Definition Acinetobacter sp. ADP1 chromosome, complete genome.
Accession NC_005966
Length 3,598,621

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The map label for this gene is ydhK [H]

Identifier: 50083611

GI number: 50083611

Start: 342115

End: 344214

Strand: Direct

Name: ydhK [H]

Synonym: ACIAD0349

Alternate gene names: 50083611

Gene position: 342115-344214 (Clockwise)

Preceding gene: 50083609

Following gene: 50083612

Centisome position: 9.51

GC content: 43.33

Gene sequence:

>2100_bases
ATGTTGTGGAAACAAATTCTGGCATTTCGGCCCAATCGAATGGACCTGATTTTTGCGGTCAAGACGTTTATTGCGATGCT
GTTGGCCTTGTATATTGCATTTGCACTGGATCTGACCTATCCAATGTGGGCAGCAGGTACGGTGATTATTATTGCACAGC
CTTATGCTGGGATGGTGTCGTCTAAGGCGGTTTATCGTTTGATGGGTACCGTGATTGGTGGGGCATTTGCAATTTTTCTC
ACGCCTCGTATGATCGATATGCCAATTCTCTTTACGTTTGTTTTAGCGCTTTGGATTGCCTTTTGCCTGTATGTTTCTTT
GCTTGATCGTACGCCGCGAAGTTATGTATTTATGCTGGCAGGCTATACCACGGCTATGGTCGCCTGTAGTTCAATCAACA
GTATTGATACCTATAGTGTGTTTGACATGGCGTTGAGTCGTGTACTTGAAATCTCGATTGCGGTCATCTGTAGTGCAGTG
GTTTCTGCGACGATATTTCCTGCACATCTTGGTACTCAACTCCAGCACAGGGTGCAAAAAACACTGGATGATACCCGAGA
GGTGTTTAAAAGTATTTTGACCGATCCTCAGCATAGTAGTAGTTATGCAGAACTTTTGGCTGGGATTACACGAGATACTT
CTGATATTCACGGTCTAGCTGTTCATCTGACCTACGAACATGGTGAGCTTAGGGGCATGACCAAGCCTTTGCAGGAATTA
CTGCATCAGATCACGATGGTGGTTGCCAATTTGATGTCGATGTCGGAGCGCATTTTACAATTGGATCAAAGTGACGTGCA
GTATCGACAGGGGCTGGGCGATCTGTATCAGCATGTGGTGACATTTTTACGTGCCCAAACCGAGATTGAAGAACAACAAT
TAAATCGTTTGCCAGATGAGTTTGAACAAGACTTTCATCATCTGATCGCACTGAGTCAGCCTCCACAGCAGGTCATGCTC
ATGGCACTGAAAATGGATATTCGCCACTTTGTGCAGAATGTCATGACGATCAAACTATTATGGGCAAGAATTCAACAAGG
TGATAAACGCATTCCAGATCATATTGCAGCGTTGACAACTCAATATCCAAGTTTGCATCGTGATCATGGTATAGCCGTTC
GTAGTTCGATAGCGGCTGGTGTAGCAACCAGTATTTCGTTTTTGCTCTGGATCTATAGTGGTTGGCATGCAGGTTACATG
ATGGCGCAGTTAACAGCTGTCAGCGTATGTATTTTATCCATGCTGGATAATCCTGTGCCTGCTTTAAAGCTGTTTGTCCG
TGGTTCTATTTATGCTGCGATTCTTACTATTTTTTATGCTTTTGTGATCATGCCAGAGGTTAAAGAGTTCTGGCAACTGG
CTTTTGTGTTGGCACCGATGGCGATTTATCTGTTGTCGATGTTTCCACATCCGCCTTTAATGGGGCTGGCTTTGCCCATG
CTGATTAATTTCATTATGAGTCTGAACTTGCAGAATCATTACACAACCAATGCTGTGATTTTGATGGATACTGCCATGGC
AGGTGTAGTCGGCCCAATTATTTCGATTTTGGCCATTTATTTTATTCGTGCGATGTCTCCCGAAACCAGTGCGACCCGAA
TTTTGGCATCGCATTATCGTGCGATGCGAGCAGCTTTGTATATTCCGTATGGTGTGGGGTTTCGTATTCATTTGCGTGGC
ATGCTGGATCGTATTGGCATTCTCAATACCAAAATGGTACAGGTTGATGAGCTAAAATTTGCGATGAATCAGGCATTAAT
TGAAACCAGTGCTGTAGTAAATTTAAGCCGAATTGCTGAATTGATGTATCAATCAGCAACCTCTCAACCTTTACAGCATG
CCTTATTTCGTTTGCAGCAACTTCTAGATCGTGCCTTTCGTGAGCTAGAAAAACAGTTGACGTTAGATTTGTCGTTAAAG
GATAAAATTTTGCAGCAGATTCAGCATATTCAGGAATTACTGGTTAATGAAACCCATACAGAAATTCGGCAGCGTATCGA
GATCAGCTTAAATAATATTCAAAGCAGTATTTTGCATGTTCAAGGGACTGAAACTGTTCAAGCCCTGGCTAAAGTGAGAG
AGATTGATGGGCGAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGTAAGATAAAACTGATGCGCCGTGTCGGTGTTGACGTCTTCACACAAGTAACTCGCTGAATGATGTAATACCAAAGCA
CACCGTGTAGAGAGCTTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCATACGGTGTTTATATTCCGAGTTTCCTGATACAGGCAATTTGTGCATTTGTTTTATTCAAACTCGTTACATTGTGGA
CAGATCGTCTGATTGCTAAA

Product: fusaric acid resistance protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 699; Mature: 699

Protein sequence:

>699_residues
MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVSSKAVYRLMGTVIGGAFAIFL
TPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLAGYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAV
VSATIFPAHLGTQLQHRVQKTLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL
LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDEFEQDFHHLIALSQPPQQVML
MALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTTQYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYM
MAQLTAVSVCILSMLDNPVPALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM
LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYRAMRAALYIPYGVGFRIHLRG
MLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAELMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLK
DKILQQIQHIQELLVNETHTEIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV

Sequences:

>Translated_699_residues
MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVSSKAVYRLMGTVIGGAFAIFL
TPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLAGYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAV
VSATIFPAHLGTQLQHRVQKTLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL
LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDEFEQDFHHLIALSQPPQQVML
MALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTTQYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYM
MAQLTAVSVCILSMLDNPVPALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM
LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYRAMRAALYIPYGVGFRIHLRG
MLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAELMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLK
DKILQQIQHIQELLVNETHTEIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV
>Mature_699_residues
MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVSSKAVYRLMGTVIGGAFAIFL
TPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLAGYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAV
VSATIFPAHLGTQLQHRVQKTLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL
LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDEFEQDFHHLIALSQPPQQVML
MALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTTQYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYM
MAQLTAVSVCILSMLDNPVPALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM
LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYRAMRAALYIPYGVGFRIHLRG
MLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAELMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLK
DKILQQIQHIQELLVNETHTEIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the aromatic acid exporter ArAE (TC 2.A.85) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787933, Length=550, Percent_Identity=24, Blast_Score=115, Evalue=9e-27,
Organism=Escherichia coli, GI1789636, Length=174, Percent_Identity=29.8850574712644, Blast_Score=84, Evalue=4e-17,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006726 [H]

Pfam domain/function: PF04632 FUSC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78834; Mature: 78834

Theoretical pI: Translated: 7.62; Mature: 7.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
5.2 %Met     (Translated Protein)
5.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
5.2 %Met     (Mature Protein)
5.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVS
CCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEECCCCCHHH
SKAVYRLMGTVIGGAFAIFLTPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEHHH
GYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAVVSATIFPAHLGTQLQHRVQK
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCHHCCHHHHHHHH
LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FEQDFHHLIALSQPPQQVMLMALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTT
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
QYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYMMAQLTAVSVCILSMLDNPVP
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
ALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYR
HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
AMRAALYIPYGVGFRIHLRGMLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAE
HHHHHHCCEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLKDKILQQIQHIQELLVNETHT
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
EIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MLWKQILAFRPNRMDLIFAVKTFIAMLLALYIAFALDLTYPMWAAGTVIIIAQPYAGMVS
CCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEECCCCCHHH
SKAVYRLMGTVIGGAFAIFLTPRMIDMPILFTFVLALWIAFCLYVSLLDRTPRSYVFMLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEHHH
GYTTAMVACSSINSIDTYSVFDMALSRVLEISIAVICSAVVSATIFPAHLGTQLQHRVQK
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLDDTREVFKSILTDPQHSSSYAELLAGITRDTSDIHGLAVHLTYEHGELRGMTKPLQEL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEECCHHCCHHHHHHHH
LHQITMVVANLMSMSERILQLDQSDVQYRQGLGDLYQHVVTFLRAQTEIEEQQLNRLPDE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
FEQDFHHLIALSQPPQQVMLMALKMDIRHFVQNVMTIKLLWARIQQGDKRIPDHIAALTT
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
QYPSLHRDHGIAVRSSIAAGVATSISFLLWIYSGWHAGYMMAQLTAVSVCILSMLDNPVP
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
ALKLFVRGSIYAAILTIFYAFVIMPEVKEFWQLAFVLAPMAIYLLSMFPHPPLMGLALPM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LINFIMSLNLQNHYTTNAVILMDTAMAGVVGPIISILAIYFIRAMSPETSATRILASHYR
HHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
AMRAALYIPYGVGFRIHLRGMLDRIGILNTKMVQVDELKFAMNQALIETSAVVNLSRIAE
HHHHHHCCEECCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LMYQSATSQPLQHALFRLQQLLDRAFRELEKQLTLDLSLKDKILQQIQHIQELLVNETHT
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
EIRQRIEISLNNIQSSILHVQGTETVQALAKVREIDGRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11677608; 12644504 [H]