| Definition | Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005966 |
| Length | 3,598,621 |
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The map label for this gene is 50086043
Identifier: 50086043
GI number: 50086043
Start: 2956060
End: 2958969
Strand: Reverse
Name: 50086043
Synonym: ACIAD3028
Alternate gene names: NA
Gene position: 2958969-2956060 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50086045
Following gene: 50086040
Centisome position: 82.23
GC content: 40.76
Gene sequence:
>2910_bases CTGATCATGTATAAAAATGATAAGTATAATATGACAATAGTGTTGCTAATTCTCGGAATTGGCTTGCTGGTAAGTTATGC ACTCGATATGACCAATGCAGTGATTGTGGTGATGGCATTGATAATCTTTTTTGTGATGCAGCAATTCAATCATTTTGAAA AAAGACTCCAGCAGCTCGAACAGCAATATCTAGCCAATATCACGCCTCATTCTAGTCGTGGCTGGCAGTGGGGGATTGGA CTTGGTGCTTTGGTTGGTCTGGTCGGTGCATATTGGGGACTTATCCCGTTACTTTTGGTCGGTATTATCGGTGGCGTATG GTGTCTACTGCAAATTTTGAATTCGTTAAATGAACGTTTATCTAGAATCGAACAGGTGAGACAACAACCTATATTACAGC CTCCAACCGATCACGAAATATTAGAGCCGAAACCTGTTGAAAAGTCAGCTTCAGTGAACAGTGCACATTCGACTACAATA ACAAATTCACCAGAATGGTTCACTACAACGTCGCAGTCAGAAAAATTACCTGATTCAAATTCAATATCGACTCATTCCAC GACAACACTTTCAACAATTTCCACAACAAAAACTGCATGGTGGCAACCTGCGCTTCAGTGGTTAATGCATGGGAATCCAA TTTTGCGTGTTGCTATCGCATTATTAATGATTGGGGTCGTGCTGTTACTCAGATTTGCCAGTGAACATTGGCAGCTCAGC CTGAGTATAAAATTATTAGGCATTGCGCTAACAGGTGGAGGAGTCACTGTACTTGGCCTGTTTTTACGCAACAAGAATGC GCTATTTGGCATTGCCTTACAAGGAGCCGGACTTGCAGTTATTTTTTTAACATTAATCTTTGCTCACCACTATGCCGTGA TTGCCAGCTTAAGTAGTGCGAGTGTCTGTTTCATCATCTTACTGATGATTACAGTGGGATTGAGTCTGAAACAAAATGCG GTCTATCTTTCGATGTTGGCGTTGAGTATGGCTTATCTGGCACCGTTGGTCATTCCACAATATCGGCCAGATAGTGTATT TCTAATCAGTTATTATCTGGTGATTAATCTTGCTGTGGCAGCGATGAATTTTGTCAAGCCATGGAAGATTCTGAATCAGA TTGCTTTTTTTGCAACAGGATTAATTGCCAGTAGTTTTATTATGCTGTATGCCGATCAGGCACAATATCAGACTTTAGAT ATTATTCTGTGGTTGCATATTTTACTCTTTATTTGGTTGAGTATCCGTTATAGCCAACTCATTCAAAAAGAATATCGTTC TTTTAAAGCTCAAGTTTTCAATGCTCAGCCTATCCTTGATTCACAGACCGTGCAGCTTCCACCTATTTTGGATGTGGGAT TGATTTTTAGTGTGCCAATCTTGGGATTTTCTTTACATGCATTTTTAATGCATCAGTCCAGTATGGCATTGACATGGGGT GCATTGGGGCTTGGCATACTTTATACGGTTTTGGGAATCTGGATTAAACAAAAACAATCAGAACTTTCTATTCTGGCAAA GAGTTTCTTTATTTTAGCTTCGGTCTTTATTGCTCTGGTTTTTCCATTATGGAAAGGCGCTCATTGGACAGCAGTGGGAT GGGTGATTCAGGGTGCAGCACTGATTGTATGGGGTGTTTCTGAACGCTATAGAACCAGTCGTTACCTTGGAATGGTATTA ATCTTTTTGAGTTCGATAGCCTTATTTTATCAATTCTGGACAGATCAGCAATTTCCAGTATTGAGCACCAGTATTTATGC CATTGCTCAATTTATAGCAGCCTACTTTCTATTCAAATTTACCCAGCAGCAAAGCAGTTACTCGGTTTTTGCAACTATTT CACTTGGTCTTGCCTTGTATGCTGGGGCGGTTGCTGTTGTGAATGCGTTGGCATGGTTAGGACACGGCTTAAGTCCTTAT CTGGCAGTAGCCACAATTTTATTGTTGCTTTTTTCAGGGCTGATGTATTTCCAGGCAAAAATTGAATGGGCATTGGCACA GTTGGGTCTAGTGAGTGCTTTATTGTTACTGTGTTATCTTGAGCTAACCGAATCTGCTGTGCTGTCATCATCGCATTGGA TGAATACCACTCAGCAGCTTTCATTTTTTGTCACCACAATTATACTTTCAGCGCTTCTGATCCTGCTGCAAAAAAGTGCT CATTTAAAGTATGAGTTACGTTTATATTGGGGTGGTTTGCTGTGGTTAAGCTTGGCAGCAATAGGCTGCGCAGTTTGGCC TGCATCTGGATGGCTATGTTTAGGAATATTTCCACTTATCTATGGCATGTGGCTATTTAAACAAAAACAATTTATTTTGC TGGACCAGATCTCTGTCTGGATACTTAGCTGGTTATGGTTATTACACCTCAATTTAATTGATCAAACATTTATTGGGTAT GATCTTCCTGTATTTAATCCTGTTGATGTCATGTCTTTATTGTGTCTGGCTGGTTTGTTGTGGATGATTTATCAACATAA CTTCAATACCCAAAATCAAACGGTCGAATGGACGTTCAAAGTGACTGGTATTTTGACTGCATTAATGGTGCTGAGTAGTG TGGTTGTGCGCGCCTTACATATTTATTTGGCAACGCCGTTATGGAGTCTTTCGGTCTGGTCAAATGGCATCGTACAGCTT AGCCTGACCTTGCTTTGGGTCATTCTGGCCTTTGTTTTGATGACCTATTCAAGTCGACGACATATTCGCCAAATCTGGTT TGTAGGTGCTGCCTTACTTGGTATTGTGGTGATCAAACTGGTGGGTTTGGATTTATCGCAAAGTGGAACATTGACCCGTG TAGTTTCATTTATTGGTGCAGGTGGCGTGATGCTTGTAATTGCATATCTGGCACCTTTACCGCCTATTGGAAATGGGAAT ACAGAGAAACAAACCGATGGTCATAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCAAAATGCTGTGATTCACTTTTACGGTTGTTTTGTATGTCTAAATATACGCTCTGTGGCGTATGGTTTAAGATAATCTA TAAATCAATGAGTTTGTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAAAAATTCTATTTTTTATCGTTATGGTTTTAGGATGCGTTTATCTATTGATGTGGACATTCCATGGCTTTCCGATGC CTTCTCATTCATCCTCTGCC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 969; Mature: 969
Protein sequence:
>969_residues MIMYKNDKYNMTIVLLILGIGLLVSYALDMTNAVIVVMALIIFFVMQQFNHFEKRLQQLEQQYLANITPHSSRGWQWGIG LGALVGLVGAYWGLIPLLLVGIIGGVWCLLQILNSLNERLSRIEQVRQQPILQPPTDHEILEPKPVEKSASVNSAHSTTI TNSPEWFTTTSQSEKLPDSNSISTHSTTTLSTISTTKTAWWQPALQWLMHGNPILRVAIALLMIGVVLLLRFASEHWQLS LSIKLLGIALTGGGVTVLGLFLRNKNALFGIALQGAGLAVIFLTLIFAHHYAVIASLSSASVCFIILLMITVGLSLKQNA VYLSMLALSMAYLAPLVIPQYRPDSVFLISYYLVINLAVAAMNFVKPWKILNQIAFFATGLIASSFIMLYADQAQYQTLD IILWLHILLFIWLSIRYSQLIQKEYRSFKAQVFNAQPILDSQTVQLPPILDVGLIFSVPILGFSLHAFLMHQSSMALTWG ALGLGILYTVLGIWIKQKQSELSILAKSFFILASVFIALVFPLWKGAHWTAVGWVIQGAALIVWGVSERYRTSRYLGMVL IFLSSIALFYQFWTDQQFPVLSTSIYAIAQFIAAYFLFKFTQQQSSYSVFATISLGLALYAGAVAVVNALAWLGHGLSPY LAVATILLLLFSGLMYFQAKIEWALAQLGLVSALLLLCYLELTESAVLSSSHWMNTTQQLSFFVTTIILSALLILLQKSA HLKYELRLYWGGLLWLSLAAIGCAVWPASGWLCLGIFPLIYGMWLFKQKQFILLDQISVWILSWLWLLHLNLIDQTFIGY DLPVFNPVDVMSLLCLAGLLWMIYQHNFNTQNQTVEWTFKVTGILTALMVLSSVVVRALHIYLATPLWSLSVWSNGIVQL SLTLLWVILAFVLMTYSSRRHIRQIWFVGAALLGIVVIKLVGLDLSQSGTLTRVVSFIGAGGVMLVIAYLAPLPPIGNGN TEKQTDGHK
Sequences:
>Translated_969_residues MIMYKNDKYNMTIVLLILGIGLLVSYALDMTNAVIVVMALIIFFVMQQFNHFEKRLQQLEQQYLANITPHSSRGWQWGIG LGALVGLVGAYWGLIPLLLVGIIGGVWCLLQILNSLNERLSRIEQVRQQPILQPPTDHEILEPKPVEKSASVNSAHSTTI TNSPEWFTTTSQSEKLPDSNSISTHSTTTLSTISTTKTAWWQPALQWLMHGNPILRVAIALLMIGVVLLLRFASEHWQLS LSIKLLGIALTGGGVTVLGLFLRNKNALFGIALQGAGLAVIFLTLIFAHHYAVIASLSSASVCFIILLMITVGLSLKQNA VYLSMLALSMAYLAPLVIPQYRPDSVFLISYYLVINLAVAAMNFVKPWKILNQIAFFATGLIASSFIMLYADQAQYQTLD IILWLHILLFIWLSIRYSQLIQKEYRSFKAQVFNAQPILDSQTVQLPPILDVGLIFSVPILGFSLHAFLMHQSSMALTWG ALGLGILYTVLGIWIKQKQSELSILAKSFFILASVFIALVFPLWKGAHWTAVGWVIQGAALIVWGVSERYRTSRYLGMVL IFLSSIALFYQFWTDQQFPVLSTSIYAIAQFIAAYFLFKFTQQQSSYSVFATISLGLALYAGAVAVVNALAWLGHGLSPY LAVATILLLLFSGLMYFQAKIEWALAQLGLVSALLLLCYLELTESAVLSSSHWMNTTQQLSFFVTTIILSALLILLQKSA HLKYELRLYWGGLLWLSLAAIGCAVWPASGWLCLGIFPLIYGMWLFKQKQFILLDQISVWILSWLWLLHLNLIDQTFIGY DLPVFNPVDVMSLLCLAGLLWMIYQHNFNTQNQTVEWTFKVTGILTALMVLSSVVVRALHIYLATPLWSLSVWSNGIVQL SLTLLWVILAFVLMTYSSRRHIRQIWFVGAALLGIVVIKLVGLDLSQSGTLTRVVSFIGAGGVMLVIAYLAPLPPIGNGN TEKQTDGHK >Mature_969_residues MIMYKNDKYNMTIVLLILGIGLLVSYALDMTNAVIVVMALIIFFVMQQFNHFEKRLQQLEQQYLANITPHSSRGWQWGIG LGALVGLVGAYWGLIPLLLVGIIGGVWCLLQILNSLNERLSRIEQVRQQPILQPPTDHEILEPKPVEKSASVNSAHSTTI TNSPEWFTTTSQSEKLPDSNSISTHSTTTLSTISTTKTAWWQPALQWLMHGNPILRVAIALLMIGVVLLLRFASEHWQLS LSIKLLGIALTGGGVTVLGLFLRNKNALFGIALQGAGLAVIFLTLIFAHHYAVIASLSSASVCFIILLMITVGLSLKQNA VYLSMLALSMAYLAPLVIPQYRPDSVFLISYYLVINLAVAAMNFVKPWKILNQIAFFATGLIASSFIMLYADQAQYQTLD IILWLHILLFIWLSIRYSQLIQKEYRSFKAQVFNAQPILDSQTVQLPPILDVGLIFSVPILGFSLHAFLMHQSSMALTWG ALGLGILYTVLGIWIKQKQSELSILAKSFFILASVFIALVFPLWKGAHWTAVGWVIQGAALIVWGVSERYRTSRYLGMVL IFLSSIALFYQFWTDQQFPVLSTSIYAIAQFIAAYFLFKFTQQQSSYSVFATISLGLALYAGAVAVVNALAWLGHGLSPY LAVATILLLLFSGLMYFQAKIEWALAQLGLVSALLLLCYLELTESAVLSSSHWMNTTQQLSFFVTTIILSALLILLQKSA HLKYELRLYWGGLLWLSLAAIGCAVWPASGWLCLGIFPLIYGMWLFKQKQFILLDQISVWILSWLWLLHLNLIDQTFIGY DLPVFNPVDVMSLLCLAGLLWMIYQHNFNTQNQTVEWTFKVTGILTALMVLSSVVVRALHIYLATPLWSLSVWSNGIVQL SLTLLWVILAFVLMTYSSRRHIRQIWFVGAALLGIVVIKLVGLDLSQSGTLTRVVSFIGAGGVMLVIAYLAPLPPIGNGN TEKQTDGHK
Specific function: Unknown
COG id: COG5373
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107989; Mature: 107989
Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41
Prosite motif: PS00165 DEHYDRATASE_SER_THR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIMYKNDKYNMTIVLLILGIGLLVSYALDMTNAVIVVMALIIFFVMQQFNHFEKRLQQLE CEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQYLANITPHSSRGWQWGIGLGALVGLVGAYWGLIPLLLVGIIGGVWCLLQILNSLNERL HHHHHCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRIEQVRQQPILQPPTDHEILEPKPVEKSASVNSAHSTTITNSPEWFTTTSQSEKLPDSN HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCC SISTHSTTTLSTISTTKTAWWQPALQWLMHGNPILRVAIALLMIGVVLLLRFASEHWQLS CCCCCCCCEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEE LSIKLLGIALTGGGVTVLGLFLRNKNALFGIALQGAGLAVIFLTLIFAHHYAVIASLSSA EEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH SVCFIILLMITVGLSLKQNAVYLSMLALSMAYLAPLVIPQYRPDSVFLISYYLVINLAVA HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH AMNFVKPWKILNQIAFFATGLIASSFIMLYADQAQYQTLDIILWLHILLFIWLSIRYSQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQKEYRSFKAQVFNAQPILDSQTVQLPPILDVGLIFSVPILGFSLHAFLMHQSSMALTWG HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH ALGLGILYTVLGIWIKQKQSELSILAKSFFILASVFIALVFPLWKGAHWTAVGWVIQGAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCE LIVWGVSERYRTSRYLGMVLIFLSSIALFYQFWTDQQFPVLSTSIYAIAQFIAAYFLFKF EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQQQSSYSVFATISLGLALYAGAVAVVNALAWLGHGLSPYLAVATILLLLFSGLMYFQAK HHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEWALAQLGLVSALLLLCYLELTESAVLSSSHWMNTTQQLSFFVTTIILSALLILLQKSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC HLKYELRLYWGGLLWLSLAAIGCAVWPASGWLCLGIFPLIYGMWLFKQKQFILLDQISVW CCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH ILSWLWLLHLNLIDQTFIGYDLPVFNPVDVMSLLCLAGLLWMIYQHNFNTQNQTVEWTFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEE VTGILTALMVLSSVVVRALHIYLATPLWSLSVWSNGIVQLSLTLLWVILAFVLMTYSSRR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HIRQIWFVGAALLGIVVIKLVGLDLSQSGTLTRVVSFIGAGGVMLVIAYLAPLPPIGNGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC TEKQTDGHK CCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MIMYKNDKYNMTIVLLILGIGLLVSYALDMTNAVIVVMALIIFFVMQQFNHFEKRLQQLE CEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQYLANITPHSSRGWQWGIGLGALVGLVGAYWGLIPLLLVGIIGGVWCLLQILNSLNERL HHHHHCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRIEQVRQQPILQPPTDHEILEPKPVEKSASVNSAHSTTITNSPEWFTTTSQSEKLPDSN HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCC SISTHSTTTLSTISTTKTAWWQPALQWLMHGNPILRVAIALLMIGVVLLLRFASEHWQLS CCCCCCCCEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEE LSIKLLGIALTGGGVTVLGLFLRNKNALFGIALQGAGLAVIFLTLIFAHHYAVIASLSSA EEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH SVCFIILLMITVGLSLKQNAVYLSMLALSMAYLAPLVIPQYRPDSVFLISYYLVINLAVA HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH AMNFVKPWKILNQIAFFATGLIASSFIMLYADQAQYQTLDIILWLHILLFIWLSIRYSQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IQKEYRSFKAQVFNAQPILDSQTVQLPPILDVGLIFSVPILGFSLHAFLMHQSSMALTWG HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH ALGLGILYTVLGIWIKQKQSELSILAKSFFILASVFIALVFPLWKGAHWTAVGWVIQGAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCE LIVWGVSERYRTSRYLGMVLIFLSSIALFYQFWTDQQFPVLSTSIYAIAQFIAAYFLFKF EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQQQSSYSVFATISLGLALYAGAVAVVNALAWLGHGLSPYLAVATILLLLFSGLMYFQAK HHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IEWALAQLGLVSALLLLCYLELTESAVLSSSHWMNTTQQLSFFVTTIILSALLILLQKSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC HLKYELRLYWGGLLWLSLAAIGCAVWPASGWLCLGIFPLIYGMWLFKQKQFILLDQISVW CCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH ILSWLWLLHLNLIDQTFIGYDLPVFNPVDVMSLLCLAGLLWMIYQHNFNTQNQTVEWTFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEE VTGILTALMVLSSVVVRALHIYLATPLWSLSVWSNGIVQLSLTLLWVILAFVLMTYSSRR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HIRQIWFVGAALLGIVVIKLVGLDLSQSGTLTRVVSFIGAGGVMLVIAYLAPLPPIGNGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC TEKQTDGHK CCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA