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The map label for this gene is ydbT [H]

Identifier: 82751676

GI number: 82751676

Start: 2089570

End: 2091147

Strand: Reverse

Name: ydbT [H]

Synonym: SAB1958c

Alternate gene names: 82751676

Gene position: 2091147-2089570 (Counterclockwise)

Preceding gene: 82751677

Following gene: 82751675

Centisome position: 76.25

GC content: 31.88

Gene sequence:

>1578_bases
ATGTCTGAACCTCAAAAATTACATCCGATTTCATATTTTAATGGCATAATTAATGCTATCAAACAAAACATAGTCGTCTT
TTTTATTTTTGTTATCTTTCACTTGAAAGATTTTGATTATACGAATCCCGAATCATATTTATGGATAGGTATTGTATTTG
TATTCTTTTTAATATCATACATTTCTCAAATTGTCGGAATTATGAACACGCGATATTGGATTGAGGATAATTATTTCATT
TTAACAACAGGTATTTTTAATAAAAAGCGTAAAGAATTAAATATAAAACGTATTCAGTCCGTTGATATGACACAAGGGGT
CGTCAATCAAATCATTGGTGGTGTGGATTTACAAATCAAAACGCCAAGTGATGGTATTGTGTTAAGTGTTATTTCGAAAA
AACAAGGTGAATATCTTGAACGCTATATTGATCAATTGCAAACAGAGTTGAAGACAGAAATGGCGCAAAAGTCTAGTACT
GAGCAGAATGGCAACCGTAATCATGACATTGAAGGTAATGTGGAAGACATCGCAGAAGGTCGGCTAGATGAAGTGCAGAA
CTCTGATAGTAAGCTTAATCAGAAAAATAAACGCATTCCTATATATCAAATGAATTTTAAAGAATCGTTATTTATGGCAA
TGACCAGTGGCGCCATTGGGGTAACGTTAGCAGCTTTAGTACCGATTTACGGCGCTGTAAGAGAGTTGATCCCATGGTCG
AAGCTAAATCATGAAATTAGTCAATGGGTTCAAATTGTAAGTGTTTCAGTATTAATCATCATTTTACTAGTATTAATACT
GGCATATATTATTAGAACGATTATAACGATGATAAGATTTTATGGCTTTTCGGTGATGCTTGAAAATGAGCAACTTAAAA
TTGAATATGGTCTATTTAACAAGAAGAAAGTGACTGTACCAACGAAACGATTGCAAGCTGTTGTTGAACATCAGTCATAT
ATACGAAGATTATTTGGCTACACAGCAATACATTTTATCATCACAAGTGATTTTGAAAATAAAAAAATTGAAGATGATGA
CAATGATTCAGGTAGTGTGTCGATATTGCCGTTTATTAAACGAGACAAAGCCTATCAAATTATCCAGAATTTAGCACCTG
ATTTATCTTATCAACAAGTTAATGAAGGTATGCCTTTTTCAGGTTTTCACAGACACTTTTTAATACCTAGTATTATTGTC
ATAGCTATGGCAGGAATTGGCTGTTATTTTTGGAATCAATTATTATTGTTATTTACGATTATAACAGTAGTCATTATTGG
TTTATTTGTGATCAAAGGATATCTTTATGTCAAACATGCGGGTTTTAAAATGACAGAAGAACAAATTACTATCCAGAATT
TCGAGCTATTGAAACGAAATATTTATTATTTTAAAGCGCATCACATTATAGGATTTGACACTTGGCAACATACATTACTT
AAACGCAACAATTTAAATAATTTTAGTTTTATTGTTGCTAAAGGTGTGACGAATGAATCAATTGAACTTAAATATGCCAG
TAGTAAAGATGTGCAAATATTGAAGGCGTGGTATTTGAGAGGTGAAAATGATGAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGACTGCAGGTCATACTATTTATTTACCGATGATGTCTCATGACGATGTTAAAATAATCGAAGCGAGAACTATGTCGAA
TTTGAGAGGGGTTGAAAGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATAATTTTATGTCACCACATGCTAAAAAAGTGATGAGGTTAAGCGCTGTGCTGTTTTGGATACCCATAGCGCTGGTAC
TTTTAATAGCATTTAATATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 525; Mature: 524

Protein sequence:

>525_residues
MSEPQKLHPISYFNGIINAIKQNIVVFFIFVIFHLKDFDYTNPESYLWIGIVFVFFLISYISQIVGIMNTRYWIEDNYFI
LTTGIFNKKRKELNIKRIQSVDMTQGVVNQIIGGVDLQIKTPSDGIVLSVISKKQGEYLERYIDQLQTELKTEMAQKSST
EQNGNRNHDIEGNVEDIAEGRLDEVQNSDSKLNQKNKRIPIYQMNFKESLFMAMTSGAIGVTLAALVPIYGAVRELIPWS
KLNHEISQWVQIVSVSVLIIILLVLILAYIIRTIITMIRFYGFSVMLENEQLKIEYGLFNKKKVTVPTKRLQAVVEHQSY
IRRLFGYTAIHFIITSDFENKKIEDDDNDSGSVSILPFIKRDKAYQIIQNLAPDLSYQQVNEGMPFSGFHRHFLIPSIIV
IAMAGIGCYFWNQLLLLFTIITVVIIGLFVIKGYLYVKHAGFKMTEEQITIQNFELLKRNIYYFKAHHIIGFDTWQHTLL
KRNNLNNFSFIVAKGVTNESIELKYASSKDVQILKAWYLRGENDE

Sequences:

>Translated_525_residues
MSEPQKLHPISYFNGIINAIKQNIVVFFIFVIFHLKDFDYTNPESYLWIGIVFVFFLISYISQIVGIMNTRYWIEDNYFI
LTTGIFNKKRKELNIKRIQSVDMTQGVVNQIIGGVDLQIKTPSDGIVLSVISKKQGEYLERYIDQLQTELKTEMAQKSST
EQNGNRNHDIEGNVEDIAEGRLDEVQNSDSKLNQKNKRIPIYQMNFKESLFMAMTSGAIGVTLAALVPIYGAVRELIPWS
KLNHEISQWVQIVSVSVLIIILLVLILAYIIRTIITMIRFYGFSVMLENEQLKIEYGLFNKKKVTVPTKRLQAVVEHQSY
IRRLFGYTAIHFIITSDFENKKIEDDDNDSGSVSILPFIKRDKAYQIIQNLAPDLSYQQVNEGMPFSGFHRHFLIPSIIV
IAMAGIGCYFWNQLLLLFTIITVVIIGLFVIKGYLYVKHAGFKMTEEQITIQNFELLKRNIYYFKAHHIIGFDTWQHTLL
KRNNLNNFSFIVAKGVTNESIELKYASSKDVQILKAWYLRGENDE
>Mature_524_residues
SEPQKLHPISYFNGIINAIKQNIVVFFIFVIFHLKDFDYTNPESYLWIGIVFVFFLISYISQIVGIMNTRYWIEDNYFIL
TTGIFNKKRKELNIKRIQSVDMTQGVVNQIIGGVDLQIKTPSDGIVLSVISKKQGEYLERYIDQLQTELKTEMAQKSSTE
QNGNRNHDIEGNVEDIAEGRLDEVQNSDSKLNQKNKRIPIYQMNFKESLFMAMTSGAIGVTLAALVPIYGAVRELIPWSK
LNHEISQWVQIVSVSVLIIILLVLILAYIIRTIITMIRFYGFSVMLENEQLKIEYGLFNKKKVTVPTKRLQAVVEHQSYI
RRLFGYTAIHFIITSDFENKKIEDDDNDSGSVSILPFIKRDKAYQIIQNLAPDLSYQQVNEGMPFSGFHRHFLIPSIIVI
AMAGIGCYFWNQLLLLFTIITVVIIGLFVIKGYLYVKHAGFKMTEEQITIQNFELLKRNIYYFKAHHIIGFDTWQHTLLK
RNNLNNFSFIVAKGVTNESIELKYASSKDVQILKAWYLRGENDE

Specific function: Unknown

COG id: COG3428

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0699 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005182
- InterPro:   IPR014529 [H]

Pfam domain/function: PF03703 DUF304 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60718; Mature: 60586

Theoretical pI: Translated: 8.86; Mature: 8.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSEPQKLHPISYFNGIINAIKQNIVVFFIFVIFHLKDFDYTNPESYLWIGIVFVFFLISY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISQIVGIMNTRYWIEDNYFILTTGIFNKKRKELNIKRIQSVDMTQGVVNQIIGGVDLQIK
HHHHHHHHCCCEEEECCEEEEEECCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
TPSDGIVLSVISKKQGEYLERYIDQLQTELKTEMAQKSSTEQNGNRNHDIEGNVEDIAEG
CCCCCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCC
RLDEVQNSDSKLNQKNKRIPIYQMNFKESLFMAMTSGAIGVTLAALVPIYGAVRELIPWS
CHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KLNHEISQWVQIVSVSVLIIILLVLILAYIIRTIITMIRFYGFSVMLENEQLKIEYGLFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEEECCCC
KKKVTVPTKRLQAVVEHQSYIRRLFGYTAIHFIITSDFENKKIEDDDNDSGSVSILPFIK
CCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHH
RDKAYQIIQNLAPDLSYQQVNEGMPFSGFHRHFLIPSIIVIAMAGIGCYFWNQLLLLFTI
CCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITVVIIGLFVIKGYLYVKHAGFKMTEEQITIQNFELLKRNIYYFKAHHIIGFDTWQHTLL
HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEHHHHHHHH
KRNNLNNFSFIVAKGVTNESIELKYASSKDVQILKAWYLRGENDE
HHCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SEPQKLHPISYFNGIINAIKQNIVVFFIFVIFHLKDFDYTNPESYLWIGIVFVFFLISY
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ISQIVGIMNTRYWIEDNYFILTTGIFNKKRKELNIKRIQSVDMTQGVVNQIIGGVDLQIK
HHHHHHHHCCCEEEECCEEEEEECCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
TPSDGIVLSVISKKQGEYLERYIDQLQTELKTEMAQKSSTEQNGNRNHDIEGNVEDIAEG
CCCCCEEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCC
RLDEVQNSDSKLNQKNKRIPIYQMNFKESLFMAMTSGAIGVTLAALVPIYGAVRELIPWS
CHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KLNHEISQWVQIVSVSVLIIILLVLILAYIIRTIITMIRFYGFSVMLENEQLKIEYGLFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEEECCCC
KKKVTVPTKRLQAVVEHQSYIRRLFGYTAIHFIITSDFENKKIEDDDNDSGSVSILPFIK
CCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHH
RDKAYQIIQNLAPDLSYQQVNEGMPFSGFHRHFLIPSIIVIAMAGIGCYFWNQLLLLFTI
CCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITVVIIGLFVIKGYLYVKHAGFKMTEEQITIQNFELLKRNIYYFKAHHIIGFDTWQHTLL
HHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEHHHHHHHH
KRNNLNNFSFIVAKGVTNESIELKYASSKDVQILKAWYLRGENDE
HHCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]