| Definition | Bacillus clausii KSM-K16, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006582 |
| Length | 4,303,871 |
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The map label for this gene is yjbB [H]
Identifier: 56963479
GI number: 56963479
Start: 1840238
End: 1841860
Strand: Direct
Name: yjbB [H]
Synonym: ABC1714
Alternate gene names: 56963479
Gene position: 1840238-1841860 (Clockwise)
Preceding gene: 56963478
Following gene: 56963480
Centisome position: 42.76
GC content: 42.08
Gene sequence:
>1623_bases GTGGGAGAGTTTCAAACGTTGCTGTTTACGTTTCTTGGAGGAATAGGGATCTTTCTATTTGCCGTCAAGTATATGGGTGA CGGACTCCAAAAGACAGCAGGAGACCGGTTGCGGGATTTGCTAGACAAATACACAACGAATCCTTTTATGGGTCTAATTT CGGGGATTGTCGTCACGATTTTACTGCAGAGCAGCACAGCGACAACGGTGTTGACGATCGGACTTGTGAATGCAGGCTTT ATGCGGCTTAGGCAAGCGATTGCTGTTATAATGGGCGCAAATATTGGGACAACAACAACAGCCTTTATTATTGGACTAAA TTTAAAAGAATACAGCTTGCCCATTATGGCAGTAGGGGCCTTTTTAATTTTCTTTTTCAAAAAGAAAAAAGTCAATCATA TCGGCCAGATCGTGTTTGGGTTTGGCGGGCTTTTTTATGGTCTAGATCTAATGGGAAGTAGCTTGCGGCCGCTTAGCAAT TGGGAACCATTTGTCGATTTTACTGTTAGGATGGGAGATAACCCATTTTTAGGAGTGATTGTAGGGGTGATTTTAGCTGT CGCCTTGCAAAGCTCGACTGCAGCAATCGGTCTGGTTCAGCAATTGTACGAGCAAGGAGCAATGGAACTACAAGCTGCGC TTCCCGTTTTAATTGGCGACAACATTGGTACTACCCTTACAGCTGTATTAGTTGCGATTGGTGCGACTGTAGGAGCACGA AGGGCTGCGCTCACCCATGTCGTGTTTAATGTCATTGGTGCGGTGTTAGTCATGATCGCGTTTCCTATTTTTGTAAACTT TATTGCTTTTTTAGGCGAACAATTCAATTTAGGCCCTTCCATGCAAATTGCATCAGCTCACGGTGTCTATAATGTCGCAA ATGTGATCATTCAATTTCCGTGTATCGCTTTACTGGCCTATATCGTTACGAAGCTTGTTCCAGGAGATGAACTTGCTTTA GATTACAAACCAAAACATTTAGATCCGATCTTTATCGGAAACTCGCCAGCAATTGCTTTAGGACAAGCCAAACAAGAAAT TATCCATATGGCCGATTACTCAAAAAAGGGATTAGAGCAAGCGATTCGCTATATGGAAACAGGCGAAAAGAAGGACGCCG AGTTGGCACTCCAGTATGAACAAGCGATTAACAATTTAGACCGCGAGATCACCGACTATTTGGTTAAAGTGTCGGCACGT TCCTTGTCGCCGACGGATTCCAATCTCCATTCAACGCTATTAAATGTTGTTAGGGATATTGAACGGATTGGCGATCATAT GGAAAACATTGTTGAACTGAAAGATTATCAAAAAGCGAATAAAGTGAAAATGAGCGATATTGCCTTAAATGACTTAAACG AGATGTTCAAATTAACGTATTCGACATTAGAAGAAGCAATGGATTCCCTTGAACGGGATGACCTTGATAAAGCCCATGAC GTTTTAAAACATGAAGATTTAATTGATAGCATGGAAAGAAAGCTAAGAAAACAACACATTAAACGGATAAATGAGGGCAA ATGTTCTGGTTCGGCGGGGATTGTCTTTGTCGATATTATTAGCAATTTAGAACGAATTGGCGACCATTCGGTCAACATTG CCCAATCGGTAATTGGCGATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTACAAATACTCAATAATTGTTTAATAATAGACACGGACCATAATGTTGAGGTTTGTCGAAAGACGCCCAAAAATGAGT TGGATGAAGGGATGAGATGC
Downstream 100 bases:
>100_bases CCTATATAACGGCCGGAAGTAAAAGCCGGCCGTTTTTTCTTAAATAATCGTTGCATCAAAGAGAAAAACGTGGTAATATA ATTTTTGTCCGAATGAGGAG
Product: sodium-dependent phosphate transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 540; Mature: 539
Protein sequence:
>540_residues MGEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTILLQSSTATTVLTIGLVNAGF MRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGAFLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSN WEPFVDFTVRMGDNPFLGVIVGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFPCIALLAYIVTKLVPGDELAL DYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQAIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSAR SLSPTDSNLHSTLLNVVRDIERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD
Sequences:
>Translated_540_residues MGEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTILLQSSTATTVLTIGLVNAGF MRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGAFLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSN WEPFVDFTVRMGDNPFLGVIVGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFPCIALLAYIVTKLVPGDELAL DYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQAIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSAR SLSPTDSNLHSTLLNVVRDIERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD >Mature_539_residues GEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTILLQSSTATTVLTIGLVNAGFM RLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGAFLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSNW EPFVDFTVRMGDNPFLGVIVGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGARR AALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFPCIALLAYIVTKLVPGDELALD YKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQAIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSARS LSPTDSNLHSTLLNVVRDIERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHDV LKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD
Specific function: Unknown
COG id: COG1283
COG function: function code P; Na+/phosphate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To B.subtilis yqeW [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=534, Percent_Identity=23.2209737827715, Blast_Score=147, Evalue=2e-36,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003841 - InterPro: IPR004633 [H]
Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 59053; Mature: 58922
Theoretical pI: Translated: 5.81; Mature: 5.81
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH LLQSSTATTVLTIGLVNAGFMRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGA HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEECCCHHHCCHHHHHHH FLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSNWEPFVDFTVRMGDNPFLGVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHH VGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHCCHHHHHHHHHHHH CIALLAYIVTKLVPGDELALDYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQ HHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH AIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSARSLSPTDSNLHSTLLNVVRDI HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure GEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH LLQSSTATTVLTIGLVNAGFMRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGA HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEECCCHHHCCHHHHHHH FLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSNWEPFVDFTVRMGDNPFLGVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHH VGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHCCHHHHHHHHHHHH CIALLAYIVTKLVPGDELALDYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQ HHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH AIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSARSLSPTDSNLHSTLLNVVRDI HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]