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Definition Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome, complete genome.
Accession NC_007413
Length 6,365,727

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The map label for this gene is 75908260

Identifier: 75908260

GI number: 75908260

Start: 2521347

End: 2524355

Strand: Direct

Name: 75908260

Synonym: Ava_2039

Alternate gene names: NA

Gene position: 2521347-2524355 (Clockwise)

Preceding gene: 75908259

Following gene: 75908262

Centisome position: 39.61

GC content: 42.64

Gene sequence:

>3009_bases
ATGGAATTGAAAAATTACTCGTTGGCGGCAAATCCAAGTTGGCTGGCACAACTTTTAAAATGGGTGAATCTACGACCAGA
GGAAGGCGAACGGACTTGGATGATGTTTGCCTTTTACACGACTGTATCTGTGGGGTTGCGATGGGCTGAGGATAGTACAG
TAGCACTATTTTTGGATGAATATGGCGCTGGGCCGTTGCCTTGGATGTATATTGCCAGTGCGGTTATGGGTATGGCGCTG
GTTTTTGTCTATTCTTGGTTGCAAAAGATTTTTCCTTTGCGCTGGGTGGTGGTGGCGATCGCACCTTGTATGGTCGTGCC
ATTAATCTTGTTAGTATTATTACGCTGGGGCATCCATCTTTCTTACTTTTCAGTCATTGTTGTATTTTTACTACGGTTGT
GGGTAGATTCCCTTTATGTAGTTAATGATCTAAATACTTCCATTGTTGCTAACCAATTATTTAATATTCGAGAAATTAAG
CGCACTTACCCACTGATTAGTAGCGGATTATTAGTGGCTGATGTGATCAGTGGCTTTAGTTTGCCTTGGTTGCTGGAGTT
CGCCAAACTCAACCGCGTGATTATGATCGCCTGTGGAGTGATTATGATTGGCTCGGCAATTCTCTGCTATTTAAGTTATC
AGTATCGCAGTTCTTTTCCCGAAGCACCACAGCGCCTAATTCCTCAAGAACAAGCCTCTCGGCATCGGCGTATCCAAGCA
CCACTCAAGCGTTATACTTTACAGCTATTTGCCTTTGTTGGGCTGTTACAAATTATTGGTTTATTAGTTGATTTTCAATA
TCTCCAAGAACTAAAAATCAACTTAGGCGATCGCGAACTAGCAGGCTTTTTAGGTATATTTGGTGGGATTGTTGGCTTGT
GTGAATTAGGAACTCAGTGGTTCGTTTCCAGCCGCTTGATCGAACGCTTTGGAGTGTTCTTTACTGCTGCACTTTTGCCT
GTGGCTGTAGGCTTTGTCGTTCCTGGGATGATTGTTGTACTTTACTTACTACCAGGAATACAATCACTGGCATTTTTCTG
GGGATTAGTCGGGTTGAAGTTCTTTGATGAACTGCTACGCTACACCTTCGTTATTAGTAGTGGGCCGTCACTATATCAAC
CGATACCAGAACGCATTCGTAGCCGGATGCAGGCATTATCAGGAGGAACGGCGGAAGCGATCGCCACTGGTACTGCTGGT
ATCATCATTGTGATTACCTTGTTTGTGTGTGGGTTATTTGTACCTGCAACAATGCAAAAGTGGGTGTTTATCTGCGAAAC
AATGGTAGTAGCCGTTGCCTGCTTGAAGGTAGTATGGTTATTGCGATCGCGTTATGTTGATTTGTTAGTCTTGAGCGCCG
ATAGAGGCGAACTAAGTGCCTCTAATGTGGGTTTACGTGCCTTTAAACAAGGGGTAGTCAAAGCTTTAGAAGAAAAGGGC
AACACCGCAGATAAACACTCATGTATTGAATTATTAGCCCAAATTGACCCCCAAGGGGCAGCAGATGTTCTCTCACCAAT
TTTATTTAAGCTAACGCCAGATTTACAACGCCATAGTTTAGAGGTGATGCTAGGGGCTGATGCTAATCCCACCCATGTAT
CGGAAGTAAAATGGTTGTTAGAGCGTCATCCAGACAATGTTAATCCCGAAGTTTTTGCCCTAGCATTACGTTATGTTTGG
CTAGCTGACCCCAATCCCAATTTAAGCCAACTGGAAGAATACCTCAACCAGCGCCACCACTCATTAACTCGCGCCACAGC
TGCGGCTTTGCTATTGCGTCAGGGAACACCAATCCAAAAAGTAGCCGCCACCAAGACTTTAAGCCGGATGCTAACCCATA
AGCAGGAACGAGAACGGGTTAATGGTGTCAAAGCCCTCCGAGAAGTGGTTTATTTACAGACGTTACGGATTCATATTCCT
AATTTGTTACAGGATGAATCCTTAAGGGTGCGTTGTGCTGTCTTAGAAATGATTGCTGCAACACGCATGGAAGAATACTA
TTCCTCACTGCTGACAGCACTTTATTACAAATCAACCCGTGCTACCGCCATGCGTGCCTTAATCAAAATGGAGAATGAAG
CATTGGATATGCTGTTACAACTGGCTACCAATGCCCATAAGCCAGAAGTATTAAGGATGTATGCTTGGCGTACCATAGGA
CAAATTTCTACTACAGAAGCTGTAGAGACTTTATGGTTGCAGTTGGAATCTTCTTGGGGTGCTACCAGGTACCATATTCT
GCGTAGCTTGTTGAAAATTCAGAAACAATCAGAAATTACCAATTTAGTAGATAGGTTTCAACACAGTCGGGTAGAAAGTC
TCATTGATCAGGAATTACGATTTTTGGGTGAGATTTATGCAGCTTATATAGACTTACGGCCACAATTAAATTTAGATAAT
AATCAAACAAATTCCAGAGCTTTGATTGTTGCGGATTTACTCCAACGTGCCTTGGCAGAAATGGAATGGGATATTCGGGA
ACGTTTATTATTATTATTAAAATTACTGTATTCACCAGATAAAATGCAGGCAGCCGCTTTTAATTTGCGGTCTGAATCGA
TGGTGAATTTAGCACGAGGATTGGAAATATTAGAACATACAGTAAATTTGCCCAGAAAATCATTGTTGTTAAATCTCTTA
GATAAGCGATCGCACCAAGAAAAGCTGCATGATCTTTTAGAGGCAGAATTCACAGAATATCAACCGTTGTCAGCTAGTGA
AAGATTGCGGAAGATGCTGACTTTAGGCACTTTTCTCTCTGATTGGTGCTTGGCTTGCTGTTTTCATTTTGCCCAGGTTA
ACCGGATTCGTTTGACAATTAACGAAATTCTGATGGCTTTGCGTCATCCTACGGGCTTTGTACGGGAAGCGGCGATCGCT
TATTTGAGTGTGGTTTCACATCGCGTCCTCTTAGAACTTCTGCCCAAATTAAAAAAAGATTCTCATCCCCTAGTAGCAGC
ACAAATTCAGGAATTGATCAAAAAATCCGCCATCAAAATTAATCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTGGGGATTGGTGAGCAATTATTAATTTTGAATTTTGAATTTTGAATTTTGAATTGATTGCTCCCCACTGGAAGGTG
AAGATACCAGAAAGTAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTCAATCAGTAGGGAGAATTCGTAATTCTGTCAGCTACTAAGGCTCAGAACTTTTCACTTCTTCAACTTGACCAACTTC
AAAAATCAAGGTGAATGGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1002; Mature: 1002

Protein sequence:

>1002_residues
MELKNYSLAANPSWLAQLLKWVNLRPEEGERTWMMFAFYTTVSVGLRWAEDSTVALFLDEYGAGPLPWMYIASAVMGMAL
VFVYSWLQKIFPLRWVVVAIAPCMVVPLILLVLLRWGIHLSYFSVIVVFLLRLWVDSLYVVNDLNTSIVANQLFNIREIK
RTYPLISSGLLVADVISGFSLPWLLEFAKLNRVIMIACGVIMIGSAILCYLSYQYRSSFPEAPQRLIPQEQASRHRRIQA
PLKRYTLQLFAFVGLLQIIGLLVDFQYLQELKINLGDRELAGFLGIFGGIVGLCELGTQWFVSSRLIERFGVFFTAALLP
VAVGFVVPGMIVVLYLLPGIQSLAFFWGLVGLKFFDELLRYTFVISSGPSLYQPIPERIRSRMQALSGGTAEAIATGTAG
IIIVITLFVCGLFVPATMQKWVFICETMVVAVACLKVVWLLRSRYVDLLVLSADRGELSASNVGLRAFKQGVVKALEEKG
NTADKHSCIELLAQIDPQGAADVLSPILFKLTPDLQRHSLEVMLGADANPTHVSEVKWLLERHPDNVNPEVFALALRYVW
LADPNPNLSQLEEYLNQRHHSLTRATAAALLLRQGTPIQKVAATKTLSRMLTHKQERERVNGVKALREVVYLQTLRIHIP
NLLQDESLRVRCAVLEMIAATRMEEYYSSLLTALYYKSTRATAMRALIKMENEALDMLLQLATNAHKPEVLRMYAWRTIG
QISTTEAVETLWLQLESSWGATRYHILRSLLKIQKQSEITNLVDRFQHSRVESLIDQELRFLGEIYAAYIDLRPQLNLDN
NQTNSRALIVADLLQRALAEMEWDIRERLLLLLKLLYSPDKMQAAAFNLRSESMVNLARGLEILEHTVNLPRKSLLLNLL
DKRSHQEKLHDLLEAEFTEYQPLSASERLRKMLTLGTFLSDWCLACCFHFAQVNRIRLTINEILMALRHPTGFVREAAIA
YLSVVSHRVLLELLPKLKKDSHPLVAAQIQELIKKSAIKINQ

Sequences:

>Translated_1002_residues
MELKNYSLAANPSWLAQLLKWVNLRPEEGERTWMMFAFYTTVSVGLRWAEDSTVALFLDEYGAGPLPWMYIASAVMGMAL
VFVYSWLQKIFPLRWVVVAIAPCMVVPLILLVLLRWGIHLSYFSVIVVFLLRLWVDSLYVVNDLNTSIVANQLFNIREIK
RTYPLISSGLLVADVISGFSLPWLLEFAKLNRVIMIACGVIMIGSAILCYLSYQYRSSFPEAPQRLIPQEQASRHRRIQA
PLKRYTLQLFAFVGLLQIIGLLVDFQYLQELKINLGDRELAGFLGIFGGIVGLCELGTQWFVSSRLIERFGVFFTAALLP
VAVGFVVPGMIVVLYLLPGIQSLAFFWGLVGLKFFDELLRYTFVISSGPSLYQPIPERIRSRMQALSGGTAEAIATGTAG
IIIVITLFVCGLFVPATMQKWVFICETMVVAVACLKVVWLLRSRYVDLLVLSADRGELSASNVGLRAFKQGVVKALEEKG
NTADKHSCIELLAQIDPQGAADVLSPILFKLTPDLQRHSLEVMLGADANPTHVSEVKWLLERHPDNVNPEVFALALRYVW
LADPNPNLSQLEEYLNQRHHSLTRATAAALLLRQGTPIQKVAATKTLSRMLTHKQERERVNGVKALREVVYLQTLRIHIP
NLLQDESLRVRCAVLEMIAATRMEEYYSSLLTALYYKSTRATAMRALIKMENEALDMLLQLATNAHKPEVLRMYAWRTIG
QISTTEAVETLWLQLESSWGATRYHILRSLLKIQKQSEITNLVDRFQHSRVESLIDQELRFLGEIYAAYIDLRPQLNLDN
NQTNSRALIVADLLQRALAEMEWDIRERLLLLLKLLYSPDKMQAAAFNLRSESMVNLARGLEILEHTVNLPRKSLLLNLL
DKRSHQEKLHDLLEAEFTEYQPLSASERLRKMLTLGTFLSDWCLACCFHFAQVNRIRLTINEILMALRHPTGFVREAAIA
YLSVVSHRVLLELLPKLKKDSHPLVAAQIQELIKKSAIKINQ
>Mature_1002_residues
MELKNYSLAANPSWLAQLLKWVNLRPEEGERTWMMFAFYTTVSVGLRWAEDSTVALFLDEYGAGPLPWMYIASAVMGMAL
VFVYSWLQKIFPLRWVVVAIAPCMVVPLILLVLLRWGIHLSYFSVIVVFLLRLWVDSLYVVNDLNTSIVANQLFNIREIK
RTYPLISSGLLVADVISGFSLPWLLEFAKLNRVIMIACGVIMIGSAILCYLSYQYRSSFPEAPQRLIPQEQASRHRRIQA
PLKRYTLQLFAFVGLLQIIGLLVDFQYLQELKINLGDRELAGFLGIFGGIVGLCELGTQWFVSSRLIERFGVFFTAALLP
VAVGFVVPGMIVVLYLLPGIQSLAFFWGLVGLKFFDELLRYTFVISSGPSLYQPIPERIRSRMQALSGGTAEAIATGTAG
IIIVITLFVCGLFVPATMQKWVFICETMVVAVACLKVVWLLRSRYVDLLVLSADRGELSASNVGLRAFKQGVVKALEEKG
NTADKHSCIELLAQIDPQGAADVLSPILFKLTPDLQRHSLEVMLGADANPTHVSEVKWLLERHPDNVNPEVFALALRYVW
LADPNPNLSQLEEYLNQRHHSLTRATAAALLLRQGTPIQKVAATKTLSRMLTHKQERERVNGVKALREVVYLQTLRIHIP
NLLQDESLRVRCAVLEMIAATRMEEYYSSLLTALYYKSTRATAMRALIKMENEALDMLLQLATNAHKPEVLRMYAWRTIG
QISTTEAVETLWLQLESSWGATRYHILRSLLKIQKQSEITNLVDRFQHSRVESLIDQELRFLGEIYAAYIDLRPQLNLDN
NQTNSRALIVADLLQRALAEMEWDIRERLLLLLKLLYSPDKMQAAAFNLRSESMVNLARGLEILEHTVNLPRKSLLLNLL
DKRSHQEKLHDLLEAEFTEYQPLSASERLRKMLTLGTFLSDWCLACCFHFAQVNRIRLTINEILMALRHPTGFVREAAIA
YLSVVSHRVLLELLPKLKKDSHPLVAAQIQELIKKSAIKINQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113672; Mature: 113672

Theoretical pI: Translated: 8.95; Mature: 8.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELKNYSLAANPSWLAQLLKWVNLRPEEGERTWMMFAFYTTVSVGLRWAEDSTVALFLDE
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEEC
YGAGPLPWMYIASAVMGMALVFVYSWLQKIFPLRWVVVAIAPCMVVPLILLVLLRWGIHL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYFSVIVVFLLRLWVDSLYVVNDLNTSIVANQLFNIREIKRTYPLISSGLLVADVISGFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
LPWLLEFAKLNRVIMIACGVIMIGSAILCYLSYQYRSSFPEAPQRLIPQEQASRHRRIQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHH
PLKRYTLQLFAFVGLLQIIGLLVDFQYLQELKINLGDRELAGFLGIFGGIVGLCELGTQW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVSSRLIERFGVFFTAALLPVAVGFVVPGMIVVLYLLPGIQSLAFFWGLVGLKFFDELLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTFVISSGPSLYQPIPERIRSRMQALSGGTAEAIATGTAGIIIVITLFVCGLFVPATMQK
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WVFICETMVVAVACLKVVWLLRSRYVDLLVLSADRGELSASNVGLRAFKQGVVKALEEKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NTADKHSCIELLAQIDPQGAADVLSPILFKLTPDLQRHSLEVMLGADANPTHVSEVKWLL
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHH
ERHPDNVNPEVFALALRYVWLADPNPNLSQLEEYLNQRHHSLTRATAAALLLRQGTPIQK
HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
VAATKTLSRMLTHKQERERVNGVKALREVVYLQTLRIHIPNLLQDESLRVRCAVLEMIAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHH
TRMEEYYSSLLTALYYKSTRATAMRALIKMENEALDMLLQLATNAHKPEVLRMYAWRTIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHC
QISTTEAVETLWLQLESSWGATRYHILRSLLKIQKQSEITNLVDRFQHSRVESLIDQELR
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLGEIYAAYIDLRPQLNLDNNQTNSRALIVADLLQRALAEMEWDIRERLLLLLKLLYSPD
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KMQAAAFNLRSESMVNLARGLEILEHTVNLPRKSLLLNLLDKRSHQEKLHDLLEAEFTEY
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QPLSASERLRKMLTLGTFLSDWCLACCFHFAQVNRIRLTINEILMALRHPTGFVREAAIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
YLSVVSHRVLLELLPKLKKDSHPLVAAQIQELIKKSAIKINQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MELKNYSLAANPSWLAQLLKWVNLRPEEGERTWMMFAFYTTVSVGLRWAEDSTVALFLDE
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEEC
YGAGPLPWMYIASAVMGMALVFVYSWLQKIFPLRWVVVAIAPCMVVPLILLVLLRWGIHL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYFSVIVVFLLRLWVDSLYVVNDLNTSIVANQLFNIREIKRTYPLISSGLLVADVISGFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCC
LPWLLEFAKLNRVIMIACGVIMIGSAILCYLSYQYRSSFPEAPQRLIPQEQASRHRRIQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHH
PLKRYTLQLFAFVGLLQIIGLLVDFQYLQELKINLGDRELAGFLGIFGGIVGLCELGTQW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVSSRLIERFGVFFTAALLPVAVGFVVPGMIVVLYLLPGIQSLAFFWGLVGLKFFDELLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTFVISSGPSLYQPIPERIRSRMQALSGGTAEAIATGTAGIIIVITLFVCGLFVPATMQK
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NTADKHSCIELLAQIDPQGAADVLSPILFKLTPDLQRHSLEVMLGADANPTHVSEVKWLL
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HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
VAATKTLSRMLTHKQERERVNGVKALREVVYLQTLRIHIPNLLQDESLRVRCAVLEMIAA
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TRMEEYYSSLLTALYYKSTRATAMRALIKMENEALDMLLQLATNAHKPEVLRMYAWRTIG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHC
QISTTEAVETLWLQLESSWGATRYHILRSLLKIQKQSEITNLVDRFQHSRVESLIDQELR
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLGEIYAAYIDLRPQLNLDNNQTNSRALIVADLLQRALAEMEWDIRERLLLLLKLLYSPD
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KMQAAAFNLRSESMVNLARGLEILEHTVNLPRKSLLLNLLDKRSHQEKLHDLLEAEFTEY
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QPLSASERLRKMLTLGTFLSDWCLACCFHFAQVNRIRLTINEILMALRHPTGFVREAAIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
YLSVVSHRVLLELLPKLKKDSHPLVAAQIQELIKKSAIKINQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA