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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 49478940

GI number: 49478940

Start: 5004583

End: 5006055

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: BT9727_4951

Alternate gene names: 49478940

Gene position: 5006055-5004583 (Counterclockwise)

Preceding gene: 49478941

Following gene: 49478938

Centisome position: 95.58

GC content: 28.24

Gene sequence:

>1473_bases
ATGAAAAAAATTATTAAGTATGTTGGTATAATTGCACTAGGTAATATCCTTATTAAGATATTAGGGTTTATAAGAGAAGT
AGCTATTTCATATAAATTTGGTGCTTCACCAATAACCGATGCATATTTAGTGGCATTTACTATTCCTTTAATATTATTCC
AATTTTTAGGGGTAGGATATGCAACATCTATAATCAAAGTATTAAGCTCATTGGAAGGAAACATTCAAGAAAAAAAGGCT
TTTATTTCTAGAGTGTTTTCATATACATTGATAACATCAGTTGTATTACTTTTTCTGGGATTTTCTTTTAGTAGACCGAT
TGTTAGAATATTTTCCCCAGGATTAGAACCCCAAACTATAGAATTAGCATCAGAATTATTAAGGCTTTCTATGCCAATGG
TTATTAGTAGTATGATTATTGCTATTTCGAGTGGAATACTGCAATATTCTAATAAATTTGCAATTGATGTATGGTCAAAT
TTGCCGAATAATTTAATAATCATAATTTCAATAGTTTGCTTTTCAGGGGTGGGTGGAATCTATGCAGTAACTTTGAGTAC
TGTTATTGGTTCTTTAACAATATTACTCATTCAATTACCTTTTAGTTTAAAATATGGGCTAAATCTTAGATTGGATTTTA
GAGTAGACGAAAATTTAAACAAGTTTGTGAAAATTTTAATACCGGCAACACTGTTATCTATGGTACAAATGATTGGGACA
TTAATTAATAGATTCATAGCATCATTTATGGAAACTGGAAGTATTTCTATCTTGTATTTTGCTGATAGGTTATATAATCT
ACCGTATTTAGTAGTAGTAATGGCAATTACTACTGTACTTTTTCCTAAATTAGTTAGTCTTTTTAATAGTGGTGAGCTAG
ATAAATTTAAGGTATATGTGGCCGGTTTATTTAAAGTAATCATAATATTAATGACTTCTATCGCAATAGTAATGTTTGTT
CTAAGACAAGAATTAGTAGAAATAGTTTATCAAAGAGGGAATTTTTCTAAGGAGGCAGTTTCCTTGACAGCAACATGTTT
TGGAATTTATTCTTTGGGGATAATTTTCTTGAGCCTTAGGGAGTTATTCATAAAAATATATTTTTGCTTAAATGATACAA
AAATATTACTAATGAACAGTTTATACATGTTTCTACTCAACATTACTTTAGGTATAATACTCTCTTATTTTTGTGGGATT
TATGGCTTAGCAGCAAGTACACCGTTATCAGTATTGATTTCGAGTTTATATTTATATAAACATTTGAAGATGAGCGGTCA
TTTGAATATTAATAAGGCCTTTTTAATGAAGTATTTTATGATTAGTTGTATTACATTTATTATAGCCAAAATATCTTTAG
AATATCTTTATAACTATACTGATAACGCATTATTAATAGTTAGTATAATTTCGTTTATGGTCATCAGTATATATGGTAGT
TTGGCGTGGGTCTTTAGATTAATAAATACTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGTTCTCTATAATACCAACTTATATGTTAATAAGGGTGACAACTAAGAAGTTTAATATAAAATAACAATAGTTCTTAA
GGGTGGAGTAGCTATAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAAATGAAAATATTTAGATTTAACCTAAGGAGATAGTTTTTATGAAAGATGAAATTATTCTGGTTGGACCAGGAACA
GATTCTATGGGGGGCGTCGC

Product: MVIN-like virulence factor

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 490; Mature: 490

Protein sequence:

>490_residues
MKKIIKYVGIIALGNILIKILGFIREVAISYKFGASPITDAYLVAFTIPLILFQFLGVGYATSIIKVLSSLEGNIQEKKA
FISRVFSYTLITSVVLLFLGFSFSRPIVRIFSPGLEPQTIELASELLRLSMPMVISSMIIAISSGILQYSNKFAIDVWSN
LPNNLIIIISIVCFSGVGGIYAVTLSTVIGSLTILLIQLPFSLKYGLNLRLDFRVDENLNKFVKILIPATLLSMVQMIGT
LINRFIASFMETGSISILYFADRLYNLPYLVVVMAITTVLFPKLVSLFNSGELDKFKVYVAGLFKVIIILMTSIAIVMFV
LRQELVEIVYQRGNFSKEAVSLTATCFGIYSLGIIFLSLRELFIKIYFCLNDTKILLMNSLYMFLLNITLGIILSYFCGI
YGLAASTPLSVLISSLYLYKHLKMSGHLNINKAFLMKYFMISCITFIIAKISLEYLYNYTDNALLIVSIISFMVISIYGS
LAWVFRLINT

Sequences:

>Translated_490_residues
MKKIIKYVGIIALGNILIKILGFIREVAISYKFGASPITDAYLVAFTIPLILFQFLGVGYATSIIKVLSSLEGNIQEKKA
FISRVFSYTLITSVVLLFLGFSFSRPIVRIFSPGLEPQTIELASELLRLSMPMVISSMIIAISSGILQYSNKFAIDVWSN
LPNNLIIIISIVCFSGVGGIYAVTLSTVIGSLTILLIQLPFSLKYGLNLRLDFRVDENLNKFVKILIPATLLSMVQMIGT
LINRFIASFMETGSISILYFADRLYNLPYLVVVMAITTVLFPKLVSLFNSGELDKFKVYVAGLFKVIIILMTSIAIVMFV
LRQELVEIVYQRGNFSKEAVSLTATCFGIYSLGIIFLSLRELFIKIYFCLNDTKILLMNSLYMFLLNITLGIILSYFCGI
YGLAASTPLSVLISSLYLYKHLKMSGHLNINKAFLMKYFMISCITFIIAKISLEYLYNYTDNALLIVSIISFMVISIYGS
LAWVFRLINT
>Mature_490_residues
MKKIIKYVGIIALGNILIKILGFIREVAISYKFGASPITDAYLVAFTIPLILFQFLGVGYATSIIKVLSSLEGNIQEKKA
FISRVFSYTLITSVVLLFLGFSFSRPIVRIFSPGLEPQTIELASELLRLSMPMVISSMIIAISSGILQYSNKFAIDVWSN
LPNNLIIIISIVCFSGVGGIYAVTLSTVIGSLTILLIQLPFSLKYGLNLRLDFRVDENLNKFVKILIPATLLSMVQMIGT
LINRFIASFMETGSISILYFADRLYNLPYLVVVMAITTVLFPKLVSLFNSGELDKFKVYVAGLFKVIIILMTSIAIVMFV
LRQELVEIVYQRGNFSKEAVSLTATCFGIYSLGIIFLSLRELFIKIYFCLNDTKILLMNSLYMFLLNITLGIILSYFCGI
YGLAASTPLSVLISSLYLYKHLKMSGHLNINKAFLMKYFMISCITFIIAKISLEYLYNYTDNALLIVSIISFMVISIYGS
LAWVFRLINT

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=369, Percent_Identity=26.2872628726287, Blast_Score=117, Evalue=2e-27,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54893; Mature: 54893

Theoretical pI: Translated: 9.73; Mature: 9.73

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKIIKYVGIIALGNILIKILGFIREVAISYKFGASPITDAYLVAFTIPLILFQFLGVGY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATSIIKVLSSLEGNIQEKKAFISRVFSYTLITSVVLLFLGFSFSRPIVRIFSPGLEPQTI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHH
ELASELLRLSMPMVISSMIIAISSGILQYSNKFAIDVWSNLPNNLIIIISIVCFSGVGGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
YAVTLSTVIGSLTILLIQLPFSLKYGLNLRLDFRVDENLNKFVKILIPATLLSMVQMIGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINRFIASFMETGSISILYFADRLYNLPYLVVVMAITTVLFPKLVSLFNSGELDKFKVYV
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
AGLFKVIIILMTSIAIVMFVLRQELVEIVYQRGNFSKEAVSLTATCFGIYSLGIIFLSLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELFIKIYFCLNDTKILLMNSLYMFLLNITLGIILSYFCGIYGLAASTPLSVLISSLYLYK
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
HLKMSGHLNINKAFLMKYFMISCITFIIAKISLEYLYNYTDNALLIVSIISFMVISIYGS
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAWVFRLINT
HHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKKIIKYVGIIALGNILIKILGFIREVAISYKFGASPITDAYLVAFTIPLILFQFLGVGY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATSIIKVLSSLEGNIQEKKAFISRVFSYTLITSVVLLFLGFSFSRPIVRIFSPGLEPQTI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHH
ELASELLRLSMPMVISSMIIAISSGILQYSNKFAIDVWSNLPNNLIIIISIVCFSGVGGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHH
YAVTLSTVIGSLTILLIQLPFSLKYGLNLRLDFRVDENLNKFVKILIPATLLSMVQMIGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LINRFIASFMETGSISILYFADRLYNLPYLVVVMAITTVLFPKLVSLFNSGELDKFKVYV
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
AGLFKVIIILMTSIAIVMFVLRQELVEIVYQRGNFSKEAVSLTATCFGIYSLGIIFLSLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ELFIKIYFCLNDTKILLMNSLYMFLLNITLGIILSYFCGIYGLAASTPLSVLISSLYLYK
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
HLKMSGHLNINKAFLMKYFMISCITFIIAKISLEYLYNYTDNALLIVSIISFMVISIYGS
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAWVFRLINT
HHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9457888; 10952301 [H]