Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46445992

Identifier: 46445992

GI number: 46445992

Start: 484092

End: 486749

Strand: Reverse

Name: 46445992

Synonym: pc0358

Alternate gene names: NA

Gene position: 486749-484092 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46445993

Following gene: 46445983

Centisome position: 20.16

GC content: 35.93

Gene sequence:

>2658_bases
ATGACTAAATCATTAGAAAGTCTCCCATCTACCGCCTCAGCCTTCCCAAGCTCACCTTGTTTTTCTTTATGTCATATCTC
ACAGGCGCAAACTTTTCCTGATATTCAAGCTTTGATTGACTCCTTTCGCTCAACTGAGTTTCTCAATTTGAGCTTTAGGC
ACCGCTTCAGAATGATCAACAAAACCCTTTGTGATTTGATTAATCAAGCGCCTACGCAATCTTTCCTTCTTAGTGCTATT
CTAGATTTTATGGAGCGTGTTAATCGAGAAAAAATTCTCAGCGAATCATTAACAATGAATACCTTCGAATTTTGGCTCAA
TAACTTCTCTGAGTTAAGCGATGAAGAAAACTATGCAATTCGTGCTAAGATCGTTGGAAAATGGATTCCTAGGAGCGATT
ACCAAGCCTTTTTTCCCATAGGAATGGATAAAAGCTATAATGGAACACATTTCATAGCTGCTCATTTGTCCCCTGACGTA
GATACCATGATAGCCTCTTTTTGGGGTTGGGTTGATGCTTTTGCCTCTAGAGTTACTAGAGGGCTCCATCAATGGTGCTT
ACCTGGAGGCCCTCCTGATTCCCCTATTTCATCGATTGTTAGTGAAATGTTTGGAGAAGGTTTATTTAATTGTCTGGCTC
GTACCGCTCAAACAATCACTTTGACAGCCATAGATCTCGTATCCCAAAAAGACTTTATTAAAGAAGCAAAAGAAACTTTA
ACGGGTTATATTGATCATGAAACTAATGAAAAAGCAATTATCTTAATTGATGAAAACGGACATTATTTAGGTGATTGGCA
AAGCTCTGATGTAGAAACTGTTCGCCAAATTATTATTCTATTTAAATCTTGTTTGAGATGGTTTAAAAATAATCTACACA
CTAAACTCATTTCCCTCTTTGCTAAAACAAACCTTTCGGTTATCGATTTTCCGCTATTTAATTCTTCAGTTTTTGATGTG
AAAATTAAAGATTGTGAACCTGTCCAGGAATTTAACGAAAAACAAAAAAATGATTTGCATGATTTTTTTTACAAAATTTT
ACATGTCAAAAAAGGACTTAGCGGAACTTTTGATGATTTAATTCAAGCACTTAATTTTTTATCTGTCTCAGAGCTCTTGT
ATTTTCAGCATAGTATCAAATCTCTTCCAAAAAGCTCTATTTTCGATGAACAAGGCAAGCTTAAAGAAGATTGCCCTAAA
ATTTTCCTTAAATTAGAAAAAATTATTAATCAGCTTGATGCGGCTATTCAAAATGTACGCAATTATGTAGAACGTCTTGA
TATCGTCTTAGGTGTCAAGCATAAAGTATTAGGATCTTCTCTCCTTTATGTTAATCTAAGAAGCGACATCGATGAAATAC
GTCACAAAATGCAGAGCCATGACTTTATCACTGTCGTTATTCCCGAAAAAGATGGGTCTTTGTTTCCCGTTGGTGTTATT
AGAGCGACAGATTTACGAATGAACGGCCTTGGGACTATTACTTTAAGAGATTTTTGTAATTTGGAAGAAGTCAAAATGGC
TTCCTATCTAGAAGTAATCAGTGTTGTTGATCACCACAAAAGCTCGCTAAAAACTTTATCCGTTCCTACAGCATTAATTG
GAGATACTCAGTCTTGTAACGTTTTGATTGCTGAACAAGCCTTTCTTATTAATGATCGCTATAGTTTAGGTGGAATGACA
GCGCAAGCCATTGATAACCGGATTCAAAAACTTGCTCTTTCAACAGGTAATTCTAGCCAAATTCGCATTCTGCAACGCCT
TCTGCAACGACGGTTAGTCACTTACCAAACCAATCAATTTTTTGTTCATCCTCAACGAGAATTTCAAGAATATTTATGCT
ACCTTCACGCAATTTTAGATGATACAGATCTTTTGACAAAAGTTTCAAACCGGGATTTGTTTTGCATTGCCCAACTTCTC
AACCGTTTAAAATCTTTATCCATGGGCTATGAAACAGAGATTATACATTTTGATGACATTCCCCTTGATAAAAAATTCAC
AAAAATAGCCGCGCAACGAATTCTCCAACAACAAGATATGTATCAATTTTATAAGAAGATTTATGACCTCAGAGAATCTT
CTGTTCAAAAAAACTTACAGCTCTGTGTGGAAGGGTGCTATTCTAACATCTTTTTAGATGCTAAAGAACAAAATGGTTGT
GCACGGGTTGGACAAACAAAAATGTTTGCGTTTAATTTTCCTTTCTTCCTTGAACATGCTCAAAGTATCCGCTCAACTTG
GTTGAATAAATCTAGGGAAATTAATCGGGATAAACCAGAGATTGATTTACATCTGCACATGATCAGTACTATTGCGAGTT
CCGAAGAAGTTTATCGCAATCAAATTGGCCCGTATTCTCATCAAGATGAACTTTGGTTTTGGATTCCAAATACGCTACAA
GCAAGTGATCATTTAAATTCTTTTCTAACAGGCTTTCAAACAGTCGCTAAAAGCTTTGTAGAAAACATGTCAGTAGAATT
CTTAGGACCTAATGCCCAAAATTATCAAATCATTTTTTCCTCTCATTTCCCTCATATTCCTCAGAAAATTGTGAACGAAT
CTCAGAAAGGAATGTCATTAGCGATTCTAAGATTTAAAGCAGGAGCGCTAAATTCTCGAAAATCGATGGTTACACCCTTT
TTACCTCGTTTAACCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTGGACTGATAGCTCAGTGGATAGAGCACCCGCCTTCTAAGCGGGTGGTCGTAGGTTCGAATCCTACTCGGTCCGATT
TGACTCAAAAGAAAATTACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTCTTTTAACCAAAAATTAAAATGTTATTTCCTAATTTCAAAACAGATTTTTTAGTCGTTTATAGGGAGCTAAAATA
AAATTTAGTGAAAAATTAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 885; Mature: 884

Protein sequence:

>885_residues
MTKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMINKTLCDLINQAPTQSFLLSAI
LDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAIRAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDV
DTMIASFWGWVDAFASRVTRGLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETL
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ARVGQTKMFAFNFPFFLEHAQSIRSTWLNKSREINRDKPEIDLHLHMISTIASSEEVYRNQIGPYSHQDELWFWIPNTLQ
ASDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFSSHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPF
LPRLT

Sequences:

>Translated_885_residues
MTKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMINKTLCDLINQAPTQSFLLSAI
LDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAIRAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDV
DTMIASFWGWVDAFASRVTRGLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETL
TGYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLFAKTNLSVIDFPLFNSSVFDV
KIKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDLIQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPK
IFLKLEKIINQLDAAIQNVRNYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVI
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AQAIDNRIQKLALSTGNSSQIRILQRLLQRRLVTYQTNQFFVHPQREFQEYLCYLHAILDDTDLLTKVSNRDLFCIAQLL
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ASDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFSSHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPF
LPRLT
>Mature_884_residues
TKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMINKTLCDLINQAPTQSFLLSAIL
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TMIASFWGWVDAFASRVTRGLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETLT
GYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLFAKTNLSVIDFPLFNSSVFDVK
IKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDLIQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPKI
FLKLEKIINQLDAAIQNVRNYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVIR
ATDLRMNGLGTITLRDFCNLEEVKMASYLEVISVVDHHKSSLKTLSVPTALIGDTQSCNVLIAEQAFLINDRYSLGGMTA
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RLKSLSMGYETEIIHFDDIPLDKKFTKIAAQRILQQQDMYQFYKKIYDLRESSVQKNLQLCVEGCYSNIFLDAKEQNGCA
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SDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFSSHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPFL
PRLT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101405; Mature: 101274

Theoretical pI: Translated: 6.91; Mature: 6.91

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMIN
CCCCHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHH
KTLCDLINQAPTQSFLLSAILDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
RAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDVDTMIASFWGWVDAFASRVTR
EEEEHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLF
HHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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EEEECCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEE
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CCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
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KTLCDLINQAPTQSFLLSAILDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAI
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SHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPFLPRLT
CCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA