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The map label for this gene is 88607935

Identifier: 88607935

GI number: 88607935

Start: 1213276

End: 1218699

Strand: Reverse

Name: 88607935

Synonym: APH_1153

Alternate gene names: NA

Gene position: 1218699-1213276 (Counterclockwise)

Preceding gene: 88606845

Following gene: 88607101

Centisome position: 82.83

GC content: 41.24

Gene sequence:

>5424_bases
ATGTACGTAAGAAATACAAGCAAGCATCTGTCTTCAATTCCCAGGGTAAAGCTTCTTAAATCACTGCTCCTTTTTTTCTG
TGTCATTTTAATGAATGTGCCAAATAGAGTAACAGGGGCGATATCAGCGGGGCTGACCATTGATGGCCGTTTCGAGAAGC
TAGATAACAAAAATGGTGATTCTGGCGGTATGTTCGAAGTGCCACGTATAGAAGCTGGTATGGGTAGCAACAGGATGCGT
TTTTGGTATTCATTAGAAAGATGGGAGTATCAATCACAGGACATTGGTACTGCGGTTGCATACGTTAAGCGTGATTCTGA
TGGGCAGCTAAAACTGTGTGCATGTGGGAGGTATACCCAGATAATCCCTGTTGAGATGCAGAACGAAGCGGCGAGAATGC
GTCTGGAGAAATACAATGAGATTACCAATTATGCAGACTTAAGTTTTGATAAAAAAATCGAGAAGGAATGCTTATATGAT
CCGGGCGTCTTAGAATTTCAAGTTTATCACGGTTGTGTCCCAATCGATTCTTCCACTCCTGCTGTTCCAGGGTTTTGTAA
TGTCTTTGCTAGAGATGTATACATGAAGGCTCTACCTATGGAGTTTGGTAAGCAGTCTTATTTTCTGCCGGGATTAAGGG
TATTGCGTGTAAAAGATCCAAGTTCTGGACAGACGGATCAGAAGATCAGTGTTTATATTGGTAATTATGATGGAGCGACG
GGGAGTGTAACAGGTATTAATAAGTATGTTAAGTGCGAGAAAAACTATTTGAGCAAAGATCCTCAATCGTGCGCCGTTAG
CGTTAGTAATGCTTCTGATTCTGGATATTCAGTGACGCAATCAGGTGACGGAGTGTGCTTAAGCTACAACTCTCAAGGAC
GGAGATCTGTCGAGTGCGTGCCATCTCCAGAGCTTCCGGATCCTGCTGTTAGTAATTCAGATCAAGGTTTAGGTTTAAGA
ATACGGTTTTCTGATTGTTACGATAAAAAAGATAACAAGCCAACCAAATACTGCGACTTTACCATGATGCCTGGGGAGAG
AGATAAGGAATTTGGTTTTTCGGTTGTAAAGCCCAAGTTGGACAAGGACAAGTATGCGTTTGAAGAAAAAAAGAAGTGTT
TGGACAGGGATGGTAATGTCTTGAGTGACATACATAGCGGTGATTGTGCGCATGTGCAAAAGTTCTACATTGAAGATCCA
AGTAGCAATGTAACTTGTTTTACTCGTCCAGATAATGCAACAAAGAAATTCTATGTCAAAAGAGGTGATAGATATCATTG
GATTAGCGAGTTAGAAAAAGTTTTGGTCGCAAGTAGCTTTCAACCCAAGCAGAAAAAATATGCTCAGTGCCCAGATAGTC
AGTCCATAGATCTATCAAAGCTGAGTCAAGCAGAGATAGATAAAATGGAGAAAGTAGGTCGCGGTACCTATGTTATGTCT
TCCAAAGTTAATGACTTCCGTGGTGTCCAAGTATTATGTAGGGATAATATCTCATATAAATATGACAACTATAGGGCATT
TCCTCGCAAAGATTTTTGCAGTGCGGATAGTAGTGCGGGTGTGTTTGCGGGGCACTGTAAAACCCGCTACAAGAGTTTAG
ATAATTTTCAGCCCATATTCTTGAAAGATAGTGACTCAGTTCCACCTGAGTATGTTATTCCACTAAATCCTATATTTCAG
GGTATGTGTGTTAGCAATTTTCCGTCTCATGAATACGTGTATGGGGAACAAGAGGGTGACATAGTCAAGAAAGGTGACGG
GTATGTAGAGTATGTTTTAGAAATTGGAGAAAAAAACGCTACATGTGACTTTTTGAAAATCGAAATGTGGGGTGCTGGTG
CGGCTGGATCGTTGTCTTCTGGAGCTGCAGGTAAGCAAGGTGAATACGTGATGGGGCTGCTAAAGCCTGATCTAAAGAAT
GTACAATACCTTTCGATAAAGGTGGGGAAAGGTGGAATAGCTAGTGCAGCACATGATGATGCGAAGAAATCCCTGGGTTC
CAATACACTTGTATCTTTGTGTGATGATTTTAACGCTATGACATGCACTATGGAATTAGGAGCAAGAGGTGGAGGTCAAT
CGGAGAAAATAGCTACTAAGGGTACGTCTACTCTTATGCATTACAGAGTTTCAGAAGGGCTTACAGAAGCTATTGGGCAA
AGCAAGGTATACACACCATATCACGGTCCATATCAATCTTCGGGGGTGCTGGATGCTGATGAGGCCGGGTGCATCAGGGA
TCCTAATGATAAGAGTAATAACACTCAAGTAGTAGCTCCTAGCAGTTTTCCAGGAACAGGTGGATGTGCAAGGTCAGATA
TAAATGTTGTGCAGGATGGTGCACATGGGCGTGTTAAGATTACGTGTGAGAAATGGTCTGGTTCTGTAGGAAACATCAAA
AAATGGCGTGCAAATTTGGTGTGTGACCAAAAGACGTTGAACGCATTGAAGGCGCTAAGTCAGGAAGCGGATAGTGTTGA
TGTTAGTGATGCAACAAAAAAATTCTTTCAAGAAATATCTACAGAGCAATTTTGCAATTACATTGCTGACTCACCTTTAT
TTTCGAATACAGTAAGGCGACTAGCGAACATGGAGCATTTTTCTACATGGTATATAATAGAAGCTCAAGCACGTATAATA
TATGCGCTTTTCCATCTTGAAGAAGCACTGAACCGCGAGAAGAAAGTTTTAAAGTATGAGGGAATTAAACCATCCAATAT
AGCTGATAGCCAAAAACGTGATTATAAGAAAGATAATATCTTAGAGAGAAAGGAAATATTCTTGTCGAGTTTCAGGGAGT
TGCTGTTTAAGAGCAAAGTGTCCGTGGTCGATCAACGCTATGAGCAGCTATGGAAAGACCTGAGTATTGAGGCTAAGAAG
CAAGGTAAGCAGCTTCATGGTATTTTCGAAATCCTGAGTCGTAAAGGAATCCGAAATATAGAGAACGGTAGCCAAATGTT
GGGGATTTATTTGGAGAGCCTTCTCGATATTTTCCGTGGGCATAAGCCTGTTTGGGCTATAAGAGACATTGTGGATTACA
ATTTGATGGCTTTACTGCGAGGTGAGAGAGAAGTATTGGAAGCGTATGAGGAGGAGTATGCCTCAGCGCAAGCTATGAGT
CCGAGCAGTGCCCACTACATGAAAGTTTTCGAAAAAGAGTTAAGGGAGGTGATAGATAGTGCTCAGTGTGTTTCAAATGG
AGGAAGTACTTCTGAAAGAGGATGGCAAGAGCTTCGAGATGTTTTAAGTGATCACAACAAGGGAAAATGGTTGCATCTTG
GGCAGCTTGTTGAAGTCATGAATAGGAATCGGTCTAAGAGTTTTGAAAATGAGAAGTTTCTTAAAACCTACCTGAATGAG
ATTGCAAATATTATTGAGAAAGGTAAATCAACTAGAGATGCAGATGAGCTAGTATCAGAATGCACAGAAAGATTTCTAAG
AACACTGACGTATCCTGCAGATGTATACAAGGAATATACGGCGGAGTATGCTATAAAAGTCAAAGATGCAAGTTCGTGGG
ACGCCATCGCTGCTCTTCAACGAGACTTAGTTAAGATCATTAATGATGCAAGATCCTCGAAGCTTGATAAAAGCGTGAGC
AGTGATGATAGATTGAGGAGTATGCTTGCAGCTTTAGAGAAACACACTAAGAATGGTTGGGAGAATATCAATGGGCTTGT
TGGGTCCATGATAAAGCATGATCATAAGTATGAAACTGAGAAAAGGTTCTTAGAGACATATGTTGGAAAGCTTTTAAGCG
CTGTTGAAAATAAGGAAAAAGATGTAGAAACTGACGCATGGGGGAAAAGGTATACGGAAAGGTTTTTACAGGTTCTAGAA
GGTCACTACTCAAAGGTGATGCAAGCATACACAGAAGCGTATGATAATAAAACAGCTGGTAAGGCAGGGGCTGGTGCGCA
GAAAGCGCGGGAAGTTGTAAAACGTGAATTAGAGGATTTGCTCAGTGTTGTATCGGGAGAGCAATTCAAAAAGATTTTGG
CTGCATTGACTCAAAAAACCAAGGGAAAGCACATCAGTGATCTTTTTAAAGTTATGCAACGTGATGGGCTTAAGGATTCT
GGGGACAGGAAATTTCTTGAAGGTAACCTCAAAAGGCTTTTAGGAGCTTTGGACAAAGGAGAAAAACGTCCGAAGTATGG
TAAAAGGGATGTGGAAGAATTATTACGGGTTTTACAGAAGAATTATCCAGAAATCTTAAAAGCATTCGAAAAAGAGCATG
CTCCAAAAAGTGGCTCTGATGCGCAAGACACTATCGAATTATTGAGAAGTGAACTGAGTGAGTTACTTGGAGTTCCCTCT
ATTGAAGATCTTCTTGAGACTTTACGTGATTTCACTGAGGGAAGATGGTCCAATGCTAATAGGCTTTTCTCATCCATGCT
TTCGGAGGCTGGAAAGTATAATAACGAGAAAGAGTTCCTAAGGTCATATCTTGGCAAGATTGTAGATATCGTTGAGGGAA
GAAAGTATGGTATTGCTGCAGGTTATGATGTAATAGCGCAGACGGACCAGTTCTCTAACGTGTTGCAGCATCATTATCCG
CAAGCGATGCGGATGTATAATGTGTGGTGCAATAGGGGTGCTGGGGGTGATTCAAGATCAAGTATGAAAAGCTGTTTTGA
AGCTTACGAGCGAGAACTGGGTGAGATCTTCCGTTGGTTATTAACCGAGAGATTCAAAAAGCTACTGGACCTATTGATAG
CAAAAACCAAGGGGAAGCACTTAGATGTTCTTTTTTCGCTCATGAAGGAGAGCAGGATTAGTGAGCCTGTAGTTGTAGAG
TTTTACGTGAATACGCTAGGCAAGCTTCTCAGAGTTTTGGAAGGAGAACAGTCGGTGCAATATACGGAGCAGGACATAGA
AGAATTTATCAAGATGATGCAGAATTCTTGTTGTAATGCAATATTGCAGGAATACGCAAATAATTATGTTAAGAAACATG
GGTCTTTTAAACGCAGTGACTCGCTTTATGGGGGGGCCGACACTACAGAATTTTTAGCGCGAGCATTTAGGAGGGTGGCG
AATAAGAGGTCATTTGAAGATCTTGTGTCTGATGTGTGTGACTACACGTATGGAGGTGGATGGGCTTACTATGTTTTTCA
GATTATGGAAAAAGTGAATGTTACGCAGGCTGCGAAAAAAAAAGAAAAAACAAACAATCTTTACTATAGTTGGTTCACGC
AGGACTATGTGACCAGGCTTGTAAATGCCATTGAGGATGATACGGCAGCAAAAGATAAAAGGTATGTTATTGAGCAAGCG
GAGCGGTTTCTTACAAAGCTCTCATTACACGATGGTTTTTTTAGGCATGGTATAATTGCCGTCCACAAAGATTTGCCAGA
ATCTAATACTGTCCTTTTTGAGGAACACCTTAAAAAGGTTGTTAAGACAAAGCCGGGAGTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAAGTTGATATTAATATTTTTTTAAGTAAATTCGTATGAACTTGTGATTATTGCCCGAAATATGCTAATACACTTTACA
CAGTAGCTGGTCGTGTCAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAATATTGAATATGATCATTATTGCATTTATGCGCCCACTTATTAGGTATTAGGTGATCTCGCGTATTATTATCGGT
GTTTACCACAAGTTTTATTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1807; Mature: 1807

Protein sequence:

>1807_residues
MYVRNTSKHLSSIPRVKLLKSLLLFFCVILMNVPNRVTGAISAGLTIDGRFEKLDNKNGDSGGMFEVPRIEAGMGSNRMR
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Sequences:

>Translated_1807_residues
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>Mature_1807_residues
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Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 204435; Mature: 204435

Theoretical pI: Translated: 7.97; Mature: 7.97

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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SGGMFEVPRIEAGMGSNRMRFWYSLERWEYQSQDIGTAVAYVKRDSDGQLKLCACGRYTQ
CCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEECCCCCE
IIPVEMQNEAARMRLEKYNEITNYADLSFDKKIEKECLYDPGVLEFQVYHGCVPIDSSTP
EEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECEEECCCCCC
AVPGFCNVFARDVYMKALPMEFGKQSYFLPGLRVLRVKDPSSGQTDQKISVYIGNYDGAT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
GSVTGINKYVKCEKNYLSKDPQSCAVSVSNASDSGYSVTQSGDGVCLSYNSQGRRSVECV
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEECCCCCCCCEEECCCCCEEEEECCCCCCEEECC
PSPELPDPAVSNSDQGLGLRIRFSDCYDKKDNKPTKYCDFTMMPGERDKEFGFSVVKPKL
CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCC
DKDKYAFEEKKKCLDRDGNVLSDIHSGDCAHVQKFYIEDPSSNVTCFTRPDNATKKFYVK
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RGDRYHWISELEKVLVASSFQPKQKKYAQCPDSQSIDLSKLSQAEIDKMEKVGRGTYVMS
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
SKVNDFRGVQVLCRDNISYKYDNYRAFPRKDFCSADSSAGVFAGHCKTRYKSLDNFQPIF
CCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCEECCCCHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCEE
LKDSDSVPPEYVIPLNPIFQGMCVSNFPSHEYVYGEQEGDIVKKGDGYVEYVLEIGEKNA
EECCCCCCCCEEECCCHHHHCCHHCCCCCCCEEECCCCCCEEECCCCHHHHHHHHCCCCC
TCDFLKIEMWGAGAAGSLSSGAAGKQGEYVMGLLKPDLKNVQYLSIKVGKGGIASAAHDD
CEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHH
AKKSLGSNTLVSLCDDFNAMTCTMELGARGGGQSEKIATKGTSTLMHYRVSEGLTEAIGQ
HHHHCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SKVYTPYHGPYQSSGVLDADEAGCIRDPNDKSNNTQVVAPSSFPGTGGCARSDINVVQDG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHCCC
AHGRVKITCEKWSGSVGNIKKWRANLVCDQKTLNALKALSQEADSVDVSDATKKFFQEIS
CCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHC
TEQFCNYIADSPLFSNTVRRLANMEHFSTWYIIEAQARIIYALFHLEEALNREKKVLKYE
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GIKPSNIADSQKRDYKKDNILERKEIFLSSFRELLFKSKVSVVDQRYEQLWKDLSIEAKK
CCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
QGKQLHGIFEILSRKGIRNIENGSQMLGIYLESLLDIFRGHKPVWAIRDIVDYNLMALLR
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GEREVLEAYEEEYASAQAMSPSSAHYMKVFEKELREVIDSAQCVSNGGSTSERGWQELRD
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
VLSDHNKGKWLHLGQLVEVMNRNRSKSFENEKFLKTYLNEIANIIEKGKSTRDADELVSE
HHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
CTERFLRTLTYPADVYKEYTAEYAIKVKDASSWDAIAALQRDLVKIINDARSSKLDKSVS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SDDRLRSMLAALEKHTKNGWENINGLVGSMIKHDHKYETEKRFLETYVGKLLSAVENKEK
CHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DVETDAWGKRYTERFLQVLEGHYSKVMQAYTEAYDNKTAGKAGAGAQKAREVVKRELEDL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LSVVSGEQFKKILAALTQKTKGKHISDLFKVMQRDGLKDSGDRKFLEGNLKRLLGALDKG
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EKRPKYGKRDVEELLRVLQKNYPEILKAFEKEHAPKSGSDAQDTIELLRSELSELLGVPS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IEDLLETLRDFTEGRWSNANRLFSSMLSEAGKYNNEKEFLRSYLGKIVDIVEGRKYGIAA
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
GYDVIAQTDQFSNVLQHHYPQAMRMYNVWCNRGAGGDSRSSMKSCFEAYERELGEIFRWL
CCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTERFKKLLDLLIAKTKGKHLDVLFSLMKESRISEPVVVEFYVNTLGKLLRVLEGEQSVQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
YTEQDIEEFIKMMQNSCCNAILQEYANNYVKKHGSFKRSDSLYGGADTTEFLARAFRRVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
NKRSFEDLVSDVCDYTYGGGWAYYVFQIMEKVNVTQAAKKKEKTNNLYYSWFTQDYVTRL
CCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHH
VNAIEDDTAAKDKRYVIEQAERFLTKLSLHDGFFRHGIIAVHKDLPESNTVLFEEHLKKV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHH
VKTKPGV
HHCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEECCCCCE
IIPVEMQNEAARMRLEKYNEITNYADLSFDKKIEKECLYDPGVLEFQVYHGCVPIDSSTP
EEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECEEECCCCCC
AVPGFCNVFARDVYMKALPMEFGKQSYFLPGLRVLRVKDPSSGQTDQKISVYIGNYDGAT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
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SKVNDFRGVQVLCRDNISYKYDNYRAFPRKDFCSADSSAGVFAGHCKTRYKSLDNFQPIF
CCCCCCCCEEEEEECCCCEEECCEECCCCHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCEE
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