| Definition | Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007503 |
| Length | 2,401,520 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 78044348
GI number: 78044348
Start: 441871
End: 444411
Strand: Direct
Name: yhgE [H]
Synonym: CHY_0511
Alternate gene names: 78044348
Gene position: 441871-444411 (Clockwise)
Preceding gene: 78044958
Following gene: 78043066
Centisome position: 18.4
GC content: 41.13
Gene sequence:
>2541_bases ATGAATTTCTTGAAAATTGCGCGGGTCGAGCTAAAACAGCTTCTTAGTACCCGTCAAGCCCGAGTAGCGTTAATTGTGAT AATTTTAATGCCGTTACTATACAGCTTTGTTTATTTGTCAGCGTTTTGGGACCCTTATGGCAATCTAAAAAATTTGCCGG TAGCGGTAGTTAATTTAGACCGGGGTTATAACGACGGAAAGGAAAAAATCAATGCCGGGAAAGAGCTTGTAGACGAGCTA AAAAGCAATAATGCGGTAAAATGGTACTTTGTTGAGGAAAAGGAAGCTTACCGGGGGTTACTGGGGGATAAATATTATTT AATAGTAAAAATACCCGAGGATTTTTCCGAGAAGTTATATAAAATGAAATCGTCGGATCCCCAAAAAACCGGGATTAAGG TAATTTATAACGAGGGTAAAAACTATCTGGCAGCCCAGTTAAACAGCCGGGTGGTTTTAGAATTAAAACAAAAAATAGAA GGGAAAATAGTTAAAGAAGCAATGACTACTCTTCTTGAGAAAATGGACGACTCTTTAAAAGATGTGGAAAAAGCTGCTGA TGGCAGCGAAAAGCTTGAAGGGGGTATCAAACAGGCGTACAACGGAAGTACGGAGTTAGCAAAGGGCGGGCAAAAATTAG CAGCAGGGGCCAAAAAACTTGCAGCAGGCACGGAGCAGCTTTATCAGGGAAGCAACCGGTTAAAAAGTGGAACCATGGAA TTTAGCCGCAATATGTCGGTGTTTGCCGCCAAAATGGAGGATGTTAGACGCGGAAGTGAAAAAATTTATGAAGGGCTAAA ACTACTTCCCGGAGATGAGTTAGGAGGTCAGTTTGCTGAACTAAACGGTGGGGTTAAAACCGTTGCTGACGGAGCTTATG GGATTTACAGCGGAAGTCTTACTTTAGAAAGAGGAGTAGCCAATCTTGCTGCGGGTAGTAGCGGTTATATAGCGGGTGTT AATTCTTTTTTGTCAGGGGTAGAAAGCTTTTGGAGTCAAGTGTCTTCCGGCTTAAAACAATTAGCTTCCGGTTATAATCA GCTTTTAGACGGCTTAAACAAATTGAAAGATAGCTTGCAAACGGGAACTACATTGGTAGCCGGAGTAGATCAATCCCAAA AAGCTGCCCAAAACCAGATTGAACAAGCCTTAAATACCTTAGAAAATTACAAAGCTAACCATCCGGACCCGGAAATAGAT AAGGCTATAAATTCTCTAAATGCAGCTAAAGAGAATTTAACAATGATTAATCAATATAATACCGGACTTTCGGCTTTGGT TAGCAAAGGCAATGAAGGAATTTCAGAGCTAAGTTCATCCCTTACAACATTAAATCTTGGACTCACGAACTTAATAAACC AGGGAGAAGAGGGTTATAAAAGTAAGTTAAAACCGGGAATGGTGGCTTTAGAAAAGGGTAGTCAGGACTTAACCGCAGGA TTTAGCCAATTGCAAGATGGCGTTGGTACCCTGGTTTACGGCAGCAAGAAGCTTTCGGAAGGTACAGATCGTTTAGCATT GAAGACCCGGGAAATACCGGCTAAAATGGAAGAGCTGGGTAGAGGACTATCGGCTTTAAAAGATGGTTACAATCAACTGT ATAACGGGATAAATCTTCTGGCAGAAGGAAGTAGTAAGCTTAATAATGCGGCATTGGCCCTTAGTAACGGAACTGCTTCC TTGAATAGCGGAATCTTGCCTGTAAAAAATGGAGCTTTGGAGTTAGAAAAGGGAGCGTTAAGGTTATCGACTGGTCAGGC GGAACTAAATGACGGTTTATTTAAGCTTTATAAAGGTTCCCAGGAGCTTACTTCAGGGCTTAAGGCCGGGGTAGAGGAAG GAAAGAAAGAGCTAACTCCTTCCTTAAAAGAAAAAAGGGCTAAAATAATTTCCGATCCGGTGGAAGTTAAAGAGGAGAAA AAATATTATGTTCCCAACTACGGAACCGCTTTTACTCCCTATTTCCTTCCGCTTTCCCTCTGGATTGGTGCTTTGGTGCT GTTTTTCCTGGTAAATTTAAAAGACCACCGTTTAACCTTATCTTCGGTTCGTTCGTGGGAGATATTAATCGGTAAATTTT TAGCGGTAGCTTTAATTGGGGTGCTTCAAGCTGTAATTTCTGGTATAATTTTAGAAAAAGGGCTTGACCTTCAGGTTGCA TCTCAATGGAAATTCTTTGGATTTGCTATTTTAATGTCCCTAACTTTCTTAGCGATTATCGGTTTAATGGTTTCCCTTTT TGGCATGGCAGGAAGGTTTTTGGCGGTAGTTTTATTGATTTTGCAATTAGCTTCTTGCGGTGGTGCTTTTCCCTTTGAAC TATTACCAAAATTCTTCCGGGAAATTAGCGTTTATTTGCCGATGACTTACGGAGTTTATGGCTTAAGGGAAGCCATTTCC GGTGGCTCCGGGATGAGCTTTAACCACAGTGTTTTCATGATGGCTTTGTTTGGGGTAATTGCCTTAATACTAAATTATTT TGTCACGCCAAGGCATGTAAGGCTTTCCGATTTATCGCCTAACGAAGGTAACGTAATTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAAAGCAAGAAGGGAAGTTAGTTATTTATACCACTTTAAAAGAAGAAGAGCTTGGTATTGCCGATACAGTAGTGGACGT TGTGCAAGGAGGTGTAAGCA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTGTTTGGAGGATAAGATGAATCCAAAGATTCGGGCGATTTTAAAAGCTGCGGCTAAAGTGATGGCCCAAAAGGGCTTTG AAAAAGCTACCATGGATGAA
Product: phage infection protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 846; Mature: 846
Protein sequence:
>846_residues MNFLKIARVELKQLLSTRQARVALIVIILMPLLYSFVYLSAFWDPYGNLKNLPVAVVNLDRGYNDGKEKINAGKELVDEL KSNNAVKWYFVEEKEAYRGLLGDKYYLIVKIPEDFSEKLYKMKSSDPQKTGIKVIYNEGKNYLAAQLNSRVVLELKQKIE GKIVKEAMTTLLEKMDDSLKDVEKAADGSEKLEGGIKQAYNGSTELAKGGQKLAAGAKKLAAGTEQLYQGSNRLKSGTME FSRNMSVFAAKMEDVRRGSEKIYEGLKLLPGDELGGQFAELNGGVKTVADGAYGIYSGSLTLERGVANLAAGSSGYIAGV NSFLSGVESFWSQVSSGLKQLASGYNQLLDGLNKLKDSLQTGTTLVAGVDQSQKAAQNQIEQALNTLENYKANHPDPEID KAINSLNAAKENLTMINQYNTGLSALVSKGNEGISELSSSLTTLNLGLTNLINQGEEGYKSKLKPGMVALEKGSQDLTAG FSQLQDGVGTLVYGSKKLSEGTDRLALKTREIPAKMEELGRGLSALKDGYNQLYNGINLLAEGSSKLNNAALALSNGTAS LNSGILPVKNGALELEKGALRLSTGQAELNDGLFKLYKGSQELTSGLKAGVEEGKKELTPSLKEKRAKIISDPVEVKEEK KYYVPNYGTAFTPYFLPLSLWIGALVLFFLVNLKDHRLTLSSVRSWEILIGKFLAVALIGVLQAVISGIILEKGLDLQVA SQWKFFGFAILMSLTFLAIIGLMVSLFGMAGRFLAVVLLILQLASCGGAFPFELLPKFFREISVYLPMTYGVYGLREAIS GGSGMSFNHSVFMMALFGVIALILNYFVTPRHVRLSDLSPNEGNVI
Sequences:
>Translated_846_residues MNFLKIARVELKQLLSTRQARVALIVIILMPLLYSFVYLSAFWDPYGNLKNLPVAVVNLDRGYNDGKEKINAGKELVDEL KSNNAVKWYFVEEKEAYRGLLGDKYYLIVKIPEDFSEKLYKMKSSDPQKTGIKVIYNEGKNYLAAQLNSRVVLELKQKIE GKIVKEAMTTLLEKMDDSLKDVEKAADGSEKLEGGIKQAYNGSTELAKGGQKLAAGAKKLAAGTEQLYQGSNRLKSGTME FSRNMSVFAAKMEDVRRGSEKIYEGLKLLPGDELGGQFAELNGGVKTVADGAYGIYSGSLTLERGVANLAAGSSGYIAGV NSFLSGVESFWSQVSSGLKQLASGYNQLLDGLNKLKDSLQTGTTLVAGVDQSQKAAQNQIEQALNTLENYKANHPDPEID KAINSLNAAKENLTMINQYNTGLSALVSKGNEGISELSSSLTTLNLGLTNLINQGEEGYKSKLKPGMVALEKGSQDLTAG FSQLQDGVGTLVYGSKKLSEGTDRLALKTREIPAKMEELGRGLSALKDGYNQLYNGINLLAEGSSKLNNAALALSNGTAS LNSGILPVKNGALELEKGALRLSTGQAELNDGLFKLYKGSQELTSGLKAGVEEGKKELTPSLKEKRAKIISDPVEVKEEK KYYVPNYGTAFTPYFLPLSLWIGALVLFFLVNLKDHRLTLSSVRSWEILIGKFLAVALIGVLQAVISGIILEKGLDLQVA SQWKFFGFAILMSLTFLAIIGLMVSLFGMAGRFLAVVLLILQLASCGGAFPFELLPKFFREISVYLPMTYGVYGLREAIS GGSGMSFNHSVFMMALFGVIALILNYFVTPRHVRLSDLSPNEGNVI >Mature_846_residues MNFLKIARVELKQLLSTRQARVALIVIILMPLLYSFVYLSAFWDPYGNLKNLPVAVVNLDRGYNDGKEKINAGKELVDEL KSNNAVKWYFVEEKEAYRGLLGDKYYLIVKIPEDFSEKLYKMKSSDPQKTGIKVIYNEGKNYLAAQLNSRVVLELKQKIE GKIVKEAMTTLLEKMDDSLKDVEKAADGSEKLEGGIKQAYNGSTELAKGGQKLAAGAKKLAAGTEQLYQGSNRLKSGTME FSRNMSVFAAKMEDVRRGSEKIYEGLKLLPGDELGGQFAELNGGVKTVADGAYGIYSGSLTLERGVANLAAGSSGYIAGV NSFLSGVESFWSQVSSGLKQLASGYNQLLDGLNKLKDSLQTGTTLVAGVDQSQKAAQNQIEQALNTLENYKANHPDPEID KAINSLNAAKENLTMINQYNTGLSALVSKGNEGISELSSSLTTLNLGLTNLINQGEEGYKSKLKPGMVALEKGSQDLTAG FSQLQDGVGTLVYGSKKLSEGTDRLALKTREIPAKMEELGRGLSALKDGYNQLYNGINLLAEGSSKLNNAALALSNGTAS LNSGILPVKNGALELEKGALRLSTGQAELNDGLFKLYKGSQELTSGLKAGVEEGKKELTPSLKEKRAKIISDPVEVKEEK KYYVPNYGTAFTPYFLPLSLWIGALVLFFLVNLKDHRLTLSSVRSWEILIGKFLAVALIGVLQAVISGIILEKGLDLQVA SQWKFFGFAILMSLTFLAIIGLMVSLFGMAGRFLAVVLLILQLASCGGAFPFELLPKFFREISVYLPMTYGVYGLREAIS GGSGMSFNHSVFMMALFGVIALILNYFVTPRHVRLSDLSPNEGNVI
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 91895; Mature: 91895
Theoretical pI: Translated: 9.27; Mature: 9.27
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNFLKIARVELKQLLSTRQARVALIVIILMPLLYSFVYLSAFWDPYGNLKNLPVAVVNLD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC RGYNDGKEKINAGKELVDELKSNNAVKWYFVEEKEAYRGLLGDKYYLIVKIPEDFSEKLY CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHH KMKSSDPQKTGIKVIYNEGKNYLAAQLNSRVVLELKQKIEGKIVKEAMTTLLEKMDDSLK HHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVEKAADGSEKLEGGIKQAYNGSTELAKGGQKLAAGAKKLAAGTEQLYQGSNRLKSGTME HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHH FSRNMSVFAAKMEDVRRGSEKIYEGLKLLPGDELGGQFAELNGGVKTVADGAYGIYSGSL HHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHCCCCCEEEECCE TLERGVANLAAGSSGYIAGVNSFLSGVESFWSQVSSGLKQLASGYNQLLDGLNKLKDSLQ EHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGTTLVAGVDQSQKAAQNQIEQALNTLENYKANHPDPEIDKAINSLNAAKENLTMINQYN CCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGLSALVSKGNEGISELSSSLTTLNLGLTNLINQGEEGYKSKLKPGMVALEKGSQDLTAG CHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHH FSQLQDGVGTLVYGSKKLSEGTDRLALKTREIPAKMEELGRGLSALKDGYNQLYNGINLL HHHHHCCCCEEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AEGSSKLNNAALALSNGTASLNSGILPVKNGALELEKGALRLSTGQAELNDGLFKLYKGS HCCCCCCCCCEEEEECCCCHHCCCCCEECCCCEEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCC QELTSGLKAGVEEGKKELTPSLKEKRAKIISDPVEVKEEKKYYVPNYGTAFTPYFLPLSL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHH WIGALVLFFLVNLKDHRLTLSSVRSWEILIGKFLAVALIGVLQAVISGIILEKGLDLQVA HHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEH SQWKFFGFAILMSLTFLAIIGLMVSLFGMAGRFLAVVLLILQLASCGGAFPFELLPKFFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH EISVYLPMTYGVYGLREAISGGSGMSFNHSVFMMALFGVIALILNYFVTPRHVRLSDLSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCC NEGNVI CCCCCC >Mature Secondary Structure MNFLKIARVELKQLLSTRQARVALIVIILMPLLYSFVYLSAFWDPYGNLKNLPVAVVNLD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC RGYNDGKEKINAGKELVDELKSNNAVKWYFVEEKEAYRGLLGDKYYLIVKIPEDFSEKLY CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHH KMKSSDPQKTGIKVIYNEGKNYLAAQLNSRVVLELKQKIEGKIVKEAMTTLLEKMDDSLK HHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DVEKAADGSEKLEGGIKQAYNGSTELAKGGQKLAAGAKKLAAGTEQLYQGSNRLKSGTME HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCHHH FSRNMSVFAAKMEDVRRGSEKIYEGLKLLPGDELGGQFAELNGGVKTVADGAYGIYSGSL HHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHCCCCCEEEECCE TLERGVANLAAGSSGYIAGVNSFLSGVESFWSQVSSGLKQLASGYNQLLDGLNKLKDSLQ EHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGTTLVAGVDQSQKAAQNQIEQALNTLENYKANHPDPEIDKAINSLNAAKENLTMINQYN CCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGLSALVSKGNEGISELSSSLTTLNLGLTNLINQGEEGYKSKLKPGMVALEKGSQDLTAG CHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHH FSQLQDGVGTLVYGSKKLSEGTDRLALKTREIPAKMEELGRGLSALKDGYNQLYNGINLL HHHHHCCCCEEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AEGSSKLNNAALALSNGTASLNSGILPVKNGALELEKGALRLSTGQAELNDGLFKLYKGS HCCCCCCCCCEEEEECCCCHHCCCCCEECCCCEEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCC QELTSGLKAGVEEGKKELTPSLKEKRAKIISDPVEVKEEKKYYVPNYGTAFTPYFLPLSL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHH WIGALVLFFLVNLKDHRLTLSSVRSWEILIGKFLAVALIGVLQAVISGIILEKGLDLQVA HHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEH SQWKFFGFAILMSLTFLAIIGLMVSLFGMAGRFLAVVLLILQLASCGGAFPFELLPKFFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH EISVYLPMTYGVYGLREAISGGSGMSFNHSVFMMALFGVIALILNYFVTPRHVRLSDLSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCC NEGNVI CCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]