| Definition | Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007413 |
| Length | 6,365,727 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 75909556
Identifier: 75909556
GI number: 75909556
Start: 4169531
End: 4170838
Strand: Direct
Name: 75909556
Synonym: Ava_3350
Alternate gene names: NA
Gene position: 4169531-4170838 (Clockwise)
Preceding gene: 75909555
Following gene: 75909557
Centisome position: 65.5
GC content: 31.04
Gene sequence:
>1308_bases ATGGCAACCCATATTATAAAAAATCAAAGTAATCTGAACTGGCTATATCTTCATATAGCAATGTTTATCATTGGATTCAT ATTAATTATAACTAGGCGACCAGATGCAATTTTAAATCCTCAATTTTGGGCAGAAGACGGAACTATATTTTATGCCCAAG CTTACAATGATGGTATTTTGAAATCATTGTTTTCTCCCTATGCAGGATATCTACATACTGTTCCCAGGTTAACTGCTGCT TTCAGTATGTTTTTCTCTTTAAAAGCAGCACCCCTTGTGTTCAATGTAATTGCGATTACAATTCAAATTCTGCCAGTTAA TTTTCTAATCTCATCGAGATTTTCTAAGTTAATCCCCAAGCTCAATCATAGAATCGCCTTATCATTACTTTATTTAGCTT TACCTGGATGCTATGAGATTAATGCAAATCTTACTAATGCACAATGGCATCTAGCACTTTTAGTATTTATGGCAATGATT GCTCAATCTTTGCAATTATTACTTAATTTATTCGATGTTATCCTAATTTTTGTTGGCGGATTAACAGGGCCATTTGCAAT TATAATGATACCTGCTATTTTATTTTTTGGCATTTATAAAAAAAAGAACAATATTAGAATTAATAAATTATTTTACACAA AATTTTGGGTTTTAACAGCCACAGCAATAATTCAAATATTAATTATTTTTACTGATAAAAGAGGGCAAGAGAGGATCAAC GGATTAGATGCAAGCTTTCTATCTTTAGATTCTGTATCTACAATTGCAAAAATTTTGATAAATCATCTGTTTTTAATATC AATTTTGGGAACTAAAATGACAGATCATCTAGTCAAGAATTTCCCATTATACCTATATATAATCGTCGGTATATTAGCAT TAATTGTAGGGACTACTATTATAGTTTATGTATTAATGAGATCACCTCTAGAACTAAGATCATTTTTTGTATTTGCTGCT CTAATTCCTTTTACTGTTCTACTTTCAGAGTTTCCAAACATCAATGATTTTGCGCTGGTTGGTTTTGGTGGACGCTACTG GTTTAATTTAACACTGGCTTTTTGTGTAGGAATTTTATGGTTTTACTGCCACATAAGTAATAAAAATAAAAGTAATTATA TTTTACAGATAGGCACACTAATTGTCTTGTTACTGATGTTACTTGGCATAGTGAGTGATTGGCAGCATCCTCCTTTTACT GATTTTAAGTTTGCTGAATATGCTGACAAATTTACGGAATTAGCACCTAGAGAAAAAATAACAATTCCCATAAATCCAAG TTGGTCTATGGAACTAATAAAACATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTGAGTAAAGATCAAATCTATCTAAATTAATTTAATTCCGTACTTGAAAAGTATGATAGTACTTAAATACGAATTAATA AACTAATTGATGTTTTTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATATTGAATGTTGATTAAGTTCATTGCAGAATATTATCCTTGATTAATTTTTGGGGAGTTTGAGTAAATTTAATATG CAAAAAAACTGATATGAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Glucosyltransferase
Number of amino acids: Translated: 435; Mature: 434
Protein sequence:
>435_residues MATHIIKNQSNLNWLYLHIAMFIIGFILIITRRPDAILNPQFWAEDGTIFYAQAYNDGILKSLFSPYAGYLHTVPRLTAA FSMFFSLKAAPLVFNVIAITIQILPVNFLISSRFSKLIPKLNHRIALSLLYLALPGCYEINANLTNAQWHLALLVFMAMI AQSLQLLLNLFDVILIFVGGLTGPFAIIMIPAILFFGIYKKKNNIRINKLFYTKFWVLTATAIIQILIIFTDKRGQERIN GLDASFLSLDSVSTIAKILINHLFLISILGTKMTDHLVKNFPLYLYIIVGILALIVGTTIIVYVLMRSPLELRSFFVFAA LIPFTVLLSEFPNINDFALVGFGGRYWFNLTLAFCVGILWFYCHISNKNKSNYILQIGTLIVLLLMLLGIVSDWQHPPFT DFKFAEYADKFTELAPREKITIPINPSWSMELIKH
Sequences:
>Translated_435_residues MATHIIKNQSNLNWLYLHIAMFIIGFILIITRRPDAILNPQFWAEDGTIFYAQAYNDGILKSLFSPYAGYLHTVPRLTAA FSMFFSLKAAPLVFNVIAITIQILPVNFLISSRFSKLIPKLNHRIALSLLYLALPGCYEINANLTNAQWHLALLVFMAMI AQSLQLLLNLFDVILIFVGGLTGPFAIIMIPAILFFGIYKKKNNIRINKLFYTKFWVLTATAIIQILIIFTDKRGQERIN GLDASFLSLDSVSTIAKILINHLFLISILGTKMTDHLVKNFPLYLYIIVGILALIVGTTIIVYVLMRSPLELRSFFVFAA LIPFTVLLSEFPNINDFALVGFGGRYWFNLTLAFCVGILWFYCHISNKNKSNYILQIGTLIVLLLMLLGIVSDWQHPPFT DFKFAEYADKFTELAPREKITIPINPSWSMELIKH >Mature_434_residues ATHIIKNQSNLNWLYLHIAMFIIGFILIITRRPDAILNPQFWAEDGTIFYAQAYNDGILKSLFSPYAGYLHTVPRLTAAF SMFFSLKAAPLVFNVIAITIQILPVNFLISSRFSKLIPKLNHRIALSLLYLALPGCYEINANLTNAQWHLALLVFMAMIA QSLQLLLNLFDVILIFVGGLTGPFAIIMIPAILFFGIYKKKNNIRINKLFYTKFWVLTATAIIQILIIFTDKRGQERING LDASFLSLDSVSTIAKILINHLFLISILGTKMTDHLVKNFPLYLYIIVGILALIVGTTIIVYVLMRSPLELRSFFVFAAL IPFTVLLSEFPNINDFALVGFGGRYWFNLTLAFCVGILWFYCHISNKNKSNYILQIGTLIVLLLMLLGIVSDWQHPPFTD FKFAEYADKFTELAPREKITIPINPSWSMELIKH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49475; Mature: 49344
Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MATHIIKNQSNLNWLYLHIAMFIIGFILIITRRPDAILNPQFWAEDGTIFYAQAYNDGIL CCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCEEEEEECCCCHHH KSLFSPYAGYLHTVPRLTAAFSMFFSLKAAPLVFNVIAITIQILPVNFLISSRFSKLIPK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNHRIALSLLYLALPGCYEINANLTNAQWHLALLVFMAMIAQSLQLLLNLFDVILIFVGG HHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LTGPFAIIMIPAILFFGIYKKKNNIRINKLFYTKFWVLTATAIIQILIIFTDKRGQERIN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHC GLDASFLSLDSVSTIAKILINHLFLISILGTKMTDHLVKNFPLYLYIIVGILALIVGTTI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVYVLMRSPLELRSFFVFAALIPFTVLLSEFPNINDFALVGFGGRYWFNLTLAFCVGILW HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH FYCHISNKNKSNYILQIGTLIVLLLMLLGIVSDWQHPPFTDFKFAEYADKFTELAPREKI HHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEE TIPINPSWSMELIKH EEECCCCCCHHHHCC >Mature Secondary Structure ATHIIKNQSNLNWLYLHIAMFIIGFILIITRRPDAILNPQFWAEDGTIFYAQAYNDGIL CCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCEEEEEECCCCHHH KSLFSPYAGYLHTVPRLTAAFSMFFSLKAAPLVFNVIAITIQILPVNFLISSRFSKLIPK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNHRIALSLLYLALPGCYEINANLTNAQWHLALLVFMAMIAQSLQLLLNLFDVILIFVGG HHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC LTGPFAIIMIPAILFFGIYKKKNNIRINKLFYTKFWVLTATAIIQILIIFTDKRGQERIN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHC GLDASFLSLDSVSTIAKILINHLFLISILGTKMTDHLVKNFPLYLYIIVGILALIVGTTI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVYVLMRSPLELRSFFVFAALIPFTVLLSEFPNINDFALVGFGGRYWFNLTLAFCVGILW HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH FYCHISNKNKSNYILQIGTLIVLLLMLLGIVSDWQHPPFTDFKFAEYADKFTELAPREKI HHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEE TIPINPSWSMELIKH EEECCCCCCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA