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The map label for this gene is mviN2 [H]

Identifier: 78043430

GI number: 78043430

Start: 474481

End: 476019

Strand: Direct

Name: mviN2 [H]

Synonym: CHY_0546

Alternate gene names: 78043430

Gene position: 474481-476019 (Clockwise)

Preceding gene: 78043738

Following gene: 78043384

Centisome position: 19.76

GC content: 42.88

Gene sequence:

>1539_bases
ATGTCCAAGAAAATAGTATTAAAAGCCACCCTTTTAATAATGGCTTTAACATTAACCAGCAGGATTCTGGGTTTTGTCCG
GGAGATGGCCATTGCTTCCGTTTTCGGGGCAAGTAAGCTTGTGGATGCTTATCTTGCTGCGCAAATTATCCCGACGTTTT
TTGCCAGTTTCATAGGTGGCGGGCTGATGGTGGTAGTTGTACCGATAATTAACGAATTTTTGGCGCAAAAAAAACATCAA
GAAGCAACATATGTTACCAACTCTATCCTAACGCTATCTTTTTTGGCCCTTGGAATTATTATGGTTATCGGAGTTTTTAC
TGCGCCTTCTTTAATAAAATTTGTTGGTTATGGGTTTCAGGGGGATACTCTAAAACTTGCCCGGACCCTCTCCACCTGGC
TTTTTCCCCTGGCAGTTTTAATGAGTTTGACCCAAATTTTAACCGGAGTATTAAATGCTTACCAGCATTTTTTTACACCG
GCCTTGGGACCGGTGTTAAACAATGTGGTTTTAATAGCCGCAGTCATCCTGCTTGGGAAAAGCCAGGGAATTGTTGCTCT
GGTAGGGGGAACGTTAGCCGGCTGGACTATTTACCTTTTAATTATGCTTCCGGCGTTTAAGAAAACTGGCTTTTATTTTA
GGCCGGTTTTAGATATCCACCATCCGGCAGTAGTAAGGGCCTGGGAGATGTTTTTGCCGGTAATCATTGGTACCACCTTC
ACTCAAATAAATTTACTGGTAGACCGGATGCTGGCGTCATCCCTTACGGAAGGCAGCATTTCTGCTTTAAACTATGCGGC
AAAGCTCTACCAGCTGCCACTGGGCTTGATTTCCCTGGCAGTTTCAAGTGCCATCTTTCCGAGTCTTTCAATTTTGGCGG
CCCAAGGAGAAAAAACGAGGCTTTTAGAACTTACCCGCTTTGGCTTAAAGCTGAGCACGGTAATTTCCCTGCCGGCTCAG
GTGGGACTTATGGTTTTAGCAACACCCATTGTGGCGGTGCTTTTTGAACGGGGGGCTTTTGATGCCCGGGCTACCGAGTT
AACGGCTGGCGCCCTTTTCTTTTATAGCTTAGCAATCGTTTTTTACGTTATCAATGCGGTATTAACCAGACTTTTTTATG
CCCAGAATGACACCCTTACCCCTTTAAAAGTGGGGGCTTTAGCGGTTCTGGGAAATATCGGGGCGAATCTTATTTTAGTC
CGTTTTCTTGCCCACCGGGGGCTTGCTTTGGGGACAAGTTTTGCGGCAATTTTAAGTAATGTTCTCTTCTTTTATTTTGC
CCAAAAAAAAATTGGCAATTTGTTTGACCGGGAAATGCAAAGCTTCTTTCTTAAATCATTAGCTGCCTCTCTTTTAATGG
GAATAGGTGCTTATAAAATATACGATTGGTTATTATTTGAGGGACGGGCCGTTGCTTTATTTACCGCTATTTTGTTCGGG
GTAACCCTGTATTTTGTTTTGCTTGTGGTTTTTGGGGTGGAAGAGGTAAAATATATTAAAAAGCTTTTTTTAAAATTTAA
GGCAAAGCTTTCTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAAGAACTCAATTTTACTCCCAAATTTGGAGACATTAAAACTATCGTCCAAACTGCCTGGGAGTGGCACAAAAACAATC
CCCGGGGGTATGACCGGTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTAAATTCTTTTTTTATTTGCTGATTGTAAAAAGAAATGATATTTCGCTGGTTTTCCAAGATTTTTACGTAGCTTATA
CTTGCTCTGGGGATGTAAGT

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 512; Mature: 511

Protein sequence:

>512_residues
MSKKIVLKATLLIMALTLTSRILGFVREMAIASVFGASKLVDAYLAAQIIPTFFASFIGGGLMVVVVPIINEFLAQKKHQ
EATYVTNSILTLSFLALGIIMVIGVFTAPSLIKFVGYGFQGDTLKLARTLSTWLFPLAVLMSLTQILTGVLNAYQHFFTP
ALGPVLNNVVLIAAVILLGKSQGIVALVGGTLAGWTIYLLIMLPAFKKTGFYFRPVLDIHHPAVVRAWEMFLPVIIGTTF
TQINLLVDRMLASSLTEGSISALNYAAKLYQLPLGLISLAVSSAIFPSLSILAAQGEKTRLLELTRFGLKLSTVISLPAQ
VGLMVLATPIVAVLFERGAFDARATELTAGALFFYSLAIVFYVINAVLTRLFYAQNDTLTPLKVGALAVLGNIGANLILV
RFLAHRGLALGTSFAAILSNVLFFYFAQKKIGNLFDREMQSFFLKSLAASLLMGIGAYKIYDWLLFEGRAVALFTAILFG
VTLYFVLLVVFGVEEVKYIKKLFLKFKAKLSL

Sequences:

>Translated_512_residues
MSKKIVLKATLLIMALTLTSRILGFVREMAIASVFGASKLVDAYLAAQIIPTFFASFIGGGLMVVVVPIINEFLAQKKHQ
EATYVTNSILTLSFLALGIIMVIGVFTAPSLIKFVGYGFQGDTLKLARTLSTWLFPLAVLMSLTQILTGVLNAYQHFFTP
ALGPVLNNVVLIAAVILLGKSQGIVALVGGTLAGWTIYLLIMLPAFKKTGFYFRPVLDIHHPAVVRAWEMFLPVIIGTTF
TQINLLVDRMLASSLTEGSISALNYAAKLYQLPLGLISLAVSSAIFPSLSILAAQGEKTRLLELTRFGLKLSTVISLPAQ
VGLMVLATPIVAVLFERGAFDARATELTAGALFFYSLAIVFYVINAVLTRLFYAQNDTLTPLKVGALAVLGNIGANLILV
RFLAHRGLALGTSFAAILSNVLFFYFAQKKIGNLFDREMQSFFLKSLAASLLMGIGAYKIYDWLLFEGRAVALFTAILFG
VTLYFVLLVVFGVEEVKYIKKLFLKFKAKLSL
>Mature_511_residues
SKKIVLKATLLIMALTLTSRILGFVREMAIASVFGASKLVDAYLAAQIIPTFFASFIGGGLMVVVVPIINEFLAQKKHQE
ATYVTNSILTLSFLALGIIMVIGVFTAPSLIKFVGYGFQGDTLKLARTLSTWLFPLAVLMSLTQILTGVLNAYQHFFTPA
LGPVLNNVVLIAAVILLGKSQGIVALVGGTLAGWTIYLLIMLPAFKKTGFYFRPVLDIHHPAVVRAWEMFLPVIIGTTFT
QINLLVDRMLASSLTEGSISALNYAAKLYQLPLGLISLAVSSAIFPSLSILAAQGEKTRLLELTRFGLKLSTVISLPAQV
GLMVLATPIVAVLFERGAFDARATELTAGALFFYSLAIVFYVINAVLTRLFYAQNDTLTPLKVGALAVLGNIGANLILVR
FLAHRGLALGTSFAAILSNVLFFYFAQKKIGNLFDREMQSFFLKSLAASLLMGIGAYKIYDWLLFEGRAVALFTAILFGV
TLYFVLLVVFGVEEVKYIKKLFLKFKAKLSL

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=508, Percent_Identity=29.3307086614173, Blast_Score=192, Evalue=3e-50,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55703; Mature: 55572

Theoretical pI: Translated: 10.41; Mature: 10.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKKIVLKATLLIMALTLTSRILGFVREMAIASVFGASKLVDAYLAAQIIPTFFASFIGG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GLMVVVVPIINEFLAQKKHQEATYVTNSILTLSFLALGIIMVIGVFTAPSLIKFVGYGFQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GDTLKLARTLSTWLFPLAVLMSLTQILTGVLNAYQHFFTPALGPVLNNVVLIAAVILLGK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SQGIVALVGGTLAGWTIYLLIMLPAFKKTGFYFRPVLDIHHPAVVRAWEMFLPVIIGTTF
CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQINLLVDRMLASSLTEGSISALNYAAKLYQLPLGLISLAVSSAIFPSLSILAAQGEKTR
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHH
LLELTRFGLKLSTVISLPAQVGLMVLATPIVAVLFERGAFDARATELTAGALFFYSLAIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYVINAVLTRLFYAQNDTLTPLKVGALAVLGNIGANLILVRFLAHRGLALGTSFAAILSN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
VLFFYFAQKKIGNLFDREMQSFFLKSLAASLLMGIGAYKIYDWLLFEGRAVALFTAILFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VTLYFVLLVVFGVEEVKYIKKLFLKFKAKLSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SKKIVLKATLLIMALTLTSRILGFVREMAIASVFGASKLVDAYLAAQIIPTFFASFIGG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GLMVVVVPIINEFLAQKKHQEATYVTNSILTLSFLALGIIMVIGVFTAPSLIKFVGYGFQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GDTLKLARTLSTWLFPLAVLMSLTQILTGVLNAYQHFFTPALGPVLNNVVLIAAVILLGK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SQGIVALVGGTLAGWTIYLLIMLPAFKKTGFYFRPVLDIHHPAVVRAWEMFLPVIIGTTF
CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQINLLVDRMLASSLTEGSISALNYAAKLYQLPLGLISLAVSSAIFPSLSILAAQGEKTR
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCHH
LLELTRFGLKLSTVISLPAQVGLMVLATPIVAVLFERGAFDARATELTAGALFFYSLAIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYVINAVLTRLFYAQNDTLTPLKVGALAVLGNIGANLILVRFLAHRGLALGTSFAAILSN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
VLFFYFAQKKIGNLFDREMQSFFLKSLAASLLMGIGAYKIYDWLLFEGRAVALFTAILFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VTLYFVLLVVFGVEEVKYIKKLFLKFKAKLSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]