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Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome.
Accession NC_006840
Length 2,897,536

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The map label for this gene is 59712262

Identifier: 59712262

GI number: 59712262

Start: 1865581

End: 1867980

Strand: Direct

Name: 59712262

Synonym: VF_1655

Alternate gene names: NA

Gene position: 1865581-1867980 (Clockwise)

Preceding gene: 59712259

Following gene: 59712263

Centisome position: 64.39

GC content: 39.12

Gene sequence:

>2400_bases
ATGACGTCTTATTTCGTCATAAATATTGAGACTTTTTCGTCACTTATGAATAATATTGTTACTCATTTTCTTTTAGCGTT
TGCTCTATTCTGTTCCTCACAAGCTTCTGCTGAATGGGGTATTAATACCTACAACCCAGTATCAATCTCGGAATCTGCAC
AAAAGATTGCGGCCGATATTAAACAGCTACCCGAACAGCACTTTTTCTCAAATAACGAATATCGACAAGTAAAAGAGTTG
ATGTCTCGAACTCTGTTTGAGCAAAATAAACAATTAAAAACATTAGAAGACTCTTTAGTTAACTATCGAAATGATGCGAC
AGACAAAAACTGGGCAAAGGTAGAACAAAATCATCGCTCACTGACATCGTTAAACGTGAGCAAAGAGAAGTTATTGCTAC
TTAGTGATACAAAAACACGCGACCAACTCACTGGATTTGGTCCTCGTGGTGTTACTCAGTTTTATTCTGAATTACGTATT
ACAAAACAAAATATTCAATACTATATTCACTACCAACTGCGCAGTTTTAAAAAACTACTGAGTGATTTAGCTATTTCACC
AGTACCTATGATTAGCGTGCTGTTTAAAGTGTTGTGTATCATGTTTATCTTTAATTGGTGGATGCGTAACAGCGATCGTC
TAATTCACGACTTTAAAGTGTCTAAGCTAAAGAGCACTTCAAATCCAAGTTTGCTGATCCGTACTATTTGGTATTGCAGT
CGTGCGCATAAAGCCATTGCATACTTGCTACTAATTACAGCGACATTACGCATTATTTCAACGTTACCAAGCTTACAGCA
TCTGATTTTCTTAGAGATCTTCACATGGTGGATCTTAGGTGGTTCCATTGCGGTAAGTTTTATTCTTGAATTTGCTTTCC
GTAATAGCAAACACAATAAAAAAGAAAATATTGCACTTCGCTTATCCACGATTCGCCGTTATGTATGGGGGATAATTGTC
GCTGGTGTGATTTTACAGATCTCATCAAGAACATTAGGCCAAGGAACCATTTATGCATGGATTAACTCCTTTGTTGCTTT
GTTCTTTGTATTACTGACGATCATCAGCTTGAAGCAATGGAACAACACTATCTTTAGTCGTATTGATCGTTTCGAAACCT
ACCCTATTTCGGTTCAATGGGCGATCCGTAATAAAGATTCAATGTTTATGTCTATTCCAGCAACCGCTTGCTGTGCTGCG
TGGCTAATAGGCAGAACACTGCAACATCTTGTGCTTTCGACTTTGTCACAATACGCTGCATTCAGTCATGCCCTTGCTTA
CCTATTTAGAATAGAAGTGGCTAAACAAACAGAAGTCTCACGTGAACAATCGAACCTTGTGCGTGTAAAAGGTCCACTAG
CATTTGACTATATTGCACCTGGCTCTGAAGAATCCGAACTTATCGAAGATTATGCTAAAGATGAAATCATCTCTCTGTCA
CGCTACTTGTTAACTGACAGCCCAGCGGTATGTGTATTATCTGGCGAGCGTGGCGTAGGTACGACAACGGTACTTAAACG
CATTCTGAATAAAACTAAAAACGCAGTACCTATTTACATTAACTGCCCTTACGACGGTTACGCTGCACTATTACCAGAGT
TAGCTCAATTACTAGGATTAGATGCAGAATCATCTGAAAAAGATATCTTACAACACCTAAGAAACAGCGAGCAGTGCTAC
CTAATCGCTTTTGATAATGCACAACGATTAGTAAAACCAAAAGTGAACGGGTTAGTTGAACTAATGAAGTTAACCAACCT
ACTAAGACGTGCACGTAAGAGTCACCGTGTGGTTTTATCCATTGATAAATCAAGCTGGCGTTTTATTGACCGTGCTCGTG
GCGAACGTTTATTGTTTGATCTTGTTACGTTTATGCCTAAATGGACAGAGAAAGAAATTGGTCAACTGCTTGATTCACGT
ATCGTAAAAGAAAATAACGTAAACACCATTTCGTTTGATGGGTTAGTGCTGCCTAGACAATGGGATGAAGATAATTTAAG
TGATGAAGAACGCGCTAAAAATGGCTTCTACCGTATTTTATGGGACTACTCAGATGGTAACCCTACGGTTGCGCTGCGCT
TCTTTAGATTGTCACTATTTAGAGATAAAGACACAGATGCCATTTTAGTTCGTCTATTTAGAGCTCCACAATCGGATGAT
TTAGAAACCATGCCAAAACCAATGTTGGCCGTACTTCGCTCTATCGTACAGTTGGAAGTCGCTTCCCCTGAAGATCTGTG
TGATTGTAGTCGTCTGAGCATTGCGGAAGTCATTAGTACACTACGCTACTTCCAGAGCCGTGGTTACATTGAATGGAATG
ATGAAAAAGCACGTATATCAGACCACTGGTATCGTCATATTACTAACGTATTACATCGTCAACACTTACTGGTGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACGCCTTTTGTTTCTGATTTGATGCGTTTTACAAAAAAATAGATAAATTGCCACATTGATCACATTTCTCCTAAACCAA
CGCATTACCTATCATCAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATGATTCGTTTATTTGTACTTTGCTTATCGCTGATGATGAGCTCAACTGCATTGGCTGAAGATGCTCAATCAATCGATA
ATTTACAACAATTTGCCAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 799; Mature: 798

Protein sequence:

>799_residues
MTSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADIKQLPEQHFFSNNEYRQVKEL
MSRTLFEQNKQLKTLEDSLVNYRNDATDKNWAKVEQNHRSLTSLNVSKEKLLLLSDTKTRDQLTGFGPRGVTQFYSELRI
TKQNIQYYIHYQLRSFKKLLSDLAISPVPMISVLFKVLCIMFIFNWWMRNSDRLIHDFKVSKLKSTSNPSLLIRTIWYCS
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IVKENNVNTISFDGLVLPRQWDEDNLSDEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLFRDKDTDAILVRLFRAPQSDD
LETMPKPMLAVLRSIVQLEVASPEDLCDCSRLSIAEVISTLRYFQSRGYIEWNDEKARISDHWYRHITNVLHRQHLLVK

Sequences:

>Translated_799_residues
MTSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADIKQLPEQHFFSNNEYRQVKEL
MSRTLFEQNKQLKTLEDSLVNYRNDATDKNWAKVEQNHRSLTSLNVSKEKLLLLSDTKTRDQLTGFGPRGVTQFYSELRI
TKQNIQYYIHYQLRSFKKLLSDLAISPVPMISVLFKVLCIMFIFNWWMRNSDRLIHDFKVSKLKSTSNPSLLIRTIWYCS
RAHKAIAYLLLITATLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFAFRNSKHNKKENIALRLSTIRRYVWGIIV
AGVILQISSRTLGQGTIYAWINSFVALFFVLLTIISLKQWNNTIFSRIDRFETYPISVQWAIRNKDSMFMSIPATACCAA
WLIGRTLQHLVLSTLSQYAAFSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRVKGPLAFDYIAPGSEESELIEDYAKDEIISLS
RYLLTDSPAVCVLSGERGVGTTTVLKRILNKTKNAVPIYINCPYDGYAALLPELAQLLGLDAESSEKDILQHLRNSEQCY
LIAFDNAQRLVKPKVNGLVELMKLTNLLRRARKSHRVVLSIDKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKEIGQLLDSR
IVKENNVNTISFDGLVLPRQWDEDNLSDEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLFRDKDTDAILVRLFRAPQSDD
LETMPKPMLAVLRSIVQLEVASPEDLCDCSRLSIAEVISTLRYFQSRGYIEWNDEKARISDHWYRHITNVLHRQHLLVK
>Mature_798_residues
TSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADIKQLPEQHFFSNNEYRQVKELM
SRTLFEQNKQLKTLEDSLVNYRNDATDKNWAKVEQNHRSLTSLNVSKEKLLLLSDTKTRDQLTGFGPRGVTQFYSELRIT
KQNIQYYIHYQLRSFKKLLSDLAISPVPMISVLFKVLCIMFIFNWWMRNSDRLIHDFKVSKLKSTSNPSLLIRTIWYCSR
AHKAIAYLLLITATLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFAFRNSKHNKKENIALRLSTIRRYVWGIIVA
GVILQISSRTLGQGTIYAWINSFVALFFVLLTIISLKQWNNTIFSRIDRFETYPISVQWAIRNKDSMFMSIPATACCAAW
LIGRTLQHLVLSTLSQYAAFSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRVKGPLAFDYIAPGSEESELIEDYAKDEIISLSR
YLLTDSPAVCVLSGERGVGTTTVLKRILNKTKNAVPIYINCPYDGYAALLPELAQLLGLDAESSEKDILQHLRNSEQCYL
IAFDNAQRLVKPKVNGLVELMKLTNLLRRARKSHRVVLSIDKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKEIGQLLDSRI
VKENNVNTISFDGLVLPRQWDEDNLSDEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLFRDKDTDAILVRLFRAPQSDDL
ETMPKPMLAVLRSIVQLEVASPEDLCDCSRLSIAEVISTLRYFQSRGYIEWNDEKARISDHWYRHITNVLHRQHLLVK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92230; Mature: 92099

Theoretical pI: Translated: 9.47; Mature: 9.47

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADI
CCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
KQLPEQHFFSNNEYRQVKELMSRTLFEQNKQLKTLEDSLVNYRNDATDKNWAKVEQNHRS
HHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LTSLNVSKEKLLLLSDTKTRDQLTGFGPRGVTQFYSELRITKQNIQYYIHYQLRSFKKLL
HHHCCCCHHEEEEEECCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHH
SDLAISPVPMISVLFKVLCIMFIFNWWMRNSDRLIHDFKVSKLKSTSNPSLLIRTIWYCS
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
RAHKAIAYLLLITATLRIISTLPSLQHLIFLEIFTWWILGGSIAVSFILEFAFRNSKHNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
KENIALRLSTIRRYVWGIIVAGVILQISSRTLGQGTIYAWINSFVALFFVLLTIISLKQW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NNTIFSRIDRFETYPISVQWAIRNKDSMFMSIPATACCAAWLIGRTLQHLVLSTLSQYAA
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSHALAYLFRIEVAKQTEVSREQSNLVRVKGPLAFDYIAPGSEESELIEDYAKDEIISLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
RYLLTDSPAVCVLSGERGVGTTTVLKRILNKTKNAVPIYINCPYDGYAALLPELAQLLGL
HHHHCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCC
DAESSEKDILQHLRNSEQCYLIAFDNAQRLVKPKVNGLVELMKLTNLLRRARKSHRVVLS
CCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
IDKSSWRFIDRARGERLLFDLVTFMPKWTEKEIGQLLDSRIVKENNVNTISFDGLVLPRQ
ECCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCEECCCC
WDEDNLSDEERAKNGFYRILWDYSDGNPTVALRFFRLSLFRDKDTDAILVRLFRAPQSDD
CCCCCCCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
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HHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHH
DHWYRHITNVLHRQHLLVK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TSYFVINIETFSSLMNNIVTHFLLAFALFCSSQASAEWGINTYNPVSISESAQKIAADI
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DHWYRHITNVLHRQHLLVK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA