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The map label for this gene is 46446672

Identifier: 46446672

GI number: 46446672

Start: 1233025

End: 1235622

Strand: Reverse

Name: 46446672

Synonym: pc1038

Alternate gene names: NA

Gene position: 1235622-1233025 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46446673

Following gene: 46446671

Centisome position: 51.18

GC content: 32.72

Gene sequence:

>2598_bases
ATGAGTAACTTGACAGTACAACCAAGCAGTTTAGGAAACGTTTATGCTCCTCAGTCTGAATCACTTATTGCATTCAATCA
TGTGACGTTTATTGTTTTAAATATCTTAAGTTTAGGTAAATATGGAGTCAGGCGTATTGTTGAACAACAACGAAAAATTC
AACATATCAAGTGTAAACAGGCAAAGTTAGTATCTAACACGCGAGAACTTCTGGAAAGATTTGAAAATTTAAAAAATAAG
ATCTTTACATTAGAAAAAGAAGTTCAACAAACTGATTTGACCTTAAATTTTGATAACAGAATTGAAGATATAAATATAAC
GAATGAGCAGTTAAAGAAGCGGTCATTAGAAAGCATTTTGAACAACGAGCAAAGCCTTGTTATGCAAAATTTTGCAGTCC
CACGCATAACTTTTTTAGGTCTTCTATTAGCTAATATTGTTTCTATCGGATTTTATAGTTTCTATCAATTTAGACAAAAT
AAATTACATATCGCGAATTTAAAAAGAGAAACCGAAAATTTTCAGGTTATTATTTCTCAACGACAAATAGAATTAGCTAA
ACAGATTAATAATCAATTAAATTTTTTACGAAGAACCAAAAGTTTAAAAGTTAAAATTGCTAGGTTACCTATCGGGAACG
ATTTTTTCCAAATTAATGAGAAAAAAGAGAGGCTTAAATGGCTGGCACAAGAAATTGAAAGATTGGATTCGGAAGTGAAA
AACTTGGCTAAACAAAATGCTAGCTATGAGGTGGAAAAATTAGGATCCGTGGCTTTCTTAAAGTGCAGAGTAAAAGATTT
AGAAAATTTAAATACTCTTATTATAGAAAAAGCTAAAAAAATGCTCTCAAAAAAAACTTTAGATAATCCAACATTAGCCT
TAGAAGAGTTAAAAGTAAAAATTCGACGTGAGCAAGAACTGACACAGAAGTTATTCCAATTAAAAAAAGATTTGGAAAGA
GAAAGTGCAGATTTGACACCAACTGAAAAGGTTTATAGCCAAATAGGCCAAATCAACCAAGCATATGCCCGAGTTGAAAA
TCAAGGCGTCATTCCAGGGGATTATGGACTAAATTTTGACGGAGATTTTGATCCATCTAAAGAAACAGAGTATGTAAAAA
ATTATAAAGGAATAAAGACAGCCCGAGAGTTTTTAGAAGTTCTTTACGCTAATTCATTTAAAGAATTAGTGGAATTAGCT
AAACATGGAAAGATTAATTTTAATAAGCATCTCTATACAGTTAGCTATGAATGGAATTGCCAAGCCTTGTATCGATTTAT
GGTATTAAAATTTATGACTCATAGTCGATTAGAAGAAAATGGCTGTAGAGGATATTTATTAAAATTGAATGTAGACGGAG
TTTCCCTTGCTGCTCCTGCACCTGAAATAGTGCTTGATTGCCCTTATGGTGAAACGGCTAATTCTGACCATTTACGAAGA
ATTAATCGAGTTGTGGATGAATTTACTTATGCAGTGGAGCCATGTCAAAATAACTCACTACCATCCTATGATCCTGAAAG
TTTAAAAAGGTTGTTAGTTGATTTATCTGAGGAAGAAAAACTGCATTTATTTAATTTAGTAATGGAAGACTTAATTGAAG
AAGATCATCCAGAAATGATTAATACGCGAAAATTTTTGCAGCAAAAAGATAATCAAAGAGTTGAAAAAATAAAAACAACT
TTTCAATTAATTTGCAATCTTGCTTTGACGCTTAAAACAAAATTTGGTCCTCAACATTTAATCATTTTAAGGGATTTATA
TGACGATGAAGGGGTTAAACCTTTCAAAAAATTTAAAGTAGAAACTGGTGAATTGAAAACTGCCTCGACTTCTCAGACCG
GGACAATTCCCTGGACTCCTAATCATGCTTGCTTAGACTCAAATTTGAAACATGTTATTCAGGATACAGTAAAAACCTAT
CAGGATTTTTATAGAGGCTTGAATCGTGAAGCTGTTAATCCAAAGGGACAAATCTGTCCCACAAATTATGTTGGAATAGA
TATGCAATATTGGCATAAACATCCCTATTTTAGCCCGCATGGGTGTTTGATGAGTGCGTTTTCCGCTTTATTGACAACTG
AAAGGGAGCTTATATCGGAATCAACTGTAAAACAGTTGAAAAATGCCATTGCTGCTTATCTTGATATTCCTGAAAAGGCG
GCACAGTTTAAAAATCAAATTTATAATGAATATAAACTCTCTATCGAGAAATACCAAAGTTATATGAGAGGTAAGAATTA
TCCAATTATTAATGTAAGTAATTTTGGCGATCTGGAAATTCAATTAATGGCTGAGGTCATTGGAGTGAAAATAGCGGTAA
TTATAGATTCAGGGATAGCGGCCAGGCAGGAATTAAATCAACCCCTTATTTTAAATGAATTTGGTTTAACAGTTCCTGAA
TCCAGCTATTACTACTTTGGTCCCAATACCTTCGAGGTTTTATATTTGTATAAAACTACCCTCCATGGGAATGGGAAAAC
GCCTACTTATGAGCCACTTTGGCCTAAGGTGAAAAAAAATTCAGCTTTGCTTACCCCAGAGTCAAAATCAGCTTATGATA
AAATTTATCTGCATGCTTATTCTAATAGAGCTTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTGGAGATTGTTAGCTCAAGCTAAAGATTAATTGCTTTAGGGTGTCTAAGGTATGAGAGTATAAATTAATACGAATTA
TCATAAGTATATAGGAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAGCTTAATCATCAATTTATCTATCTTTCTTTTTCTATATATACGACTTCTTGAGTAGAAATTATAAAAATTGGTTTGG
GTGTCTTTGGGTGTCTCTGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 865; Mature: 864

Protein sequence:

>865_residues
MSNLTVQPSSLGNVYAPQSESLIAFNHVTFIVLNILSLGKYGVRRIVEQQRKIQHIKCKQAKLVSNTRELLERFENLKNK
IFTLEKEVQQTDLTLNFDNRIEDINITNEQLKKRSLESILNNEQSLVMQNFAVPRITFLGLLLANIVSIGFYSFYQFRQN
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Sequences:

>Translated_865_residues
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IFTLEKEVQQTDLTLNFDNRIEDINITNEQLKKRSLESILNNEQSLVMQNFAVPRITFLGLLLANIVSIGFYSFYQFRQN
KLHIANLKRETENFQVIISQRQIELAKQINNQLNFLRRTKSLKVKIARLPIGNDFFQINEKKERLKWLAQEIERLDSEVK
NLAKQNASYEVEKLGSVAFLKCRVKDLENLNTLIIEKAKKMLSKKTLDNPTLALEELKVKIRREQELTQKLFQLKKDLER
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FQLICNLALTLKTKFGPQHLIILRDLYDDEGVKPFKKFKVETGELKTASTSQTGTIPWTPNHACLDSNLKHVIQDTVKTY
QDFYRGLNREAVNPKGQICPTNYVGIDMQYWHKHPYFSPHGCLMSAFSALLTTERELISESTVKQLKNAIAAYLDIPEKA
AQFKNQIYNEYKLSIEKYQSYMRGKNYPIINVSNFGDLEIQLMAEVIGVKIAVIIDSGIAARQELNQPLILNEFGLTVPE
SSYYYFGPNTFEVLYLYKTTLHGNGKTPTYEPLWPKVKKNSALLTPESKSAYDKIYLHAYSNRAF
>Mature_864_residues
SNLTVQPSSLGNVYAPQSESLIAFNHVTFIVLNILSLGKYGVRRIVEQQRKIQHIKCKQAKLVSNTRELLERFENLKNKI
FTLEKEVQQTDLTLNFDNRIEDINITNEQLKKRSLESILNNEQSLVMQNFAVPRITFLGLLLANIVSIGFYSFYQFRQNK
LHIANLKRETENFQVIISQRQIELAKQINNQLNFLRRTKSLKVKIARLPIGNDFFQINEKKERLKWLAQEIERLDSEVKN
LAKQNASYEVEKLGSVAFLKCRVKDLENLNTLIIEKAKKMLSKKTLDNPTLALEELKVKIRREQELTQKLFQLKKDLERE
SADLTPTEKVYSQIGQINQAYARVENQGVIPGDYGLNFDGDFDPSKETEYVKNYKGIKTAREFLEVLYANSFKELVELAK
HGKINFNKHLYTVSYEWNCQALYRFMVLKFMTHSRLEENGCRGYLLKLNVDGVSLAAPAPEIVLDCPYGETANSDHLRRI
NRVVDEFTYAVEPCQNNSLPSYDPESLKRLLVDLSEEEKLHLFNLVMEDLIEEDHPEMINTRKFLQQKDNQRVEKIKTTF
QLICNLALTLKTKFGPQHLIILRDLYDDEGVKPFKKFKVETGELKTASTSQTGTIPWTPNHACLDSNLKHVIQDTVKTYQ
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QFKNQIYNEYKLSIEKYQSYMRGKNYPIINVSNFGDLEIQLMAEVIGVKIAVIIDSGIAARQELNQPLILNEFGLTVPES
SYYYFGPNTFEVLYLYKTTLHGNGKTPTYEPLWPKVKKNSALLTPESKSAYDKIYLHAYSNRAF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 99993; Mature: 99862

Theoretical pI: Translated: 8.90; Mature: 8.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNLTVQPSSLGNVYAPQSESLIAFNHVTFIVLNILSLGKYGVRRIVEQQRKIQHIKCKQ
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKLVSNTRELLERFENLKNKIFTLEKEVQQTDLTLNFDNRIEDINITNEQLKKRSLESIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
NNEQSLVMQNFAVPRITFLGLLLANIVSIGFYSFYQFRQNKLHIANLKRETENFQVIISQ
CCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHCCCCCEEEHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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SALLTPESKSAYDKIYLHAYSNRAF
CEEECCCCCCCHHEEEEEEECCCCC
>Mature Secondary Structure 
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKLVSNTRELLERFENLKNKIFTLEKEVQQTDLTLNFDNRIEDINITNEQLKKRSLESIL
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HHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCC
SALLTPESKSAYDKIYLHAYSNRAF
CEEECCCCCCCHHEEEEEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA