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The map label for this gene is 59712493

Identifier: 59712493

GI number: 59712493

Start: 2118702

End: 2120153

Strand: Direct

Name: 59712493

Synonym: VF_1886

Alternate gene names: NA

Gene position: 2118702-2120153 (Clockwise)

Preceding gene: 59712492

Following gene: 172087732

Centisome position: 73.12

GC content: 30.3

Gene sequence:

>1452_bases
ATGCTAGGTTATTTTCACTTTATTATCGGTTGTTTTTTCTTACTGATAAGCTTCAATTCGTCTGCAACTTCAGTCATGTC
CTCAGAATCTTGGCAAGAAGAATATCATTTAAACCGTATTGAGAATCCAAACAAAGCGCTTTCAATGCTAAACAATGTAT
ATTCATCACTACCACCAAGTGCTGAACGTATTTTTACTGCAACAAGAATCCATGGATTTGTAACGCGCCGTGGTAACGTA
TATACCTCCCCACTAAAAAATAATACAACGAATATTTATGATCACATTGAATCATTAATCTTATTATCTATGGACTTAGA
AGATAATGGAGATTATAAACAAGCTCTTCAGCAAATTAAGAAAGCTCAGTTAAAATCAAAAAATTTAAATGACTTAGATT
TAAATAGCTTGTTATCTATTAAACAGTGTCGTTCAAACCTAGCTTTAGGAAATTATTATCTCGCAGAGTTTTACTGCCAA
TCAGCAATAAAGCATTTAGAAAAAACAAAAGATCATTATATCGATATTAAATGGGCGTATCGCTTATTAGCTTTAAGCTA
CCAAGGCGTGAGTGATTTTAAATCCGCATTAAAAGCCAATGAAAAAGCATTATCTCTAAGCAAAAGTTATGAATTAAACG
ATACTATTTATAATAATATTAGCTCGTTATTACTACAGATGGGACAATTAAAAGAAGCAGAGAAATATGCGAAAAAAGCA
CTAAAAATAAGAGAAAAGCGTCAAATCAGCCAAAAAATTGCCCAATCACATATTGTTCTCGCACAAATATATTTAAAATC
ATCGCAATACGTTCACGCGAAATCGTGTGCAAATTTCGCTATAGCACAACTCAATGACAATACAGCTAATGCGCAAACTC
TTAGTCGAGCATACTTAACATTAGCAGCAGTTCTAAATAAACAAAGTTATTATGATGAAGCTATTGAATATCTACTACTC
ACATTAAAACAATTAGACAACAATTCAAATTCCGACTTACTTATCAATACTTACCAGCTACTTAGCAGTGCTTATTTAAA
ACATGAAAACTCAAATAAAGCATTAGACTACATATCAATTGCTATTGATAAATCTCTACAATCCCAGAACCAACAAGCAT
TAGCAAATTCATATCTCATAAAATCAGATATAGAAGAATTTACTGGTGATATAAAAGCTGCTCTTATTACTCGTAAGCTA
TATGAAAATGTTATCAAAAAAGTTCATGCTCTAAATGATGGTAATAAAGATATGACGTTAGAATTACGTAATATTTTGAT
TGAGAAAGAAAAAGAGAAACTGAATAATTTAAAAGAGAAACATCAACAAATAGTTGAAATTAATAAAGAAAAGCAACACA
AACTTTTATTTCAAGTTACTGTTATTATTCTAATTTTAATCATATACCTAATATTACGTATTCGATGGTTTCCTATGCAT
AAGCCAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGTTGTTTCTCATTGTTTTATGACTCTTACCAACGTTTTGCCTCCTTAGTTATTGTATTCTTAGTCAATAATTCAAATT
CAATTTCAAATCAGAACGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATCTATATTTAAATGTAGCAACGGATATGCATACAAAAAGTCGTAAGGAAAAATCAATTATTTTATTGAGGTCTTAAC
GATGAAATACACATTATTAG

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: TPR Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483

Protein sequence:

>483_residues
MLGYFHFIIGCFFLLISFNSSATSVMSSESWQEEYHLNRIENPNKALSMLNNVYSSLPPSAERIFTATRIHGFVTRRGNV
YTSPLKNNTTNIYDHIESLILLSMDLEDNGDYKQALQQIKKAQLKSKNLNDLDLNSLLSIKQCRSNLALGNYYLAEFYCQ
SAIKHLEKTKDHYIDIKWAYRLLALSYQGVSDFKSALKANEKALSLSKSYELNDTIYNNISSLLLQMGQLKEAEKYAKKA
LKIREKRQISQKIAQSHIVLAQIYLKSSQYVHAKSCANFAIAQLNDNTANAQTLSRAYLTLAAVLNKQSYYDEAIEYLLL
TLKQLDNNSNSDLLINTYQLLSSAYLKHENSNKALDYISIAIDKSLQSQNQQALANSYLIKSDIEEFTGDIKAALITRKL
YENVIKKVHALNDGNKDMTLELRNILIEKEKEKLNNLKEKHQQIVEINKEKQHKLLFQVTVIILILIIYLILRIRWFPMH
KPN

Sequences:

>Translated_483_residues
MLGYFHFIIGCFFLLISFNSSATSVMSSESWQEEYHLNRIENPNKALSMLNNVYSSLPPSAERIFTATRIHGFVTRRGNV
YTSPLKNNTTNIYDHIESLILLSMDLEDNGDYKQALQQIKKAQLKSKNLNDLDLNSLLSIKQCRSNLALGNYYLAEFYCQ
SAIKHLEKTKDHYIDIKWAYRLLALSYQGVSDFKSALKANEKALSLSKSYELNDTIYNNISSLLLQMGQLKEAEKYAKKA
LKIREKRQISQKIAQSHIVLAQIYLKSSQYVHAKSCANFAIAQLNDNTANAQTLSRAYLTLAAVLNKQSYYDEAIEYLLL
TLKQLDNNSNSDLLINTYQLLSSAYLKHENSNKALDYISIAIDKSLQSQNQQALANSYLIKSDIEEFTGDIKAALITRKL
YENVIKKVHALNDGNKDMTLELRNILIEKEKEKLNNLKEKHQQIVEINKEKQHKLLFQVTVIILILIIYLILRIRWFPMH
KPN
>Mature_483_residues
MLGYFHFIIGCFFLLISFNSSATSVMSSESWQEEYHLNRIENPNKALSMLNNVYSSLPPSAERIFTATRIHGFVTRRGNV
YTSPLKNNTTNIYDHIESLILLSMDLEDNGDYKQALQQIKKAQLKSKNLNDLDLNSLLSIKQCRSNLALGNYYLAEFYCQ
SAIKHLEKTKDHYIDIKWAYRLLALSYQGVSDFKSALKANEKALSLSKSYELNDTIYNNISSLLLQMGQLKEAEKYAKKA
LKIREKRQISQKIAQSHIVLAQIYLKSSQYVHAKSCANFAIAQLNDNTANAQTLSRAYLTLAAVLNKQSYYDEAIEYLLL
TLKQLDNNSNSDLLINTYQLLSSAYLKHENSNKALDYISIAIDKSLQSQNQQALANSYLIKSDIEEFTGDIKAALITRKL
YENVIKKVHALNDGNKDMTLELRNILIEKEKEKLNNLKEKHQQIVEINKEKQHKLLFQVTVIILILIIYLILRIRWFPMH
KPN

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55529; Mature: 55529

Theoretical pI: Translated: 9.49; Mature: 9.49

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLGYFHFIIGCFFLLISFNSSATSVMSSESWQEEYHLNRIENPNKALSMLNNVYSSLPPS
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AERIFTATRIHGFVTRRGNVYTSPLKNNTTNIYDHIESLILLSMDLEDNGDYKQALQQIK
HHHHHHHHHHHHHHEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHH
KAQLKSKNLNDLDLNSLLSIKQCRSNLALGNYYLAEFYCQSAIKHLEKTKDHYIDIKWAY
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHH
RLLALSYQGVSDFKSALKANEKALSLSKSYELNDTIYNNISSLLLQMGQLKEAEKYAKKA
HHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKIREKRQISQKIAQSHIVLAQIYLKSSQYVHAKSCANFAIAQLNDNTANAQTLSRAYLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
LAAVLNKQSYYDEAIEYLLLTLKQLDNNSNSDLLINTYQLLSSAYLKHENSNKALDYISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
AIDKSLQSQNQQALANSYLIKSDIEEFTGDIKAALITRKLYENVIKKVHALNDGNKDMTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
ELRNILIEKEKEKLNNLKEKHQQIVEINKEKQHKLLFQVTVIILILIIYLILRIRWFPMH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KPN
CCC
>Mature Secondary Structure
MLGYFHFIIGCFFLLISFNSSATSVMSSESWQEEYHLNRIENPNKALSMLNNVYSSLPPS
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
AERIFTATRIHGFVTRRGNVYTSPLKNNTTNIYDHIESLILLSMDLEDNGDYKQALQQIK
HHHHHHHHHHHHHHEECCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCHHHHHHHHH
KAQLKSKNLNDLDLNSLLSIKQCRSNLALGNYYLAEFYCQSAIKHLEKTKDHYIDIKWAY
HHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHH
RLLALSYQGVSDFKSALKANEKALSLSKSYELNDTIYNNISSLLLQMGQLKEAEKYAKKA
HHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKIREKRQISQKIAQSHIVLAQIYLKSSQYVHAKSCANFAIAQLNDNTANAQTLSRAYLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
LAAVLNKQSYYDEAIEYLLLTLKQLDNNSNSDLLINTYQLLSSAYLKHENSNKALDYISI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
AIDKSLQSQNQQALANSYLIKSDIEEFTGDIKAALITRKLYENVIKKVHALNDGNKDMTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
ELRNILIEKEKEKLNNLKEKHQQIVEINKEKQHKLLFQVTVIILILIIYLILRIRWFPMH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KPN
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA