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The map label for this gene is 59711861

Identifier: 59711861

GI number: 59711861

Start: 1395094

End: 1396551

Strand: Reverse

Name: 59711861

Synonym: VF_1254

Alternate gene names: NA

Gene position: 1396551-1395094 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59711862

Following gene: 59711860

Centisome position: 48.2

GC content: 41.7

Gene sequence:

>1458_bases
ATGACACATTCATCAAAGCCTCTTCCATCCTTTGCATTAGCAATAGCTCCTATTGCTGTAATGTTTGGTCTACTGGCAAT
TGGATATGGCCTATTTGGTCTACAAATTGAAGCACTACTACTTACTTCAGCAACCTTCACTGGTTTTATTGCATATAAAA
TGGGATACAACTGGGATGAGATAATGAACGCCATTGTTGAGAAACTGGCGAAAGCAATGCCAGTTATCTTAATTTTAGTG
TCGGTTGGCGGCCTAATCGCAAGTTGGATGATCAGTGGCACTATCCCCTACATGGTTTATTGGGGATTAAAAGTTATTAG
CCCTCAATATATTTTAATCGCTGCTTTCTTTGTTACCAGTGTGGTTTCTGTGTGTACTGGTACATCATGGGGATCTGCAG
GAACAGTAGGTGTTGCGTTAATGGGTGTAGCAGCAGGTCTTGACGTATCCTTGGCGGCAGCTGCTGGCGCGGTGGTTTCT
GGCGCTTACTTTGGTGATAAAATCTCCCCTCTTTCTGATTCAACAAATTTTGCACCTATTGTTTCTGGCACTACATTATA
TGAACACATCCAACATATGCTTTATACCACGCTACCAGGCTTTGTTATTGCTTCTGTTGTCTTCTTCTTTGCTGGTCAAT
ACGGTGATATTACAAATGTGAGCGAACCTCAAAAAGTAGTTGATATCATTGCTGGCTTGGACAGTTTATATAACTTCAGC
ATTCTATTAATTGTGCCACCAATCATGATCTTATGGGGCGCATTCACGAAAAAACCAGTACTTCCTCTGATGCTTGCAGC
CTCTGCCCTTGCTCTACTTATCGGTGTATTTCTACAAGGCTTCAGCTTACAACAAGCACTGCAAGCGTTTGTTAATGGTT
TCAATATCGATATGTTGAACACTAACGGTCACACAACAGATGGTTTAGTTCCAGATATTGCAAAACTGCTTAATCGTGGT
GGCCTGTTCTCTATGATGAGCACCATTCTTCTTGTATTTTGTGCCTTTGCTTTTGCGGGAATTTTAAGTCTAACAGGTGC
ATTAAATGTGGTTCTAGGCCGCTTCTTACATCTTATTCACAGCACTGGTCAGTTAATTCTATCAACTGTGATTGCTACGA
TTACCGTGGTATTCACAACCTCTGATGGCAAACTTGCCTTATTAATCCCAGGTGAATTATTCCAAAATGCTTATCGCAAA
ATGGGATTGGACACTAAAAACCTTTCAAGAACTATTGAAGATGCGGGCACCATTATCGAACCACTGGTTCCGTGGACTGC
AGCAGGTATTTACATGGCAAGCACATTAGGCGTAGCAACGCTTGATTACCTCCCATGGGCAATTCAATGTTACACCGGCG
TGATTTTCGCCATCATTTATGGTTTCACAGGCTTTGGTATTGCAAAAGCACCAGTAACTCAAGACAACGACTCACTATCT
CCAGTTGACGTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATGAGTGCGTTACCTGTCTCTCATATTCTAATTAATAGAACTCTTATTATGACCTCATAAAAACAAAACAACCCTACAA
CTTTTTATGAGGAATACAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGCTATCTCATGACAACTTCTTTTGACTGCATTCACAACCGTTGTAACACAGGCTCATTAAAATGGGATTTCATGAAAGA
AAAACTCGGATTAGATGGCA

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 485; Mature: 484

Protein sequence:

>485_residues
MTHSSKPLPSFALAIAPIAVMFGLLAIGYGLFGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEIMNAIVEKLAKAMPVILILV
SVGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSVVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSLAAAAGAVVS
GAYFGDKISPLSDSTNFAPIVSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASVVFFFAGQYGDITNVSEPQKVVDIIAGLDSLYNFS
ILLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALALLIGVFLQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNTNGHTTDGLVPDIAKLLNRG
GLFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHSTGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQNAYRK
MGLDTKNLSRTIEDAGTIIEPLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLS
PVDVK

Sequences:

>Translated_485_residues
MTHSSKPLPSFALAIAPIAVMFGLLAIGYGLFGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEIMNAIVEKLAKAMPVILILV
SVGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSVVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSLAAAAGAVVS
GAYFGDKISPLSDSTNFAPIVSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASVVFFFAGQYGDITNVSEPQKVVDIIAGLDSLYNFS
ILLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALALLIGVFLQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNTNGHTTDGLVPDIAKLLNRG
GLFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHSTGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQNAYRK
MGLDTKNLSRTIEDAGTIIEPLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLS
PVDVK
>Mature_484_residues
THSSKPLPSFALAIAPIAVMFGLLAIGYGLFGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDEIMNAIVEKLAKAMPVILILVS
VGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTSVVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSLAAAAGAVVSG
AYFGDKISPLSDSTNFAPIVSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASVVFFFAGQYGDITNVSEPQKVVDIIAGLDSLYNFSI
LLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALALLIGVFLQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLNTNGHTTDGLVPDIAKLLNRGG
LFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIHSTGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQNAYRKM
GLDTKNLSRTIEDAGTIIEPLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLSP
VDVK

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51365; Mature: 51234

Theoretical pI: Translated: 5.57; Mature: 5.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTHSSKPLPSFALAIAPIAVMFGLLAIGYGLFGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDE
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IMNAIVEKLAKAMPVILILVSVGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSLAAAAGAVVSGAYFGDKISPLSDSTNFAPI
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
VSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASVVFFFAGQYGDITNVSEPQKVVDIIAGLDSLYNFS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ILLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALALLIGVFLQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEC
TNGHTTDGLVPDIAKLLNRGGLFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIH
CCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
STGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQNAYRKMGLDTKNLSRTIEDAGTIIE
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
PLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
PVDVK
CCCCC
>Mature Secondary Structure 
THSSKPLPSFALAIAPIAVMFGLLAIGYGLFGLQIEALLLTSATFTGFIAYKMGYNWDE
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
IMNAIVEKLAKAMPVILILVSVGGLIASWMISGTIPYMVYWGLKVISPQYILIAAFFVTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VVSVCTGTSWGSAGTVGVALMGVAAGLDVSLAAAAGAVVSGAYFGDKISPLSDSTNFAPI
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
VSGTTLYEHIQHMLYTTLPGFVIASVVFFFAGQYGDITNVSEPQKVVDIIAGLDSLYNFS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ILLIVPPIMILWGAFTKKPVLPLMLAASALALLIGVFLQGFSLQQALQAFVNGFNIDMLN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEC
TNGHTTDGLVPDIAKLLNRGGLFSMMSTILLVFCAFAFAGILSLTGALNVVLGRFLHLIH
CCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
STGQLILSTVIATITVVFTTSDGKLALLIPGELFQNAYRKMGLDTKNLSRTIEDAGTIIE
HHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
PLVPWTAAGIYMASTLGVATLDYLPWAIQCYTGVIFAIIYGFTGFGIAKAPVTQDNDSLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
PVDVK
CCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]