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The map label for this gene is secY [H]

Identifier: 88658436

GI number: 88658436

Start: 406836

End: 408134

Strand: Direct

Name: secY [H]

Synonym: ECH_0428

Alternate gene names: 88658436

Gene position: 406836-408134 (Clockwise)

Preceding gene: 88658246

Following gene: 88658097

Centisome position: 34.59

GC content: 28.25

Gene sequence:

>1299_bases
ATGGATTTACTATCTTGGAATAAGGATAATTTATTGGGTAAACTTTGGTTTACTTTATTTTGTCTTATTATATACCGTTT
GGGTACATATATACCTATTCCTGGTATTAATCCAGATGTAATAGATGCAGTAGTTACAAAACATTCTGTAGGTGTTTTAG
GAATTTTTAATGTATTTTCTGGTGGTGCTTTAGGTAGAATGACTGTTTTTGCATTAAATGTTATGCCATATATAGTATCT
TCTATAATTATTCAGTTATTATCAGTAACTATTCCAAAATTAAATGAGCTGAGGCAAAATGGTGAATTAGGGCGGATTAA
AATTAATAGTTATATACGGTATATGACTATTTTTTTCTGTATGGTTCAAGGTTTTGTTATTTTGCTTGGATTAGAAAAGA
TGAATACTGAAACTAGTATTGTAGTTATTGAGCCTGGTCTGTTATTTCGTATAGTGGGTATTAGCAGTCTTTTAGGTGGG
ACAATGTTTTTACTATGGTTAGGAGAAAGAATTAATAAAAATGGCATAGGTAATGGCGTATCTATGATTATATTTACGGG
TATAGTAGCTGAATTACCTGGTTCTTTTTCTTCTATGTTTTTATTAGGGAAAAATGGAAATGTTCCAATATTTGTAATTT
TATTGATGTTATTGGTATTTTTTGCGTTATTGTTATTAATTATTTTTATTGAAAAATCTTATAGAAAAATACTGGTGCAG
TATCCAAAAAGACAAGTTAAGAATAAGTTATATGGTAGTAGTTCTACTTATATTCCATTAAAGATTAATATTTCTGGAGT
AATTCCACCTATTTTTGCTAATGCTTTATTATTATCTCCGATTACAGTTGCAAATTTTCATCAAGGATCTCCATGGTCTG
ATTTTATATTAATGCATTTTTCATCTGGTAAATTACTATATATGGGGTGTTATGCATTATTAATAATATTTTTCGCGTTT
TTTTATACGACTTTTGTTTTTGATTCAAAAGAGACGTCAGAGATATTAAAAAAAAATGGAGGTTTTGTTCCTGGGAAGAG
GCCTGGGAATGGTACTTGTGAGTATTTTAATTATGTAATAAAGAGATTAACTGTTTTAGGGTCAATTTATTTAACGGTTA
TTTGTATAATTCCTGAGTTAATAAGGTATAATTATTCCATTTCTTTTACTTTAGGGGGTACTAGTTTTTTGATAATAATC
AACGTAATAATTGATACGTTTTCTCAGGTGCAGACACATTTGTATTCAAGCAGATATAGTACATTAATTAAAAAGTCTGA
GTTATGGAAAATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCAGCAGAATCACAGGTTACTTTGTTAAGTAATGTATCAGCAAGTAAAGAATAGAATAGTATTTAAGTTCATAGTTAA
GTAATATTATGTCACAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATGTTAATTTTTGGTCCTCCTGGGTCTGGTAAAGGTACGCAATGTCATATTTTGTCAAAAATTTATAGTACTATTTCT
GTAATTTCAACAGGTGATTT

Product: preprotein translocase subunit SecY

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 432; Mature: 432

Protein sequence:

>432_residues
MDLLSWNKDNLLGKLWFTLFCLIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVVTKHSVGVLGIFNVFSGGALGRMTVFALNVMPYIVS
SIIIQLLSVTIPKLNELRQNGELGRIKINSYIRYMTIFFCMVQGFVILLGLEKMNTETSIVVIEPGLLFRIVGISSLLGG
TMFLLWLGERINKNGIGNGVSMIIFTGIVAELPGSFSSMFLLGKNGNVPIFVILLMLLVFFALLLLIIFIEKSYRKILVQ
YPKRQVKNKLYGSSSTYIPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMHFSSGKLLYMGCYALLIIFFAF
FYTTFVFDSKETSEILKKNGGFVPGKRPGNGTCEYFNYVIKRLTVLGSIYLTVICIIPELIRYNYSISFTLGGTSFLIII
NVIIDTFSQVQTHLYSSRYSTLIKKSELWKIK

Sequences:

>Translated_432_residues
MDLLSWNKDNLLGKLWFTLFCLIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVVTKHSVGVLGIFNVFSGGALGRMTVFALNVMPYIVS
SIIIQLLSVTIPKLNELRQNGELGRIKINSYIRYMTIFFCMVQGFVILLGLEKMNTETSIVVIEPGLLFRIVGISSLLGG
TMFLLWLGERINKNGIGNGVSMIIFTGIVAELPGSFSSMFLLGKNGNVPIFVILLMLLVFFALLLLIIFIEKSYRKILVQ
YPKRQVKNKLYGSSSTYIPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMHFSSGKLLYMGCYALLIIFFAF
FYTTFVFDSKETSEILKKNGGFVPGKRPGNGTCEYFNYVIKRLTVLGSIYLTVICIIPELIRYNYSISFTLGGTSFLIII
NVIIDTFSQVQTHLYSSRYSTLIKKSELWKIK
>Mature_432_residues
MDLLSWNKDNLLGKLWFTLFCLIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVVTKHSVGVLGIFNVFSGGALGRMTVFALNVMPYIVS
SIIIQLLSVTIPKLNELRQNGELGRIKINSYIRYMTIFFCMVQGFVILLGLEKMNTETSIVVIEPGLLFRIVGISSLLGG
TMFLLWLGERINKNGIGNGVSMIIFTGIVAELPGSFSSMFLLGKNGNVPIFVILLMLLVFFALLLLIIFIEKSYRKILVQ
YPKRQVKNKLYGSSSTYIPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMHFSSGKLLYMGCYALLIIFFAF
FYTTFVFDSKETSEILKKNGGFVPGKRPGNGTCEYFNYVIKRLTVLGSIYLTVICIIPELIRYNYSISFTLGGTSFLIII
NVIIDTFSQVQTHLYSSRYSTLIKKSELWKIK

Specific function: Involved in protein export. Interacts with secA and secE to allow the translocation of proteins across the plasma membrane, by forming part of a channel [H]

COG id: COG0201

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecY

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secY/SEC61-alpha family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789696, Length=418, Percent_Identity=44.4976076555024, Blast_Score=333, Evalue=2e-92,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002208
- InterPro:   IPR023201 [H]

Pfam domain/function: PF00344 SecY [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48458; Mature: 48458

Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97

Prosite motif: PS00755 SECY_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDLLSWNKDNLLGKLWFTLFCLIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVVTKHSVGVLGIFNVFS
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC
GGALGRMTVFALNVMPYIVSSIIIQLLSVTIPKLNELRQNGELGRIKINSYIRYMTIFFC
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
MVQGFVILLGLEKMNTETSIVVIEPGLLFRIVGISSLLGGTMFLLWLGERINKNGIGNGV
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
SMIIFTGIVAELPGSFSSMFLLGKNGNVPIFVILLMLLVFFALLLLIIFIEKSYRKILVQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YPKRQVKNKLYGSSSTYIPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMHF
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEE
SSGKLLYMGCYALLIIFFAFFYTTFVFDSKETSEILKKNGGFVPGKRPGNGTCEYFNYVI
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
KRLTVLGSIYLTVICIIPELIRYNYSISFTLGGTSFLIIINVIIDTFSQVQTHLYSSRYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLIKKSELWKIK
HHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDLLSWNKDNLLGKLWFTLFCLIIYRLGTYIPIPGINPDVIDAVVTKHSVGVLGIFNVFS
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHC
GGALGRMTVFALNVMPYIVSSIIIQLLSVTIPKLNELRQNGELGRIKINSYIRYMTIFFC
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
MVQGFVILLGLEKMNTETSIVVIEPGLLFRIVGISSLLGGTMFLLWLGERINKNGIGNGV
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
SMIIFTGIVAELPGSFSSMFLLGKNGNVPIFVILLMLLVFFALLLLIIFIEKSYRKILVQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YPKRQVKNKLYGSSSTYIPLKINISGVIPPIFANALLLSPITVANFHQGSPWSDFILMHF
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEE
SSGKLLYMGCYALLIIFFAFFYTTFVFDSKETSEILKKNGGFVPGKRPGNGTCEYFNYVI
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
KRLTVLGSIYLTVICIIPELIRYNYSISFTLGGTSFLIIINVIIDTFSQVQTHLYSSRYS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLIKKSELWKIK
HHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA