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The map label for this gene is 54295090

Identifier: 54295090

GI number: 54295090

Start: 2480327

End: 2483227

Strand: Direct

Name: 54295090

Synonym: lpl2170

Alternate gene names: NA

Gene position: 2480327-2483227 (Clockwise)

Preceding gene: 54295089

Following gene: 54295093

Centisome position: 74.14

GC content: 35.85

Gene sequence:

>2901_bases
ATGTTAGAACTGAACGACAAAGAAACTGCAGTCATTAAGGCTATTCATCATAACCATAAGAAACGACTTGAAAGCCAAAT
GATAACCCGTTTTGGGGTATATTTTGAGCAATCAAAACATCCTGAAAAATTATATTCCTGGATAGAAAAAATTGAAGACA
CGCGCCTGTTAGCTAATCACTATCTGGACACTATCGCTCTAAGCCGAGCTCCAAGCACAATATCTTCATTGGAAAAGGAA
ACAGCAGGTTCTTCCTACTACATTGAAAAAACAAAACTGCTTATTCCGGAATCTATAAGAAATTTTCTTTCTGATATCAA
TTCTTCCAATGACAATACCTTATTCAATTTTGTAGCCGCCGAGGTCTTTTCTCTCGCTTTAGGCAAATCAATTACCGACC
TGTTATTCGATTACTTCAATAATGAATTTTTAGGGGCGCCAGAGAATGTACAAAAAGAATTTAATGAAACCCTGGAAAAA
CAAACTGAATTATCCAATTTGATAAAAAAAGAATGTGAGCGCATCTCCATTGAAATTATCAAATTATTTCATTTCAGAGA
AATGTTGCTGCTTGGGAAAATAAGCAAATCACCAATCGAACCCAATTCCAGAGAGGAATTCATTGCCAAAGCAAAGATTG
CCAACCAATCTGGCGAATCTGTTCATTTGGCTATCGAAATCTATTTTGCACGTGAATTAAGTCGTATTTTTAACTCAGGT
TTTAAATCACTTTATCAAGTCCACGATGTGGAAATTCAAAGTGAACATCAATCGCCTCTGGTCAAGTGGATTAATCAAAT
GTCAGAGTCTGAACAGGTTCGATTGGCCTTTACTCAGGAAATCCAGTTGAAATTCATGCTTCTGGCAAGAGATTTTTTAC
TGGAAAAAATGAATCAGAAAGGGATACTCGCAAGATACCCTATCATTTTTTCGCTCTTTGCAGGAGTCATTATTGCTCCA
ATAGTCGGTGTGACTATGATTATTATGACTGGCGGTACTTTTCTATGGGCGATAGCTGCTCTGGCTGTCATGGTTTTTGC
TCTCTCTTGCATAGCAACGCACCTCCTGATCAATAAACTCAGCGTATTAACTTACCAACGTTCTTCGGATAATAGAGCTC
ATATTCAGCAATCTATCGACATGATAAATGGAGAGTTTTTACGTTTGAAAAAAGAAAGTTTATTAAAAAAGGAAACAACC
AGTGAGGTTATTGAAAATACAAGAGATTTTCAAAAAATCAACCAGAATTTTCATTTAGTCACGATTGGTAAAAAGGTAGC
CAGAGGCTCAGTATCTGGATGGTTAAGAGAATACGCTTCTCGGTATAGGCACAGTAAAGCCATCGAAATTGATTTGGGGG
ATGAATACAAAGAATTAATTACTCAAAGCAGGATACAAACTCAAGAACTCATTCATTCGATTAACAAGAAAAACTCCAAG
TTATTGATTAAGTGGATTCACGATACCATGACTTATTTGCAGGATGAAAAAAATCAATCTGTGATTGAAGAATTTGAATT
AATCCCCAAAATGAAAGAGCAAGTCCTTGAGATTGTCTGTCAACTCAATTACATCCCCCCTATGTTATTGAAATTCTATT
CTAACTCCAGAGAGAAAGGTGGCCTGGGAGGTAGTGAATCCGATTTTTCTCATATAAAACGTTTAACTCCCATTGATGCG
CCAGATAAATCCAGGCATAACCCCTATAATTATCTCTGCGATACAGCTCTGAATCTGTTTAAAAAATATGAGCCTTTATA
TACTTCGACTTGTATTTTTTTAGGAGACCCGGAATATCGACAAATGTTAGGTATCGCCAGAAGAGATGCCGGGGAGCCTC
TAACAGCGGAAAACATCAATCGTTATCTTGATAACTCCTATGCCTTTTTATTATCGCTTTGCCATAAAATAAAACCTGGA
TTAGGCTTGGATCCCTTACAACAATCAGCGCGCGTCACTGATGAATTCGTTCTCTACAGAATGCTGTTGTTAAAGCAGTT
GGCAGCAATTTCCGAATCTGATAGCAAAGAAATAAGCAATGAAATCAAATTTAAGATTAGACTTTTTATTCAAAAATACT
TTAATCAGGATACCAAAGTCATTTTTGATGATCTTGAAAACCAAATGTTTTTGCTAAACAAGGAAGCCCCCAACTCTCGT
ATCTATAAAAACAGCGACCATTTTGAGGTAATTGATACAGAATTGGATAACATTTTTCAAGCCATCACTCTTGATATGGC
TTATAACTCTAATAATTTCAGATTCGTTGATATTCTTGACTACTTCATTAATAGATTTATTAAAGAACACGCCCCCCAGT
CCGCAACAGTATTTGCTTATGGAAAAGCAGAACAGGAAATCAACCCTCAAGGCACAAAATACTATCTCAAAATTCTTGCT
CAATACTGTAACAATACGACCGAATTTTTAAAAAGCGCTCAAACAAATACAACATTAACGGCCACAAATCTTCTTGATTG
CTATCGATACAACATCAGTTTGCAAGTTTGTAGAACGCAAATTCGGATTATCTGTAGCATAAAGGAAATCAATAAATTAA
AAATGACAAATGAGACTACTGAACAAATAACCCTTTTACTCAAATCCTTTCAACAACTTGCAGAGTTCGCAAAAATCCAT
TGTTTCTTGTTAAAGATTGACTCTTCTTGTTATCGATTATTTAAACTGATTGAAAACAAAGCAATGCAATCTACTTTATC
CAGAGATTGGATAAGACAGCTCGATGCAAAAGATGCGCTCATTTACATGATGGATGATCTGCCTAATCAATTAAAACTTA
CTGCAGATTACAACGCTTCGAGTTTATTTTTTAGTTCGGCAAAACAAGCTAAAAGAGAAAAAATGGAAAACTCAGAAGAA
CCTATAATGAAGCCAGCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCAGGAAAATGCCAGGAAACAAGCAACAGCAAATATAGTCTCTTGGCATAGCCCTTATTGCATAAAGTCATATCTAATC
ACTCTACGAGGGAGCGAAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTAATTTAAAGGGATTATTGGTAAATATAAACACAATTGATTGGGGTCTGGATGCCCAACACAAGGACATCCAGGTTTT
TCTATAAGCTTGATTTTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 966; Mature: 966

Protein sequence:

>966_residues
MLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANHYLDTIALSRAPSTISSLEKE
TAGSSYYIEKTKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGAPENVQKEFNETLEK
QTELSNLIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIEIYFARELSRIFNSG
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LGLDPLQQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKVIFDDLENQMFLLNKEAPNSR
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QYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKMTNETTEQITLLLKSFQQLAEFAKIH
CFLLKIDSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKDALIYMMDDLPNQLKLTADYNASSLFFSSAKQAKREKMENSEE
PIMKPA

Sequences:

>Translated_966_residues
MLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANHYLDTIALSRAPSTISSLEKE
TAGSSYYIEKTKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGAPENVQKEFNETLEK
QTELSNLIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIEIYFARELSRIFNSG
FKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFMLLARDFLLEKMNQKGILARYPIIFSLFAGVIIAP
IVGVTMIIMTGGTFLWAIAALAVMVFALSCIATHLLINKLSVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEFLRLKKESLLKKETT
SEVIENTRDFQKINQNFHLVTIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQTQELIHSINKKNSK
LLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIPPMLLKFYSNSREKGGLGGSESDFSHIKRLTPIDA
PDKSRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPLYTSTCIFLGDPEYRQMLGIARRDAGEPLTAENINRYLDNSYAFLLSLCHKIKPG
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QYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKMTNETTEQITLLLKSFQQLAEFAKIH
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PIMKPA
>Mature_966_residues
MLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANHYLDTIALSRAPSTISSLEKE
TAGSSYYIEKTKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAAEVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGAPENVQKEFNETLEK
QTELSNLIKKECERISIEIIKLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIEIYFARELSRIFNSG
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LGLDPLQQSARVTDEFVLYRMLLLKQLAAISESDSKEISNEIKFKIRLFIQKYFNQDTKVIFDDLENQMFLLNKEAPNSR
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QYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQIRIICSIKEINKLKMTNETTEQITLLLKSFQQLAEFAKIH
CFLLKIDSSCYRLFKLIENKAMQSTLSRDWIRQLDAKDALIYMMDDLPNQLKLTADYNASSLFFSSAKQAKREKMENSEE
PIMKPA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 111744; Mature: 111744

Theoretical pI: Translated: 7.45; Mature: 7.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANH
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLDTIALSRAPSTISSLEKETAGSSYYIEKTKLLIPESIRNFLSDINSSNDNTLFNFVAA
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHEECHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
EVFSLALGKSITDLLFDYFNNEFLGAPENVQKEFNETLEKQTELSNLIKKECERISIEII
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLFHFREMLLLGKISKSPIEPNSREEFIAKAKIANQSGESVHLAIEIYFARELSRIFNSG
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH
FKSLYQVHDVEIQSEHQSPLVKWINQMSESEQVRLAFTQEIQLKFMLLARDFLLEKMNQK
HHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GILARYPIIFSLFAGVIIAPIVGVTMIIMTGGTFLWAIAALAVMVFALSCIATHLLINKL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SVLTYQRSSDNRAHIQQSIDMINGEFLRLKKESLLKKETTSEVIENTRDFQKINQNFHLV
HHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
TIGKKVARGSVSGWLREYASRYRHSKAIEIDLGDEYKELITQSRIQTQELIHSINKKNSK
EECHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
LLIKWIHDTMTYLQDEKNQSVIEEFELIPKMKEQVLEIVCQLNYIPPMLLKFYSNSREKG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCC
GLGGSESDFSHIKRLTPIDAPDKSRHNPYNYLCDTALNLFKKYEPLYTSTCIFLGDPEYR
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HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCC
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CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
GKAEQEINPQGTKYYLKILAQYCNNTTEFLKSAQTNTTLTATNLLDCYRYNISLQVCRTQ
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IRIICSIKEINKLKMTNETTEQITLLLKSFQQLAEFAKIHCFLLKIDSSCYRLFKLIENK
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AMQSTLSRDWIRQLDAKDALIYMMDDLPNQLKLTADYNASSLFFSSAKQAKREKMENSEE
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PIMKPA
CCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLELNDKETAVIKAIHHNHKKRLESQMITRFGVYFEQSKHPEKLYSWIEKIEDTRLLANH
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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AMQSTLSRDWIRQLDAKDALIYMMDDLPNQLKLTADYNASSLFFSSAKQAKREKMENSEE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PIMKPA
CCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA