Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 46447014

Identifier: 46447014

GI number: 46447014

Start: 1654345

End: 1656954

Strand: Direct

Name: 46447014

Synonym: pc1380

Alternate gene names: NA

Gene position: 1654345-1656954 (Clockwise)

Preceding gene: 46447012

Following gene: 46447015

Centisome position: 68.52

GC content: 35.33

Gene sequence:

>2610_bases
ATGGTCATGTCAGATATTAACAACATTGGTGGATCCACTCAAGGCCTGCAATCTTACTCTTCTTATACAGATAACCCCGT
TTTTCAAAGCCTTCCATCTTCGGTTCAAGATAGCCTAATTCAATCTTTCACAAAAGAAGAATTAAATAAACGATTTGCAA
ATGCAACCGTTAGTATCCCTTCACTTCTAGCTCCTAATGATATTTCTGGTTCATTAGACAACTTTTTTAAAGTGCTAAGT
GAAGCAAAAGTACAGCTTAATCTTCAATTTCGTACTGCTGAATTTATTGACCAGTTAACAAGACGACAAGATAGCCGAGA
AGCGGGTCTTCAAGCTTTAGGCCTCGTCGGTGAATTTGCAAGGAGAGAAGTTGCTTTGCAGCAAACAAAAGAAGCCGCTG
AAGCAAAAATGGCAGAAATTCACAATCTTAATGAAGCGATAAAAAATCAAATTAATGATCAAAATAATGCCATTGATAAT
ATTAATAATGGAAATAGCCAAGAAAAATCAAAATACCAAGAGTTGATTAATAATTATAACTCTTATGTAGCTAAACTTGC
TGAAAATGGCATTACGATCAATGGCAATGGAACCGCTACAATTCCTGATGGCAAGGTTAATATCTTTAACTCCCTCACAC
AGACTTATTTTGGACAAGTAGCTGGATTCAATAATTATATAGGATCCCGCAAAAACGAATTGAATAATTATAACAACACA
GCCAATTCTTATAATCAAACGGCAACTGCGAATAATGAATGGATCAATAACTTAGTAAAAGATCTTGCCCTACAAGACTA
TTTAGATAAACATCAACTAACAGTTCCTTTACAGGCAGCAGCTGGTACTAGGAATACCACAGAAATTCCTCAAGAAGCAG
CCCCTGCCGCTGCTGGTGCCGCAGGAGTTGTGGCTATTCCTACTCCATCTGCCTATGCTTATTCAGTTGCCAATGGAACC
CGTTCGTTGGCTATTGGGAAAGTTCCTGACTATCAAGAACTTAACGAAAATGAAGTCAAACCAGTCATTGAAGATGGATA
TTATACGCAAATCGTTAAACCTGTGGACTCCGATATCATTTATAATTCCCAATATTGGGGTTTTTTACGAGTCTTAAGCA
TTTTTAATCCTAATCGAGATTATGTTCCGGATCCTTTGCTAAATTTTAAACCACTAGCCAAGAAAATCTCACCTAACACA
ATTGTGGAAGCTATGCAACCTATTCAAGGAAATAATGCACAAGGAGCAGGAGGGCTTACAGTTGAATCAGCCGGATTAGA
TAATCCTCACATTACAGCTATCTTAGGGCAAGCTGCCTTCGCACAAGCTCTTCGAAATGCAAACTTAAATTTAACAGAAG
AGCAAATCCAAGAATATTCAAATAATCTTGTGCTTTTATCCTCGGATTTAATTGCTCAAAGTAGCATTGATGCACTCTTA
CCAAGTTTAGCACCTATTTTATCTCAGCTAGAAACAACTCCTCAAGATAGTCCTCTTTTTAGCCTTTCATTTTCCCTTTC
TTTTGCTAACCGTATTAATGAATTAACTGGCCATGGATTGACAGAAGAATCCCTTAAAGAATTTTTAAGTGGCATCCCAG
CTCTTCAAAATTTAAGTAAAGCGGATATTGCCACCCTAACAGCCAATTTAAATTTAGGTTTATTACTTACTTCTTCTAAA
TTATTAGAATCGAGTTTAGGATTACCAGGCATTTCTCAACAACTTATTCTTTCTCAACTTCCTCCTGAATTATCTTCAAG
CATTATTAGTCAAGCTTCTATACAAAGTGATCAATTGAATGCCGATTTAAAAACACAGATTAATGCTAATTTTATCCAAC
AAGGTTTTGCGGAAGATCAAGCTGCTTTTTTAGCGAATCTAGGGCAAGAAATGATTAAAAATGACATTTTAAGACCTTCG
CCAACTTCTATTTCTGAGAATAATTTAAATACGCAATTATTAACGGATTCAATCAAGGCAAGTTTAATTTTGTCCGATTC
TAAAATTTATGATTTGGCTAAAGCTGATGCAATTGCAAATGAAGTTGTTTCAAGGACACTAAGTGATAGCGAAGGAGCTA
TTATTTCTTCGACTCAATTTAAAGCCAATCTTGAATCGAATTTAAGAGATTCGAATATTTCTTCTAGTCAGATTGATGAA
ATTTTAAAAGATGTTATTTTAGTGTCTTCTCAAAATGCATTTAATCAAGAACAGCTTAATTTGACTCAGTTGATTGAACA
ATCTGTCAATTCGCTTGTTCCGCAAGGTGGAGGACAACTAGCTAAACTTATTAGCGCAGAAATTGCAAATACCTTGTTTG
GCCATTATAATCCAGATACTAGAGATATTGCCAATTTAAAATCTCCTTTGTCTTTGATTAATTTAGTCAATGATCAATTG
AATAAACTTGAAATTGATCAAAATAACGAATCTGCAAAAGCAGTCTCTGAAGCATTTAAGGCAACTTTGTTAACAACGAC
AGATTTTTATGCCTTTTCATTACAAGTAATGGATCCCGCTTATTCTTTAGTTTATTCCGTTGGAACTGGCTTAATGTATG
CAGGGCAAGAGCCGGAAAATTACAGAAAATCTATAGATATCATTGTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTATTATTATTTCTGACAATTAATTAACTTTATTACTCGTTCATAATAGACATTGTTTTTGATTGGCGAGGAAAATCT
GAGACACATACACAAGGAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATGGAGATGTAATAAATAAAATAATTTGTTGACAATGCATAAAACAAAGCATAAATCATAATGTAAGGAGGGTGTGT
ATGGAAGTGGCCATTATAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 869; Mature: 869

Protein sequence:

>869_residues
MVMSDINNIGGSTQGLQSYSSYTDNPVFQSLPSSVQDSLIQSFTKEELNKRFANATVSIPSLLAPNDISGSLDNFFKVLS
EAKVQLNLQFRTAEFIDQLTRRQDSREAGLQALGLVGEFARREVALQQTKEAAEAKMAEIHNLNEAIKNQINDQNNAIDN
INNGNSQEKSKYQELINNYNSYVAKLAENGITINGNGTATIPDGKVNIFNSLTQTYFGQVAGFNNYIGSRKNELNNYNNT
ANSYNQTATANNEWINNLVKDLALQDYLDKHQLTVPLQAAAGTRNTTEIPQEAAPAAAGAAGVVAIPTPSAYAYSVANGT
RSLAIGKVPDYQELNENEVKPVIEDGYYTQIVKPVDSDIIYNSQYWGFLRVLSIFNPNRDYVPDPLLNFKPLAKKISPNT
IVEAMQPIQGNNAQGAGGLTVESAGLDNPHITAILGQAAFAQALRNANLNLTEEQIQEYSNNLVLLSSDLIAQSSIDALL
PSLAPILSQLETTPQDSPLFSLSFSLSFANRINELTGHGLTEESLKEFLSGIPALQNLSKADIATLTANLNLGLLLTSSK
LLESSLGLPGISQQLILSQLPPELSSSIISQASIQSDQLNADLKTQINANFIQQGFAEDQAAFLANLGQEMIKNDILRPS
PTSISENNLNTQLLTDSIKASLILSDSKIYDLAKADAIANEVVSRTLSDSEGAIISSTQFKANLESNLRDSNISSSQIDE
ILKDVILVSSQNAFNQEQLNLTQLIEQSVNSLVPQGGGQLAKLISAEIANTLFGHYNPDTRDIANLKSPLSLINLVNDQL
NKLEIDQNNESAKAVSEAFKATLLTTTDFYAFSLQVMDPAYSLVYSVGTGLMYAGQEPENYRKSIDIIV

Sequences:

>Translated_869_residues
MVMSDINNIGGSTQGLQSYSSYTDNPVFQSLPSSVQDSLIQSFTKEELNKRFANATVSIPSLLAPNDISGSLDNFFKVLS
EAKVQLNLQFRTAEFIDQLTRRQDSREAGLQALGLVGEFARREVALQQTKEAAEAKMAEIHNLNEAIKNQINDQNNAIDN
INNGNSQEKSKYQELINNYNSYVAKLAENGITINGNGTATIPDGKVNIFNSLTQTYFGQVAGFNNYIGSRKNELNNYNNT
ANSYNQTATANNEWINNLVKDLALQDYLDKHQLTVPLQAAAGTRNTTEIPQEAAPAAAGAAGVVAIPTPSAYAYSVANGT
RSLAIGKVPDYQELNENEVKPVIEDGYYTQIVKPVDSDIIYNSQYWGFLRVLSIFNPNRDYVPDPLLNFKPLAKKISPNT
IVEAMQPIQGNNAQGAGGLTVESAGLDNPHITAILGQAAFAQALRNANLNLTEEQIQEYSNNLVLLSSDLIAQSSIDALL
PSLAPILSQLETTPQDSPLFSLSFSLSFANRINELTGHGLTEESLKEFLSGIPALQNLSKADIATLTANLNLGLLLTSSK
LLESSLGLPGISQQLILSQLPPELSSSIISQASIQSDQLNADLKTQINANFIQQGFAEDQAAFLANLGQEMIKNDILRPS
PTSISENNLNTQLLTDSIKASLILSDSKIYDLAKADAIANEVVSRTLSDSEGAIISSTQFKANLESNLRDSNISSSQIDE
ILKDVILVSSQNAFNQEQLNLTQLIEQSVNSLVPQGGGQLAKLISAEIANTLFGHYNPDTRDIANLKSPLSLINLVNDQL
NKLEIDQNNESAKAVSEAFKATLLTTTDFYAFSLQVMDPAYSLVYSVGTGLMYAGQEPENYRKSIDIIV
>Mature_869_residues
MVMSDINNIGGSTQGLQSYSSYTDNPVFQSLPSSVQDSLIQSFTKEELNKRFANATVSIPSLLAPNDISGSLDNFFKVLS
EAKVQLNLQFRTAEFIDQLTRRQDSREAGLQALGLVGEFARREVALQQTKEAAEAKMAEIHNLNEAIKNQINDQNNAIDN
INNGNSQEKSKYQELINNYNSYVAKLAENGITINGNGTATIPDGKVNIFNSLTQTYFGQVAGFNNYIGSRKNELNNYNNT
ANSYNQTATANNEWINNLVKDLALQDYLDKHQLTVPLQAAAGTRNTTEIPQEAAPAAAGAAGVVAIPTPSAYAYSVANGT
RSLAIGKVPDYQELNENEVKPVIEDGYYTQIVKPVDSDIIYNSQYWGFLRVLSIFNPNRDYVPDPLLNFKPLAKKISPNT
IVEAMQPIQGNNAQGAGGLTVESAGLDNPHITAILGQAAFAQALRNANLNLTEEQIQEYSNNLVLLSSDLIAQSSIDALL
PSLAPILSQLETTPQDSPLFSLSFSLSFANRINELTGHGLTEESLKEFLSGIPALQNLSKADIATLTANLNLGLLLTSSK
LLESSLGLPGISQQLILSQLPPELSSSIISQASIQSDQLNADLKTQINANFIQQGFAEDQAAFLANLGQEMIKNDILRPS
PTSISENNLNTQLLTDSIKASLILSDSKIYDLAKADAIANEVVSRTLSDSEGAIISSTQFKANLESNLRDSNISSSQIDE
ILKDVILVSSQNAFNQEQLNLTQLIEQSVNSLVPQGGGQLAKLISAEIANTLFGHYNPDTRDIANLKSPLSLINLVNDQL
NKLEIDQNNESAKAVSEAFKATLLTTTDFYAFSLQVMDPAYSLVYSVGTGLMYAGQEPENYRKSIDIIV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94340; Mature: 94340

Theoretical pI: Translated: 4.29; Mature: 4.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
0.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
0.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVMSDINNIGGSTQGLQSYSSYTDNPVFQSLPSSVQDSLIQSFTKEELNKRFANATVSIP
CCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCC
SLLAPNDISGSLDNFFKVLSEAKVQLNLQFRTAEFIDQLTRRQDSREAGLQALGLVGEFA
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RREVALQQTKEAAEAKMAEIHNLNEAIKNQINDQNNAIDNINNGNSQEKSKYQELINNYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SYVAKLAENGITINGNGTATIPDGKVNIFNSLTQTYFGQVAGFNNYIGSRKNELNNYNNT
HHHHHHHHCCEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHCCCCCC
ANSYNQTATANNEWINNLVKDLALQDYLDKHQLTVPLQAAAGTRNTTEIPQEAAPAAAGA
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCC
AGVVAIPTPSAYAYSVANGTRSLAIGKVPDYQELNENEVKPVIEDGYYTQIVKPVDSDII
CCEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEECCCCCHHHCCCCCCCCHHCCCCHHHHCCCCCCCEE
YNSQYWGFLRVLSIFNPNRDYVPDPLLNFKPLAKKISPNTIVEAMQPIQGNNAQGAGGLT
ECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCE
VESAGLDNPHITAILGQAAFAQALRNANLNLTEEQIQEYSNNLVLLSSDLIAQSSIDALL
EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH
PSLAPILSQLETTPQDSPLFSLSFSLSFANRINELTGHGLTEESLKEFLSGIPALQNLSK
HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCH
ADIATLTANLNLGLLLTSSKLLESSLGLPGISQQLILSQLPPELSSSIISQASIQSDQLN
HHHHEEEECCCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCC
ADLKTQINANFIQQGFAEDQAAFLANLGQEMIKNDILRPSPTSISENNLNTQLLTDSIKA
CCHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHE
SLILSDSKIYDLAKADAIANEVVSRTLSDSEGAIISSTQFKANLESNLRDSNISSSQIDE
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
ILKDVILVSSQNAFNQEQLNLTQLIEQSVNSLVPQGGGQLAKLISAEIANTLFGHYNPDT
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
RDIANLKSPLSLINLVNDQLNKLEIDQNNESAKAVSEAFKATLLTTTDFYAFSLQVMDPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEEECCHH
YSLVYSVGTGLMYAGQEPENYRKSIDIIV
HHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVMSDINNIGGSTQGLQSYSSYTDNPVFQSLPSSVQDSLIQSFTKEELNKRFANATVSIP
CCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCC
SLLAPNDISGSLDNFFKVLSEAKVQLNLQFRTAEFIDQLTRRQDSREAGLQALGLVGEFA
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RREVALQQTKEAAEAKMAEIHNLNEAIKNQINDQNNAIDNINNGNSQEKSKYQELINNYN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SYVAKLAENGITINGNGTATIPDGKVNIFNSLTQTYFGQVAGFNNYIGSRKNELNNYNNT
HHHHHHHHCCEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHCCCCCC
ANSYNQTATANNEWINNLVKDLALQDYLDKHQLTVPLQAAAGTRNTTEIPQEAAPAAAGA
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCC
AGVVAIPTPSAYAYSVANGTRSLAIGKVPDYQELNENEVKPVIEDGYYTQIVKPVDSDII
CCEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEECCCCCHHHCCCCCCCCHHCCCCHHHHCCCCCCCEE
YNSQYWGFLRVLSIFNPNRDYVPDPLLNFKPLAKKISPNTIVEAMQPIQGNNAQGAGGLT
ECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCE
VESAGLDNPHITAILGQAAFAQALRNANLNLTEEQIQEYSNNLVLLSSDLIAQSSIDALL
EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH
PSLAPILSQLETTPQDSPLFSLSFSLSFANRINELTGHGLTEESLKEFLSGIPALQNLSK
HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCH
ADIATLTANLNLGLLLTSSKLLESSLGLPGISQQLILSQLPPELSSSIISQASIQSDQLN
HHHHEEEECCCEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCC
ADLKTQINANFIQQGFAEDQAAFLANLGQEMIKNDILRPSPTSISENNLNTQLLTDSIKA
CCHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHE
SLILSDSKIYDLAKADAIANEVVSRTLSDSEGAIISSTQFKANLESNLRDSNISSSQIDE
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
ILKDVILVSSQNAFNQEQLNLTQLIEQSVNSLVPQGGGQLAKLISAEIANTLFGHYNPDT
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
RDIANLKSPLSLINLVNDQLNKLEIDQNNESAKAVSEAFKATLLTTTDFYAFSLQVMDPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEEECCHH
YSLVYSVGTGLMYAGQEPENYRKSIDIIV
HHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA