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Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome.
Accession NC_006840
Length 2,897,536

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The map label for this gene is gdhB [H]

Identifier: 59711891

GI number: 59711891

Start: 1428697

End: 1433535

Strand: Direct

Name: gdhB [H]

Synonym: VF_1284

Alternate gene names: 59711891

Gene position: 1428697-1433535 (Clockwise)

Preceding gene: 59711890

Following gene: 59711892

Centisome position: 49.31

GC content: 39.31

Gene sequence:

>4839_bases
ATGACGACGCGTGATCCTATTGTTCCTGTACTACTTGAGAAAGTGTACGCTCTTATTGCTGAAAAGCTTGAAATGCCTCA
ACAATCCCTAATAACGCAACTTGCTCAGCGTTTATTTGCCAACATTGATGATGACGATTTACTGCAACGCAATGAATCAG
ATATGTATGGTGCAACACTCAGTCTTTGGAACCACTTATCTGATGTTAAAATATCAGATATTTCGGTTCGTGTTTTTAAT
CCTAAACTCAGTCAAGATGGGTGGCAGTCAACACATACTGTAGTTGAGATTGTCACACCAGATAGCCCATTTTTAGTTGA
TTCCGTAAAAATGGCTTTAGCTCGTTTAGACATGACGAGCCATTTTATGCTTCACGGACCACATTGTTTTGGCCGTAACG
AAAGCGGTGAGATCATTTCAGTCTGTGAGAGTAACGCTGATATGCAACAAACTCTATTCCATTTTGAAGTTGATCATTTA
AATGACAAGGTTGAAATGGAAAGGCTTCAAAATGAATTGCTTATTGTTCTACAAGACATCCATCGGGTCGTGAATCAATG
GAAGCCGATGTCAGATAAATTGACTGAGGTAATTGAAGAGTTAAAAACGTCGGATTTACCAATAGTAAAAGAAGAGATAG
ATGAAGCCATTTCATTTCTTTCTTGGCTTAAAAATCACAACTTCACTTTGATGGGTTATAAGAACTTTGATTTACAAGCA
GTAGAAGGTGATCATGAGTTGGTTCCAACCCAAGAAGAAGGGTTAGGGCTGTTCTCGTTAGCGTCACGAATTCATACGAC
AAAGCTTTCCGAAATGCCATCTTCTGCACGAGCTGCAGCAAAGAAATCAGATCTTCTTATTCTTACCAAATCAAACACCA
AATCACGAATTCACCGTCCTGCTTATACTGATTACATCGGTATCAAACGTTTAAATAAAGAAGGTAAGGTAATAGGCGAG
CATCGCTTTACAGGTCTTTATACGTCAACAGCATATAATCAAAGCGTTTCAAACATTCCATTATTGAGTAATAAAGTTGA
ACGTATCTTGGATGCGAGCAAATACATTAAGGGCTCACACTCTTATAAAGCTCTGCATAATATTCTAGAAACGTACCCAC
GAGATGAATTATTCCAAGCTAATGAAGAAGAGATGCTTGAAGTTGGCGTAGGTGTGGTAAAAATGCAAGATCGTGATTTA
TTGCGATTATTTGTCCGTCGTGATCCATTCGGACGCTTTTTCTCATGCATGGTGTATGTCACTAAAGAGCGTTATAACAC
AGAGTTACGTCGACAAACTCAACGTATATTACAAAATTATTTTGGCTCAAAACAAGAAGTTGAATTTACGACTTTCTTCT
CTGAAAGTGCGTTAGCAAGAACGCATTACATCGTTCGTGTCGATAATAATAATGGCGATATTAATGTGAAAGACATTGAA
AATAATCTAATGGAAGCCGCTTCAACATGGGATGATCGTCTTTGTGATGTGATTGTTGCTAATTTAGGTGAGAGCAAAGG
AACTGCAATAGCTAAACAGTATCAACGTGCTTTTCCTCGCTCGTATAAAGAAGCGACATTACCAGGCTCAGCGGTTGCGG
ATATTGAACGATTAGAACTGCTAAACGATGATAACAAATTAGGTATGCTTTTCTATCGTCCACAAGAAGAGAAGAAAGGG
TCAGCCAATGTTAAATTAAAATTGTTCCATCGTGATGAGCCAATTCACTTATCTGATGTGATGCCAATGCTTGAAAACCT
AGGGTTACGAGTTATTGGTGAGTCACCATATGCGGTGAAAAAGAGTGATGGATCGGTTGATTGGATCTTAGATTTCTCGA
TGATTCATAATGGATCAGCTGAAGTGGATCTTCGTCAAGCTCGTGATCGTTTTCAAGAAGCGTTTGCTCAGATTTGGAAT
GGTCAATTAGAGAGTGATGGTTTTAACCGATTGGTTCTAGGTGCTGGTTTATCTGGCCGTGAAGTGACTATTTTACGTGC
TTATGCGCGTTATATGCGTCAAGTTGGCTTCCCATTTAGTCAGCAATATATTGAAGATACATTATCAACCCACACTGATT
TAGCGGTTTCTGTGGTTAAACTGTTTGAACTCCGCTTTGATCCTAAATCGAATTGGTCTGATAAAAAAGAACAAAAACAA
CTAGATGCCATTTATTCAAGCTTGGATAAAGTAGAGAGTCTAGATGATGATCGTATTATTCGTCGTTATGTAGAAATGAT
CGTTGCGACGTTACGTACCAACTACTATCAAACTGCAGAAGATGGGCAAGCTAAGCCTTGGTTATCGTTAAAGATGCAAC
CATCAAATATTCCTGAAATCCCAGCACCAGTACCTGCGTATGAAATTTTCGTTTATGCGCCAGATATTGAAGGTGTGCAT
TTACGTGGTGGAAAGGTAGCTCGTGGTGGATTACGTTGGTCTGATAGACAAGAAGATTTCCGAACCGAAGTGCTTGGCTT
AGTTAAAGCACAACAAGTTAAAAATACGGTTATTGTTCCTGTTGGTGCAAAAGGCGGTTTTGTTTGTAAGAAACAGCATA
ACTTTACGACTCGTGAAGATATCTTCGCTGAAGGTCAACGCTGCTATAAACAATTCATTCGAGCGTTATTGGATGTATCT
GATAATATTATTGAAGGCGAGGTGGTTCCTCCATCTAATGTTGTTCGTCATGATGACGATGATCCGTATTTGGTTGTTGC
AGCAGATAAAGGTACCGCAACCTTCTCTGATTTAGCTAACTCAGTATCAGAAGAGTATAACTTCTGGTTAGGGGATGCAT
TTGCTTCCGGTGGTTCTAATGGTTATGACCATAAAGCCATGGGTATTACAGCAAAAGGGGCTTGGGAGTCGGTAAAACGT
CATTTCCGTGAAATGGGAATTGATTGTCAAACAACTGATTTTACAGCCATTGGTGTTGGCGATATGGCTGGTGATGTGTT
TGGTAATGGTATGCTTTTATCAAAACACATTCGATTACAAGCCGCATTTAACCATTTACATATATTTATCGATCCAAATC
CTAATTCTGAATTGACTTGGCCAGAGCGTAAGCGTTTATTTGAGCTTCAGGGATCGAGTTGGGAAGACTACAACAAATCA
TTGATCTCTCAAGGCGGTGGTATTTTCTCTCGCCGAGCGAAATCGATCGAACTTTCTCCTGAAATTCAGAAAATGTTAGG
TACTCGCAAGCAATCTCTTGCTCCAAATGATCTTATTCAGATGATCTTAAAAATGGACGTTGATCTGTTATGGAACGGTG
GGATTGGTACTTACGTTAAATCCAGTAAAGAAACCAGTGTTGATGTTGGTGACCGTGCTAATGATGCCTTACGTATCAAT
GGCTCAGAGCTAAATGCTAAAGTAGTTGGCGAGGGTGGTAACTTAGGCATGACTCAATTAGGGCGTATTGAATATGCACT
AAAAGGTGGTCGAGTTAACACCGATTTTGTTGATAATGTTGGTGGGGTTGATTGTTCTGATAATGAAGTAAACATTAAGA
TCTTACTGAATGGCTTAGTGGCTAATGGCGATCTTACTTATAAACAACGCAACGTACTTCTTGAGAAAATGGAAGATGAA
GTCGGTCAAATTGTTCTTGATGATGCGTATTGTCAGTCTGAATCGATCTCAGTAACAGAGCAACAAGGTACATCATTGGT
GAAAGAGCAGATCCGCTTTATTCATCACTTAGAAAAACAAGGTAAGTTAGATCGTGCTTTAGAGTTTATTCCAGACGATG
AAACTTTAATTGAGCGAGAGAAAATGGGGCAGGCATTAACCCGTCCAGAGCTTTCTGTTCTTGTTGCCTACGGAAAAATG
GTATTAAAAGATCAGCTAGCTTGTGATGAAATCGCAAATAATCCGTATCATGCTGATTTATTAACAACGTATTTCCCAAC
TGAGTTACAACGTAACTATAAGGCTGCAATGGATAACCATCCATTACGTTCAGAGATTATTGCGACTTGTTTAGCCAATC
AGATGGTTAATGAGATGGGGTGCAATTTTATCACTCGTCTACAAGAAGAAACAGGTTACGCCGTCACTGATATTGCTAAT
GCGTATGCCGCAACTCGAGCTATCTTTGAATTTGGTGATTTATTTAAGCAAATTCGTGAGTTGGATAATACGGCAACAAC
GGAAGCACAATATGAAGCCTTCTTTGCAATGCGCCGTACAATTCGTCGTGTTACTCGATGGTTATTGCGTAATGGCTCTC
AAAACATGTCCATTCAAGCACTTATCGAAAAATACAAATCAGCGGTTGATGATATTAAAGTGAATCTCGATGGGTATTTG
GTTAATGATGAGGTGGTGGAACATATTGAGCAGGCTAATCATTACTTTGAATTAGGGGTTCCGTGTGAACTTGGCAATGT
GCTAGCACGCTTAAGTAGTTTATATTCAGCGATGGATATTTCTGAAGTTGCAGAAGCCGCAGGGCAACCAGTGTCTGTCG
CATCACGTTTATACTATGTATTAGGTGATAAATTATCGCTTCATTGGTTCTTGAAACAAATTAACAACCAAGGAGTTGAT
AATCATTGGCAAGCCCTGGCTCGAGCATCATTTAGGGAAGATCTTGATTGGCAACAACGTCAATTAACGACCTTGGTTTT
AGCGGACTATAAAGATGATACAAGCATCGAAAATGCAATAGAAGAATGGTGTTTGAATAACGCTGCTTCTGTTGAGCGTT
GGGAAAATATCTTGAATGAATTTAAGGTCGGTTCAGTGCACGAATTTGCTAAATTTTCAGTTGCACTGAGAGAATTAACC
TTATTAAATTTGAGTTGTTCTTCTGCTTTAGCAAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTTTCTGCCATATAATCCTTACAATGTAAGGTGCGTGGGCAGTTTCAACTGCTACACTATATAAATAATACTAATCATA
AAAAACGGAGCATTCGCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAACGCCGATAAAAATAGGGCAAGCCAAACGTTTGCTCTTCTATAAGGAAAGTGATTTTTTATTCACTTTCCTTTTTT
ATTACCCCGAGAATTTTCTC

Product: NAD-specific glutamate dehydrogenase

Products: NA

Alternate protein names: NAD-GDH; NAD(+)-dependent glutamate dehydrogenase [H]

Number of amino acids: Translated: 1612; Mature: 1611

Protein sequence:

>1612_residues
MTTRDPIVPVLLEKVYALIAEKLEMPQQSLITQLAQRLFANIDDDDLLQRNESDMYGATLSLWNHLSDVKISDISVRVFN
PKLSQDGWQSTHTVVEIVTPDSPFLVDSVKMALARLDMTSHFMLHGPHCFGRNESGEIISVCESNADMQQTLFHFEVDHL
NDKVEMERLQNELLIVLQDIHRVVNQWKPMSDKLTEVIEELKTSDLPIVKEEIDEAISFLSWLKNHNFTLMGYKNFDLQA
VEGDHELVPTQEEGLGLFSLASRIHTTKLSEMPSSARAAAKKSDLLILTKSNTKSRIHRPAYTDYIGIKRLNKEGKVIGE
HRFTGLYTSTAYNQSVSNIPLLSNKVERILDASKYIKGSHSYKALHNILETYPRDELFQANEEEMLEVGVGVVKMQDRDL
LRLFVRRDPFGRFFSCMVYVTKERYNTELRRQTQRILQNYFGSKQEVEFTTFFSESALARTHYIVRVDNNNGDINVKDIE
NNLMEAASTWDDRLCDVIVANLGESKGTAIAKQYQRAFPRSYKEATLPGSAVADIERLELLNDDNKLGMLFYRPQEEKKG
SANVKLKLFHRDEPIHLSDVMPMLENLGLRVIGESPYAVKKSDGSVDWILDFSMIHNGSAEVDLRQARDRFQEAFAQIWN
GQLESDGFNRLVLGAGLSGREVTILRAYARYMRQVGFPFSQQYIEDTLSTHTDLAVSVVKLFELRFDPKSNWSDKKEQKQ
LDAIYSSLDKVESLDDDRIIRRYVEMIVATLRTNYYQTAEDGQAKPWLSLKMQPSNIPEIPAPVPAYEIFVYAPDIEGVH
LRGGKVARGGLRWSDRQEDFRTEVLGLVKAQQVKNTVIVPVGAKGGFVCKKQHNFTTREDIFAEGQRCYKQFIRALLDVS
DNIIEGEVVPPSNVVRHDDDDPYLVVAADKGTATFSDLANSVSEEYNFWLGDAFASGGSNGYDHKAMGITAKGAWESVKR
HFREMGIDCQTTDFTAIGVGDMAGDVFGNGMLLSKHIRLQAAFNHLHIFIDPNPNSELTWPERKRLFELQGSSWEDYNKS
LISQGGGIFSRRAKSIELSPEIQKMLGTRKQSLAPNDLIQMILKMDVDLLWNGGIGTYVKSSKETSVDVGDRANDALRIN
GSELNAKVVGEGGNLGMTQLGRIEYALKGGRVNTDFVDNVGGVDCSDNEVNIKILLNGLVANGDLTYKQRNVLLEKMEDE
VGQIVLDDAYCQSESISVTEQQGTSLVKEQIRFIHHLEKQGKLDRALEFIPDDETLIEREKMGQALTRPELSVLVAYGKM
VLKDQLACDEIANNPYHADLLTTYFPTELQRNYKAAMDNHPLRSEIIATCLANQMVNEMGCNFITRLQEETGYAVTDIAN
AYAATRAIFEFGDLFKQIRELDNTATTEAQYEAFFAMRRTIRRVTRWLLRNGSQNMSIQALIEKYKSAVDDIKVNLDGYL
VNDEVVEHIEQANHYFELGVPCELGNVLARLSSLYSAMDISEVAEAAGQPVSVASRLYYVLGDKLSLHWFLKQINNQGVD
NHWQALARASFREDLDWQQRQLTTLVLADYKDDTSIENAIEEWCLNNAASVERWENILNEFKVGSVHEFAKFSVALRELT
LLNLSCSSALAR

Sequences:

>Translated_1612_residues
MTTRDPIVPVLLEKVYALIAEKLEMPQQSLITQLAQRLFANIDDDDLLQRNESDMYGATLSLWNHLSDVKISDISVRVFN
PKLSQDGWQSTHTVVEIVTPDSPFLVDSVKMALARLDMTSHFMLHGPHCFGRNESGEIISVCESNADMQQTLFHFEVDHL
NDKVEMERLQNELLIVLQDIHRVVNQWKPMSDKLTEVIEELKTSDLPIVKEEIDEAISFLSWLKNHNFTLMGYKNFDLQA
VEGDHELVPTQEEGLGLFSLASRIHTTKLSEMPSSARAAAKKSDLLILTKSNTKSRIHRPAYTDYIGIKRLNKEGKVIGE
HRFTGLYTSTAYNQSVSNIPLLSNKVERILDASKYIKGSHSYKALHNILETYPRDELFQANEEEMLEVGVGVVKMQDRDL
LRLFVRRDPFGRFFSCMVYVTKERYNTELRRQTQRILQNYFGSKQEVEFTTFFSESALARTHYIVRVDNNNGDINVKDIE
NNLMEAASTWDDRLCDVIVANLGESKGTAIAKQYQRAFPRSYKEATLPGSAVADIERLELLNDDNKLGMLFYRPQEEKKG
SANVKLKLFHRDEPIHLSDVMPMLENLGLRVIGESPYAVKKSDGSVDWILDFSMIHNGSAEVDLRQARDRFQEAFAQIWN
GQLESDGFNRLVLGAGLSGREVTILRAYARYMRQVGFPFSQQYIEDTLSTHTDLAVSVVKLFELRFDPKSNWSDKKEQKQ
LDAIYSSLDKVESLDDDRIIRRYVEMIVATLRTNYYQTAEDGQAKPWLSLKMQPSNIPEIPAPVPAYEIFVYAPDIEGVH
LRGGKVARGGLRWSDRQEDFRTEVLGLVKAQQVKNTVIVPVGAKGGFVCKKQHNFTTREDIFAEGQRCYKQFIRALLDVS
DNIIEGEVVPPSNVVRHDDDDPYLVVAADKGTATFSDLANSVSEEYNFWLGDAFASGGSNGYDHKAMGITAKGAWESVKR
HFREMGIDCQTTDFTAIGVGDMAGDVFGNGMLLSKHIRLQAAFNHLHIFIDPNPNSELTWPERKRLFELQGSSWEDYNKS
LISQGGGIFSRRAKSIELSPEIQKMLGTRKQSLAPNDLIQMILKMDVDLLWNGGIGTYVKSSKETSVDVGDRANDALRIN
GSELNAKVVGEGGNLGMTQLGRIEYALKGGRVNTDFVDNVGGVDCSDNEVNIKILLNGLVANGDLTYKQRNVLLEKMEDE
VGQIVLDDAYCQSESISVTEQQGTSLVKEQIRFIHHLEKQGKLDRALEFIPDDETLIEREKMGQALTRPELSVLVAYGKM
VLKDQLACDEIANNPYHADLLTTYFPTELQRNYKAAMDNHPLRSEIIATCLANQMVNEMGCNFITRLQEETGYAVTDIAN
AYAATRAIFEFGDLFKQIRELDNTATTEAQYEAFFAMRRTIRRVTRWLLRNGSQNMSIQALIEKYKSAVDDIKVNLDGYL
VNDEVVEHIEQANHYFELGVPCELGNVLARLSSLYSAMDISEVAEAAGQPVSVASRLYYVLGDKLSLHWFLKQINNQGVD
NHWQALARASFREDLDWQQRQLTTLVLADYKDDTSIENAIEEWCLNNAASVERWENILNEFKVGSVHEFAKFSVALRELT
LLNLSCSSALAR
>Mature_1611_residues
TTRDPIVPVLLEKVYALIAEKLEMPQQSLITQLAQRLFANIDDDDLLQRNESDMYGATLSLWNHLSDVKISDISVRVFNP
KLSQDGWQSTHTVVEIVTPDSPFLVDSVKMALARLDMTSHFMLHGPHCFGRNESGEIISVCESNADMQQTLFHFEVDHLN
DKVEMERLQNELLIVLQDIHRVVNQWKPMSDKLTEVIEELKTSDLPIVKEEIDEAISFLSWLKNHNFTLMGYKNFDLQAV
EGDHELVPTQEEGLGLFSLASRIHTTKLSEMPSSARAAAKKSDLLILTKSNTKSRIHRPAYTDYIGIKRLNKEGKVIGEH
RFTGLYTSTAYNQSVSNIPLLSNKVERILDASKYIKGSHSYKALHNILETYPRDELFQANEEEMLEVGVGVVKMQDRDLL
RLFVRRDPFGRFFSCMVYVTKERYNTELRRQTQRILQNYFGSKQEVEFTTFFSESALARTHYIVRVDNNNGDINVKDIEN
NLMEAASTWDDRLCDVIVANLGESKGTAIAKQYQRAFPRSYKEATLPGSAVADIERLELLNDDNKLGMLFYRPQEEKKGS
ANVKLKLFHRDEPIHLSDVMPMLENLGLRVIGESPYAVKKSDGSVDWILDFSMIHNGSAEVDLRQARDRFQEAFAQIWNG
QLESDGFNRLVLGAGLSGREVTILRAYARYMRQVGFPFSQQYIEDTLSTHTDLAVSVVKLFELRFDPKSNWSDKKEQKQL
DAIYSSLDKVESLDDDRIIRRYVEMIVATLRTNYYQTAEDGQAKPWLSLKMQPSNIPEIPAPVPAYEIFVYAPDIEGVHL
RGGKVARGGLRWSDRQEDFRTEVLGLVKAQQVKNTVIVPVGAKGGFVCKKQHNFTTREDIFAEGQRCYKQFIRALLDVSD
NIIEGEVVPPSNVVRHDDDDPYLVVAADKGTATFSDLANSVSEEYNFWLGDAFASGGSNGYDHKAMGITAKGAWESVKRH
FREMGIDCQTTDFTAIGVGDMAGDVFGNGMLLSKHIRLQAAFNHLHIFIDPNPNSELTWPERKRLFELQGSSWEDYNKSL
ISQGGGIFSRRAKSIELSPEIQKMLGTRKQSLAPNDLIQMILKMDVDLLWNGGIGTYVKSSKETSVDVGDRANDALRING
SELNAKVVGEGGNLGMTQLGRIEYALKGGRVNTDFVDNVGGVDCSDNEVNIKILLNGLVANGDLTYKQRNVLLEKMEDEV
GQIVLDDAYCQSESISVTEQQGTSLVKEQIRFIHHLEKQGKLDRALEFIPDDETLIEREKMGQALTRPELSVLVAYGKMV
LKDQLACDEIANNPYHADLLTTYFPTELQRNYKAAMDNHPLRSEIIATCLANQMVNEMGCNFITRLQEETGYAVTDIANA
YAATRAIFEFGDLFKQIRELDNTATTEAQYEAFFAMRRTIRRVTRWLLRNGSQNMSIQALIEKYKSAVDDIKVNLDGYLV
NDEVVEHIEQANHYFELGVPCELGNVLARLSSLYSAMDISEVAEAAGQPVSVASRLYYVLGDKLSLHWFLKQINNQGVDN
HWQALARASFREDLDWQQRQLTTLVLADYKDDTSIENAIEEWCLNNAASVERWENILNEFKVGSVHEFAKFSVALRELTL
LNLSCSSALAR

Specific function: Involved in arginine catabolism by converting L- glutamate, into 2-oxoglutarate, which is then channeled into the tricarboxylic acid cycle. Can also utilize other amino acids of the glutamate family [H]

COG id: COG2902

COG function: function code E; NAD-specific glutamate dehydrogenase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenases family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR007780 [H]

Pfam domain/function: PF05088 Bac_GDH [H]

EC number: =1.4.1.2 [H]

Molecular weight: Translated: 182418; Mature: 182287

Theoretical pI: Translated: 5.10; Mature: 5.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTTRDPIVPVLLEKVYALIAEKLEMPQQSLITQLAQRLFANIDDDDLLQRNESDMYGATL
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHH
SLWNHLSDVKISDISVRVFNPKLSQDGWQSTHTVVEIVTPDSPFLVDSVKMALARLDMTS
HHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HFMLHGPHCFGRNESGEIISVCESNADMQQTLFHFEVDHLNDKVEMERLQNELLIVLQDI
HHEEECCEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HRVVNQWKPMSDKLTEVIEELKTSDLPIVKEEIDEAISFLSWLKNHNFTLMGYKNFDLQA
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEE
VEGDHELVPTQEEGLGLFSLASRIHTTKLSEMPSSARAAAKKSDLLILTKSNTKSRIHRP
ECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHCCC
AYTDYIGIKRLNKEGKVIGEHRFTGLYTSTAYNQSVSNIPLLSNKVERILDASKYIKGSH
CHHHHHHHHHCCCCCCEEECEEECEEEECCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SYKALHNILETYPRDELFQANEEEMLEVGVGVVKMQDRDLLRLFVRRDPFGRFFSCMVYV
HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
TKERYNTELRRQTQRILQNYFGSKQEVEFTTFFSESALARTHYIVRVDNNNGDINVKDIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHEEEEEEEEEECCCCCEEEEEHH
NNLMEAASTWDDRLCDVIVANLGESKGTAIAKQYQRAFPRSYKEATLPGSAVADIERLEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LNDDNKLGMLFYRPQEEKKGSANVKLKLFHRDEPIHLSDVMPMLENLGLRVIGESPYAVK
HCCCCCEEEEEECCCHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEE
KSDGSVDWILDFSMIHNGSAEVDLRQARDRFQEAFAQIWNGQLESDGFNRLVLGAGLSGR
CCCCCEEEEEEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCC
EVTILRAYARYMRQVGFPFSQQYIEDTLSTHTDLAVSVVKLFELRFDPKSNWSDKKEQKQ
CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
LDAIYSSLDKVESLDDDRIIRRYVEMIVATLRTNYYQTAEDGQAKPWLSLKMQPSNIPEI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC
PAPVPAYEIFVYAPDIEGVHLRGGKVARGGLRWSDRQEDFRTEVLGLVKAQQVKNTVIVP
CCCCCCEEEEEECCCCCCEEECCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
VGAKGGFVCKKQHNFTTREDIFAEGQRCYKQFIRALLDVSDNIIEGEVVPPSNVVRHDDD
ECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCC
DPYLVVAADKGTATFSDLANSVSEEYNFWLGDAFASGGSNGYDHKAMGITAKGAWESVKR
CCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
HFREMGIDCQTTDFTAIGVGDMAGDVFGNGMLLSKHIRLQAAFNHLHIFIDPNPNSELTW
HHHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHCCCEEEEHHHHHEEEECEEEEEECCCCCCCCCC
PERKRLFELQGSSWEDYNKSLISQGGGIFSRRAKSIELSPEIQKMLGTRKQSLAPNDLIQ
HHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHH
MILKMDVDLLWNGGIGTYVKSSKETSVDVGDRANDALRINGSELNAKVVGEGGNLGMTQL
HHHHCCCCEEECCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHH
GRIEYALKGGRVNTDFVDNVGGVDCSDNEVNIKILLNGLVANGDLTYKQRNVLLEKMEDE
CCCCEEEECCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VGQIVLDDAYCQSESISVTEQQGTSLVKEQIRFIHHLEKQGKLDRALEFIPDDETLIERE
HCCEEEEHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHH
KMGQALTRPELSVLVAYGKMVLKDQLACDEIANNPYHADLLTTYFPTELQRNYKAAMDNH
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCC
PLRSEIIATCLANQMVNEMGCNFITRLQEETGYAVTDIANAYAATRAIFEFGDLFKQIRE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDNTATTEAQYEAFFAMRRTIRRVTRWLLRNGSQNMSIQALIEKYKSAVDDIKVNLDGYL
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCEE
VNDEVVEHIEQANHYFELGVPCELGNVLARLSSLYSAMDISEVAEAAGQPVSVASRLYYV
ECHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
LGDKLSLHWFLKQINNQGVDNHWQALARASFREDLDWQQRQLTTLVLADYKDDTSIENAI
HCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHH
EEWCLNNAASVERWENILNEFKVGSVHEFAKFSVALRELTLLNLSCSSALAR
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TTRDPIVPVLLEKVYALIAEKLEMPQQSLITQLAQRLFANIDDDDLLQRNESDMYGATL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHH
SLWNHLSDVKISDISVRVFNPKLSQDGWQSTHTVVEIVTPDSPFLVDSVKMALARLDMTS
HHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HFMLHGPHCFGRNESGEIISVCESNADMQQTLFHFEVDHLNDKVEMERLQNELLIVLQDI
HHEEECCEECCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HRVVNQWKPMSDKLTEVIEELKTSDLPIVKEEIDEAISFLSWLKNHNFTLMGYKNFDLQA
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEE
VEGDHELVPTQEEGLGLFSLASRIHTTKLSEMPSSARAAAKKSDLLILTKSNTKSRIHRP
ECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHCCC
AYTDYIGIKRLNKEGKVIGEHRFTGLYTSTAYNQSVSNIPLLSNKVERILDASKYIKGSH
CHHHHHHHHHCCCCCCEEECEEECEEEECCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SYKALHNILETYPRDELFQANEEEMLEVGVGVVKMQDRDLLRLFVRRDPFGRFFSCMVYV
HHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
TKERYNTELRRQTQRILQNYFGSKQEVEFTTFFSESALARTHYIVRVDNNNGDINVKDIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHEEEEEEEEEECCCCCEEEEEHH
NNLMEAASTWDDRLCDVIVANLGESKGTAIAKQYQRAFPRSYKEATLPGSAVADIERLEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LNDDNKLGMLFYRPQEEKKGSANVKLKLFHRDEPIHLSDVMPMLENLGLRVIGESPYAVK
HCCCCCEEEEEECCCHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEE
KSDGSVDWILDFSMIHNGSAEVDLRQARDRFQEAFAQIWNGQLESDGFNRLVLGAGLSGR
CCCCCEEEEEEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCC
EVTILRAYARYMRQVGFPFSQQYIEDTLSTHTDLAVSVVKLFELRFDPKSNWSDKKEQKQ
CHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
LDAIYSSLDKVESLDDDRIIRRYVEMIVATLRTNYYQTAEDGQAKPWLSLKMQPSNIPEI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCC
PAPVPAYEIFVYAPDIEGVHLRGGKVARGGLRWSDRQEDFRTEVLGLVKAQQVKNTVIVP
CCCCCCEEEEEECCCCCCEEECCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
VGAKGGFVCKKQHNFTTREDIFAEGQRCYKQFIRALLDVSDNIIEGEVVPPSNVVRHDDD
ECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCC
DPYLVVAADKGTATFSDLANSVSEEYNFWLGDAFASGGSNGYDHKAMGITAKGAWESVKR
CCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHH
HFREMGIDCQTTDFTAIGVGDMAGDVFGNGMLLSKHIRLQAAFNHLHIFIDPNPNSELTW
HHHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHCCCEEEEHHHHHEEEECEEEEEECCCCCCCCCC
PERKRLFELQGSSWEDYNKSLISQGGGIFSRRAKSIELSPEIQKMLGTRKQSLAPNDLIQ
HHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHH
MILKMDVDLLWNGGIGTYVKSSKETSVDVGDRANDALRINGSELNAKVVGEGGNLGMTQL
HHHHCCCCEEECCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHH
GRIEYALKGGRVNTDFVDNVGGVDCSDNEVNIKILLNGLVANGDLTYKQRNVLLEKMEDE
CCCCEEEECCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
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