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The map label for this gene is 50086318

Identifier: 50086318

GI number: 50086318

Start: 3239175

End: 3240821

Strand: Reverse

Name: 50086318

Synonym: ACIAD3337

Alternate gene names: NA

Gene position: 3240821-3239175 (Counterclockwise)

Preceding gene: 50086319

Following gene: 50086317

Centisome position: 90.06

GC content: 23.98

Gene sequence:

>1647_bases
ATGAATAGTATTTTTAAAAAAATCAAAAATTACACGATAGTTTCTGGTGTATTTTTCCTTGGTAGTGCTTTTATAATTCC
AAATACTTCAAATTTATCTTCTACTTTATATAAAGAGCTAATTGCAGTTTTAGGTTTGCTAATATTGCTAACTGTGAAGT
CCTTTGATTATAAAAAAATTCTAATTCCTAAAAATTTTTACTGGTTCTTATTTGTCATATTCATAATTTTTATTCAGTTA
ATTGTAGGTGAGATTTATTTTTTCCAAGATTTTTTCTTTTCAATTTCATTTTTAGTAATTCTATTTCTGAGTTTTCTTTT
AGGTTTTAATGAAAGATTAAATGGTGATGACCTAATAGTAAAAAAGATTGCTTGGATTTTTATTATTGTGGTTCAGATTT
CATTTCTTATTGCTATAAATCAAAAAATAGAAATAGTTCAAAATTTTTTTCTATTTAGCTCCTCATATAATGGTCGTTCT
ACTGCTAATCTGGGTCAACCAAATCAATTTTCGACTTTGATTTTAATAACTTTATTTCTATTATGCTATTTAAGAGAAAA
AAATAGTTTAAATAATATGGTATTTAATATTTTATCTTTTTGTTTGATTTTTGCTAATGTAATGACGCAGTCTAGAAGTG
CATGGATAAGTGTAATTCTGATTTCTCTATTATATCTTTTAAAATTTCAAAAAAAGATAGAATTAAGAAGAGTTATTTTT
TTCAATATTGTATTTTGGACATTAGTTTATTGTGTTCCATTACTATTTAATTTAATTTTTTTTCAAAAAAATAGCTATTC
TACGTTTGATCGTCTTACTATGGGATCTTCTCGGTTTGAAATTTGGCCTCAATTATTAAAAGCTGTATTTCATAAACCAT
TTATCGGATATGGTTGGGGTCAGACAGGAGTAGCACAATTAGAAACAATTAATAAATCTTCAACAAAAGGAGAATGGTTT
ACATACTCACACAATTTGTTCTTAGATTTAATGTTATGGAATGGTTTTTTTATAGGTTTAATAATCTCTATTTTAATTTT
ATGCTTTTTGATTGAGCTATATTCTTCAATTAAAAATAAATCTGATTTATTTTTATTTTTTTGTGTTGTGGCTTTTTTTG
TACATTGTTTATTGGAATATCCTTTTGCATATACTTACTTTTTAATTCCTGTTGGCTTTCTATGTGGTTATATCTCTACT
CAAAATATCAAAAATTCTATATCTTATTTTAATTTATCAAAAAGAAAATTGACTTTGTTTCTTGGGTGTTGTTGGTTAGG
CTATGTAGCTTTTTGGGTTGAAGTTTTAGATATTTCAAAGAAAAATGAAATATATGCTAGACAATTTCTTTTTAGTAATC
ATGTTAAATTTTATAATATAGAAAACTATATACTTGATGGCTTTTCTAAACAATTAGATTTTCAATATTTAGACTATTGT
GAACTGAAAGATAAATATCAACTATTAGATTTTAAGAAAGTTGCTTATCGATATCCAAATGCATCTATTGTTTATAAGTA
TTATTCAATTTCTGCTGAAATGAAAATGGATCAAAAAAGTGCAAATCAAATTATAAGAGCATATAGTGTAATAAAAAATC
AAAAAATTATAAAACCTAAGTTAAAATTTTGTTCAATAGAATATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTGATAAAAAATATGTACCATCAGAATGTCGTGGTTGATAGTAGTACTATATGGCTTTAAAAGAAGAACTTTTATAAGT
TCTTCTTTAAATTATAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATTTTATTATCAATTGATAATCATTATTATTATATTGAGTGGTTTTATTTTTGAATTTATTTAAATAATGTATATAT
TTTTAAAATATTCATTTTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Lipid A Core; O-Antigen Polymerase Family Protein

Number of amino acids: Translated: 548; Mature: 548

Protein sequence:

>548_residues
MNSIFKKIKNYTIVSGVFFLGSAFIIPNTSNLSSTLYKELIAVLGLLILLTVKSFDYKKILIPKNFYWFLFVIFIIFIQL
IVGEIYFFQDFFFSISFLVILFLSFLLGFNERLNGDDLIVKKIAWIFIIVVQISFLIAINQKIEIVQNFFLFSSSYNGRS
TANLGQPNQFSTLILITLFLLCYLREKNSLNNMVFNILSFCLIFANVMTQSRSAWISVILISLLYLLKFQKKIELRRVIF
FNIVFWTLVYCVPLLFNLIFFQKNSYSTFDRLTMGSSRFEIWPQLLKAVFHKPFIGYGWGQTGVAQLETINKSSTKGEWF
TYSHNLFLDLMLWNGFFIGLIISILILCFLIELYSSIKNKSDLFLFFCVVAFFVHCLLEYPFAYTYFLIPVGFLCGYIST
QNIKNSISYFNLSKRKLTLFLGCCWLGYVAFWVEVLDISKKNEIYARQFLFSNHVKFYNIENYILDGFSKQLDFQYLDYC
ELKDKYQLLDFKKVAYRYPNASIVYKYYSISAEMKMDQKSANQIIRAYSVIKNQKIIKPKLKFCSIEY

Sequences:

>Translated_548_residues
MNSIFKKIKNYTIVSGVFFLGSAFIIPNTSNLSSTLYKELIAVLGLLILLTVKSFDYKKILIPKNFYWFLFVIFIIFIQL
IVGEIYFFQDFFFSISFLVILFLSFLLGFNERLNGDDLIVKKIAWIFIIVVQISFLIAINQKIEIVQNFFLFSSSYNGRS
TANLGQPNQFSTLILITLFLLCYLREKNSLNNMVFNILSFCLIFANVMTQSRSAWISVILISLLYLLKFQKKIELRRVIF
FNIVFWTLVYCVPLLFNLIFFQKNSYSTFDRLTMGSSRFEIWPQLLKAVFHKPFIGYGWGQTGVAQLETINKSSTKGEWF
TYSHNLFLDLMLWNGFFIGLIISILILCFLIELYSSIKNKSDLFLFFCVVAFFVHCLLEYPFAYTYFLIPVGFLCGYIST
QNIKNSISYFNLSKRKLTLFLGCCWLGYVAFWVEVLDISKKNEIYARQFLFSNHVKFYNIENYILDGFSKQLDFQYLDYC
ELKDKYQLLDFKKVAYRYPNASIVYKYYSISAEMKMDQKSANQIIRAYSVIKNQKIIKPKLKFCSIEY
>Mature_548_residues
MNSIFKKIKNYTIVSGVFFLGSAFIIPNTSNLSSTLYKELIAVLGLLILLTVKSFDYKKILIPKNFYWFLFVIFIIFIQL
IVGEIYFFQDFFFSISFLVILFLSFLLGFNERLNGDDLIVKKIAWIFIIVVQISFLIAINQKIEIVQNFFLFSSSYNGRS
TANLGQPNQFSTLILITLFLLCYLREKNSLNNMVFNILSFCLIFANVMTQSRSAWISVILISLLYLLKFQKKIELRRVIF
FNIVFWTLVYCVPLLFNLIFFQKNSYSTFDRLTMGSSRFEIWPQLLKAVFHKPFIGYGWGQTGVAQLETINKSSTKGEWF
TYSHNLFLDLMLWNGFFIGLIISILILCFLIELYSSIKNKSDLFLFFCVVAFFVHCLLEYPFAYTYFLIPVGFLCGYIST
QNIKNSISYFNLSKRKLTLFLGCCWLGYVAFWVEVLDISKKNEIYARQFLFSNHVKFYNIENYILDGFSKQLDFQYLDYC
ELKDKYQLLDFKKVAYRYPNASIVYKYYSISAEMKMDQKSANQIIRAYSVIKNQKIIKPKLKFCSIEY

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64445; Mature: 64445

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNSIFKKIKNYTIVSGVFFLGSAFIIPNTSNLSSTLYKELIAVLGLLILLTVKSFDYKKI
CCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
LIPKNFYWFLFVIFIIFIQLIVGEIYFFQDFFFSISFLVILFLSFLLGFNERLNGDDLIV
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
KKIAWIFIIVVQISFLIAINQKIEIVQNFFLFSSSYNGRSTANLGQPNQFSTLILITLFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LCYLREKNSLNNMVFNILSFCLIFANVMTQSRSAWISVILISLLYLLKFQKKIELRRVIF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNIVFWTLVYCVPLLFNLIFFQKNSYSTFDRLTMGSSRFEIWPQLLKAVFHKPFIGYGWG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
QTGVAQLETINKSSTKGEWFTYSHNLFLDLMLWNGFFIGLIISILILCFLIELYSSIKNK
CCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SDLFLFFCVVAFFVHCLLEYPFAYTYFLIPVGFLCGYISTQNIKNSISYFNLSKRKLTLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LGCCWLGYVAFWVEVLDISKKNEIYARQFLFSNHVKFYNIENYILDGFSKQLDFQYLDYC
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHCHHHHCCHHHHHHH
ELKDKYQLLDFKKVAYRYPNASIVYKYYSISAEMKMDQKSANQIIRAYSVIKNQKIIKPK
HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
LKFCSIEY
HHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNSIFKKIKNYTIVSGVFFLGSAFIIPNTSNLSSTLYKELIAVLGLLILLTVKSFDYKKI
CCHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
LIPKNFYWFLFVIFIIFIQLIVGEIYFFQDFFFSISFLVILFLSFLLGFNERLNGDDLIV
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
KKIAWIFIIVVQISFLIAINQKIEIVQNFFLFSSSYNGRSTANLGQPNQFSTLILITLFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LCYLREKNSLNNMVFNILSFCLIFANVMTQSRSAWISVILISLLYLLKFQKKIELRRVIF
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
QTGVAQLETINKSSTKGEWFTYSHNLFLDLMLWNGFFIGLIISILILCFLIELYSSIKNK
CCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SDLFLFFCVVAFFVHCLLEYPFAYTYFLIPVGFLCGYISTQNIKNSISYFNLSKRKLTLF
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HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
LKFCSIEY
HHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA