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The map label for this gene is 46447424

Identifier: 46447424

GI number: 46447424

Start: 2144705

End: 2145937

Strand: Direct

Name: 46447424

Synonym: pc1790

Alternate gene names: NA

Gene position: 2144705-2145937 (Clockwise)

Preceding gene: 46447423

Following gene: 46447428

Centisome position: 88.83

GC content: 33.5

Gene sequence:

>1233_bases
ATGTTAATTTCTATCTTTGCCATTGTTCTTGCTTATTTGACCCAGAGTTATTTTCCCTCATTTAATCCTCAGGAGTCTTC
GATTTTAATCATTGCGGGAAGCCTACTTGTTCTTTTGCTAACAGTATTATCAATTACCCTTTCATTACTACCTCTACAAA
AGCTTGAGCAAAACCTAGTTCCCAATCTTGTAGAATTATATAAACGTAATCGCTGGTTGAAAATTAATCGATTTTGTCTT
TTTTTATTTCCTCTTGTTTCCTTTTTTGCCGTAAATTGGATAAATTCAAATTCTTTTCAATTTAAAGAATGGATTATGCC
CATTTGGCTGGTAACATTTGGATTGAGTTTAGATTTACTGAAATGCTATTGGCAAAACTTAATGCAATTTTTAAATCCAA
GTGATTTTGTAAATATGCTTACGAGGCAAGGTAAAAAAGCTGTTCAAAATGAAAAAGATGACACTTTATGGAGTTGTTTA
GATAATTTATCTGAAATAGCTGTAAGGTCTATTGAGAAAAGCAAAATTGCCCTTAGTACTCAAACACTCAAGTCTTTTCC
TCCCATTGTGGATGCTTTTTTTGCTTCTTCAAAAAGTATCAGCCGCATAAATGTCGATGCAGAAACAGAAAAAAAGACAG
GTCGAGATGAAGCCAGCTTTACAATTTTTTATCTATTGCAAAGATTAGAACTTATCAACGATCGTGCTTTACAAAACCGT
TTGGAAACTGTTTGTCGACAGATGATAATGACGATGGGAAAACTCATTGTATCATGTGCTAAATTTGATTTAACCATGGT
GAATTTCCCAACACATTTTCTGACCAAATTTGGTTTAAAAGCTTTACAACATCATTTTGAAGAGGTGGGAGTATTAACAA
CGAGTACTCTACTTGAAATTGCCAAGACAATTTTAAAAGATGTCAACATCAATTATGCTGAATTGCAAAGTCCTTTTCAA
GCTATTGTTAATGGATTGAATGCTATTGCCAAAGCGACGTTCAAAAAAGAGAAAAATACGAGCATCAAATTGCTAGTACA
ACCTTTTGAAGAGTTGAAAACAATGTTTCAAGCTGAAAAAATGGTTAATCATCCAGATACTTCTGTAATTATTCATGAGA
TTGACCGTATCTTGGAAGAATTTACAGTCCTAGGCCAAGTCATGCGTTCTATTCCTCCCATTCCCAATTTAGAAGATGAT
TCCCCTACAACAGCAAATTCCAACCTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAACTCACTAGAAAAATTTATTGAGTTACCGTTAAATAAATTTATTTTACATGCAAAATGAACAGTTAAAAAAAAGGTT
TTGCTTAGGAGATGAAAACG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTATAAAAGTAGAGATTTTTTCCTATTAAAAAGATTTGAAGTAAAGCTATGATAAGCAGTTTCAGGGATTAAAACTAAA
AGGTAACGCAGTTTGAAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 410; Mature: 410

Protein sequence:

>410_residues
MLISIFAIVLAYLTQSYFPSFNPQESSILIIAGSLLVLLLTVLSITLSLLPLQKLEQNLVPNLVELYKRNRWLKINRFCL
FLFPLVSFFAVNWINSNSFQFKEWIMPIWLVTFGLSLDLLKCYWQNLMQFLNPSDFVNMLTRQGKKAVQNEKDDTLWSCL
DNLSEIAVRSIEKSKIALSTQTLKSFPPIVDAFFASSKSISRINVDAETEKKTGRDEASFTIFYLLQRLELINDRALQNR
LETVCRQMIMTMGKLIVSCAKFDLTMVNFPTHFLTKFGLKALQHHFEEVGVLTTSTLLEIAKTILKDVNINYAELQSPFQ
AIVNGLNAIAKATFKKEKNTSIKLLVQPFEELKTMFQAEKMVNHPDTSVIIHEIDRILEEFTVLGQVMRSIPPIPNLEDD
SPTTANSNLK

Sequences:

>Translated_410_residues
MLISIFAIVLAYLTQSYFPSFNPQESSILIIAGSLLVLLLTVLSITLSLLPLQKLEQNLVPNLVELYKRNRWLKINRFCL
FLFPLVSFFAVNWINSNSFQFKEWIMPIWLVTFGLSLDLLKCYWQNLMQFLNPSDFVNMLTRQGKKAVQNEKDDTLWSCL
DNLSEIAVRSIEKSKIALSTQTLKSFPPIVDAFFASSKSISRINVDAETEKKTGRDEASFTIFYLLQRLELINDRALQNR
LETVCRQMIMTMGKLIVSCAKFDLTMVNFPTHFLTKFGLKALQHHFEEVGVLTTSTLLEIAKTILKDVNINYAELQSPFQ
AIVNGLNAIAKATFKKEKNTSIKLLVQPFEELKTMFQAEKMVNHPDTSVIIHEIDRILEEFTVLGQVMRSIPPIPNLEDD
SPTTANSNLK
>Mature_410_residues
MLISIFAIVLAYLTQSYFPSFNPQESSILIIAGSLLVLLLTVLSITLSLLPLQKLEQNLVPNLVELYKRNRWLKINRFCL
FLFPLVSFFAVNWINSNSFQFKEWIMPIWLVTFGLSLDLLKCYWQNLMQFLNPSDFVNMLTRQGKKAVQNEKDDTLWSCL
DNLSEIAVRSIEKSKIALSTQTLKSFPPIVDAFFASSKSISRINVDAETEKKTGRDEASFTIFYLLQRLELINDRALQNR
LETVCRQMIMTMGKLIVSCAKFDLTMVNFPTHFLTKFGLKALQHHFEEVGVLTTSTLLEIAKTILKDVNINYAELQSPFQ
AIVNGLNAIAKATFKKEKNTSIKLLVQPFEELKTMFQAEKMVNHPDTSVIIHEIDRILEEFTVLGQVMRSIPPIPNLEDD
SPTTANSNLK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46860; Mature: 46860

Theoretical pI: Translated: 8.20; Mature: 8.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLISIFAIVLAYLTQSYFPSFNPQESSILIIAGSLLVLLLTVLSITLSLLPLQKLEQNLV
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PNLVELYKRNRWLKINRFCLFLFPLVSFFAVNWINSNSFQFKEWIMPIWLVTFGLSLDLL
HHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
KCYWQNLMQFLNPSDFVNMLTRQGKKAVQNEKDDTLWSCLDNLSEIAVRSIEKSKIALST
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTLKSFPPIVDAFFASSKSISRINVDAETEKKTGRDEASFTIFYLLQRLELINDRALQNR
HHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LETVCRQMIMTMGKLIVSCAKFDLTMVNFPTHFLTKFGLKALQHHFEEVGVLTTSTLLEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKTILKDVNINYAELQSPFQAIVNGLNAIAKATFKKEKNTSIKLLVQPFEELKTMFQAEK
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MVNHPDTSVIIHEIDRILEEFTVLGQVMRSIPPIPNLEDDSPTTANSNLK
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLISIFAIVLAYLTQSYFPSFNPQESSILIIAGSLLVLLLTVLSITLSLLPLQKLEQNLV
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PNLVELYKRNRWLKINRFCLFLFPLVSFFAVNWINSNSFQFKEWIMPIWLVTFGLSLDLL
HHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
KCYWQNLMQFLNPSDFVNMLTRQGKKAVQNEKDDTLWSCLDNLSEIAVRSIEKSKIALST
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QTLKSFPPIVDAFFASSKSISRINVDAETEKKTGRDEASFTIFYLLQRLELINDRALQNR
HHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LETVCRQMIMTMGKLIVSCAKFDLTMVNFPTHFLTKFGLKALQHHFEEVGVLTTSTLLEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKTILKDVNINYAELQSPFQAIVNGLNAIAKATFKKEKNTSIKLLVQPFEELKTMFQAEK
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MVNHPDTSVIIHEIDRILEEFTVLGQVMRSIPPIPNLEDDSPTTANSNLK
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA