| Definition | Neorickettsia sennetsu str. Miyayama chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007798 |
| Length | 859,006 |
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The map label for this gene is 88608640
Identifier: 88608640
GI number: 88608640
Start: 409574
End: 415339
Strand: Direct
Name: 88608640
Synonym: NSE_0496
Alternate gene names: NA
Gene position: 409574-415339 (Clockwise)
Preceding gene: 88608574
Following gene: 88608126
Centisome position: 47.68
GC content: 42.33
Gene sequence:
>5766_bases ATGCAGGGTCTATACAATAAACTTTTAGATGCTATTAGTTGTGGCAACTACTCTCTTTTCTCTCAACTCACTAAGCGTGT CGATTTTGATTATTCAGGGAGTCCCTATAACGGAGTTTCAGCTTTTAATGCGGTGGTTTCTGCTATTTGCATAGAAACTC CAAAAGATGAGAGAGACATTGCTGATTTGCTTCCTGTGCAGACAAAAGAATCGTCCACTGCGATTGCAGGTTTGAGGGCA AGAATAACTGGTAGAGAGGAGATTTTTGCAGATTTATGCAAACACCTTCGTGTAAATAGTTTAATAAATTTGGCGGATTT TGGAACTGGTCTCACACCGGTGCAAGTTGCCTTAGCTGCTAATAACACCACTCTAATAAATCGATTGTTTGCGAACGGTG CCCTGAGAAGTGCTAGGTGTGAGATTGATAGGGTTTCCGGTTGTACTTTGTTCATGAAAGCGCTTAGTTGTGCAAGTGGT ACGGCCTCTGTGGAAATGTTGAAAGCGGTTGCTCGTGGTACGGCCAACATTCGACAGTTGACTACAACAGGTAAGACAGA TAGGCAGATAGTAAATGACCTATGTAACTATTTTCGCTCTCTTGCGTCGAATTATGAAGAAGCACTGGCAGTTTTAATGT CTTCAGACGGCGATGGGAAGAACTTATATCATAGGGCACTTGAAAAAAATGATCCTGAAGCTTTGCAGTGGTTAAACAAG CTGTTCCTATCAGAAAAACCCATCATTGAAGAGGCAGAGGAACTTTTGAATAATCTTAGTCTATCAAGTAAGTACAAAAC GCAGATTTTACAAAGTGTTCGCTATTCGAATGATAAGTTTACCCGCATAAGGAAAGCGATAGGTGCAGCGGATGTGATAT TTAATATGCCGTGTGGGGAGCTCACTCCAACGGAGTTTATAGTGAGTAATATACCTTCCCAGGACGCTGGAGAGTTTGCT 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ATTCTTCTAGAACATAAAAAATTACAGGAAAAAAGTAAAAATAAATGTAAGGACGTTGAGGCTGAACTTGAACAACTGAC AGCCTTCCAGACTCCTGAAGTGCAAGAAAAGATCGGTGATCTGGAAGCTGAGAGGACGCTTCAAGAAGGGATGCAGCGTG CTAGATCCGATGCGATGTGTAGGCATGCTAACGAAACGTTGTTAAGGGTGCTTAGTACCCAAAACCCGCAAGATTGGCAT CAAGAAGTAATGGATGCTGCGGATTTGCGTGAAGAGACGCTTGTTGCAACACTTTTGGATAGTGGTGCAAACCCGCTAGT TACAGCTGTACAAAGTGGTAACAATCCGGTTGCACAGAAAATATTGTCAGAAGCCAAAGAGTGTGCAAATGATGATCTAA AGGATAGTCTTATCAAAAATCAAGATGTTACTGGTCTTTTAAAGTGTGGCTTTGGATCATCTAGCTTATATGATGCTACT TATACTCCGCTCAGGGATCCTGGAAAGGATAAGGCAGAGTTTGAGCCTTCAGTAGCGGCCGTTGCACTTATACGTGAGGA AATGAATACTCTTAGGAAACAGGTTACTTCAAAGTTTTCTGGTAAGGGTGTTTTGCTTACGTATGCACACGCTATCTCCA TGGATACACCTGAAGCAGAGAATATAAAAGATAAATTGAATGGCTTTGAAGATGGAGATAAAGGGCTTCTTTCAGTGTGC AGCCCAGATGGGCATAACATAGGTACCCTCATTGCTGCCTTTGGTGGCATTGCACAATGGCAGGCCTACGCAAATAAGTA TAGCAAGCTAAAGTCTGCAGATAGTGGTGGTGTTTCTCCAGCGGTAAACGTGTCTGCTGATATAGGTACTCCCTTGCAGG TTGCGCTTTTGGCGAAGCACTTTGCAAACAATGGTCCGGAAAAGAGAAGGAGATCACTCCTCCTTGATTATTTGCTACAG 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Upstream 100 bases:
>100_bases TCCTTGAATTTACTGTTCCCTTCTGGACGGGGACTTGGTGGGCTGATTTTGATGTGTTGTTTTGTCGTGTTCAGGGGATT TTTTTGCTTTATAGTGAGCT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAACCATTGTGTACTGGCTGGCTCTGTGCACATCTTGGTTACCAGGAACGGAGTTTATTAATATTTTGGATGAGTGAACT GTAGAAAGTTTTCTTTTTAT
Product: ankyrin repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: Ankyrin Repeat-Containing Protein
Number of amino acids: Translated: 1921; Mature: 1921
Protein sequence:
>1921_residues MQGLYNKLLDAISCGNYSLFSQLTKRVDFDYSGSPYNGVSAFNAVVSAICIETPKDERDIADLLPVQTKESSTAIAGLRA RITGREEIFADLCKHLRVNSLINLADFGTGLTPVQVALAANNTTLINRLFANGALRSARCEIDRVSGCTLFMKALSCASG TASVEMLKAVARGTANIRQLTTTGKTDRQIVNDLCNYFRSLASNYEEALAVLMSSDGDGKNLYHRALEKNDPEALQWLNK LFLSEKPIIEEAEELLNNLSLSSKYKTQILQSVRYSNDKFTRIRKAIGAADVIFNMPCGELTPTEFIVSNIPSQDAGEFA RNAMIGNSDGSGYMSLAEIVDGGTDPADLIKLADAMVRCAPENVCARFFAGHSGSVLLKKLCDFYEKRDGSINEKAFIDF LIKIAFPSCLEFVTEGRINVEDILHGVVETRDPNRIAGIAALASPKSWEHENKAGCNPLELAIANEDPDCFAAILQSLEG ALVAASTQEELSAHRECIDRLLAGVGKTSGKAALHFVVDKAPQLIGMILNLSSDGEALLRVKDARGLLPVHHNANINAFY QPLYEKKFCKPITEATANQINDLKESVVLHKKIADGDKSVLQTLFLQDESNVYKCIDTAEGTKSILEVAAESGRPDLVKF ILLEHKKLQEKSKNKCKDVEAELEQLTAFQTPEVQEKIGDLEAERTLQEGMQRARSDAMCRHANETLLRVLSTQNPQDWH QEVMDAADLREETLVATLLDSGANPLVTAVQSGNNPVAQKILSEAKECANDDLKDSLIKNQDVTGLLKCGFGSSSLYDAT YTPLRDPGKDKAEFEPSVAAVALIREEMNTLRKQVTSKFSGKGVLLTYAHAISMDTPEAENIKDKLNGFEDGDKGLLSVC SPDGHNIGTLIAAFGGIAQWQAYANKYSKLKSADSGGVSPAVNVSADIGTPLQVALLAKHFANNGPEKRRRSLLLDYLLQ HHLDDVFIPNVNGENLLHTAVKCSDMEVLDLMLTHAIYTSTTTFSALNQRNGAGRTVLELAVYMDNASALKIIVESVLAR HGAGAASALLLESRLLHTAVATNNDAMLKLIASVQKMLNVITAPDQQLLLENQKDQQGRDPFVLAVEMGNLSAMKTMHRA GLQMNAESVKEAIAGLPASFDKGKLDGLIKLLKLDRAESAALLAEREKRLRKTLPPTPPLAVEPQSSEVRGEFIDQVRCI AESESELFKRQSFHAHNSLFSQFQQEYNKRATSLKEDITNDRIDIALANMRLHPDLVDSADNRGEIIEAVLASNNLELAK VVVQSSNKFIKNSSGDNLLNCIIKHASDGSLKELVAECINTGYSLAEVSRDGISAFQLLEERDPAFAAELRSAHEKESAK ITSLMNCLEDVLQSANTGAKSRASSVLLGEMNSFPKGYNFPVFSQIFSQILSDNTHGEHSLVTKRLGLLCYLFKGVSYFG EKSPENGDTVLHMLFKVLKSNPGAIVEVREALEAIIANKNFYPELLLEKNYYGFSALDVLAGVKGSWHLLDVIRRTFPNF DDKISLAKMLMFSVLEADLDETREFLERHQGSLLDINSEDNDGVSSLECAILRNDVPMCKLLLEYGAEINTVDLHGRNFL DKILDRSFETGVQPSPEMVSLLVSRGVDLMHSSGDLTTLERFEKFEQKKDVLRTRLAVLMDKPNLCQSDYTELRILMNAQ LHQDYCRILRDAVLERERLNEEVSKRAANALYVASGFNFVESIRPIVSAPFRLPKDKSSASLIGGVVCIKVDENASIDID ELFSSVKPYGVRCSDLSFNGGRDVVKVERKANGLTNYIPKSGCVIVSVDAKVKGNSEKVEIFISSDGSVSFGSKKNSAKL TSLFKEGKIDFTSSGVYVDGTPLEKAFGSAPKKAVVHEQLQGVARSLREAGASGAENVHASHRHVPTGGASRVTERGGDI T
Sequences:
>Translated_1921_residues MQGLYNKLLDAISCGNYSLFSQLTKRVDFDYSGSPYNGVSAFNAVVSAICIETPKDERDIADLLPVQTKESSTAIAGLRA RITGREEIFADLCKHLRVNSLINLADFGTGLTPVQVALAANNTTLINRLFANGALRSARCEIDRVSGCTLFMKALSCASG TASVEMLKAVARGTANIRQLTTTGKTDRQIVNDLCNYFRSLASNYEEALAVLMSSDGDGKNLYHRALEKNDPEALQWLNK LFLSEKPIIEEAEELLNNLSLSSKYKTQILQSVRYSNDKFTRIRKAIGAADVIFNMPCGELTPTEFIVSNIPSQDAGEFA RNAMIGNSDGSGYMSLAEIVDGGTDPADLIKLADAMVRCAPENVCARFFAGHSGSVLLKKLCDFYEKRDGSINEKAFIDF LIKIAFPSCLEFVTEGRINVEDILHGVVETRDPNRIAGIAALASPKSWEHENKAGCNPLELAIANEDPDCFAAILQSLEG ALVAASTQEELSAHRECIDRLLAGVGKTSGKAALHFVVDKAPQLIGMILNLSSDGEALLRVKDARGLLPVHHNANINAFY QPLYEKKFCKPITEATANQINDLKESVVLHKKIADGDKSVLQTLFLQDESNVYKCIDTAEGTKSILEVAAESGRPDLVKF ILLEHKKLQEKSKNKCKDVEAELEQLTAFQTPEVQEKIGDLEAERTLQEGMQRARSDAMCRHANETLLRVLSTQNPQDWH QEVMDAADLREETLVATLLDSGANPLVTAVQSGNNPVAQKILSEAKECANDDLKDSLIKNQDVTGLLKCGFGSSSLYDAT YTPLRDPGKDKAEFEPSVAAVALIREEMNTLRKQVTSKFSGKGVLLTYAHAISMDTPEAENIKDKLNGFEDGDKGLLSVC SPDGHNIGTLIAAFGGIAQWQAYANKYSKLKSADSGGVSPAVNVSADIGTPLQVALLAKHFANNGPEKRRRSLLLDYLLQ HHLDDVFIPNVNGENLLHTAVKCSDMEVLDLMLTHAIYTSTTTFSALNQRNGAGRTVLELAVYMDNASALKIIVESVLAR HGAGAASALLLESRLLHTAVATNNDAMLKLIASVQKMLNVITAPDQQLLLENQKDQQGRDPFVLAVEMGNLSAMKTMHRA GLQMNAESVKEAIAGLPASFDKGKLDGLIKLLKLDRAESAALLAEREKRLRKTLPPTPPLAVEPQSSEVRGEFIDQVRCI AESESELFKRQSFHAHNSLFSQFQQEYNKRATSLKEDITNDRIDIALANMRLHPDLVDSADNRGEIIEAVLASNNLELAK VVVQSSNKFIKNSSGDNLLNCIIKHASDGSLKELVAECINTGYSLAEVSRDGISAFQLLEERDPAFAAELRSAHEKESAK ITSLMNCLEDVLQSANTGAKSRASSVLLGEMNSFPKGYNFPVFSQIFSQILSDNTHGEHSLVTKRLGLLCYLFKGVSYFG EKSPENGDTVLHMLFKVLKSNPGAIVEVREALEAIIANKNFYPELLLEKNYYGFSALDVLAGVKGSWHLLDVIRRTFPNF DDKISLAKMLMFSVLEADLDETREFLERHQGSLLDINSEDNDGVSSLECAILRNDVPMCKLLLEYGAEINTVDLHGRNFL DKILDRSFETGVQPSPEMVSLLVSRGVDLMHSSGDLTTLERFEKFEQKKDVLRTRLAVLMDKPNLCQSDYTELRILMNAQ LHQDYCRILRDAVLERERLNEEVSKRAANALYVASGFNFVESIRPIVSAPFRLPKDKSSASLIGGVVCIKVDENASIDID ELFSSVKPYGVRCSDLSFNGGRDVVKVERKANGLTNYIPKSGCVIVSVDAKVKGNSEKVEIFISSDGSVSFGSKKNSAKL TSLFKEGKIDFTSSGVYVDGTPLEKAFGSAPKKAVVHEQLQGVARSLREAGASGAENVHASHRHVPTGGASRVTERGGDI T >Mature_1921_residues MQGLYNKLLDAISCGNYSLFSQLTKRVDFDYSGSPYNGVSAFNAVVSAICIETPKDERDIADLLPVQTKESSTAIAGLRA RITGREEIFADLCKHLRVNSLINLADFGTGLTPVQVALAANNTTLINRLFANGALRSARCEIDRVSGCTLFMKALSCASG TASVEMLKAVARGTANIRQLTTTGKTDRQIVNDLCNYFRSLASNYEEALAVLMSSDGDGKNLYHRALEKNDPEALQWLNK LFLSEKPIIEEAEELLNNLSLSSKYKTQILQSVRYSNDKFTRIRKAIGAADVIFNMPCGELTPTEFIVSNIPSQDAGEFA RNAMIGNSDGSGYMSLAEIVDGGTDPADLIKLADAMVRCAPENVCARFFAGHSGSVLLKKLCDFYEKRDGSINEKAFIDF LIKIAFPSCLEFVTEGRINVEDILHGVVETRDPNRIAGIAALASPKSWEHENKAGCNPLELAIANEDPDCFAAILQSLEG ALVAASTQEELSAHRECIDRLLAGVGKTSGKAALHFVVDKAPQLIGMILNLSSDGEALLRVKDARGLLPVHHNANINAFY QPLYEKKFCKPITEATANQINDLKESVVLHKKIADGDKSVLQTLFLQDESNVYKCIDTAEGTKSILEVAAESGRPDLVKF ILLEHKKLQEKSKNKCKDVEAELEQLTAFQTPEVQEKIGDLEAERTLQEGMQRARSDAMCRHANETLLRVLSTQNPQDWH QEVMDAADLREETLVATLLDSGANPLVTAVQSGNNPVAQKILSEAKECANDDLKDSLIKNQDVTGLLKCGFGSSSLYDAT YTPLRDPGKDKAEFEPSVAAVALIREEMNTLRKQVTSKFSGKGVLLTYAHAISMDTPEAENIKDKLNGFEDGDKGLLSVC SPDGHNIGTLIAAFGGIAQWQAYANKYSKLKSADSGGVSPAVNVSADIGTPLQVALLAKHFANNGPEKRRRSLLLDYLLQ HHLDDVFIPNVNGENLLHTAVKCSDMEVLDLMLTHAIYTSTTTFSALNQRNGAGRTVLELAVYMDNASALKIIVESVLAR HGAGAASALLLESRLLHTAVATNNDAMLKLIASVQKMLNVITAPDQQLLLENQKDQQGRDPFVLAVEMGNLSAMKTMHRA GLQMNAESVKEAIAGLPASFDKGKLDGLIKLLKLDRAESAALLAEREKRLRKTLPPTPPLAVEPQSSEVRGEFIDQVRCI AESESELFKRQSFHAHNSLFSQFQQEYNKRATSLKEDITNDRIDIALANMRLHPDLVDSADNRGEIIEAVLASNNLELAK VVVQSSNKFIKNSSGDNLLNCIIKHASDGSLKELVAECINTGYSLAEVSRDGISAFQLLEERDPAFAAELRSAHEKESAK ITSLMNCLEDVLQSANTGAKSRASSVLLGEMNSFPKGYNFPVFSQIFSQILSDNTHGEHSLVTKRLGLLCYLFKGVSYFG EKSPENGDTVLHMLFKVLKSNPGAIVEVREALEAIIANKNFYPELLLEKNYYGFSALDVLAGVKGSWHLLDVIRRTFPNF DDKISLAKMLMFSVLEADLDETREFLERHQGSLLDINSEDNDGVSSLECAILRNDVPMCKLLLEYGAEINTVDLHGRNFL DKILDRSFETGVQPSPEMVSLLVSRGVDLMHSSGDLTTLERFEKFEQKKDVLRTRLAVLMDKPNLCQSDYTELRILMNAQ LHQDYCRILRDAVLERERLNEEVSKRAANALYVASGFNFVESIRPIVSAPFRLPKDKSSASLIGGVVCIKVDENASIDID ELFSSVKPYGVRCSDLSFNGGRDVVKVERKANGLTNYIPKSGCVIVSVDAKVKGNSEKVEIFISSDGSVSFGSKKNSAKL TSLFKEGKIDFTSSGVYVDGTPLEKAFGSAPKKAVVHEQLQGVARSLREAGASGAENVHASHRHVPTGGASRVTERGGDI T
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 210149; Mature: 210149
Theoretical pI: Translated: 5.64; Mature: 5.64
Prosite motif: PS50088 ANK_REPEAT ; PS50297 ANK_REP_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQGLYNKLLDAISCGNYSLFSQLTKRVDFDYSGSPYNGVSAFNAVVSAICIETPKDERDI CCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH ADLLPVQTKESSTAIAGLRARITGREEIFADLCKHLRVNSLINLADFGTGLTPVQVALAA HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEEEEEC NNTTLINRLFANGALRSARCEIDRVSGCTLFMKALSCASGTASVEMLKAVARGTANIRQL CCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH TTTGKTDRQIVNDLCNYFRSLASNYEEALAVLMSSDGDGKNLYHRALEKNDPEALQWLNK HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH LFLSEKPIIEEAEELLNNLSLSSKYKTQILQSVRYSNDKFTRIRKAIGAADVIFNMPCGE HHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC LTPTEFIVSNIPSQDAGEFARNAMIGNSDGSGYMSLAEIVDGGTDPADLIKLADAMVRCA CCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC PENVCARFFAGHSGSVLLKKLCDFYEKRDGSINEKAFIDFLIKIAFPSCLEFVTEGRINV CHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH EDILHGVVETRDPNRIAGIAALASPKSWEHENKAGCNPLELAIANEDPDCFAAILQSLEG 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