYLLFEDSNAVIDAQADLLEWYGESREDEDAALRAKSHRLNLR
LRKVRGSIDDTRIYVDQLKFQYWATETIASSLRELASIGDAISKLDEATPNLNDPIAAVEDPRARLFQVLNLAYKEFCTN
EFYGVDSYIGRRIRHGTLHGVLVAELKEPVDAIADQFAASSPEFSSFVRLWHKEVETVVKTFGLELLRVRSSERKAGLII
PTIGDSDKRNTALNMLNSVATALAEDRGAGVAISYIYDFCWLLLEIDLKRLRAAALAAQHELVIRPKQHISGSGSELEAQ
ILDAARHLNTELQQRFEQLVGWLTRPSNVSPSATLSLLFHAVILEVQGRYSGFFPKWVELGETGIDMFGHRFHTFYDVLF
VLVDNAAKHGDRAGEVQFEVQSNSVSPSTSEITMSVTSSLRSGQDESSNQAITAAMNSDIGAAMLEDKNSGLRKIRVLVE
DVDELSDFTVNFGEGRVTFSVVMSLVMTGTEQRTEAAE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112145; Mature: 112014

Theoretical pI: Translated: 5.52; Mature: 5.52

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGRKLKWVPNNLTEQNAISLFAIRNKAVRNILRGILAADKPSVSRQAMRRLKKEASSLDL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EKAFQFLITSPTSQHVSIAPIFPANIEDCTSAPYLGDSRVEAELAIQKARFGASEQELLR
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
AISSVKQINEAVFERDGVRVSQLLQEHADDFGISLFMMRKALSLRHTEFSKEGSLRLSAV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHH
IDPFLSKRRHILAVAFEDSVDEQLSYIRVRRTFLSHVKNARIARAISPVLQDFLSPVSWP
HHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PEQILTPLEAYSRWGVLDSLEFLERCLSDQNPRFREDVAKKIHGVIPENVHRAWIDAFGE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHC
IRFNEVVNLLQGDQDFLEYRVFRHSLAWSEVNDVMDYRRRIEIGFGHRLDGVFRDREIDQ
CHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH
TLVESGISRVDHLLPSGGLSDLPELPINTRTCGTFHRTLALTGALSANGSTLEVAGGKNL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHH
LKLLDRTMDVSQLLSLPELTKFIPISSGDRLYEYLRTALRFDAEENRVSDHAFRRATQDV
HHHHHHHCCHHHHHCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGQDFSGDIVKFAQYLDGGAPNVAEHLFVICNEYFLTELYLLFEDSNAVIDAQADLLEWY
HCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEECHHHHHHHH
GESREDEDAALRAKSHRLNLRLRKVRGSIDDTRIYVDQLKFQYWATETIASSLRELASIG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DAISKLDEATPNLNDPIAAVEDPRARLFQVLNLAYKEFCTNEFYGVDSYIGRRIRHGTLH
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHH
GVLVAELKEPVDAIADQFAASSPEFSSFVRLWHKEVETVVKTFGLELLRVRSSERKAGLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
IPTIGDSDKRNTALNMLNSVATALAEDRGAGVAISYIYDFCWLLLEIDLKRLRAAALAAQ
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HELVIRPKQHISGSGSELEAQILDAARHLNTELQQRFEQLVGWLTRPSNVSPSATLSLLF
HHHEECCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
HAVILEVQGRYSGFFPKWVELGETGIDMFGHRFHTFYDVLFVLVDNAAKHGDRAGEVQFE
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
VQSNSVSPSTSEITMSVTSSLRSGQDESSNQAITAAMNSDIGAAMLEDKNSGLRKIRVLV
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHH
EDVDELSDFTVNFGEGRVTFSVVMSLVMTGTEQRTEAAE
HHHHHHHHCEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
GRKLKWVPNNLTEQNAISLFAIRNKAVRNILRGILAADKPSVSRQAMRRLKKEASSLDL
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
EKAFQFLITSPTSQHVSIAPIFPANIEDCTSAPYLGDSRVEAELAIQKARFGASEQELLR
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AISSVKQINEAVFERDGVRVSQLLQEHADDFGISLFMMRKALSLRHTEFSKEGSLRLSAV
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IDPFLSKRRHILAVAFEDSVDEQLSYIRVRRTFLSHVKNARIARAISPVLQDFLSPVSWP
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VGQDFSGDIVKFAQYLDGGAPNVAEHLFVICNEYFLTELYLLFEDSNAVIDAQADLLEWY
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GESREDEDAALRAKSHRLNLRLRKVRGSIDDTRIYVDQLKFQYWATETIASSLRELASIG
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HAVILEVQGRYSGFFPKWVELGETGIDMFGHRFHTFYDVLFVLVDNAAKHGDRAGEVQFE
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VQSNSVSPSTSEITMSVTSSLRSGQDESSNQAITAAMNSDIGAAMLEDKNSGLRKIRVLV
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHH
EDVDELSDFTVNFGEGRVTFSVVMSLVMTGTEQRTEAAE
HHHHHHHHCEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA