| Definition | Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005966 |
| Length | 3,598,621 |
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The map label for this gene is ydhK [H]
Identifier: 50083611
GI number: 50083611
Start: 342115
End: 344214
Strand: Direct
Name: ydhK [H]
Synonym: ACIAD0349
Alternate gene names: 50083611
Gene position: 342115-344214 (Clockwise)
Preceding gene: 50083609
Following gene: 50083612
Centisome position: 9.51
GC content: 43.33
Gene sequence:
>2100_bases ATGTTGTGGAAACAAATTCTGGCATTTCGGCCCAATCGAATGGACCTGATTTTTGCGGTCAAGACGTTTATTGCGATGCT GTTGGCCTTGTATATTGCATTTGCACTGGATCTGACCTATCCAATGTGGGCAGCAGGTACGGTGATTATTATTGCACAGC CTTATGCTGGGATGGTGTCGTCTAAGGCGGTTTATCGTTTGATGGGTACCGTGATTGGTGGGGCATTTGCAATTTTTCTC ACGCCTCGTATGATCGATATGCCAATTCTCTTTACGTTTGTTTTAGCGCTTTGGATTGCCTTTTGCCTGTATGTTTCTTT GCTTGATCGTACGCCGCGAAGTTATGTATTTATGCTGGCAGGCTATACCACGGCTATGGTCGCCTGTAGTTCAATCAACA GTATTGATACCTATAGTGTGTTTGACATGGCGTTGAGTCGTGTACTTGAAATCTCGATTGCGGTCATCTGTAGTGCAGTG GTTTCTGCGACGATATTTCCTGCACATCTTGGTACTCAACTCCAGCACAGGGTGCAAAAAACACTGGATGATACCCGAGA GGTGTTTAAAAGTATTTTGACCGATCCTCAGCATAGTAGTAGTTATGCAGAACTTTTGGCTGGGATTACACGAGATACTT CTGATATTCACGGTCTAGCTGTTCATCTGACCTACGAACATGGTGAGCTTAGGGGCATGACCAAGCCTTTGCAGGAATTA CTGCATCAGATCACGATGGTGGTTGCCAATTTGATGTCGATGTCGGAGCGCATTTTACAATTGGATCAAAGTGACGTGCA GTATCGACAGGGGCTGGGCGATCTGTATCAGCATGTGGTGACATTTTTACGTGCCCAAACCGAGATTGAAGAACAACAAT TAAATCGTTTGCCAGATGAGTTTGAACAAGACTTTCATCATCTGATCGCACTGAGTCAGCCTCCACAGCAGGTCATGCTC ATGGCACTGAAAATGGATATTCGCCACTTTGTGCAGAATGTCATGACGATCAAACTATTATGGGCAAGAATTCAACAAGG TGATAAACGCATTCCAGATCATATTGCAGCGTTGACAACTCAATATCCAAGTTTGCATCGTGATCATGGTATAGCCGTTC GTAGTTCGATAGCGGCTGGTGTAGCAACCAGTATTTCGTTTTTGCTCTGGATCTATAGTGGTTGGCATGCAGGTTACATG ATGGCGCAGTTAACAGCTGTCAGCGTATGTATTTTATCCATGCTGGATAATCCTGTGCCTGCTTTAAAGCTGTTTGTCCG TGGTTCTATTTATGCTGCGATTCTTACTATTTTTTATGCTTTTGTGATCATGCCAGAGGTTAAAGAGTTCTGGCAACTGG CTTTTGTGTTGGCACCGATGGCGATTTATCTGTTGTCGATGTTTCCACATCCGCCTTTAATGGGGCTGGCTTTGCCCATG CTGATTAATTTCATTATGAGTCTGAACTTGCAGAATCATTACACAACCAATGCTGTGATTTTGATGGATACTGCCATGGC AGGTGTAGTCGGCCCAATTATTTCGATTTTGGCCATTTATTTTATTCGTGCGATGTCTCCCGAAACCAGTGCGACCCGAA TTTTGGCATCGCATTATCGTGCGATGCGAGCAGCTTTGTATATTCCGTATGGTGTGGGGTTTCGTATTCATTTGCGTGGC ATGCTGGATCGTATTGGCATTCTCAATACCAAAATGGTACAGGTTGATGAGCTAAAATTTGCGATGAATCAGGCATTAAT TGAAACCAGTGCTGTAGTAAATTTAAGCCGAATTGCTGAATTGATGTATCAATCAGCAACCTCTCAACCTTTACAGCATG CCTTATTTCGTTTGCAGCAACTTCTAGATCGTGCCTTTCGTGAGCTAGAAAAACAGTTGACGTTAGATTTGTCGTTAAAG GATAAAATTTTGCAGCAGATTCAGCATATTCAGGAATTACTGGTTAATGAAACCCATACAGAAATTCGGCAGCGTATCGA GATCAGCTTAAATAATATTCAAAGCAGTATTTTGCATGTTCAAGGGACTGAAACTGTTCAAGCCCTGGCTAAAGTGAGAG AGATTGATGGGCGAGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTGTAAGATAAAACTGATGCGCCGTGTCGGTGTTGACGTCTTCACACAAGTAACTCGCTGAATGATGTAATACCAAAGCA CACCGTGTAGAGAGCTTTTC
Downstream 100 bases:
>100_bases TGCATACGGTGTTTATATTCCGAGTTTCCTGATACAGGCAATTTGTGCATTTGTTTTATTCAAACTCGTTACATTGTGGA CAGATCGTCTGATTGCTAAA
Product: fusaric acid resistance protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 699; Mature: 699
Protein sequence:
>699_residues MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVSSKAVYRLMGTVIGGAFAIFL TPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLAGYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAV VSATIFPAHLGTQLQHRVQKTLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDEFEQDFHHLIALSQPPQQVML MALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTTQYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYM MAQLTAVSVCILSMLDNPVPALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYRAMRAALYIPYGVGFRIHLRG MLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAELMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLK DKILQQIQHIQELLVNETHTEIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV
Sequences:
>Translated_699_residues MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVSSKAVYRLMGTVIGGAFAIFL TPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLAGYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAV VSATIFPAHLGTQLQHRVQKTLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDEFEQDFHHLIALSQPPQQVML MALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTTQYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYM MAQLTAVSVCILSMLDNPVPALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYRAMRAALYIPYGVGFRIHLRG MLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAELMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLK DKILQQIQHIQELLVNETHTEIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV >Mature_699_residues MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVSSKAVYRLMGTVIGGAFAIFL TPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLAGYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAV VSATIFPAHLGTQLQHRVQKTLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDEFEQDFHHLIALSQPPQQVML MALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTTQYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYM MAQLTAVSVCILSMLDNPVPALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYRAMRAALYIPYGVGFRIHLRG MLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAELMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLK DKILQQIQHIQELLVNETHTEIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV
Specific function: Unknown
COG id: COG1289
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the aromatic acid exporter ArAE (TC 2.A.85) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787933, Length=550, Percent_Identity=24, Blast_Score=115, Evalue=9e-27, Organism=Escherichia coli, GI1789636, Length=174, Percent_Identity=29.8850574712644, Blast_Score=84, Evalue=4e-17,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006726 [H]
Pfam domain/function: PF04632 FUSC [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 78834; Mature: 78834
Theoretical pI: Translated: 7.62; Mature: 7.62
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 5.2 %Met (Translated Protein) 5.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 5.2 %Met (Mature Protein) 5.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVS CCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEECCCCCHHH SKAVYRLMGTVIGGAFAIFLTPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEHHH GYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAVVSATIFPAHLGTQLQHRVQK HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCHHCCHHHHHHHH LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH FEQDFHHLIALSQPPQQVMLMALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTT HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH QYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYMMAQLTAVSVCILSMLDNPVP HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH ALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYR HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH AMRAALYIPYGVGFRIHLRGMLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAE HHHHHHCCEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLKDKILQQIQHIQELLVNETHT HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH EIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVS CCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEECCCCCHHH SKAVYRLMGTVIGGAFAIFLTPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEHHH GYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAVVSATIFPAHLGTQLQHRVQK HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCHHCCHHHHHHHH LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH FEQDFHHLIALSQPPQQVMLMALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTT HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH QYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYMMAQLTAVSVCILSMLDNPVP HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH ALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYR HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH AMRAALYIPYGVGFRIHLRGMLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAE HHHHHHCCEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLKDKILQQIQHIQELLVNETHT HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH EIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11677608; 12644504 [H]