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The map label for this gene is rfbX [H]

Identifier: 50083367

GI number: 50083367

Start: 71489

End: 72739

Strand: Direct

Name: rfbX [H]

Synonym: ACIAD0075

Alternate gene names: 50083367

Gene position: 71489-72739 (Clockwise)

Preceding gene: 50083366

Following gene: 50083368

Centisome position: 1.99

GC content: 25.02

Gene sequence:

>1251_bases
ATGAAATCCAAAGAGTTAAAAGAAGTAGGATATCTGTATTTAATACAAATAGTTAATTTTGTATTACCTATTTTTTTAAT
GACCTATTTGGTGAAAATTTTAGGTTTGGATGGTTATGGTAAATTAAGTTTCTATCAAATATGTAGCTTATTGATGATTT
TTATTGTCGATTTTGGATTCAACCAATCATCTGCTCAGAAGTTCGCAGTTTCGGATGCAAGGGACAGGGATAAAATATTT
AATAATACACAAAGTATTAAATTTTTTATTTCGATTTTTATAATAATTTTTACAGTTTTTTTCCTATCTTTTGATTTTAT
TGTTTTTAGTGATATTGATAAAAATATCTTATTAATTTCCAGTTTAACTACATTAGGTACAGTATTATCATCTGCTTGGC
TTTATCAGGCTATAGGTAAAAATTCAGCACTTGCCTTAATTACTGTTTTTTTTCGATTGATATCTTTTTTCTTAATAATA
TTTACTGTTAAAGTTAAAGACGATCTGATGTATTGTATTTGGGTGCAATTTTTTTCTTCAATTCTAATTGGTTTCTTTTC
TTTATATTATTTGATAAAAAAGAAAATAACAGCTATTGACTATAAATTATTTGATTTATCATATTCTTTTCTTCTTGTAA
AAGATAGCTATCATATTTTCCTTGCATCTTCAATTACTTTGGGCTTTACTTATTTAAATCCATTATTTGTTAAATATTTT
TTTGGAGATGCTTTTCTTGGACTTTATAGTATAGCAGATAAAATTTCTAGTACTTTGAAAATGGTTTTTGGTCCATTTAT
TCAGGCATTTTACAGTAAATTCTGTACTTTAGCTAATCAGCATAAATACTGGGAAAGTATTAAGCTATCTTCTAAAATTA
TTACCTTTTTTCTTGTTGTTTCTTTTATTGGGTTTTTGCTTAATATTTGGATTGGAAACTCTATTTATAATCTATTTTTT
AGTCATGTGGAAGAATTAATAAAGCTGCTGAATATTATGATTTTATCTCAAGCTATAGTTGGAGTCGCTATGGTTTTGGT
TAATTTAAATATAATACCTTTAGGTAGGGCATTTGTATTAAAAAGATTCTACTTGATTGGTTTGTTTTTTCACTTTACTT
ATCTGTATTTTTTAATTTCCAATTATGGTGTGTATGGTATTGCTTTATCAGTTTTTTTAACAGAGTTGATTTTGGTTTTT
TTATTTGCTTTATATTTGTTTTTCTATTTTAAGAGAAATAAATACTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTTAAAGGTAATATGCCTTTTTTAGAAAAAAATAAAATTTTTAAGCAGATTAAATTTGGTGAACCTCTCATCCTAAGT
TATTTGGTATGGTTGTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTATTTTAATTTTTTATCGGAGTAATAATGATGAAAATATTAATAACAGGTGGTGCTGGTTTTATTGGTTCGGCAGTG
GTACGTCATATTATTCAGAA

Product: polysaccharide transporter

Products: lipopolysaccharide [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 416; Mature: 416

Protein sequence:

>416_residues
MKSKELKEVGYLYLIQIVNFVLPIFLMTYLVKILGLDGYGKLSFYQICSLLMIFIVDFGFNQSSAQKFAVSDARDRDKIF
NNTQSIKFFISIFIIIFTVFFLSFDFIVFSDIDKNILLISSLTTLGTVLSSAWLYQAIGKNSALALITVFFRLISFFLII
FTVKVKDDLMYCIWVQFFSSILIGFFSLYYLIKKKITAIDYKLFDLSYSFLLVKDSYHIFLASSITLGFTYLNPLFVKYF
FGDAFLGLYSIADKISSTLKMVFGPFIQAFYSKFCTLANQHKYWESIKLSSKIITFFLVVSFIGFLLNIWIGNSIYNLFF
SHVEELIKLLNIMILSQAIVGVAMVLVNLNIIPLGRAFVLKRFYLIGLFFHFTYLYFLISNYGVYGIALSVFLTELILVF
LFALYLFFYFKRNKYL

Sequences:

>Translated_416_residues
MKSKELKEVGYLYLIQIVNFVLPIFLMTYLVKILGLDGYGKLSFYQICSLLMIFIVDFGFNQSSAQKFAVSDARDRDKIF
NNTQSIKFFISIFIIIFTVFFLSFDFIVFSDIDKNILLISSLTTLGTVLSSAWLYQAIGKNSALALITVFFRLISFFLII
FTVKVKDDLMYCIWVQFFSSILIGFFSLYYLIKKKITAIDYKLFDLSYSFLLVKDSYHIFLASSITLGFTYLNPLFVKYF
FGDAFLGLYSIADKISSTLKMVFGPFIQAFYSKFCTLANQHKYWESIKLSSKIITFFLVVSFIGFLLNIWIGNSIYNLFF
SHVEELIKLLNIMILSQAIVGVAMVLVNLNIIPLGRAFVLKRFYLIGLFFHFTYLYFLISNYGVYGIALSVFLTELILVF
LFALYLFFYFKRNKYL
>Mature_416_residues
MKSKELKEVGYLYLIQIVNFVLPIFLMTYLVKILGLDGYGKLSFYQICSLLMIFIVDFGFNQSSAQKFAVSDARDRDKIF
NNTQSIKFFISIFIIIFTVFFLSFDFIVFSDIDKNILLISSLTTLGTVLSSAWLYQAIGKNSALALITVFFRLISFFLII
FTVKVKDDLMYCIWVQFFSSILIGFFSLYYLIKKKITAIDYKLFDLSYSFLLVKDSYHIFLASSITLGFTYLNPLFVKYF
FGDAFLGLYSIADKISSTLKMVFGPFIQAFYSKFCTLANQHKYWESIKLSSKIITFFLVVSFIGFLLNIWIGNSIYNLFF
SHVEELIKLLNIMILSQAIVGVAMVLVNLNIIPLGRAFVLKRFYLIGLFFHFTYLYFLISNYGVYGIALSVFLTELILVF
LFALYLFFYFKRNKYL

Specific function: May be involved in the translocation process of the nascent O-polysaccharide molecules and/or its ligation to lipid A core units [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788349, Length=273, Percent_Identity=24.9084249084249, Blast_Score=90, Evalue=3e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001991
- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48326; Mature: 48326

Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSKELKEVGYLYLIQIVNFVLPIFLMTYLVKILGLDGYGKLSFYQICSLLMIFIVDFGF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NQSSAQKFAVSDARDRDKIFNNTQSIKFFISIFIIIFTVFFLSFDFIVFSDIDKNILLIS
CCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEHHH
SLTTLGTVLSSAWLYQAIGKNSALALITVFFRLISFFLIIFTVKVKDDLMYCIWVQFFSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILIGFFSLYYLIKKKITAIDYKLFDLSYSFLLVKDSYHIFLASSITLGFTYLNPLFVKYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGDAFLGLYSIADKISSTLKMVFGPFIQAFYSKFCTLANQHKYWESIKLSSKIITFFLVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIGFLLNIWIGNSIYNLFFSHVEELIKLLNIMILSQAIVGVAMVLVNLNIIPLGRAFVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHHHH
KRFYLIGLFFHFTYLYFLISNYGVYGIALSVFLTELILVFLFALYLFFYFKRNKYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSKELKEVGYLYLIQIVNFVLPIFLMTYLVKILGLDGYGKLSFYQICSLLMIFIVDFGF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NQSSAQKFAVSDARDRDKIFNNTQSIKFFISIFIIIFTVFFLSFDFIVFSDIDKNILLIS
CCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEHHH
SLTTLGTVLSSAWLYQAIGKNSALALITVFFRLISFFLIIFTVKVKDDLMYCIWVQFFSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILIGFFSLYYLIKKKITAIDYKLFDLSYSFLLVKDSYHIFLASSITLGFTYLNPLFVKYF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGDAFLGLYSIADKISSTLKMVFGPFIQAFYSKFCTLANQHKYWESIKLSSKIITFFLVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIGFLLNIWIGNSIYNLFFSHVEELIKLLNIMILSQAIVGVAMVLVNLNIIPLGRAFVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHHHH
KRFYLIGLFFHFTYLYFLISNYGVYGIALSVFLTELILVFLFALYLFFYFKRNKYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: lipopolysaccharide [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: lipopolysaccharide [Cytoplasm] = lipopolysaccharide [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7692219 [H]