Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46447276

Identifier: 46447276

GI number: 46447276

Start: 1971962

End: 1973137

Strand: Direct

Name: 46447276

Synonym: pc1642

Alternate gene names: NA

Gene position: 1971962-1973137 (Clockwise)

Preceding gene: 46447275

Following gene: 46447278

Centisome position: 81.67

GC content: 35.2

Gene sequence:

>1176_bases
ATGTATAATCTTTTGTCTTTTATAATTTGCAAGCAGCTTGATGCAACCCCCTTTCAAATTACTTTACTAATTAGTTCTAA
GCCTCTTGTAGCTCTTATTTCTTTTTATAGTTCTGTTTTTATCAAAAACAGGCCTGAACGACTCAAATCATTAATTATCA
GTTCCACAATATTGAGTTTTATTCCTTGTTTTGCTTTTCCTTTTGTCACTAATTGTTGGTTTTTTATTTTTGCTTTCGCT
CTCTTTATGATGTCAGCGAAAGCCATGCTTCCTGCTTGGGCTGAAATTTTTAAACGAAATATTGGCCCAGAAGGAAGAAG
CGCTATTTTTTCTAAGGGATCCACAGTTAATTATCTCGCTAACATCTTTGTTCCTCTATTATTAGCGCCAATTTTAGATT
ACTATCCCTCAATTTGGACAGAAATATTTTTTATTTTGGCTCTTATTCAACTCGCTCACGTAGTTTTTTTACTTCGTTTA
AAAGTCCGTTTAGAAAAGCATGAATCATCATCATTTGCTCCCAATTCTTTCTCTTTTCGATCCGTCATATTTGATCCGTG
GAAAAATAGCTGGCAATTAATGAAGCAACGACCTGATTTTCGCAACTACCAAATCGTTTTTTTATTGGGAGGAACGGGTT
TAATTCTTTCGCAACCTGTTTTACCTCTTTTTTTTGAGCAAATTCTACACTTATCGTATACTCAACTTATCTTTGCTGTC
TCATTATGTAAAGGAATAGGATTTGCTATCACCTCTCCTTTATGGGCTAACGCATTTAATCGCATCTCTATTAATTTATT
TAATTTCTTTGTCACGGCATTAGCTGGCCTATTTGCTATTGTTTTAGCTACTATCCAGCAAGAAGTTTTATGGCTTTATT
TAGCCTATTTGATTTATGGCATTATGCAAGCGGGAAGTGAGATGAGTTGGCATTTAGCAGGTCCTCAATTTGCCAAACAA
GAAGACAGTACATTATACACAAGTGTAAACATAGCTATGATCGGTTTAAGAGGATGTATAGCTCCCTTTATTGGGGAGCT
TCTTTTCTGCACAACGAATTTTAGTGTGGTATTTTTCTGTAGTGCAGGGTGTTGCTTAGCTGGAGCTTTTTACTCCTACT
GGCTTGAATTTCAAGATCGAAAAGCAGATAATCTTACATTTTCTGCTGTTGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGATAAACGCCTATTAAAATGCAAAAAAATTTAGATTATTTAAAAAATACTCAATTTATTTTTATTGCCAGTAAGCTTC
TAAATAGCCCTTTAGGAGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAATTTTAAACTCCTTTTAACAACAACTAAAGGCACGATTAGCTAGACAGCCTTTTAGTTTGGGCTTTAATTTCACTCT
TTTTCACTTCATTTTTTAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 391; Mature: 391

Protein sequence:

>391_residues
MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSFIPCFAFPFVTNCWFFIFAFA
LFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLANIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRL
KVRLEKHESSSFAPNSFSFRSVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV
SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYGIMQAGSEMSWHLAGPQFAKQ
EDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFCSAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE

Sequences:

>Translated_391_residues
MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSFIPCFAFPFVTNCWFFIFAFA
LFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLANIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRL
KVRLEKHESSSFAPNSFSFRSVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV
SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYGIMQAGSEMSWHLAGPQFAKQ
EDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFCSAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE
>Mature_391_residues
MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSFIPCFAFPFVTNCWFFIFAFA
LFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLANIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRL
KVRLEKHESSSFAPNSFSFRSVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV
SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYGIMQAGSEMSWHLAGPQFAKQ
EDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFCSAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44326; Mature: 44326

Theoretical pI: Translated: 8.60; Mature: 8.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSF
CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IPCFAFPFVTNCWFFIFAFALFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHH
NIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRLKVRLEKHESSSFAPNSFSFR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
SVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV
HHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYG
HHHHCCCHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMQAGSEMSWHLAGPQFAKQEDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFC
HHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE
SAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECC
>Mature Secondary Structure
MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSF
CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IPCFAFPFVTNCWFFIFAFALFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHH
NIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRLKVRLEKHESSSFAPNSFSFR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH
SVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV
HHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYG
HHHHCCCHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMQAGSEMSWHLAGPQFAKQEDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFC
HHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE
SAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA