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The map label for this gene is 88658206

Identifier: 88658206

GI number: 88658206

Start: 486464

End: 489232

Strand: Direct

Name: 88658206

Synonym: ECH_0497

Alternate gene names: NA

Gene position: 486464-489232 (Clockwise)

Preceding gene: 88658009

Following gene: 88657563

Centisome position: 41.36

GC content: 30.16

Gene sequence:

>2769_bases
ATGTTTAAAATAGTTTTGATAATCAGTATTTTTCTTCTTTCAAGTTGTGGCTATCATGGTTGTATTAAACCGCAGAGTGT
ACTATTTGATGAATATTCAACTACTGTAGAAGCTGGATTAGAAGATGGGAAAAAAGAACATGTTGCTTGGGTTAAATCGG
ATTTGGTACTAGCTGGAAGACAGTTCCTTACTATAAAAGTTGATACAGTGAATGTTAATTTTTGTAATAATACAAAAGAT
GTGGTAAATATTTTTTCTAGTGAAGGGAGTACTCTTGATTCCAGTGCTAAAAAATTTCCTGTTAACATCCCTAATATAAT
GAAGGGGGAAAAGTTAAATTTTAGGTTATCTCCAGCTTTGAAATTTACTGTGGATAAAGATATATGTAAAAATAACAACC
CTAAAGTTTATGTTCAGAATACTAGTAAATGCATGGAGGATTATCTTGATACGGAATATTATATTCCGGTTGATAATTAC
GATTTTCAAATGAATAATCTCATGTATTTGAAAGATCGTGGTTCAGCAAATAAAGATAAGGAGAAGTCCTGGATTAATTT
TCCACTTAAAATTTTATATCATCTAGATAGAAAAACATATAGAGATGTGAGTCAGATGAATATTTCTAAGTTATCTAGTG
ATCGTTATCAAAATAATAATGATCTTTTCTATCTTTGTGTTACGGATAAGAGGCTGAATGAATATGTAACTAAAATTGTA
GAAGATATGTTAAACAAAACATCTAGTGGCAATACTGCTTATTCAGGAGATAAAAAGGAGCAACTAATATCAGAGAAAAA
AGAATCTCTCTTAAGGAAGCGGGATGCAGTTAGAAAGAAATATCAAAAATTATATGATGCGTATACTGTAAATATGCTAT
GCGGAAATTTATGTAATATTCCTGGTTATGATAAACAAAAATTGGATAAAAATTGTTTTGTTGTAGAAACGAATAATATG
CTTAATAGTTGTACTATTGAGAAAAGTGGTATATCAGGGTGTAATTTAAATGAAGCAGGACAATATAGTACTGTTTTGCC
TTTTTTATATTTAACACATGATTCAGGTATAACGAATTTTATTACTGTTGATGATGCAGTTAAAAAATGGCAGGCAGATA
ACAATTCTTCTTCTGATATTGGTCTTTTGACTAATCACCAGTATTCTATTAGTAAAGATTTAGATAAAAATCTTTATTTA
GAATTGCGTGTCAAAGATGATTTAGAGTTAATAGGTAAGTATACAATTGAAGTAACCAAGGATTGTAGTAATCACGTCAA
GGATAGTTTATATTATACCATATCTAAAGGTCCACCTACAGTAAAACCAGGAGAACAAGGGACTACACCACTTAATTTTA
TAAATAATGAAGATACAATAGTCAAATTAACGGGTAATGATGAAGTTGGTGAACTATATTTTGGTGTAAAAGATAATGGA
GATGGTTATGAAAATAATACAGGATATTTTAATATTACAGTAATTGCGAAAAAGAAAATACCAAAAGTGATTTCATATAT
GGTAGAACGATTGAAAGATTCACTGGAAAGAGGATTATACGGAACATCATCTACTAATTCTGGTGGTGTTAATATAATAT
ATAATAGTATTATAGAAAATATGCATTTTATTAAAATAGTGAATTCATTATTGGTATTATATATATTAATGAATGCACTG
TTTTATTGTGCTGGGTTTTCTAAGGCTTCTATTTTTGAATTGTTAACTATAACATTAAAAATTAGCATAATAATTTATGT
GATTGGTCCTAATAGTTGGGATTTTTTTAATAATCATTTGTTTAAATTATTCACTGAAGCACCAATACAATTAATTTCTA
TAATGACAGGTCAAGATCCTGATACTAGTACAAGTTTTGAATTTTTAGATATAATCTTATATCGGTTTTCTTTATCTGAG
AGTTGGTTACAGATTTTAGCATTATTGTTTGCTGGTCCAGTAGGATGGGTAAGTGTAGTTCTAATTTTTTGGGGATTAGT
AGTTTTATTTCTCACTATAGCAACTGCAGTTATTACTTATTTGATATCTATTATTCTTATAGGATTGTTGCTTAGTATTG
CACCTTTCTTTATAATTTGTATTTTATTTAGACGTACTAAAGCAATTTTTGATTCGTGGATTAAGTCTTTGGTACAGACA
GCTATGCAACCAGTGATAATATTTGCTTCTTTTGCTCTTTTGACTCAAGTTATAGATAATATAATATATGCTATGTTTAA
TTTTGAATCATGTGATGTATGTGTACTTCGTCCTGAGTTTGACATAGGAATTACGACAATAGGTTTTTGTTTACTTGAAT
TTTTGCTCCCTTTAGGATTCTCTCCTGTATCAGTTTTTACTGATAATGTAAGAGATTCAGTGAATAGTGATACAGTTATG
TTTATAGGATTACCAATGCCTATTGTTAATATATTAATATTTGTAATAATGGCAAATGCGACAAAGCATTTTGTTGGTTC
TTCTGGGGAAATGTGTACATCAATTTTTGGTTCATTTGCTAATTTATCTATGGTGGCTGAGGGTGCTAAAGAAAGTGCAT
TAGGCATTATTGGTATGGATCAAAATAGCCGTATGCAAAGGTCAAGGTATCAGCAAATGAATGAGATGAATAATCAAGAT
AGCGATGGTGAACGTCGACGTGATCCTCTTGACTTGCATTCGCCTTCAAGAAGTGATGACTCTACCAACAGGACATCACG
TGGTGGTGTATCAATACCTGAAAATCCTCCATCTAGTTTCGGTAGGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTAAGTACTTTTGTTAAAGTTTGGTTATTTATGAAAATTTTATCAAGATATTTGATTTAATGTGATTATGTTATTTTTTT
AGGGTAGAAGAGCTGATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTATGAAAAAGTTTATAATATTATTACTATTTTTTGTTACAGGATGTGGGGTTAATTGTATTGAGGGTAGTAAAGGTAT
TAGTGGGAATTCAGTTGTTG

Product: VirB6 family type IV secretion system protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 922; Mature: 922

Protein sequence:

>922_residues
MFKIVLIISIFLLSSCGYHGCIKPQSVLFDEYSTTVEAGLEDGKKEHVAWVKSDLVLAGRQFLTIKVDTVNVNFCNNTKD
VVNIFSSEGSTLDSSAKKFPVNIPNIMKGEKLNFRLSPALKFTVDKDICKNNNPKVYVQNTSKCMEDYLDTEYYIPVDNY
DFQMNNLMYLKDRGSANKDKEKSWINFPLKILYHLDRKTYRDVSQMNISKLSSDRYQNNNDLFYLCVTDKRLNEYVTKIV
EDMLNKTSSGNTAYSGDKKEQLISEKKESLLRKRDAVRKKYQKLYDAYTVNMLCGNLCNIPGYDKQKLDKNCFVVETNNM
LNSCTIEKSGISGCNLNEAGQYSTVLPFLYLTHDSGITNFITVDDAVKKWQADNNSSSDIGLLTNHQYSISKDLDKNLYL
ELRVKDDLELIGKYTIEVTKDCSNHVKDSLYYTISKGPPTVKPGEQGTTPLNFINNEDTIVKLTGNDEVGELYFGVKDNG
DGYENNTGYFNITVIAKKKIPKVISYMVERLKDSLERGLYGTSSTNSGGVNIIYNSIIENMHFIKIVNSLLVLYILMNAL
FYCAGFSKASIFELLTITLKISIIIYVIGPNSWDFFNNHLFKLFTEAPIQLISIMTGQDPDTSTSFEFLDIILYRFSLSE
SWLQILALLFAGPVGWVSVVLIFWGLVVLFLTIATAVITYLISIILIGLLLSIAPFFIICILFRRTKAIFDSWIKSLVQT
AMQPVIIFASFALLTQVIDNIIYAMFNFESCDVCVLRPEFDIGITTIGFCLLEFLLPLGFSPVSVFTDNVRDSVNSDTVM
FIGLPMPIVNILIFVIMANATKHFVGSSGEMCTSIFGSFANLSMVAEGAKESALGIIGMDQNSRMQRSRYQQMNEMNNQD
SDGERRRDPLDLHSPSRSDDSTNRTSRGGVSIPENPPSSFGR

Sequences:

>Translated_922_residues
MFKIVLIISIFLLSSCGYHGCIKPQSVLFDEYSTTVEAGLEDGKKEHVAWVKSDLVLAGRQFLTIKVDTVNVNFCNNTKD
VVNIFSSEGSTLDSSAKKFPVNIPNIMKGEKLNFRLSPALKFTVDKDICKNNNPKVYVQNTSKCMEDYLDTEYYIPVDNY
DFQMNNLMYLKDRGSANKDKEKSWINFPLKILYHLDRKTYRDVSQMNISKLSSDRYQNNNDLFYLCVTDKRLNEYVTKIV
EDMLNKTSSGNTAYSGDKKEQLISEKKESLLRKRDAVRKKYQKLYDAYTVNMLCGNLCNIPGYDKQKLDKNCFVVETNNM
LNSCTIEKSGISGCNLNEAGQYSTVLPFLYLTHDSGITNFITVDDAVKKWQADNNSSSDIGLLTNHQYSISKDLDKNLYL
ELRVKDDLELIGKYTIEVTKDCSNHVKDSLYYTISKGPPTVKPGEQGTTPLNFINNEDTIVKLTGNDEVGELYFGVKDNG
DGYENNTGYFNITVIAKKKIPKVISYMVERLKDSLERGLYGTSSTNSGGVNIIYNSIIENMHFIKIVNSLLVLYILMNAL
FYCAGFSKASIFELLTITLKISIIIYVIGPNSWDFFNNHLFKLFTEAPIQLISIMTGQDPDTSTSFEFLDIILYRFSLSE
SWLQILALLFAGPVGWVSVVLIFWGLVVLFLTIATAVITYLISIILIGLLLSIAPFFIICILFRRTKAIFDSWIKSLVQT
AMQPVIIFASFALLTQVIDNIIYAMFNFESCDVCVLRPEFDIGITTIGFCLLEFLLPLGFSPVSVFTDNVRDSVNSDTVM
FIGLPMPIVNILIFVIMANATKHFVGSSGEMCTSIFGSFANLSMVAEGAKESALGIIGMDQNSRMQRSRYQQMNEMNNQD
SDGERRRDPLDLHSPSRSDDSTNRTSRGGVSIPENPPSSFGR
>Mature_922_residues
MFKIVLIISIFLLSSCGYHGCIKPQSVLFDEYSTTVEAGLEDGKKEHVAWVKSDLVLAGRQFLTIKVDTVNVNFCNNTKD
VVNIFSSEGSTLDSSAKKFPVNIPNIMKGEKLNFRLSPALKFTVDKDICKNNNPKVYVQNTSKCMEDYLDTEYYIPVDNY
DFQMNNLMYLKDRGSANKDKEKSWINFPLKILYHLDRKTYRDVSQMNISKLSSDRYQNNNDLFYLCVTDKRLNEYVTKIV
EDMLNKTSSGNTAYSGDKKEQLISEKKESLLRKRDAVRKKYQKLYDAYTVNMLCGNLCNIPGYDKQKLDKNCFVVETNNM
LNSCTIEKSGISGCNLNEAGQYSTVLPFLYLTHDSGITNFITVDDAVKKWQADNNSSSDIGLLTNHQYSISKDLDKNLYL
ELRVKDDLELIGKYTIEVTKDCSNHVKDSLYYTISKGPPTVKPGEQGTTPLNFINNEDTIVKLTGNDEVGELYFGVKDNG
DGYENNTGYFNITVIAKKKIPKVISYMVERLKDSLERGLYGTSSTNSGGVNIIYNSIIENMHFIKIVNSLLVLYILMNAL
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SWLQILALLFAGPVGWVSVVLIFWGLVVLFLTIATAVITYLISIILIGLLLSIAPFFIICILFRRTKAIFDSWIKSLVQT
AMQPVIIFASFALLTQVIDNIIYAMFNFESCDVCVLRPEFDIGITTIGFCLLEFLLPLGFSPVSVFTDNVRDSVNSDTVM
FIGLPMPIVNILIFVIMANATKHFVGSSGEMCTSIFGSFANLSMVAEGAKESALGIIGMDQNSRMQRSRYQQMNEMNNQD
SDGERRRDPLDLHSPSRSDDSTNRTSRGGVSIPENPPSSFGR

Specific function: Unknown

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Cell membrane; Lipid-anchor (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007688 [H]

Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103947; Mature: 103947

Theoretical pI: Translated: 5.93; Mature: 5.93

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKIVLIISIFLLSSCGYHGCIKPQSVLFDEYSTTVEAGLEDGKKEHVAWVKSDLVLAGR
CEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEECC
QFLTIKVDTVNVNFCNNTKDVVNIFSSEGSTLDSSAKKFPVNIPNIMKGEKLNFRLSPAL
EEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCE
KFTVDKDICKNNNPKVYVQNTSKCMEDYLDTEYYIPVDNYDFQMNNLMYLKDRGSANKDK
EEEECHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCC
EKSWINFPLKILYHLDRKTYRDVSQMNISKLSSDRYQNNNDLFYLCVTDKRLNEYVTKIV
CHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHH
EDMLNKTSSGNTAYSGDKKEQLISEKKESLLRKRDAVRKKYQKLYDAYTVNMLCGNLCNI
HHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PGYDKQKLDKNCFVVETNNMLNSCTIEKSGISGCNLNEAGQYSTVLPFLYLTHDSGITNF
CCCCHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEEEECCCCCEE
ITVDDAVKKWQADNNSSSDIGLLTNHQYSISKDLDKNLYLELRVKDDLELIGKYTIEVTK
EEEHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHEEEEEEH
DCSNHVKDSLYYTISKGPPTVKPGEQGTTPLNFINNEDTIVKLTGNDEVGELYFGVKDNG
HHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCC
DGYENNTGYFNITVIAKKKIPKVISYMVERLKDSLERGLYGTSSTNSGGVNIIYNSIIEN
CCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHEEEHHHHCC
MHFIKIVNSLLVLYILMNALFYCAGFSKASIFELLTITLKISIIIYVIGPNSWDFFNNHL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHH
FKLFTEAPIQLISIMTGQDPDTSTSFEFLDIILYRFSLSESWLQILALLFAGPVGWVSVV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LIFWGLVVLFLTIATAVITYLISIILIGLLLSIAPFFIICILFRRTKAIFDSWIKSLVQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMQPVIIFASFALLTQVIDNIIYAMFNFESCDVCVLRPEFDIGITTIGFCLLEFLLPLGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
SPVSVFTDNVRDSVNSDTVMFIGLPMPIVNILIFVIMANATKHFVGSSGEMCTSIFGSFA
CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
NLSMVAEGAKESALGIIGMDQNSRMQRSRYQQMNEMNNQDSDGERRRDPLDLHSPSRSDD
HHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCC
STNRTSRGGVSIPENPPSSFGR
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKIVLIISIFLLSSCGYHGCIKPQSVLFDEYSTTVEAGLEDGKKEHVAWVKSDLVLAGR
CEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEECC
QFLTIKVDTVNVNFCNNTKDVVNIFSSEGSTLDSSAKKFPVNIPNIMKGEKLNFRLSPAL
EEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCE
KFTVDKDICKNNNPKVYVQNTSKCMEDYLDTEYYIPVDNYDFQMNNLMYLKDRGSANKDK
EEEECHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCC
EKSWINFPLKILYHLDRKTYRDVSQMNISKLSSDRYQNNNDLFYLCVTDKRLNEYVTKIV
CHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHH
EDMLNKTSSGNTAYSGDKKEQLISEKKESLLRKRDAVRKKYQKLYDAYTVNMLCGNLCNI
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PGYDKQKLDKNCFVVETNNMLNSCTIEKSGISGCNLNEAGQYSTVLPFLYLTHDSGITNF
CCCCHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEEEECCCCCEE
ITVDDAVKKWQADNNSSSDIGLLTNHQYSISKDLDKNLYLELRVKDDLELIGKYTIEVTK
EEEHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHEEEEEEH
DCSNHVKDSLYYTISKGPPTVKPGEQGTTPLNFINNEDTIVKLTGNDEVGELYFGVKDNG
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DGYENNTGYFNITVIAKKKIPKVISYMVERLKDSLERGLYGTSSTNSGGVNIIYNSIIEN
CCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHEEEHHHHCC
MHFIKIVNSLLVLYILMNALFYCAGFSKASIFELLTITLKISIIIYVIGPNSWDFFNNHL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCCCHHHHHH
FKLFTEAPIQLISIMTGQDPDTSTSFEFLDIILYRFSLSESWLQILALLFAGPVGWVSVV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LIFWGLVVLFLTIATAVITYLISIILIGLLLSIAPFFIICILFRRTKAIFDSWIKSLVQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMQPVIIFASFALLTQVIDNIIYAMFNFESCDVCVLRPEFDIGITTIGFCLLEFLLPLGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
SPVSVFTDNVRDSVNSDTVMFIGLPMPIVNILIFVIMANATKHFVGSSGEMCTSIFGSFA
CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
NLSMVAEGAKESALGIIGMDQNSRMQRSRYQQMNEMNNQDSDGERRRDPLDLHSPSRSDD
HHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCC
STNRTSRGGVSIPENPPSSFGR
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA