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The map label for this gene is yjbG [H]

Identifier: 56965659

GI number: 56965659

Start: 4059702

End: 4061489

Strand: Direct

Name: yjbG [H]

Synonym: ABC3901

Alternate gene names: 56965659

Gene position: 4059702-4061489 (Clockwise)

Preceding gene: 56965657

Following gene: 56965661

Centisome position: 94.33

GC content: 44.85

Gene sequence:

>1788_bases
TTGAGTACATACAAATCCCGTAAAGATGTACCTGAACATGAAAAATGGGACTTAACCGACCTTTATGCGGACGAACAAGC
GTGGCAGGCCGATGTAGACCAGTGCTATCAGCTAGCGGACACGTTAAGTCAATTTGATGGCGCGATTCAAGACGCAAAAA
GCTTGCTCGATTTCCTAGAAACACAAGAGAAGCTCTCCTTCACGTTGCGAAAAGTTTTCGCCTACACGATGTTTTTATCC
GATATTGACACACGGGACGCCCATGCCCAAAAATTAAGTGCCAAAGCGACACAACTAAGCGTAAAAGTGAGTGAATCCAC
CTCCTTCTTCATGCCGTTTCTTTTAAGTTTAAGCGAAGAGACGCTCCGTGCTTACATTTCTGCGGAAAAGAAACTTGCCT
ATTTCGAGGATGAATTGTGGAAGTCATTTCGCTTTAAAAAACATGTGCTGACAAAGGAAAAAGAAGAGCTTTTGTCGCAA
TTAGGCGCAACCTTTCAAGCCCCTGGCGACACATACAATATGCTGAACAATGCCGATATTCAGTTTGGCGTGGTGACAGA
CGACAATGGCCAGCAAGTGCAACTGACAAGGGGCATGTATTCAAAGCTCATCGAAGACGAAGACCGAAACAAGCGGAAAG
AAGCATACAAAGCTTACTACAAGCCGTACGTGGAATTAAACAATACGATTGCAACGACGCTGTCAGCAGAAATCAAAACA
AATGTCACATTGGCGAAAGTTCGTCAATACGAATCGGCTCTCCATAAAGCTTTATTTGCCGACAACATTGAGCAAAGCGT
CTATGACCAATTGATTGATGCGGCTAAAGCGAATATTGAACCGCTCCATGAATATGCGCGCCTCCGCAAACAAAAGCTCG
GCCTCGATGAATTGCGGCAATATGATTTGAATGCGCCAATTGTTCCTGGTGTGAAAGCGGAAATTTCGTATGAAGAAGCG
TATGAAACGATGCTGAAAGCGCTAAAGCCTCTTGGTGACGATTACATCGCCAAATTAAAAGAGTTTAAGGAAAAGCGTTA
CATTGATGTGCGTGAAACACCAGGAAAACGGTCTGGTGCTTACAATATGGGCGTCTACGGTGTCCATCCTTTCGTATTGC
TCAACCACCATGATGACTTAAACAGCTTGTTTACACTCGTTCATGAAATGGGCCATGCCATGCACAGCTACTATTCCAGC
AAATACCAACCACAAATTACGGCCAATTATCGAATTTTTGTCGCTGAAGTCGCTTCCACGGTGAATGAAGTGTTGCTAAT
TAACTATTTGCTGAAAGAAACAAGCGACAAGAGAATGCGCGCCTATTTACTGAACCATTTTATTGAGCAATTCCGCGGAA
CCTTTTTTACACAAGTCATGTTTGCTGATTTTGAAAAGCAAACGCACGAACGAGCCGAAGCAGGTGAACCGCTTAATGCA
GAGAGCTTAAATGAGCTTTATGAACAGTTGTTCCGTACCTACAATGGCCCAGACATTGTGTTTGATGACGAAGTCAAATA
CGGCTGGTCGCGCATCCCCCATTTTTACAGGGCTTTTTACGTTTACCAGTATGCGACTGGCTTTGCTTCAGCAATCAAAA
TCGCCACAGCCATTTTAGACGGTGAAGAAGGCGCACTCGACGCTTATATGACCTTTTTGCAAAGCGGAAGTTCCGACGAG
CCACTCGAACTGCTAAAAAAAGCAGGTGTCGACTTAACGACGCCTGAGCCAGTGCAAGCCGCGATGGCGCGCTTCTCTGC
ACTCGTGGAGGAACTAAAACAGCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCCACCGCCAGCAAAAATTCATACAAAAAAGCAGAAACGAACATATTTTCAGCGATAAGTGCTACACTAGAACGAAAAA
ACATGCAAGGAGTGATTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGCAGCGGAAGGAGAGCCCTTCCGCTGCTTTTTTGTCCTAGTACTTATCGTCAGGATGTTCATCCATGTCTCTAGC
GTAGCCGAAGCGAAAAAAGA

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 594

Protein sequence:

>595_residues
MSTYKSRKDVPEHEKWDLTDLYADEQAWQADVDQCYQLADTLSQFDGAIQDAKSLLDFLETQEKLSFTLRKVFAYTMFLS
DIDTRDAHAQKLSAKATQLSVKVSESTSFFMPFLLSLSEETLRAYISAEKKLAYFEDELWKSFRFKKHVLTKEKEELLSQ
LGATFQAPGDTYNMLNNADIQFGVVTDDNGQQVQLTRGMYSKLIEDEDRNKRKEAYKAYYKPYVELNNTIATTLSAEIKT
NVTLAKVRQYESALHKALFADNIEQSVYDQLIDAAKANIEPLHEYARLRKQKLGLDELRQYDLNAPIVPGVKAEISYEEA
YETMLKALKPLGDDYIAKLKEFKEKRYIDVRETPGKRSGAYNMGVYGVHPFVLLNHHDDLNSLFTLVHEMGHAMHSYYSS
KYQPQITANYRIFVAEVASTVNEVLLINYLLKETSDKRMRAYLLNHFIEQFRGTFFTQVMFADFEKQTHERAEAGEPLNA
ESLNELYEQLFRTYNGPDIVFDDEVKYGWSRIPHFYRAFYVYQYATGFASAIKIATAILDGEEGALDAYMTFLQSGSSDE
PLELLKKAGVDLTTPEPVQAAMARFSALVEELKQL

Sequences:

>Translated_595_residues
MSTYKSRKDVPEHEKWDLTDLYADEQAWQADVDQCYQLADTLSQFDGAIQDAKSLLDFLETQEKLSFTLRKVFAYTMFLS
DIDTRDAHAQKLSAKATQLSVKVSESTSFFMPFLLSLSEETLRAYISAEKKLAYFEDELWKSFRFKKHVLTKEKEELLSQ
LGATFQAPGDTYNMLNNADIQFGVVTDDNGQQVQLTRGMYSKLIEDEDRNKRKEAYKAYYKPYVELNNTIATTLSAEIKT
NVTLAKVRQYESALHKALFADNIEQSVYDQLIDAAKANIEPLHEYARLRKQKLGLDELRQYDLNAPIVPGVKAEISYEEA
YETMLKALKPLGDDYIAKLKEFKEKRYIDVRETPGKRSGAYNMGVYGVHPFVLLNHHDDLNSLFTLVHEMGHAMHSYYSS
KYQPQITANYRIFVAEVASTVNEVLLINYLLKETSDKRMRAYLLNHFIEQFRGTFFTQVMFADFEKQTHERAEAGEPLNA
ESLNELYEQLFRTYNGPDIVFDDEVKYGWSRIPHFYRAFYVYQYATGFASAIKIATAILDGEEGALDAYMTFLQSGSSDE
PLELLKKAGVDLTTPEPVQAAMARFSALVEELKQL
>Mature_594_residues
STYKSRKDVPEHEKWDLTDLYADEQAWQADVDQCYQLADTLSQFDGAIQDAKSLLDFLETQEKLSFTLRKVFAYTMFLSD
IDTRDAHAQKLSAKATQLSVKVSESTSFFMPFLLSLSEETLRAYISAEKKLAYFEDELWKSFRFKKHVLTKEKEELLSQL
GATFQAPGDTYNMLNNADIQFGVVTDDNGQQVQLTRGMYSKLIEDEDRNKRKEAYKAYYKPYVELNNTIATTLSAEIKTN
VTLAKVRQYESALHKALFADNIEQSVYDQLIDAAKANIEPLHEYARLRKQKLGLDELRQYDLNAPIVPGVKAEISYEEAY
ETMLKALKPLGDDYIAKLKEFKEKRYIDVRETPGKRSGAYNMGVYGVHPFVLLNHHDDLNSLFTLVHEMGHAMHSYYSSK
YQPQITANYRIFVAEVASTVNEVLLINYLLKETSDKRMRAYLLNHFIEQFRGTFFTQVMFADFEKQTHERAEAGEPLNAE
SLNELYEQLFRTYNGPDIVFDDEVKYGWSRIPHFYRAFYVYQYATGFASAIKIATAILDGEEGALDAYMTFLQSGSSDEP
LELLKKAGVDLTTPEPVQAAMARFSALVEELKQL

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68376; Mature: 68245

Theoretical pI: Translated: 5.01; Mature: 5.01

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTYKSRKDVPEHEKWDLTDLYADEQAWQADVDQCYQLADTLSQFDGAIQDAKSLLDFLE
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQEKLSFTLRKVFAYTMFLSDIDTRDAHAQKLSAKATQLSVKVSESTSFFMPFLLSLSEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
TLRAYISAEKKLAYFEDELWKSFRFKKHVLTKEKEELLSQLGATFQAPGDTYNMLNNADI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCE
QFGVVTDDNGQQVQLTRGMYSKLIEDEDRNKRKEAYKAYYKPYVELNNTIATTLSAEIKT
EEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHC
NVTLAKVRQYESALHKALFADNIEQSVYDQLIDAAKANIEPLHEYARLRKQKLGLDELRQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YDLNAPIVPGVKAEISYEEAYETMLKALKPLGDDYIAKLKEFKEKRYIDVRETPGKRSGA
HCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
YNMGVYGVHPFVLLNHHDDLNSLFTLVHEMGHAMHSYYSSKYQPQITANYRIFVAEVAST
CCCCEECCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEHHHHHHHH
VNEVLLINYLLKETSDKRMRAYLLNHFIEQFRGTFFTQVMFADFEKQTHERAEAGEPLNA
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
ESLNELYEQLFRTYNGPDIVFDDEVKYGWSRIPHFYRAFYVYQYATGFASAIKIATAILD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GEEGALDAYMTFLQSGSSDEPLELLKKAGVDLTTPEPVQAAMARFSALVEELKQL
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
STYKSRKDVPEHEKWDLTDLYADEQAWQADVDQCYQLADTLSQFDGAIQDAKSLLDFLE
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TQEKLSFTLRKVFAYTMFLSDIDTRDAHAQKLSAKATQLSVKVSESTSFFMPFLLSLSEE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
TLRAYISAEKKLAYFEDELWKSFRFKKHVLTKEKEELLSQLGATFQAPGDTYNMLNNADI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCCCCCE
QFGVVTDDNGQQVQLTRGMYSKLIEDEDRNKRKEAYKAYYKPYVELNNTIATTLSAEIKT
EEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHC
NVTLAKVRQYESALHKALFADNIEQSVYDQLIDAAKANIEPLHEYARLRKQKLGLDELRQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YDLNAPIVPGVKAEISYEEAYETMLKALKPLGDDYIAKLKEFKEKRYIDVRETPGKRSGA
HCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
YNMGVYGVHPFVLLNHHDDLNSLFTLVHEMGHAMHSYYSSKYQPQITANYRIFVAEVAST
CCCCEECCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEEHHHHHHHH
VNEVLLINYLLKETSDKRMRAYLLNHFIEQFRGTFFTQVMFADFEKQTHERAEAGEPLNA
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
ESLNELYEQLFRTYNGPDIVFDDEVKYGWSRIPHFYRAFYVYQYATGFASAIKIATAILD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GEEGALDAYMTFLQSGSSDEPLELLKKAGVDLTTPEPVQAAMARFSALVEELKQL
CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]