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The map label for this gene is 84489717

Identifier: 84489717

GI number: 84489717

Start: 1050569

End: 1052119

Strand: Direct

Name: 84489717

Synonym: Msp_0918

Alternate gene names: NA

Gene position: 1050569-1052119 (Clockwise)

Preceding gene: 84489714

Following gene: 84489722

Centisome position: 59.44

GC content: 31.01

Gene sequence:

>1551_bases
TTGACTGATAAAAAATCCAAACTAGCCTCAGGTAGTATTATTATTCTACTTGGTTCCATAATTCTCAGATTAGGCGGATT
TATTTATAGATTTATTTTAAGTAGACTTTTAACTACAACAGGATATGGTATAGTAGGATTAACATTACCATTTCAAAATA
TTTTTATTATAGGAGCATCAGGAGGAGTACCTCCAGCAATAGCAAAATATGTGTCAGAATATAAGGCAGTTGATGATAAG
AAGATGGTTCATCAAATCATTATAACTGGTTTGAAATTAATGATATTCATGGCACTACTAGCAGCAGTTATAATGTTTTT
AATATCAGAACCTATAGCAATAGGAATATGGCACAAACCCGAAGCATTACTGCCATTACGATTAGTTGCACTAATAATAC
CATTTAGTATAATTGTAGGAGCACTAAGAGGAGTTTTCCAAGGATTTTATCAAATGACTTACATATTCTATAGTAAGTTT
ATTGAACAAATATTCACATTGATTTTTGCCATAATACTAGTACTTATTGGATGGTATGCAGCAGGAGCAGTTCTTGGTAC
TGCAATAGGATTTTTAATGGCACTACTTGGATCATATTATCTTTTTAAAACTGATATGAAGAAAAACTATTTAAATGGAA
ACTATGAACCAATAACATTTAAGGAAGAACTTGGATTAATTCTTAAAATATTTAAATTCTCAATACCAGTTGTAATATCA
GGTGTTGCAGAAATATTTTTATATGATACTGGAACATTCTTCATTGGTATGTTTTTACCAACATTATTTGCAGGTTTCTA
TACAAATGCAAGTGCAATTGCAAGAATACCACTTATAATATCAAATTCCATATCCACATCAGTACTTCCAGCAACTAGTG
AAGCAAGTAGTCTAAAGAATAGGGAATTACTTAAATTATATATTCATCAATCATACAGATACACAACACTAACAACACTA
CCAGTATCAGCATTCATAATGGTATTTGCAGCACCAATTATGTCAATACTATTTGGTAAAGAATATGTTCCTGGAGCTAG
TGCTCTATGGATACTTGTTACTGGAATGTTTTTCTTCTCAATATATCTTATAGGAAGTAGTATGTGTCAAGGTCTTGGAA
AACCACAAAAACCAATGTATGCACTGATAATAGGAGCTATAGTGAATATGGTACTTAGCTTTATTTTAATACCACGTTAT
GGTATAGCTGGTGCAGCATTTGCAACAACAATATCAACATGTCTTCTTATGATAATAACAATGTATGATTTAACAAAGAT
TACTTCAATTCATGCACCATACTTAGACATGATAAAGATGTTTATTGCATCGTTTGTCATGATTGGTATGATGTATGTTG
TACCACAAAATATTCTTGGTATGATAATTGGTGGAATAATTGGAAGTATATTGTACTTGGCCATAGTGGTCTTTACTAAG
GCAATAAAAAGGGATGATGTTGTATTTATTGAACATATTGCAAATAAAACAGGTCCACTTAAAAAATACCTAGATCCAGT
AGTTAGATTTATCTACAACTACACAGACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACTTTAATACTATATTCTAATTAATAAGTATATTATAAAAATCTATTGAAAATTATTATAATAAAATATAATATGCTCT
AAGACTAAGGAGGTAGATAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAGTATCACCACCCTTTTTCTATTTTTTTAATGATAAAAATCTATTTCATTGTATAATAAATTAATTTAAAAATTGA
ATCTGAATCTGAAAAATACA

Product: O-antigen and teichoic acid export protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 516; Mature: 515

Protein sequence:

>516_residues
MTDKKSKLASGSIIILLGSIILRLGGFIYRFILSRLLTTTGYGIVGLTLPFQNIFIIGASGGVPPAIAKYVSEYKAVDDK
KMVHQIIITGLKLMIFMALLAAVIMFLISEPIAIGIWHKPEALLPLRLVALIIPFSIIVGALRGVFQGFYQMTYIFYSKF
IEQIFTLIFAIILVLIGWYAAGAVLGTAIGFLMALLGSYYLFKTDMKKNYLNGNYEPITFKEELGLILKIFKFSIPVVIS
GVAEIFLYDTGTFFIGMFLPTLFAGFYTNASAIARIPLIISNSISTSVLPATSEASSLKNRELLKLYIHQSYRYTTLTTL
PVSAFIMVFAAPIMSILFGKEYVPGASALWILVTGMFFFSIYLIGSSMCQGLGKPQKPMYALIIGAIVNMVLSFILIPRY
GIAGAAFATTISTCLLMIITMYDLTKITSIHAPYLDMIKMFIASFVMIGMMYVVPQNILGMIIGGIIGSILYLAIVVFTK
AIKRDDVVFIEHIANKTGPLKKYLDPVVRFIYNYTD

Sequences:

>Translated_516_residues
MTDKKSKLASGSIIILLGSIILRLGGFIYRFILSRLLTTTGYGIVGLTLPFQNIFIIGASGGVPPAIAKYVSEYKAVDDK
KMVHQIIITGLKLMIFMALLAAVIMFLISEPIAIGIWHKPEALLPLRLVALIIPFSIIVGALRGVFQGFYQMTYIFYSKF
IEQIFTLIFAIILVLIGWYAAGAVLGTAIGFLMALLGSYYLFKTDMKKNYLNGNYEPITFKEELGLILKIFKFSIPVVIS
GVAEIFLYDTGTFFIGMFLPTLFAGFYTNASAIARIPLIISNSISTSVLPATSEASSLKNRELLKLYIHQSYRYTTLTTL
PVSAFIMVFAAPIMSILFGKEYVPGASALWILVTGMFFFSIYLIGSSMCQGLGKPQKPMYALIIGAIVNMVLSFILIPRY
GIAGAAFATTISTCLLMIITMYDLTKITSIHAPYLDMIKMFIASFVMIGMMYVVPQNILGMIIGGIIGSILYLAIVVFTK
AIKRDDVVFIEHIANKTGPLKKYLDPVVRFIYNYTD
>Mature_515_residues
TDKKSKLASGSIIILLGSIILRLGGFIYRFILSRLLTTTGYGIVGLTLPFQNIFIIGASGGVPPAIAKYVSEYKAVDDKK
MVHQIIITGLKLMIFMALLAAVIMFLISEPIAIGIWHKPEALLPLRLVALIIPFSIIVGALRGVFQGFYQMTYIFYSKFI
EQIFTLIFAIILVLIGWYAAGAVLGTAIGFLMALLGSYYLFKTDMKKNYLNGNYEPITFKEELGLILKIFKFSIPVVISG
VAEIFLYDTGTFFIGMFLPTLFAGFYTNASAIARIPLIISNSISTSVLPATSEASSLKNRELLKLYIHQSYRYTTLTTLP
VSAFIMVFAAPIMSILFGKEYVPGASALWILVTGMFFFSIYLIGSSMCQGLGKPQKPMYALIIGAIVNMVLSFILIPRYG
IAGAAFATTISTCLLMIITMYDLTKITSIHAPYLDMIKMFIASFVMIGMMYVVPQNILGMIIGGIIGSILYLAIVVFTKA
IKRDDVVFIEHIANKTGPLKKYLDPVVRFIYNYTD

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57020; Mature: 56889

Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTDKKSKLASGSIIILLGSIILRLGGFIYRFILSRLLTTTGYGIVGLTLPFQNIFIIGAS
CCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEECC
GGVPPAIAKYVSEYKAVDDKKMVHQIIITGLKLMIFMALLAAVIMFLISEPIAIGIWHKP
CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC
EALLPLRLVALIIPFSIIVGALRGVFQGFYQMTYIFYSKFIEQIFTLIFAIILVLIGWYA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGAVLGTAIGFLMALLGSYYLFKTDMKKNYLNGNYEPITFKEELGLILKIFKFSIPVVIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVAEIFLYDTGTFFIGMFLPTLFAGFYTNASAIARIPLIISNSISTSVLPATSEASSLKN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHH
RELLKLYIHQSYRYTTLTTLPVSAFIMVFAAPIMSILFGKEYVPGASALWILVTGMFFFS
HHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IYLIGSSMCQGLGKPQKPMYALIIGAIVNMVLSFILIPRYGIAGAAFATTISTCLLMIIT
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MYDLTKITSIHAPYLDMIKMFIASFVMIGMMYVVPQNILGMIIGGIIGSILYLAIVVFTK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIKRDDVVFIEHIANKTGPLKKYLDPVVRFIYNYTD
HHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TDKKSKLASGSIIILLGSIILRLGGFIYRFILSRLLTTTGYGIVGLTLPFQNIFIIGAS
CCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEECC
GGVPPAIAKYVSEYKAVDDKKMVHQIIITGLKLMIFMALLAAVIMFLISEPIAIGIWHKP
CCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCC
EALLPLRLVALIIPFSIIVGALRGVFQGFYQMTYIFYSKFIEQIFTLIFAIILVLIGWYA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGAVLGTAIGFLMALLGSYYLFKTDMKKNYLNGNYEPITFKEELGLILKIFKFSIPVVIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVAEIFLYDTGTFFIGMFLPTLFAGFYTNASAIARIPLIISNSISTSVLPATSEASSLKN
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHH
RELLKLYIHQSYRYTTLTTLPVSAFIMVFAAPIMSILFGKEYVPGASALWILVTGMFFFS
HHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
IYLIGSSMCQGLGKPQKPMYALIIGAIVNMVLSFILIPRYGIAGAAFATTISTCLLMIIT
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MYDLTKITSIHAPYLDMIKMFIASFVMIGMMYVVPQNILGMIIGGIIGSILYLAIVVFTK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIKRDDVVFIEHIANKTGPLKKYLDPVVRFIYNYTD
HHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]