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The map label for this gene is 54294312

Identifier: 54294312

GI number: 54294312

Start: 1536614

End: 1539265

Strand: Direct

Name: 54294312

Synonym: lpl1377

Alternate gene names: NA

Gene position: 1536614-1539265 (Clockwise)

Preceding gene: 54294311

Following gene: 54294313

Centisome position: 45.93

GC content: 35.07

Gene sequence:

>2652_bases
ATGACCCCACAGCACGTCATAAGTCAACTGCTGGAATCTGATACCAAATACCCTCAGAATTTAGATTTATTAAAAAAAAT
AATCATATCAGCTTATCTGGGACGCCTCAGAATTAATGGATTACCTCCAGATAACAAGATTGCACTTGGAAATTATTTAT
TTGATGATGAACGTATGATTTTTGATTTCACTCGATTGAGCGATTCAAAAAGAGCTTTATTTATTGAATGGTTGCTTGAG
CCTCATCAAAAAGATAAAGAGCATGGTTTTTTAAGTGGCGTTTACGTTAATGAATATCGAGGTTTCACTGCGGAGGTTGC
TTTAAGTTGGTGGGGTATCTTAAAAAACTGGTTATTTAATAATAAATCTGAGCATTGGAAAATAACGGATTTGGGACTTT
CTGTCAATTATCAGTTGACTGGTATTGAAATGTGTCATGGAAAGCAGGGTATCTTAATTGGATTTAACCAGTTTTTGGTA
CCACCTTCAGGTACAAAATACAGAGATCCGAATGATAGCCAAAGTGAGCCATTAGGTAATGTTAAAAGAGTATTCATTAC
TGATAAACTGGTTGATGAACTTGTTGGACTCAATTATAAAAATCTTAATTATGAATCTGTCTGTAAAAGCCCTCATCCTC
AATCTATTGATGTAACTGATCCAGAAGCTCGTCATAAAGACATGTATGACTACAGAAAAATGCAACGTTTCAATGGTGTG
AGGCCTTGGTATATCAGACTTTGGAGATGGATATCCAAACTATTTTTTGGCGATACATACGACGCTAAAAAAACAAGCAC
TTCAGACGACAATTTGGAATTACTTTATAAAACTAAAACTGTCAAAATTTATCAGCGCTCCAAATCAAAAGAAATCTTGG
TCACAGAGAAGCGACCTGATATTACTAATTTGGTTTTTTGTGGAGGTGGGGCAAAAATTTTTGCTCACGTGGGGGTTTGG
AAGGCTCTCAATGAAGCAGGAATGAAGCCAACCAAATTTGCAGGAAGCTCTGCCGGTGCAATCATGTCTTTGATGTGCTA
CCTAGGTTATACTGCTGATGAAATTAGTGAACTTTTCCAGCATTTCAAACAAGAGCATTTAGTTCAATTTGATATAGACA
GAAATGGATTATCTGATACTCATTCCTTAAAGACTGCGCTGGATTATGCTATCGCAAATAAAGTAAGGCAAATAGTAAAT
AAATATAAAATTCCATATCCTAAGGGAAAAATAACTTTTAGTACTTTAGCGTCTCTAAGAGAGCAATTTCCAGATTGTGG
AATAGGCAAAGAATTAATTGTTACAGCAACAAATAAACGCTCAGGAAAAACTATTTATTTATCAGCAAATCGTTACCCAT
TATTGGAGGTCAGTGAAGCAGTTAAAATTTCTGCGAGCTTTCCAGTTTTGTATAGAGATACTCTGCTGGATGGTGAAGAG
CATAATGACGGTGGAATCTTAAGTAATTTTCCAACCGAGGTTTTTTTTGATGACCACTCAACGCTGTTGGAGTCTGAATT
TGGTAATAATTTAAAAGTATTGGCAGTTCAATTTGATAATGGGATTGAAAGAAATGTTATTGATAGAATAATGGACAAAG
TTTATCGAGAGAATTTCGTTCTTAACTGGATTTATAGCTTATTAACTGGAGTGAGTGATCCTGCAAGTGGATGGGAAAGA
GACCGCCTTAAATTAAGACAATATGCCCTTCAAACTATAATTCCTGAAACAGGGAAAGTATCAACAACAGGATTTAATGT
AGAGAGGCAGAGCCAGGAGGCATTGATCCAAAATGGTTATCAATCAACTCTGGATTATCTTAATGTAAGATATACTAGAA
AAAACAACAGCTATGTTAACAAGGAAATAATGTACTCTACTTTCAATTCTTTGGGAGATTTGCTTGCTTACTGTTGTTAC
AGAGGAGATGAACAATGGTTTAATGTTGTTAATAATCTAATTGTGCAATCTACCTTACCTAATCGTACTGCTTTAATGAA
GCAATCCCTTGAACTTAGAAAACTTTATTTTAATACGTCTCTACCATTTAATCCTGAAAAGAATAAAACAGCTTGTACTG
AAAGCAATACTTTAACTTTTTTTGGTAATGCGGTTTGTCAGCATCATAATCACAACCAGGAGCTTGAAAATGGAAACCAT
GATGTCTTACTGGCGCTCTATCCAATTTTTTTAAAACTATCTACTGATTTATTAATAAATAAAATTGATAAGAACCTATT
AGACCGTGCACGTCATTCACTAAATATACATTCTCCCTTTGATTGTCTTGAGCATTTTAACAAAATTTCAGGAAATGCTC
ATGTTATGATTCATATCATCGTTAAATTAATTAAAGAGCTCAAAGAAAGATCATGCCAGCAAATTTATGAGGTATTAAAA
GAGGTTAGGCATTTATTGTATAGCGACATTAATCTTATGAAAGCAAATTATTTTGGCAAATGGGATTTAAGTCTCCCTCA
ATGTATACGGATCTTGAATTTGTTAAAACAGGAAAAGCATGACGATGTAGCTCGGCTATTAGATTGCCTACGTAACCAAA
TGGAGCCTGTGCAAACAGTAAAAGGAGGAGTGCATCATGATGACCTTAATAACGGGGGCCACGAGAGGTATAGGCTTGGC
TTTGGCGTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGATAATTGTTATAAAGATGATTAATAAATATTTAAAAATAACCCATATTATTTCAGATATTTATTCTATGGACTAC
CCAGACGTAAGGATTTACTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTGCATCACATGGCCATGATTTAATACTTATTGGTAGAGATTCTGAACAGCTGGAGCACATTTCAAAGCAACTAAATA
CACAATATCAAATTAATGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Patatin; Esterase; Alpha-Beta Hydrolase Superfamily Esterase; Esterase Of Alpha/Beta Hydrolase Superfamily Protein; Phospholipase Patatin Family; Phospholipase

Number of amino acids: Translated: 883; Mature: 882

Protein sequence:

>883_residues
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLE
PHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLV
PPSGTKYRDPNDSQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTSDDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVW
KALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVN
KYKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWER
DRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEALIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCY
RGDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTSLPFNPEKNKTACTESNTLTFFGNAVCQHHNHNQELENGNH
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERSCQQIYEVLK
EVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVARLLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLG
FGV

Sequences:

>Translated_883_residues
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLE
PHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLV
PPSGTKYRDPNDSQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTSDDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVW
KALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVN
KYKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWER
DRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEALIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCY
RGDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTSLPFNPEKNKTACTESNTLTFFGNAVCQHHNHNQELENGNH
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERSCQQIYEVLK
EVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVARLLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLG
FGV
>Mature_882_residues
TPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLEP
HQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLVP
PSGTKYRDPNDSQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGVR
PWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTSDDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVWK
ALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNK
YKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEEH
NDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWERD
RLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEALIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYR
GDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTSLPFNPEKNKTACTESNTLTFFGNAVCQHHNHNQELENGNHD
VLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERSCQQIYEVLKE
VRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVARLLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGF
GV

Specific function: Unknown

COG id: COG1752

COG function: function code R; Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101646; Mature: 101515

Theoretical pI: Translated: 8.23; Mature: 8.23

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMI
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECCEEECCCCEE
FDFTRLSDSKRALFIEWLLEPHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFN
EEEHHCCCCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLVPPSGTKYRDPNDSQSEPLGN
CCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
HHEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTSDDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPD
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCC
ITNLVFCGGGAKIFAHVGVWKALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQ
CCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
HFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNKYKIPYPKGKITFSTLASLR
HHHHCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHH
EQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCHHEEECCCCEEEHHHHCCCCC
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFV
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNWIYSLLTGVSDPASGWERDRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEALIQNGY
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHCCH
QSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYRGDEQWFNVVNNLIVQSTLP
HHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
NRTALMKQSLELRKLYFNTSLPFNPEKNKTACTESNTLTFFGNAVCQHHNHNQELENGNH
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHCCCCCCHHCCCCC
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHII
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VKLIKELKERSCQQIYEVLKEVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DDVARLLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGFGV
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCC
>Mature Secondary Structure 
TPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMI
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECCEEECCCCEE
FDFTRLSDSKRALFIEWLLEPHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFN
EEEHHCCCCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLVPPSGTKYRDPNDSQSEPLGN
CCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
HHEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTSDDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPD
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCC
ITNLVFCGGGAKIFAHVGVWKALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQ
CCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
HFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNKYKIPYPKGKITFSTLASLR
HHHHCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHH
EQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCHHEEECCCCEEEHHHHCCCCC
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFV
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNWIYSLLTGVSDPASGWERDRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEALIQNGY
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QSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYRGDEQWFNVVNNLIVQSTLP
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DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHII
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VKLIKELKERSCQQIYEVLKEVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DDVARLLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGFGV
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA