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The map label for this gene is 78189830

Identifier: 78189830

GI number: 78189830

Start: 2382485

End: 2384926

Strand: Reverse

Name: 78189830

Synonym: Cag_1875

Alternate gene names: NA

Gene position: 2384926-2382485 (Counterclockwise)

Preceding gene: 78189831

Following gene: 78189829

Centisome position: 92.72

GC content: 48.81

Gene sequence:

>2442_bases
ATGAGCATTCAGTTTGTAAAACATAACCCCGCTTTTCTTGATGCTGGGCACTTTCTTGAGCAAGTGGTGGCGCGCCGTGC
CGATGTAGCGCATTTGCTTGGGCATCTCGGTAGTTGTGAACCTATAGGTACGGTTCGTCATCTTTTTATTACCGGTCAAC
GTGGCAGCGGCAAAACATTTGTGGTGCGCCGTGTTGCTTTAGCGGTTGAGCAACATAACGCTTTACGTAGCCGCTACTAT
CCGCTCTTTTTTTCTGAGGAGAGCTACTCTGTTAGTTCATCAGCCGAATTTTGGCTTGAAGCTTTATTTCATCTTGCTCG
CCAAACCGCTAATGAGCAGTTTGCCCAAACCTATCAAGCCTTGCGCGAAGAGGTTGATGAAGAGCGTATTCGCCAAATTG
TGCTGCCGTTGTTGCTTGATTTTGCAGATAATCAAGGTAAAACGCTCCTTTTGATTATTGAAAACTTCTCCATGTTGCTT
GCCGATATGGCAAGCAGTCGCGAAGGTGAAGTGCTTGCGCAAACGCTGTTGCAGGAGCCTCGTTTTCAACTCTTAGCTAC
GGGAACTTTTACTTTTGACAGCTTGGAGGTGCCTTTTGGTAAATACTTTAGTAGCATAACCCATCACGCGCTTGAGCCGC
TCAGCAATGCTGATTGTAATGCCTTGTGGCAGCTTTATAGCGGTACGCCTTTAGCCGATGGGCAAATTAGAGCAATGAAC
ATTTTAGCGGGTGGAAATGCTCGTTTGTTGGTAACGCTTGCGCGTGTAGCTAACGGGCGAACCTTTAGCCAACTGCCTGA
AATTTTGGCGCTTGCTCTTGATGAGCATACCGAGTATTGCAAAAGCTATCTTGATGTGATGGCGCCGGTTGAGCGCAAAG
TCTATTTATCTATTGCGGAATTATGGGCAATGGTTTCAGCGCGAGAAGTGTCATTAGCCGCACGTATTGATATCAATAAA
ACCAGTGCCTATCTCAACCGCTTAATTAATCGAGGTGCTATTAGCGTTGAGCGGCAGGCAAAGCGCAATAAGCTGTATGG
CGTAACCGAGCGTATTTATAGCATTTACTATCTCATGCGCCGCCATGGATGGCAATCGGGGAGAGTGCGTGCGTTGCTTG
ATTGTATGTTGGCATTTTACGATCCCGCCTCATTCCCAGACCGCCTTTCCGATAGTGAGCGTGAGCGCTGCACCTCCGTT
GCTGAAGCATTAACTATGTTGCCCGAGCGCGAGCATGTGGAGCAGTGCCATCAAAATTTTCTTGATGCAAAACGCCACTC
CCGTTTTGTGCCATCTCTTGCCTATTTTGTTCGCTTTGTGCAAAAGAGTGATGTTTCTCATGCTGATGAATCATCTTCAC
CGATGCTTGGTGAAAGCTTTCGTCAAGCGTTTGAACTGCTTGAAACCGAAAGTTACACGGAAGCGCTCCCGATTTTTGAT
GCCATTATTATGGTGTCGCGCCATAGCGAAAGCGAGCAAGCCATTGGGCAGCGTTATGGTGCCATGATTGGGCGCGGCGT
GGCGCTTGGCAATCTTGAGCGGTATGAGGAAGGATTTCGTTTGCTTGATGAAGTGGCCGCAACCTGCCAAGAGCGTTCGG
TGCGGCGCCGCTTAAAGTGGGGATTGCTTGCATTGTTGGGCAAAGCAAGTGTACTTGAGCGAGCAGGGCGCATTGATGAA
GCCGTAACGTTGTACGATGAATTGGTAAGCCGTTATCGCCGTCAGCAAGAATTGGAATGCTCCACCTTAGTGGCGGCAGC
GCTTTTGCACAAGTCGCTCTTAGTAAGCAAAAGTAAAGGTGGAGAAGAAGAGATTGCCATGTGCGACACCTTGCTTGAAT
TGTATAGCGAGCGCGTCGAGTTACCGTTAGTTGAGTTAGTGTGTGCAGCATGGCGGAACAAAGCAATTGCGTTTGAAGCG
CTTAATCGTAATGATGACGCATTGCTTGCTTATGGAAAACTGTTAGCGCTATGCCGTCAGCGAAGTGAACCACATATGAT
GCAGCACACGGCTCATGCGTTACAGAATATGGGCGTTGTGTATGGTAAAATGCACCGTTATAGTGATGCCGAGCACTGCT
TTATGGAGGTGCAGAGCCTTGCGCCGCAGCAAGCTCGTGCGCATCTTATGCTTTTAAAGTTGTTAGTAAAAATGGAGGAG
CAGCAGCACGCCGTGCTTTCGGAATTGCGCAACTACCTTGCTGCTACAAGTCTTGCCTTACGGGCGCTGCCTCAAACCAT
TGAATTATTTATTACCTGTGCTGTTGCAGGATATGCGGCTGAAGCATTAGAGTTGCTGGTGGCATCGCCTCTTGCGGTTT
CACTGGAGCCTGTGCAAGCGGCATTGCAACACGCTACGGGTGATGAAGTGCGAAGTGCTCCCACGATCGTAGAGGTTGCT
AACGATATTGTGGCAGCAATTGAGGCGCGTCGTAACGCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTTGAGCGTGAGGCACTCAAACGCGAGTTGGAACCGGGTAGTTAATTGCTGTTCGATTTTTTTGCACAAGAAGTCCCCA
TTTATGGAGAGCATCATCGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTGCCACCCCATGCTCGTCTTAACGGTATCTGTTGTTATACAAACCCTTTCATGTTGTACAAATATTTGTTTCTTATGA
AGTTCATCTCATTTCTTAAA

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: ATPase; Pentatricopeptide Repeat Containing Protein; Tetratricopeptide TPR_2 Repeat Protein

Number of amino acids: Translated: 813; Mature: 812

Protein sequence:

>813_residues
MSIQFVKHNPAFLDAGHFLEQVVARRADVAHLLGHLGSCEPIGTVRHLFITGQRGSGKTFVVRRVALAVEQHNALRSRYY
PLFFSEESYSVSSSAEFWLEALFHLARQTANEQFAQTYQALREEVDEERIRQIVLPLLLDFADNQGKTLLLIIENFSMLL
ADMASSREGEVLAQTLLQEPRFQLLATGTFTFDSLEVPFGKYFSSITHHALEPLSNADCNALWQLYSGTPLADGQIRAMN
ILAGGNARLLVTLARVANGRTFSQLPEILALALDEHTEYCKSYLDVMAPVERKVYLSIAELWAMVSAREVSLAARIDINK
TSAYLNRLINRGAISVERQAKRNKLYGVTERIYSIYYLMRRHGWQSGRVRALLDCMLAFYDPASFPDRLSDSERERCTSV
AEALTMLPEREHVEQCHQNFLDAKRHSRFVPSLAYFVRFVQKSDVSHADESSSPMLGESFRQAFELLETESYTEALPIFD
AIIMVSRHSESEQAIGQRYGAMIGRGVALGNLERYEEGFRLLDEVAATCQERSVRRRLKWGLLALLGKASVLERAGRIDE
AVTLYDELVSRYRRQQELECSTLVAAALLHKSLLVSKSKGGEEEIAMCDTLLELYSERVELPLVELVCAAWRNKAIAFEA
LNRNDDALLAYGKLLALCRQRSEPHMMQHTAHALQNMGVVYGKMHRYSDAEHCFMEVQSLAPQQARAHLMLLKLLVKMEE
QQHAVLSELRNYLAATSLALRALPQTIELFITCAVAGYAAEALELLVASPLAVSLEPVQAALQHATGDEVRSAPTIVEVA
NDIVAAIEARRNA

Sequences:

>Translated_813_residues
MSIQFVKHNPAFLDAGHFLEQVVARRADVAHLLGHLGSCEPIGTVRHLFITGQRGSGKTFVVRRVALAVEQHNALRSRYY
PLFFSEESYSVSSSAEFWLEALFHLARQTANEQFAQTYQALREEVDEERIRQIVLPLLLDFADNQGKTLLLIIENFSMLL
ADMASSREGEVLAQTLLQEPRFQLLATGTFTFDSLEVPFGKYFSSITHHALEPLSNADCNALWQLYSGTPLADGQIRAMN
ILAGGNARLLVTLARVANGRTFSQLPEILALALDEHTEYCKSYLDVMAPVERKVYLSIAELWAMVSAREVSLAARIDINK
TSAYLNRLINRGAISVERQAKRNKLYGVTERIYSIYYLMRRHGWQSGRVRALLDCMLAFYDPASFPDRLSDSERERCTSV
AEALTMLPEREHVEQCHQNFLDAKRHSRFVPSLAYFVRFVQKSDVSHADESSSPMLGESFRQAFELLETESYTEALPIFD
AIIMVSRHSESEQAIGQRYGAMIGRGVALGNLERYEEGFRLLDEVAATCQERSVRRRLKWGLLALLGKASVLERAGRIDE
AVTLYDELVSRYRRQQELECSTLVAAALLHKSLLVSKSKGGEEEIAMCDTLLELYSERVELPLVELVCAAWRNKAIAFEA
LNRNDDALLAYGKLLALCRQRSEPHMMQHTAHALQNMGVVYGKMHRYSDAEHCFMEVQSLAPQQARAHLMLLKLLVKMEE
QQHAVLSELRNYLAATSLALRALPQTIELFITCAVAGYAAEALELLVASPLAVSLEPVQAALQHATGDEVRSAPTIVEVA
NDIVAAIEARRNA
>Mature_812_residues
SIQFVKHNPAFLDAGHFLEQVVARRADVAHLLGHLGSCEPIGTVRHLFITGQRGSGKTFVVRRVALAVEQHNALRSRYYP
LFFSEESYSVSSSAEFWLEALFHLARQTANEQFAQTYQALREEVDEERIRQIVLPLLLDFADNQGKTLLLIIENFSMLLA
DMASSREGEVLAQTLLQEPRFQLLATGTFTFDSLEVPFGKYFSSITHHALEPLSNADCNALWQLYSGTPLADGQIRAMNI
LAGGNARLLVTLARVANGRTFSQLPEILALALDEHTEYCKSYLDVMAPVERKVYLSIAELWAMVSAREVSLAARIDINKT
SAYLNRLINRGAISVERQAKRNKLYGVTERIYSIYYLMRRHGWQSGRVRALLDCMLAFYDPASFPDRLSDSERERCTSVA
EALTMLPEREHVEQCHQNFLDAKRHSRFVPSLAYFVRFVQKSDVSHADESSSPMLGESFRQAFELLETESYTEALPIFDA
IIMVSRHSESEQAIGQRYGAMIGRGVALGNLERYEEGFRLLDEVAATCQERSVRRRLKWGLLALLGKASVLERAGRIDEA
VTLYDELVSRYRRQQELECSTLVAAALLHKSLLVSKSKGGEEEIAMCDTLLELYSERVELPLVELVCAAWRNKAIAFEAL
NRNDDALLAYGKLLALCRQRSEPHMMQHTAHALQNMGVVYGKMHRYSDAEHCFMEVQSLAPQQARAHLMLLKLLVKMEEQ
QHAVLSELRNYLAATSLALRALPQTIELFITCAVAGYAAEALELLVASPLAVSLEPVQAALQHATGDEVRSAPTIVEVAN
DIVAAIEARRNA

Specific function: Unknown

COG id: COG1672

COG function: function code R; Predicted ATPase (AAA+ superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91287; Mature: 91156

Theoretical pI: Translated: 6.35; Mature: 6.35

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSIQFVKHNPAFLDAGHFLEQVVARRADVAHLLGHLGSCEPIGTVRHLFITGQRGSGKTF
CCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCCHH
VVRRVALAVEQHNALRSRYYPLFFSEESYSVSSSAEFWLEALFHLARQTANEQFAQTYQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LREEVDEERIRQIVLPLLLDFADNQGKTLLLIIENFSMLLADMASSREGEVLAQTLLQEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC
RFQLLATGTFTFDSLEVPFGKYFSSITHHALEPLSNADCNALWQLYSGTPLADGQIRAMN
CEEEEEECEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE
ILAGGNARLLVTLARVANGRTFSQLPEILALALDEHTEYCKSYLDVMAPVERKVYLSIAE
EEECCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LWAMVSAREVSLAARIDINKTSAYLNRLINRGAISVERQAKRNKLYGVTERIYSIYYLMR
HHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RHGWQSGRVRALLDCMLAFYDPASFPDRLSDSERERCTSVAEALTMLPEREHVEQCHQNF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LDAKRHSRFVPSLAYFVRFVQKSDVSHADESSSPMLGESFRQAFELLETESYTEALPIFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIMVSRHSESEQAIGQRYGAMIGRGVALGNLERYEEGFRLLDEVAATCQERSVRRRLKW
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLALLGKASVLERAGRIDEAVTLYDELVSRYRRQQELECSTLVAAALLHKSLLVSKSKG
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEEEIAMCDTLLELYSERVELPLVELVCAAWRNKAIAFEALNRNDDALLAYGKLLALCRQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RSEPHMMQHTAHALQNMGVVYGKMHRYSDAEHCFMEVQSLAPQQARAHLMLLKLLVKMEE
CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQHAVLSELRNYLAATSLALRALPQTIELFITCAVAGYAAEALELLVASPLAVSLEPVQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHH
ALQHATGDEVRSAPTIVEVANDIVAAIEARRNA
HHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SIQFVKHNPAFLDAGHFLEQVVARRADVAHLLGHLGSCEPIGTVRHLFITGQRGSGKTF
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEEECCCCCCCHH
VVRRVALAVEQHNALRSRYYPLFFSEESYSVSSSAEFWLEALFHLARQTANEQFAQTYQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LREEVDEERIRQIVLPLLLDFADNQGKTLLLIIENFSMLLADMASSREGEVLAQTLLQEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCC
RFQLLATGTFTFDSLEVPFGKYFSSITHHALEPLSNADCNALWQLYSGTPLADGQIRAMN
CEEEEEECEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE
ILAGGNARLLVTLARVANGRTFSQLPEILALALDEHTEYCKSYLDVMAPVERKVYLSIAE
EEECCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LWAMVSAREVSLAARIDINKTSAYLNRLINRGAISVERQAKRNKLYGVTERIYSIYYLMR
HHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RHGWQSGRVRALLDCMLAFYDPASFPDRLSDSERERCTSVAEALTMLPEREHVEQCHQNF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
LDAKRHSRFVPSLAYFVRFVQKSDVSHADESSSPMLGESFRQAFELLETESYTEALPIFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIMVSRHSESEQAIGQRYGAMIGRGVALGNLERYEEGFRLLDEVAATCQERSVRRRLKW
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLALLGKASVLERAGRIDEAVTLYDELVSRYRRQQELECSTLVAAALLHKSLLVSKSKG
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEEEIAMCDTLLELYSERVELPLVELVCAAWRNKAIAFEALNRNDDALLAYGKLLALCRQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
RSEPHMMQHTAHALQNMGVVYGKMHRYSDAEHCFMEVQSLAPQQARAHLMLLKLLVKMEE
CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QQHAVLSELRNYLAATSLALRALPQTIELFITCAVAGYAAEALELLVASPLAVSLEPVQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHH
ALQHATGDEVRSAPTIVEVANDIVAAIEARRNA
HHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA