| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007295 |
| Length | 897,405 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 71894021
Identifier: 71894021
GI number: 71894021
Start: 892390
End: 895008
Strand: Reverse
Name: 71894021
Synonym: MHJ_0673
Alternate gene names: NA
Gene position: 895008-892390 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71894022
Following gene: 71894020
Centisome position: 99.73
GC content: 25.47
Gene sequence:
>2619_bases ATCTGGAGAAATATAATGAAAAACAAAATCACACCTTGTATTTGGTCACTTATTTCAAACACTCACCTTAGAAAAGCCGA AAGTTTAGAAATTTTAATCCGTGCACTTCTTTTAAATAACGAAGAAATTAATCAAAATTTTAAAAATAAATGATTAAAAA TTTATAAAAATAAAAATTGAAAACCAATTGGCGATTTAAATGAACACTTAAAATTAGCAGCACAATTAGGAGTGACAAAA ACAGATATTTTAACTCCTGGACAACAAAAAATTAACATATTAGCCAAATTAGTAAACAGTGGGATTATTAAAATTAGAGA ATATATCAGCATAATTTTGTTTAATTTAGTTAGTTTTATCAATTATGAATATCGTCATATTTTTAAAATGACGCTTGAAT TGCTTAAAAAACAGAACAATTCTCCTGTTTCTGTTGATGAAATATTTCAAAATTTTAATTTTGGCGAACCAGTTTGCGCT GAATTTAACATAAAATTACTCCGTTACAATTTAAAACAAAAAGATCATATTTTTTATATTTTAATTTCAGGAGTTTTTTT TGAAGTTTTATCATCTCGGGGAAAAAATCAACAATATAACATTAATTTTTTTAAAATAAAACTTTATGATCACTGATATT CAAGGATTGATGAATTAATTAAAAGATGTAATAATCAGCTGGAAAGTTATAATTTTGAAAAAGCAAGTTTGATTAGGTTA GATTCTGAAAAATGATCAAATTATTTAACCCAAAATTCACAAGCAAATTACGATTATATCGTTGATGTTCTTATGCAAAA AGAGTCAAATAATCTTGATGAAAAAAATGATAATACTATAAATTTTAAAGCATCAATTAATCATTTAGAAAACCAAGTGC AGAAAAATTTAGAAAATTCCTTACAAGAAACACAAATAAATCAAGATATTTCAACTACAATTTCAAATAACCCCGAAAAA GTTGATATTGAATTAGAAGCTATTTTAGAAAATAGTCAAGAAAATAAAGTTGATTTATCAGAATTACCCGCAAATTTTAA TGATAAGGATCAAGCAGAAAGTCACCAAATTTCTCTTGAAAATGCAGATTTAACTTCCACAAATTCAGTTGAAAAACTTG AAATTGAAGAAAAAATACAAGAAAAACAGAGCGATATTCGCATAATTTCTAATAATTTAGAACAAAATTGTTGTCCAGAA CAAAATGTTGTTGAAAAAGAAATTGAAAAAACTTATGAAGACAATATAGAAAAAAACAGTTTTTACAGTAATTTTTACCA AGATCAATTTGAAAGAGATTTTAATAAAATTTCTGAACCATCTGGAGAAAAAAATCTGCAAGATAACGCACAAAGTGAAA TATGCGCAGCTGAAAAATGTTGTAATCACATCCAATTAGAAAAAGAAAATCTTGAACATATAGATTCTTCAAAACAAGAA AAGGTTGTTAAAATCAACAGCAATTATCTTAATAAAGGCGAAAAAAATAATTCTAATACTAATAAAAAAGTTCCTTCACT TCCGTTATTATACCAAGCAAAACAGGAAATGCAAAGGGAAATTTCAAAATATCCAATTTCAAAATCAGTTAATTCCAAGG AACATTACTATAATTATTTTATTCATAAAATTAACAAATTATTTAACTTTTCCTTGGAAAACATGTTAAATAAAACTAAT TTTAAGCAAAATTTTTTTAATATATTAGATTTTCATAAGAAAAATCACGAAATTATATTAAAGCCTAAAAAAACAATAAT AAAAAGTGGGAAAAACTTGCTCTTAATTTCCCCTTCGGCAAATTTAATTTATTCTAAGATTAAAAATGAATTATGTAAAA CAGAGATCAGCGAAAAAAACTATGAAATAGTGACTTTTTTTGATGATTATAACCCTGAAAGTTTTATCGGTTATAATGAT TTTGTTTTAGGTTCTAAGGAAAAATTAAACTTTATCCCTGGTCCTTTTGCAAGAATTTTACACAAGGCTTATTGAAATCC AGAAAAAAAATATTGCTTAATTCTTGAAAATATCGACAACGATGCCGCAAAAATCACATTAGCTCCTTTAAAACCGCTTT TTATTCGCGGAGAAAACGGTGAAAGTTTGCTCGGAATTTCGCAGTTTGATCTATCTTTCTATATATTTTCTCATCCTGAG GAAAAAAATTTTATCCCCGGAAATCTTACAATTATTGGTACAGTAAATTCTAATTTAGATAGGGACTTTGTTGATCTTTA CCCTGATTTTCTTGAAAATTGAGAGATTAAATATTTAGAAAGAGATAATTTATATTCACATATTACCAAATATCAAATTT GTGATACAGGATTATCTTGAAAACACTTTTCAGAGAAGTTAAATTCCTTGCTAGAATCAGAAAATTTAAACAATAAATGA TTTTTACCTAACCAAATTGAAACAAAAATTCTTGAAAATCCCCGGATTTTTGTAGATAAGGTTCTCTTTTCGCTTTGAAA TTTCACTTCACCCGAGAAAAGAAAGATAATTTTTAGATCAAATTCTTATTCTGTTATGGTTAAGGAATTTTTAGAAACTA AGGGATCAAAACGCTTAAATATTTTTAAATTCGACTATGAAAAAATTAAAAATATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGAAAGAAAAAAATGGGTTTAATTAAAATTATCCCCATTTTTTTAAAATTTTACTTGAAATTTAGTAAAATTTTATTAGT TTAAAAACGTTTAAAAATCA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAATTTAAATTATTTTTTGCCTAGTTTTGTTTTTTTAGGTGGCGCTTTTTTTGTTTTAGTTAGTTGTGGTTCAACCCATT TCGGGTTAAATATTTCAAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 872; Mature: 872
Protein sequence:
>872_residues MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNKWLKIYKNKNWKPIGDLNEHLKLAAQLGVTK TDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINYEYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCA EFNIKLLRYNLKQKDHIFYILISGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDHWYSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRL DSEKWSNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQETQINQDISTTISNNPEK VDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADLTSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPE QNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSNFYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQE KVVKINSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKINKLFNFSLENMLNKTN FKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIYSKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYND FVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAYWNPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPE EKNFIPGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLENWEIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLSWKHFSEKLNSLLESENLNNKW FLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSLWNFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKEFLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI
Sequences:
>Translated_872_residues MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNK*LKIYKNKN*KPIGDLNEHLKLAAQLGVTK TDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINYEYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCA EFNIKLLRYNLKQKDHIFYILISGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDH*YSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRL DSEK*SNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQETQINQDISTTISNNPEK VDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADLTSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPE QNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSNFYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQE KVVKINSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKINKLFNFSLENMLNKTN FKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIYSKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYND FVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY*NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPE EKNFIPGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLEN*EIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLS*KHFSEKLNSLLESENLNNK* FLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSL*NFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKEFLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI >Mature_872_residues MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNK*LKIYKNKN*KPIGDLNEHLKLAAQLGVTK TDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINYEYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCA EFNIKLLRYNLKQKDHIFYILISGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDH*YSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRL DSEK*SNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQETQINQDISTTISNNPEK VDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADLTSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPE QNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSNFYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQE KVVKINSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKINKLFNFSLENMLNKTN FKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIYSKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYND FVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY*NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPE EKNFIPGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLEN*EIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLS*KHFSEKLNSLLESENLNNK* FLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSL*NFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKEFLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI
Specific function: Unknown
COG id: COG1401
COG function: function code V; GTPase subunit of restriction endonuclease
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 100804; Mature: 100804
Theoretical pI: Translated: 6.87; Mature: 6.87
Prosite motif: PS01164 COPPER_AMINE_OXID_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNKLKIYKNKNKP CCHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEECCCCC IGDLNEHLKLAAQLGVTKTDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINY CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCAEFNIKLLRYNLKQKDHIFYILI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEHH SGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDHYSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRLDSE HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC KSNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQET CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QINQDISTTISNNPEKVDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADL HCCCCHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCC TSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPEQNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH FYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQEKVVK HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECHHHHHHCCCCCCCEEEE INSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKI ECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH NKLFNFSLENMLNKTNFKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIY HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHH SKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYNDFVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPEEKNFI CCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEEEEEECEEEEEEECCCCCCCC PGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLENEIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLSKHFSEKL CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NSLLESENLNNKFLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSLNFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKE HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH FLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI HHHCCCCCEEEEEEECHHHHCCC >Mature Secondary Structure MWRNIMKNKITPCIWSLISNTHLRKAESLEILIRALLLNNEEINQNFKNKLKIYKNKNKP CCHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHEEECCCCC IGDLNEHLKLAAQLGVTKTDILTPGQQKINILAKLVNSGIIKIREYISIILFNLVSFINY CCHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EYRHIFKMTLELLKKQNNSPVSVDEIFQNFNFGEPVCAEFNIKLLRYNLKQKDHIFYILI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEHH SGVFFEVLSSRGKNQQYNINFFKIKLYDHYSRIDELIKRCNNQLESYNFEKASLIRLDSE HHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC KSNYLTQNSQANYDYIVDVLMQKESNNLDEKNDNTINFKASINHLENQVQKNLENSLQET CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QINQDISTTISNNPEKVDIELEAILENSQENKVDLSELPANFNDKDQAESHQISLENADL HCCCCHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCC TSTNSVEKLEIEEKIQEKQSDIRIISNNLEQNCCPEQNVVEKEIEKTYEDNIEKNSFYSN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH FYQDQFERDFNKISEPSGEKNLQDNAQSEICAAEKCCNHIQLEKENLEHIDSSKQEKVVK HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECHHHHHHCCCCCCCEEEE INSNYLNKGEKNNSNTNKKVPSLPLLYQAKQEMQREISKYPISKSVNSKEHYYNYFIHKI ECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH NKLFNFSLENMLNKTNFKQNFFNILDFHKKNHEIILKPKKTIIKSGKNLLLISPSANLIY HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHH SKIKNELCKTEISEKNYEIVTFFDDYNPESFIGYNDFVLGSKEKLNFIPGPFARILHKAY HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC NPEKKYCLILENIDNDAAKITLAPLKPLFIRGENGESLLGISQFDLSFYIFSHPEEKNFI CCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEEEEEECEEEEEEECCCCCCCC PGNLTIIGTVNSNLDRDFVDLYPDFLENEIKYLERDNLYSHITKYQICDTGLSKHFSEKL CCCEEEEEECCCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NSLLESENLNNKFLPNQIETKILENPRIFVDKVLFSLNFTSPEKRKIIFRSNSYSVMVKE HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH FLETKGSKRLNIFKFDYEKIKNI HHHCCCCCEEEEEEECHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA