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The map label for this gene is nuoL [H]

Identifier: 58617217

GI number: 58617217

Start: 793675

End: 795600

Strand: Reverse

Name: nuoL [H]

Synonym: ERGA_CDS_04900

Alternate gene names: 58617217

Gene position: 795600-793675 (Counterclockwise)

Preceding gene: 58617218

Following gene: 58617216

Centisome position: 53.04

GC content: 28.04

Gene sequence:

>1926_bases
TTGTCTAGCTATTTATGTTTAAATATTAAAAATAGTAATTTATTGGAGATCAGTTTTATGATAAAAATAGAGCTATTATG
TGTATTATTACCTTTAATAGGTTCTGTTTTTGCTAATATAATAAGTCATCGATTTTTTGCACAGTTGTGTGCTGTTTTTT
TTATCACTTCTTCATCATTATTATCGTGGTATTTATTTTTCAATTTTCAAAATAGCTATATTATTGATTTATTCTCATGG
ATTCAAGTCTATGATTTAAAAATTCACTGGTCGTTGTATTTAGATTCTTTGAGTATTATTATGCTTGTTATAGTGAATAC
AGTGTCAGTAGTAGTACATATATATTCAATAGGTTATATGTCTCATGATGTAGGAGCAGCTAGGTTTTTGTCATACTTGT
CATTATTTACATTTTTTATGTTAATTTTAGTAACAAGTGGTAATTTTTTACAATTGTTTCTAGGGTGGGAAGGTGTTGGT
CTATGTTCTTACTTATTGATAGGATTTTGGTTTGAAAAATCTTCAGCTACTAAAGCTGCAATGAAGGCATTTATTATAAA
TAGAGTAGGTGATTTTTTTTTTATATTAGGGATTATAGCAGTATTTTTAGTATTTGATTCGTTAGATTTTGCTAGAGTAT
TTCATAGTATAGTGAATTCAGATTATAGAATTGGTATAATTAATTTTTTTGGTTATCAAGTCCCTTATATAGATGTTATA
TGTGTACTGCTTTTTATTGGATGTATGGGTAAGTCTGCTCAAATTGGTTTACATACGTGGTTGCCTGATGCTATGGAGGG
GCCTACTCCTGCTTCAGCATTGATTCATGCTGCAACTATGGTAACAGCTGGAGTATTTCTTGTTGTTAGGTGTTCTCCAT
TATTTGAGTTATCAGATGTAGCACGTCATTTTATATTAATTGTGGGAACAATTACTTGTTTATTTGCTGCTACTATTGCT
ATTGTTCAAACTGATTTAAAAAAGATAATAGCATATTCTACTTGTAGCCAATTAGGATATATGTTTCTTGCATGTGGTTT
GTCAGCATATAGTGTTGCTATATTTCATCTAATGACACACGCTTTTTTTAAAGCATTGTTGTTTTTATGTGCTGGTAATA
TAATTCATTCTACACATGAGCAAGATATTTATAAAATACGTGCTTCTTGGCGTCAAATACCATTCACGTATGTGTTAACT
TGGATAGGATCTTTAGCATTGGCAGGTATTTTCCCATTTGCTGGTTTTTATTCAAAAGATTTGATTATTGAAAGTAGTTA
TAATGTTAGTAATACTGCTTTTATAATATCTAACATAGTTGCATTTTTAACTGCATTTTATTCTTGGAGATTAATTATAA
TTGTTTTTCATGGTATTGATTCAGAAAAAAAATCTATATTTGAGTCAGGAAAAATAATGCTTTTGCCTTTGTTAGTATTA
TCTGTAGGTTCTATATTTTCTGGTATGTGGGGGGAAAAGGTATTACTAATAAATGATCATATATTTTGGAAAGGTAGCCT
TACAATACACACCCATGAAGATGTTGGGTTATTAATAAAGTTATTACCTTTAGTTTTAAGTGTTTTAGGGATAGTGTGTG
CATATTTAAGATATTATTTTAACTATTTTACTTTTTTTAAGTTTCATAGGTTAACTGAGTTCTTGTATAAAAAATGGTAT
ATTGATGAATTATATTATTACGTATTTGTAATACCTATTAAATTAATTGCTGACTTTTTTTCACAAATTATTGATAAAAA
AGTTATTGATTATTTTGGGTTAGGTGGTATTACTAGAACGGTAAATTCCTTATCAAAAGGTAGTGTTAAAATACAGACTG
GTTTTATTTTCGATTATGCATTTGTAATGTTATTAGGATTGATAAGTATTGTCATGTGGTTAATTTATAATAATACAGGA
TTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAGTGGGATTAGCAATTATTGTTGTATATTTTAGGAGTTGTGGAAATATTGATATTGAAACAGCAAATAAGATGAAAGA
ATAATGAAAATGTACTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACCTTATGCTGCTTTTTATGATTTTGTTGCCAATATTAGGGTCGTGCTTATTAACAATTAATAATTTTAAGACAACTTC
AGTATTGATAAAGGTAATTT

Product: NADH-quinone oxidoreductase chain L

Products: NA

Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit L; NDH-1 subunit L [H]

Number of amino acids: Translated: 641; Mature: 640

Protein sequence:

>641_residues
MSSYLCLNIKNSNLLEISFMIKIELLCVLLPLIGSVFANIISHRFFAQLCAVFFITSSSLLSWYLFFNFQNSYIIDLFSW
IQVYDLKIHWSLYLDSLSIIMLVIVNTVSVVVHIYSIGYMSHDVGAARFLSYLSLFTFFMLILVTSGNFLQLFLGWEGVG
LCSYLLIGFWFEKSSATKAAMKAFIINRVGDFFFILGIIAVFLVFDSLDFARVFHSIVNSDYRIGIINFFGYQVPYIDVI
CVLLFIGCMGKSAQIGLHTWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVVRCSPLFELSDVARHFILIVGTITCLFAATIA
IVQTDLKKIIAYSTCSQLGYMFLACGLSAYSVAIFHLMTHAFFKALLFLCAGNIIHSTHEQDIYKIRASWRQIPFTYVLT
WIGSLALAGIFPFAGFYSKDLIIESSYNVSNTAFIISNIVAFLTAFYSWRLIIIVFHGIDSEKKSIFESGKIMLLPLLVL
SVGSIFSGMWGEKVLLINDHIFWKGSLTIHTHEDVGLLIKLLPLVLSVLGIVCAYLRYYFNYFTFFKFHRLTEFLYKKWY
IDELYYYVFVIPIKLIADFFSQIIDKKVIDYFGLGGITRTVNSLSKGSVKIQTGFIFDYAFVMLLGLISIVMWLIYNNTG
F

Sequences:

>Translated_641_residues
MSSYLCLNIKNSNLLEISFMIKIELLCVLLPLIGSVFANIISHRFFAQLCAVFFITSSSLLSWYLFFNFQNSYIIDLFSW
IQVYDLKIHWSLYLDSLSIIMLVIVNTVSVVVHIYSIGYMSHDVGAARFLSYLSLFTFFMLILVTSGNFLQLFLGWEGVG
LCSYLLIGFWFEKSSATKAAMKAFIINRVGDFFFILGIIAVFLVFDSLDFARVFHSIVNSDYRIGIINFFGYQVPYIDVI
CVLLFIGCMGKSAQIGLHTWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVVRCSPLFELSDVARHFILIVGTITCLFAATIA
IVQTDLKKIIAYSTCSQLGYMFLACGLSAYSVAIFHLMTHAFFKALLFLCAGNIIHSTHEQDIYKIRASWRQIPFTYVLT
WIGSLALAGIFPFAGFYSKDLIIESSYNVSNTAFIISNIVAFLTAFYSWRLIIIVFHGIDSEKKSIFESGKIMLLPLLVL
SVGSIFSGMWGEKVLLINDHIFWKGSLTIHTHEDVGLLIKLLPLVLSVLGIVCAYLRYYFNYFTFFKFHRLTEFLYKKWY
IDELYYYVFVIPIKLIADFFSQIIDKKVIDYFGLGGITRTVNSLSKGSVKIQTGFIFDYAFVMLLGLISIVMWLIYNNTG
F
>Mature_640_residues
SSYLCLNIKNSNLLEISFMIKIELLCVLLPLIGSVFANIISHRFFAQLCAVFFITSSSLLSWYLFFNFQNSYIIDLFSWI
QVYDLKIHWSLYLDSLSIIMLVIVNTVSVVVHIYSIGYMSHDVGAARFLSYLSLFTFFMLILVTSGNFLQLFLGWEGVGL
CSYLLIGFWFEKSSATKAAMKAFIINRVGDFFFILGIIAVFLVFDSLDFARVFHSIVNSDYRIGIINFFGYQVPYIDVIC
VLLFIGCMGKSAQIGLHTWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVVRCSPLFELSDVARHFILIVGTITCLFAATIAI
VQTDLKKIIAYSTCSQLGYMFLACGLSAYSVAIFHLMTHAFFKALLFLCAGNIIHSTHEQDIYKIRASWRQIPFTYVLTW
IGSLALAGIFPFAGFYSKDLIIESSYNVSNTAFIISNIVAFLTAFYSWRLIIIVFHGIDSEKKSIFESGKIMLLPLLVLS
VGSIFSGMWGEKVLLINDHIFWKGSLTIHTHEDVGLLIKLLPLVLSVLGIVCAYLRYYFNYFTFFKFHRLTEFLYKKWYI
DELYYYVFVIPIKLIADFFSQIIDKKVIDYFGLGGITRTVNSLSKGSVKIQTGFIFDYAFVMLLGLISIVMWLIYNNTGF

Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. Couples the redox reaction to proton translocation (for every two electrons transferred, four hydrogen ions are translocated across the cyto

COG id: COG1009

COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=521, Percent_Identity=37.236084452975, Blast_Score=293, Evalue=3e-79,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=571, Percent_Identity=39.2294220665499, Blast_Score=333, Evalue=2e-92,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=500, Percent_Identity=29.2, Blast_Score=159, Evalue=5e-40,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=353, Percent_Identity=29.7450424929178, Blast_Score=130, Evalue=2e-31,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=363, Percent_Identity=28.6501377410468, Blast_Score=111, Evalue=1e-25,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=390, Percent_Identity=25.6410256410256, Blast_Score=86, Evalue=6e-18,
Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=155, Percent_Identity=25.8064516129032, Blast_Score=73, Evalue=5e-14,
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=209, Percent_Identity=26.3157894736842, Blast_Score=65, Evalue=2e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR001516
- InterPro:   IPR003945
- InterPro:   IPR018393 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N [H]

EC number: =1.6.99.5 [H]

Molecular weight: Translated: 72730; Mature: 72599

Theoretical pI: Translated: 8.02; Mature: 8.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSYLCLNIKNSNLLEISFMIKIELLCVLLPLIGSVFANIISHRFFAQLCAVFFITSSSL
CCCEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSWYLFFNFQNSYIIDLFSWIQVYDLKIHWSLYLDSLSIIMLVIVNTVSVVVHIYSIGYM
HHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
SHDVGAARFLSYLSLFTFFMLILVTSGNFLQLFLGWEGVGLCSYLLIGFWFEKSSATKAA
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
MKAFIINRVGDFFFILGIIAVFLVFDSLDFARVFHSIVNSDYRIGIINFFGYQVPYIDVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHCCCCCHHHHH
CVLLFIGCMGKSAQIGLHTWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVVRCSPLFELSDV
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHH
ARHFILIVGTITCLFAATIAIVQTDLKKIIAYSTCSQLGYMFLACGLSAYSVAIFHLMTH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFFKALLFLCAGNIIHSTHEQDIYKIRASWRQIPFTYVLTWIGSLALAGIFPFAGFYSKD
HHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LIIESSYNVSNTAFIISNIVAFLTAFYSWRLIIIVFHGIDSEKKSIFESGKIMLLPLLVL
EEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
SVGSIFSGMWGEKVLLINDHIFWKGSLTIHTHEDVGLLIKLLPLVLSVLGIVCAYLRYYF
HHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYFTFFKFHRLTEFLYKKWYIDELYYYVFVIPIKLIADFFSQIIDKKVIDYFGLGGITRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
VNSLSKGSVKIQTGFIFDYAFVMLLGLISIVMWLIYNNTGF
HHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SSYLCLNIKNSNLLEISFMIKIELLCVLLPLIGSVFANIISHRFFAQLCAVFFITSSSL
CCEEEEEECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSWYLFFNFQNSYIIDLFSWIQVYDLKIHWSLYLDSLSIIMLVIVNTVSVVVHIYSIGYM
HHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
SHDVGAARFLSYLSLFTFFMLILVTSGNFLQLFLGWEGVGLCSYLLIGFWFEKSSATKAA
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
MKAFIINRVGDFFFILGIIAVFLVFDSLDFARVFHSIVNSDYRIGIINFFGYQVPYIDVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHCCCCCHHHHH
CVLLFIGCMGKSAQIGLHTWLPDAMEGPTPASALIHAATMVTAGVFLVVRCSPLFELSDV
HHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHH
ARHFILIVGTITCLFAATIAIVQTDLKKIIAYSTCSQLGYMFLACGLSAYSVAIFHLMTH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFFKALLFLCAGNIIHSTHEQDIYKIRASWRQIPFTYVLTWIGSLALAGIFPFAGFYSKD
HHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
LIIESSYNVSNTAFIISNIVAFLTAFYSWRLIIIVFHGIDSEKKSIFESGKIMLLPLLVL
EEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
SVGSIFSGMWGEKVLLINDHIFWKGSLTIHTHEDVGLLIKLLPLVLSVLGIVCAYLRYYF
HHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYFTFFKFHRLTEFLYKKWYIDELYYYVFVIPIKLIADFFSQIIDKKVIDYFGLGGITRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
VNSLSKGSVKIQTGFIFDYAFVMLLGLISIVMWLIYNNTGF
HHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA