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The map label for this gene is 75909619

Identifier: 75909619

GI number: 75909619

Start: 4240074

End: 4242425

Strand: Direct

Name: 75909619

Synonym: Ava_3413

Alternate gene names: NA

Gene position: 4240074-4242425 (Clockwise)

Preceding gene: 75909616

Following gene: 75909622

Centisome position: 66.61

GC content: 38.35

Gene sequence:

>2352_bases
ATGGGTGCAGAAGAAGCTCTAGAGCTTTTGGATAGCTTGGTTTATAGGAAAACAGGGGAACGTTTAGGCACTACTCAAAG
AATAATTCTACGTAATTTATGGGAGGATAGAAAACAAACTTATCAAAATATTGCGGATATTTGTGGTTATACGGAAGCCC
ATTTAAAAGCAGTTGGCGCGGAATTGTGGCAAATACTGACGAACGTCTTAGGGGAAAAAGTCTCAAAGTCAAACTTTTCT
TCAGTGGTGCAGAGACTTTGGCAATCTCAACGGCTACAAAAGATGTCGCCTATTGTAAATTCAGTCCTCAATAATGGCAA
GTCACAAGAACTGGATTATAACTTTGTGGGGCGCGATCGCGAAATAGGCGAACTTGATAGCTATGTTGTCCGAGGTGCAA
AAATTATCCTCATCCAAGGTGAAGGCGGTGTTGGCAAAACTACCTTAGCGCGGCGATATTTTAAGGCGCAAGGTTTTGAT
TTCCTAGAGTTGTGGATGGCTAAGGAAAGCCAACATATCGTTTCTGTGGAGAGTGTGGTTGAGGAATGGCTAAGGGTTGA
TTTTAATGAGGAACCAGGTAAAGAGTTTGGTATTAATCTAGATAGGCTACGGCGCAAGCTACGGGATGAAACGCGCAAGA
TAGGGGTTTTAATTGATAATCTTGAGTCTGCGTTGGATAGAAATGGTCAAATTATTGCTTCTCGTCGTTCCTATGTGGAA
CTGTTACGGGTATTAGCAGACCCTAGCATTCAATCTATCACTTTGATTACTAGTCGTGAGCGTCTGTATGAATCAGATGT
AGATTTGACTTTCTATCCCCTGGGGGGTTTGGATGAGTGTACTTGGCAAAAGTTTTTTACTAGTTGTCAAATCAAATCTA
ATTCATCCGCACTGAGTGAAATGTATAAAGCTTTCGGTGGAAATGCCAAAGCCATGCAAATTATTAGTGGCGCAATTACT
ACAGATTTTGAAGGAAATGCAGATATTTATTGGCGAGAAAATAAGCATGATTTATTAATTGAACCAGAGTTAAAAAATTT
AGTTGCTAGTCAATTTGACCGTTTAGAACAAATGGATAGCGAAGCATATCGGCTGCTTTGTCGTTTGGGATGCTATCGCT
ATCAAGATGTTACTCATGTGAGTGTTCAGGGATTACAATGTTTACTTTGGGATGTGCCGGAACAACAAGCTAGGCGAGTC
GTTAGATATCTAACAGATCGTTTATTGATAGAGTTTCGTAAAGGAAAATATTGGTTACATCCGGTGATTTGTACAGAGGC
GATCGCCAGATTAAAACAAAGCGGTGAATGGCAAATTGCTAATCAACAAGCGGCGGAATTTTGGAATCAAAGCGTTACTC
AAGTAGAAAACCCTCAAGATGCTTTGATGGCGTTAGAAGCTTATCATCACTATATGGAAATTGGGGATTATGAACAAGCT
GCTGATGTGATTATTCGTAGTAGACCCAAAAAGTGTGATCACAGTATATCTTTAGGAGTTTTATTTAATCGACTGGGTTT
ATTGGAAACCTTAATTTCTGTGATTAATCCCCTCATTTATAATTTACATTCCGACTATCATTTGAATATACTGTATAACC
TATTGGGACGAGCTTATCACCAAATAGGTAATATCAACTTAGCTCTGGAATGCCACTACAAGTCTAATAAAATTGCTGAA
AAAAATAACTTTCTGCAAGAGAGAATTTCCAGTAGTTTCAATTTGGGTCTTTGTTACACAGATTTATGGGAAATTGACAA
AGCAAGTGAAATTTTTTACTACGTCAAGAATCTAGCAGCAACAGACAGAAATTATTATCAATATGTTGTTTATTCTCTGT
GTTGTTTAGCTTATTTAGATTCTTCTGTCGGCAATAATGAAAACGTAACGTTGATGTTACGAGAAGCAGAAGCCGGATTA
TCTCACGACAGATTAACTTCCTGGGGTATAGGCACTAGTTTACTATTTCTCAGCTTGACTTATAAAAATTTAGGTTTAAT
AGATAAGGCTTTGTTAATGTGCCATCAAGCTATTAACCATTGTCGTCAAAATCAGTTTAGTTTTTTGGAAGCAAGGGCTA
CATCTTGTTTAGCATCATTATATCGAGAACAGGGACAGTTTACAGTGGCGATAGATAAACATTTAGAAGCGATCGCCAAC
ATGAACAAGGTGTCTGATAAATGCAATCTCGCCAAAGCCTACTACCAATTAGGGTTGACCTATCAGAGAATGGGCGAAGT
TAACCAAAGTAGAGAGACATTTCATCAGGCGATCGTTATTTTCAATGATCTACCTGCACCAAAGCAAGTAGAAAAAGTGC
AAATAACAATGATGCGTTTAGAAAATAGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTACTGGGTAGGAAAAAGTAGTTTGTAGTATTGCGAGCAAAAGTGAAATCGTAAAAATATGGTTATAATTAAGCACAA
ATGATACATTCAGGCGATCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGAAAACAATGTAAGTTGGGTGGAGACTTTGCGTTAGTTAAGAGAATAGTAGGTTGGGTGTAGCGATAGCGGAACCCA
ACAAAGTCTTGAAAATGTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 783; Mature: 782

Protein sequence:

>783_residues
MGAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGAELWQILTNVLGEKVSKSNFS
SVVQRLWQSQRLQKMSPIVNSVLNNGKSQELDYNFVGRDREIGELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFD
FLELWMAKESQHIVSVESVVEEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
LLRVLADPSIQSITLITSRERLYESDVDLTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSSALSEMYKAFGGNAKAMQIISGAIT
TDFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLEQMDSEAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRV
VRYLTDRLLIEFRKGKYWLHPVICTEAIARLKQSGEWQIANQQAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEQA
ADVIIRSRPKKCDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIYNLHSDYHLNILYNLLGRAYHQIGNINLALECHYKSNKIAE
KNNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIDKASEIFYYVKNLAATDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVTLMLREAEAGL
SHDRLTSWGIGTSLLFLSLTYKNLGLIDKALLMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDLPAPKQVEKVQITMMRLENS

Sequences:

>Translated_783_residues
MGAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGAELWQILTNVLGEKVSKSNFS
SVVQRLWQSQRLQKMSPIVNSVLNNGKSQELDYNFVGRDREIGELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFD
FLELWMAKESQHIVSVESVVEEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
LLRVLADPSIQSITLITSRERLYESDVDLTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSSALSEMYKAFGGNAKAMQIISGAIT
TDFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLEQMDSEAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRV
VRYLTDRLLIEFRKGKYWLHPVICTEAIARLKQSGEWQIANQQAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEQA
ADVIIRSRPKKCDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIYNLHSDYHLNILYNLLGRAYHQIGNINLALECHYKSNKIAE
KNNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIDKASEIFYYVKNLAATDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVTLMLREAEAGL
SHDRLTSWGIGTSLLFLSLTYKNLGLIDKALLMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDLPAPKQVEKVQITMMRLENS
>Mature_782_residues
GAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGAELWQILTNVLGEKVSKSNFSS
VVQRLWQSQRLQKMSPIVNSVLNNGKSQELDYNFVGRDREIGELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFDF
LELWMAKESQHIVSVESVVEEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVEL
LRVLADPSIQSITLITSRERLYESDVDLTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSSALSEMYKAFGGNAKAMQIISGAITT
DFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLEQMDSEAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRVV
RYLTDRLLIEFRKGKYWLHPVICTEAIARLKQSGEWQIANQQAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEQAA
DVIIRSRPKKCDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIYNLHSDYHLNILYNLLGRAYHQIGNINLALECHYKSNKIAEK
NNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIDKASEIFYYVKNLAATDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVTLMLREAEAGLS
HDRLTSWGIGTSLLFLSLTYKNLGLIDKALLMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIANM
NKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDLPAPKQVEKVQITMMRLENS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 15 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR002182
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00931 NB-ARC; PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89922; Mature: 89790

Theoretical pI: Translated: 6.47; Mature: 6.47

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ELWQILTNVLGEKVSKSNFSSVVQRLWQSQRLQKMSPIVNSVLNNGKSQELDYNFVGRDR
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
EIGELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFDFLELWMAKESQHIVSVESVV
CHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
EEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
HHHHHCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHH
LLRVLADPSIQSITLITSRERLYESDVDLTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSSALSE
HHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
MYKAFGGNAKAMQIISGAITTDFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLEQMDS
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRVVRYLTDRLLIEFRKGKYWLH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEH
PVICTEAIARLKQSGEWQIANQQAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEQA
HHHHHHHHHHHHHCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
ADVIIRSRPKKCDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIYNLHSDYHLNILYNLLGRAYH
HHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
QIGNINLALECHYKSNKIAEKNNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIDKASEIFYYVKNLAA
HHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
TDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVTLMLREAEAGLSHDRLTSWGIGTSLLFLSLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YKNLGLIDKALLMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHH
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDLPAPKQVEKVQITMMRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHEE
ENS
CCC
>Mature Secondary Structure 
GAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
ELWQILTNVLGEKVSKSNFSSVVQRLWQSQRLQKMSPIVNSVLNNGKSQELDYNFVGRDR
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EEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
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EAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRVVRYLTDRLLIEFRKGKYWLH
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ADVIIRSRPKKCDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIYNLHSDYHLNILYNLLGRAYH
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHEE
ENS
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]