| Definition | Anaplasma phagocytophilum HZ, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007797 |
| Length | 1,471,282 |
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The map label for this gene is 88607809
Identifier: 88607809
GI number: 88607809
Start: 765105
End: 768680
Strand: Reverse
Name: 88607809
Synonym: APH_0724
Alternate gene names: NA
Gene position: 768680-765105 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88607539
Following gene: 88606957
Centisome position: 52.25
GC content: 40.07
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1191; Mature: 1190
Protein sequence:
>1191_residues MGFEKSMRDEVGKRLVSGKARTNIGREFASWVESTGYTRSRNTLGILIVSTMSIGCAFSYYASRAKAVIGVTVFSTYAII FLAMSTAFLVALAVVLRDKEDLKEIERLNEKVKSGDIAFIAIEEEKTSTAHTGLSKEEVEESSWEIEADSDADEMTYTSG DEWGAKFCFAGDRLDEFIEHANSSPEKNLALYTYPLAKGMELVKSGFSGEEDMHTPSPFKGALLSRLKIDLMDRGQLLRI ILGEYDSALGFKRDGCAFGFYLDYHLNRLEKRIYLLGFIGRGGRSCRVETDDEVHLRELQRLFGETGLLKDFDENRAYFE NMRGCSNLAKSHVGLIDYLINNIPENSTSGLSGTSVDALRSVCALSRYGNLFLEETSKDKSGSWFPKKMQEKNELSYGDA RRVNTLQSPFVRLITAKFALDRGFRCALLSSIFCAISISEEGHFTLDTDNVAYLCRFVPWLMQTMKIFVEAANFRGSSIG LRGEEAIHANLSRVKCFKEAVSYADEGVLETLQSYVDERIMRDRKNPFIAQDPGAYIFLEYQALWRAAKNEEYSLDSFRT DSVQRSADDLEIALCLLEKEHEINESRVAWFMQEFTASLVASELLTVERRMRCRFNEKMDYSIDGLIKFVKSGSIQPDDT ERLIAWSLDGIWKEDREWKSRALFSDALKRECIIDDYVPSEKIKVDIEGLRSGTKATRGDSLRRTLQASTMGEGDDLYAS SSLGAIDITEEHRKYEEDLRSLPSQSTIDKQKRGETRDDISQPLQGSTCVSYVMQDMGALFGESFLLGSCIKHCRRVVER YIERGFTLQEAIVKTGFLYDFHTHRVKWEQMRQSGDLDCDDKKWIGNALEALDQGKYGGQSSLLCSDSIPNIDIRNNILG VHTVFATSLVDKVMAEGMKALPIKESVIHFLISPTFCELLMISILGRNTSLAAVKYSNDVGLYEYMDAHVVDALCTYMET LFPYKCAEDNTVKRIAIDPRRKIIIQTALGVTLRNTIDSIELNPHNKSIIEINKMTEGEDSDLLRIFIFLRVGMDGGRVS EILSSYKQFSSRSSYKEHLDELVDEVIMDKGGSDLLCDAMMYAMGLSLGRAIKREGIKTIDEFRRYTAGIDKIMVDYCML DGEEGAFFKLLANSVGFNGDCFLYSEDKSQDDMILGIFRNESYGNAAIEGNPPSSLVLQDSKGLQDKSWQV
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 134309; Mature: 134178
Theoretical pI: Translated: 4.92; Mature: 4.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.0 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 2.0 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGFEKSMRDEVGKRLVSGKARTNIGREFASWVESTGYTRSRNTLGILIVSTMSIGCAFSY CCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHH YASRAKAVIGVTVFSTYAIIFLAMSTAFLVALAVVLRDKEDLKEIERLNEKVKSGDIAFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE AIEEEKTSTAHTGLSKEEVEESSWEIEADSDADEMTYTSGDEWGAKFCFAGDRLDEFIEH EEECCCCCHHHCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCCCEECCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHH ANSSPEKNLALYTYPLAKGMELVKSGFSGEEDMHTPSPFKGALLSRLKIDLMDRGQLLRI CCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ILGEYDSALGFKRDGCAFGFYLDYHLNRLEKRIYLLGFIGRGGRSCRVETDDEVHLRELQ HHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHH RLFGETGLLKDFDENRAYFENMRGCSNLAKSHVGLIDYLINNIPENSTSGLSGTSVDALR HHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHH SVCALSRYGNLFLEETSKDKSGSWFPKKMQEKNELSYGDARRVNTLQSPFVRLITAKFAL HHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DRGFRCALLSSIFCAISISEEGHFTLDTDNVAYLCRFVPWLMQTMKIFVEAANFRGSSIG CCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC LRGEEAIHANLSRVKCFKEAVSYADEGVLETLQSYVDERIMRDRKNPFIAQDPGAYIFLE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEEEE YQALWRAAKNEEYSLDSFRTDSVQRSADDLEIALCLLEKEHEINESRVAWFMQEFTASLV HHHHHHHHCCCCCCCCHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ASELLTVERRMRCRFNEKMDYSIDGLIKFVKSGSIQPDDTERLIAWSLDGIWKEDREWKS HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHH RALFSDALKRECIIDDYVPSEKIKVDIEGLRSGTKATRGDSLRRTLQASTMGEGDDLYAS HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEC SSLGAIDITEEHRKYEEDLRSLPSQSTIDKQKRGETRDDISQPLQGSTCVSYVMQDMGAL CCCCEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FGESFLLGSCIKHCRRVVERYIERGFTLQEAIVKTGFLYDFHTHRVKWEQMRQSGDLDCD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DKKWIGNALEALDQGKYGGQSSLLCSDSIPNIDIRNNILGVHTVFATSLVDKVMAEGMKA CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC LPIKESVIHFLISPTFCELLMISILGRNTSLAAVKYSNDVGLYEYMDAHVVDALCTYMET CCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFPYKCAEDNTVKRIAIDPRRKIIIQTALGVTLRNTIDSIELNPHNKSIIEINKMTEGED HCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHEEEHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCEEEEECCCCCCC SDLLRIFIFLRVGMDGGRVSEILSSYKQFSSRSSYKEHLDELVDEVIMDKGGSDLLCDAM CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH MYAMGLSLGRAIKREGIKTIDEFRRYTAGIDKIMVDYCMLDGEEGAFFKLLANSVGFNGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC CFLYSEDKSQDDMILGIFRNESYGNAAIEGNPPSSLVLQDSKGLQDKSWQV EEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure GFEKSMRDEVGKRLVSGKARTNIGREFASWVESTGYTRSRNTLGILIVSTMSIGCAFSY CCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHH YASRAKAVIGVTVFSTYAIIFLAMSTAFLVALAVVLRDKEDLKEIERLNEKVKSGDIAFI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE AIEEEKTSTAHTGLSKEEVEESSWEIEADSDADEMTYTSGDEWGAKFCFAGDRLDEFIEH EEECCCCCHHHCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCCCEECCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHH ANSSPEKNLALYTYPLAKGMELVKSGFSGEEDMHTPSPFKGALLSRLKIDLMDRGQLLRI CCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ILGEYDSALGFKRDGCAFGFYLDYHLNRLEKRIYLLGFIGRGGRSCRVETDDEVHLRELQ HHHHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHH RLFGETGLLKDFDENRAYFENMRGCSNLAKSHVGLIDYLINNIPENSTSGLSGTSVDALR HHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHH SVCALSRYGNLFLEETSKDKSGSWFPKKMQEKNELSYGDARRVNTLQSPFVRLITAKFAL HHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DRGFRCALLSSIFCAISISEEGHFTLDTDNVAYLCRFVPWLMQTMKIFVEAANFRGSSIG CCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC LRGEEAIHANLSRVKCFKEAVSYADEGVLETLQSYVDERIMRDRKNPFIAQDPGAYIFLE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCEEEEE YQALWRAAKNEEYSLDSFRTDSVQRSADDLEIALCLLEKEHEINESRVAWFMQEFTASLV HHHHHHHHCCCCCCCCHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ASELLTVERRMRCRFNEKMDYSIDGLIKFVKSGSIQPDDTERLIAWSLDGIWKEDREWKS HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHH RALFSDALKRECIIDDYVPSEKIKVDIEGLRSGTKATRGDSLRRTLQASTMGEGDDLYAS HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEC SSLGAIDITEEHRKYEEDLRSLPSQSTIDKQKRGETRDDISQPLQGSTCVSYVMQDMGAL CCCCEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH FGESFLLGSCIKHCRRVVERYIERGFTLQEAIVKTGFLYDFHTHRVKWEQMRQSGDLDCD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DKKWIGNALEALDQGKYGGQSSLLCSDSIPNIDIRNNILGVHTVFATSLVDKVMAEGMKA CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC LPIKESVIHFLISPTFCELLMISILGRNTSLAAVKYSNDVGLYEYMDAHVVDALCTYMET CCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFPYKCAEDNTVKRIAIDPRRKIIIQTALGVTLRNTIDSIELNPHNKSIIEINKMTEGED HCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHEEEHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCEEEEECCCCCCC SDLLRIFIFLRVGMDGGRVSEILSSYKQFSSRSSYKEHLDELVDEVIMDKGGSDLLCDAM CHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH MYAMGLSLGRAIKREGIKTIDEFRRYTAGIDKIMVDYCMLDGEEGAFFKLLANSVGFNGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC CFLYSEDKSQDDMILGIFRNESYGNAAIEGNPPSSLVLQDSKGLQDKSWQV EEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA