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The map label for this gene is 54293072

Identifier: 54293072

GI number: 54293072

Start: 127417

End: 129219

Strand: Direct

Name: 54293072

Synonym: lpl0109

Alternate gene names: NA

Gene position: 127417-129219 (Clockwise)

Preceding gene: 54293064

Following gene: 54293073

Centisome position: 3.81

GC content: 37.38

Gene sequence:

>1803_bases
ATGATTCAGTTAGGCGATTTGTTAAAACCAACTTGGGCTGCGGAGCGGTCTTTAAATAATGCTTGGTCTGTATTGAATGA
TGAGGAAAAGGAATCCATCAAAAGCCGAATGGACAAGATATTTTACAACGAAATTCCTTTCCAACTTGAGCATGACAAGC
TTATCTATATTCATTTATTTTCCTTGTTTGCCCAATTAGAAACGATTGGCCTAAGAGGGCTTATAAAATCTCTAGAGAAA
CTCCGTGGAACAGATTTGTATCAACAAATGCGTCAACAAATTACCGACGAGATTTTCCATGCCACTGTCTTTGCAAAAAT
TGCGTTTCAATTGTCCGCTCCTTACGCATTGCCACTTGGTCATCAAAAGAGTATCAATCATTTTATTTCTTCTCTTGAAG
GTGAAGAGGATCTGGCCACTTCTATTACCTTGGTCAATTTGGTTGGAGAAGGATGGGTAGAAGAATTATGCGTTGCAATG
AAAGAGAACAACATTGCAGTAACTATTTTTGCAACAGTCCTTGAAGATGAAAGCCGGCATATGGACGAGTACGATTTATA
TCGTCAGATTGGGTTGCCAAATAAAGACTATTTAAGGAAAAAATTAGCAATTTTTGAAGATGAGCTGATAAATACTGTAT
TTGCGCATGAACAATATTTGACCGCCCTTGATATTCTATTAGGCAAGGAGGGGGCGCTGAAACTGCTCAACAATATCAAT
AATAAACACCATTGGATGCTTAAAAAAATTGGCTTAACGCCTTCAGCCCATTGGCAATTGTTTATGGATACCATGCCTTT
ATTGATGAAGAATTTATCGCATGATTTTGAAAAAGACAAAGCCATTGAACCGACCAACATTCGTAAATTACTTTCAGCGA
TTTGGAATGACCCCGAATTACCTACTGAGTCTGCAATTTTTAATATCAATGTTACTCCGGTTTGTTTTTTTGAAAAGAAA
TTTAAACCGGAAACAATAACTTGCCTCATGTTACAGGCATTGAGTAAAGCTTGCTTTGATAATCCGCAGACGAGAAATTA
TATTTTCAATCATAAACTGTACCACTCGCACAATAGTTACGTAGCGCTTGCGGTAAAGATTCCAGGTAGTGATCAATTAG
GTGCGATTGAGTTTAAAAACTGCCATGAGATGACTATGACTGAATTAGCGCAACACATTCAGCATGACATGCGCATCATG
ATGTACTGTTATGAAAAAACACAATCATTACAAAAAGAGCATCCCTATTTAATCGAGGTAGTCAATCGCTTGCTAACTCC
ACGGCACGAGCGAGTGTACCGTGATTTCTTATTTGCAAGACCTGCTATTTCTTTGAGCAATATTGGTCATTGGGGATATC
AAGCAGCGGTTTCACCTTTATTTCCAAATGAAACGTTTAAAATAACTCTGACAGAAATCGAAAGAAAACAAGTCTGGAAT
AAAACAAATAACACATTTGAGGTGCAAGATGTTTTGCCAGTAGGCATGAGTGTTGATCACCGAGTTTTTGATGGCAATAT
CCCGTTCCCGCGTTATATGCAGGAGGCTTTTGATCAAATGTTTCAAGACATGGAGCAATCCAGGATAAAGCCACTGTCAA
AACCCTTTTCAAATTTAGATAGCTTTATCAAGTACAGTAATACATTATTGGAAAACGACCTGGAGTTTGGGTTTCTGTAT
TTATTTTCTTTAATGCAAGTATGGAAAAATTATATTTCATATGATGAGTTGTCAAAAACAGTGGAAGAAAATTACGAGAG
AATAAAACGGGCATTATCGAAAAGCGAACATCAACTTGGCTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACAAAAAACGCTTTCAATAGTACACTTCCCCTTAAGTATTAGTATGTGCTTCGGAAGAGTGTAGGCGTTTGCAATATAAC
AAATGGATTGGGGTTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGTTATGCGATCGTTTTCTTTTTATTACCAACATCTAGAAAATGTTAGCAGAAGTTTTAGTTTTTGTATAAGCCAGTTA
ACTTCTCCAGCAAAAGAATG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 600; Mature: 600

Protein sequence:

>600_residues
MIQLGDLLKPTWAAERSLNNAWSVLNDEEKESIKSRMDKIFYNEIPFQLEHDKLIYIHLFSLFAQLETIGLRGLIKSLEK
LRGTDLYQQMRQQITDEIFHATVFAKIAFQLSAPYALPLGHQKSINHFISSLEGEEDLATSITLVNLVGEGWVEELCVAM
KENNIAVTIFATVLEDESRHMDEYDLYRQIGLPNKDYLRKKLAIFEDELINTVFAHEQYLTALDILLGKEGALKLLNNIN
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MYCYEKTQSLQKEHPYLIEVVNRLLTPRHERVYRDFLFARPAISLSNIGHWGYQAAVSPLFPNETFKITLTEIERKQVWN
KTNNTFEVQDVLPVGMSVDHRVFDGNIPFPRYMQEAFDQMFQDMEQSRIKPLSKPFSNLDSFIKYSNTLLENDLEFGFLY
LFSLMQVWKNYISYDELSKTVEENYERIKRALSKSEHQLG

Sequences:

>Translated_600_residues
MIQLGDLLKPTWAAERSLNNAWSVLNDEEKESIKSRMDKIFYNEIPFQLEHDKLIYIHLFSLFAQLETIGLRGLIKSLEK
LRGTDLYQQMRQQITDEIFHATVFAKIAFQLSAPYALPLGHQKSINHFISSLEGEEDLATSITLVNLVGEGWVEELCVAM
KENNIAVTIFATVLEDESRHMDEYDLYRQIGLPNKDYLRKKLAIFEDELINTVFAHEQYLTALDILLGKEGALKLLNNIN
NKHHWMLKKIGLTPSAHWQLFMDTMPLLMKNLSHDFEKDKAIEPTNIRKLLSAIWNDPELPTESAIFNINVTPVCFFEKK
FKPETITCLMLQALSKACFDNPQTRNYIFNHKLYHSHNSYVALAVKIPGSDQLGAIEFKNCHEMTMTELAQHIQHDMRIM
MYCYEKTQSLQKEHPYLIEVVNRLLTPRHERVYRDFLFARPAISLSNIGHWGYQAAVSPLFPNETFKITLTEIERKQVWN
KTNNTFEVQDVLPVGMSVDHRVFDGNIPFPRYMQEAFDQMFQDMEQSRIKPLSKPFSNLDSFIKYSNTLLENDLEFGFLY
LFSLMQVWKNYISYDELSKTVEENYERIKRALSKSEHQLG
>Mature_600_residues
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LRGTDLYQQMRQQITDEIFHATVFAKIAFQLSAPYALPLGHQKSINHFISSLEGEEDLATSITLVNLVGEGWVEELCVAM
KENNIAVTIFATVLEDESRHMDEYDLYRQIGLPNKDYLRKKLAIFEDELINTVFAHEQYLTALDILLGKEGALKLLNNIN
NKHHWMLKKIGLTPSAHWQLFMDTMPLLMKNLSHDFEKDKAIEPTNIRKLLSAIWNDPELPTESAIFNINVTPVCFFEKK
FKPETITCLMLQALSKACFDNPQTRNYIFNHKLYHSHNSYVALAVKIPGSDQLGAIEFKNCHEMTMTELAQHIQHDMRIM
MYCYEKTQSLQKEHPYLIEVVNRLLTPRHERVYRDFLFARPAISLSNIGHWGYQAAVSPLFPNETFKITLTEIERKQVWN
KTNNTFEVQDVLPVGMSVDHRVFDGNIPFPRYMQEAFDQMFQDMEQSRIKPLSKPFSNLDSFIKYSNTLLENDLEFGFLY
LFSLMQVWKNYISYDELSKTVEENYERIKRALSKSEHQLG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69989; Mature: 69989

Theoretical pI: Translated: 6.21; Mature: 6.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIQLGDLLKPTWAAERSLNNAWSVLNDEEKESIKSRMDKIFYNEIPFQLEHDKLIYIHLF
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHH
SLFAQLETIGLRGLIKSLEKLRGTDLYQQMRQQITDEIFHATVFAKIAFQLSAPYALPLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCC
HQKSINHFISSLEGEEDLATSITLVNLVGEGWVEELCVAMKENNIAVTIFATVLEDESRH
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHCCHHHC
MDEYDLYRQIGLPNKDYLRKKLAIFEDELINTVFAHEQYLTALDILLGKEGALKLLNNIN
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCC
NKHHWMLKKIGLTPSAHWQLFMDTMPLLMKNLSHDFEKDKAIEPTNIRKLLSAIWNDPEL
CCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
PTESAIFNINVTPVCFFEKKFKPETITCLMLQALSKACFDNPQTRNYIFNHKLYHSHNSY
CCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEECCCCE
VALAVKIPGSDQLGAIEFKNCHEMTMTELAQHIQHDMRIMMYCYEKTQSLQKEHPYLIEV
EEEEEEECCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
VNRLLTPRHERVYRDFLFARPAISLSNIGHWGYQAAVSPLFPNETFKITLTEIERKQVWN
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHC
KTNNTFEVQDVLPVGMSVDHRVFDGNIPFPRYMQEAFDQMFQDMEQSRIKPLSKPFSNLD
CCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
SFIKYSNTLLENDLEFGFLYLFSLMQVWKNYISYDELSKTVEENYERIKRALSKSEHQLG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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SLFAQLETIGLRGLIKSLEKLRGTDLYQQMRQQITDEIFHATVFAKIAFQLSAPYALPLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCC
HQKSINHFISSLEGEEDLATSITLVNLVGEGWVEELCVAMKENNIAVTIFATVLEDESRH
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHCCHHHC
MDEYDLYRQIGLPNKDYLRKKLAIFEDELINTVFAHEQYLTALDILLGKEGALKLLNNIN
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CCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC
PTESAIFNINVTPVCFFEKKFKPETITCLMLQALSKACFDNPQTRNYIFNHKLYHSHNSY
CCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEECCCCE
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EEEEEEECCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
VNRLLTPRHERVYRDFLFARPAISLSNIGHWGYQAAVSPLFPNETFKITLTEIERKQVWN
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHC
KTNNTFEVQDVLPVGMSVDHRVFDGNIPFPRYMQEAFDQMFQDMEQSRIKPLSKPFSNLD
CCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
SFIKYSNTLLENDLEFGFLYLFSLMQVWKNYISYDELSKTVEENYERIKRALSKSEHQLG
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA