Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is secDf [H]

Identifier: 46445885

GI number: 46445885

Start: 353704

End: 358236

Strand: Direct

Name: secDf [H]

Synonym: pc0251

Alternate gene names: 46445885

Gene position: 353704-358236 (Clockwise)

Preceding gene: 46445884

Following gene: 46445888

Centisome position: 14.65

GC content: 36.27

Gene sequence:

>4533_bases
ATGGAAAAACAGAAGCGTTGGCAATTCTATTTGATTGTTGCCGTCTTGGCAATTACGCTTTATAACATTCTCCCCACCTT
ATTTTTTTACTCGAAACCTCTGAAATCTTCGATTGATGCTCCGCGTGCACAGCACGTTGCATCCGGGATTGTGGAAAGAG
TGAATCAAACAGAAGTGGATTCAAAAGAATGGTTATATTCTTTTTGTCGTTTATTAGGAATTAAACCAATCTCTATTGAT
TTAGTTACAACAAATAATGGATTATTTCAAATTTCATTTAAAAATGAACAAGATGCTGAGTTATTTAAGCGATTTTTACC
AAGAGCTGGAGCGTTAATTCCATTTGTACCTAATCAGCTTGAGCTAAGTTCTATCACAGCTAATGTCGATCCTACTCAAG
TGTTGGTTCGACGTAACGTTGCTGTTCGATTAGATGCGAGCGACATGGATAAGTTATTTCAATTTACTCCAAAGTATAGT
CATGATCACCAAATCGCAGATCTTTACCGTGAAGTTATTGATGATCGAGTGACTCAAGTCGCTCTAGCAATTGCAGGACC
TAGTAAAACCGCTTTGCAAATGTTTGCAACAACTAGTGAAGTAGGTAATGATCCTAGTTATGACGAAATAATTATCACAT
TAGCAAAAGAAATTGTTGATGTAGATAATATTTTAGGAAAAAATAATCCGATTACAAAACGTTACTACGAAACATTTTCT
CAACTATCCTCTAAAGAACGTGAAGGATTAAATACTAAATTTATTGCTAAGATGGAAACACTTAGTAAAAAAATTAAAGA
AAAGCAAGCTAGTTTATATGGAGATTTTTCAGCTGAAGCTGCACAAAATCTAGCAGTTTCAAATAATCAAATTCAAGCGC
TGGATTCAGCTGTTACGATTATGCGTGAAAACGAAGAATTTCGAAAAGGGAAAGAGCCTTTAACAAATGAAAATATTCAG
CAGTTGTTAAAACAAAACTCCAACCATGAAATGCAAATTGTCGATTTAACGGGTTATCATCCTTTTATCAAAGGATTAAC
AATTAACTGGGAAAGTGGTTTATTGTTAGTCAATTTGTATGACGATGTACAATCTTTGCATTTTTCAGAAGGAAAAACTG
AAAAAGATGCATTTGTCAAAGACAGAATTAACCAATATTTAATCAATGATATTGCACGTATTGCCCGTTTATCAGATGAA
ACATTTAAACCTAATGAAGAAAGTTTTGTTATAAATTTTGATAATCTAACAAATAGTCAAAGTTATTTGACTCTCAATTT
AGGCTATTTAGCAGATAAAATAGCTCAGCAAGTCACAGATCAAATTATTCTTTCTTGGTCTCCAGCCCATGCAGATTTGA
TTAAAGATGTTTATCCGATTCGTTCTTATAATGATTATCAAACAGAGAAATCAGAAGATCAAAAGCTAGGTCTTGTGGTT
TATGCTCCTGCTATGTATTTAGCTGCAGCGCCTACAGGCTTCCGAACTGGATCAATCTATGTAATCGCAAAAGGAATGGA
TGCTCTTGTTCAGAAGTATCAGGAAGCTCCAGAAGCGGAAGAAAATCAAGTTTTAGCTACAGATTTTAACCAACTCAATA
CCCTTTTACAGCAAATGGGTTTTATTGGTTATCCTGGCTCAGCCTTTAATTTACCAAAAGAATTTAATAAAGATTATATT
TTTGAATTGAATGATTATTATAGCACTCTTTTAAAAGCTTCTCGCGAAGATTTTCAAGCCAAGGGAAGTAAACGTTTTGC
TGTCTTAGACTTTTCTGATGTAGAGCAACGTTTGTTAACTATCAACAAAATTGATGATCGTATACAAGAAGACCTTCTGA
AATGGAAAGAATCTTATAATGCTGCTCAAGTTGATTTGAACTTAACAAGCAAATACACAGTTCCAGCACCAACTAAAAAT
GTTTATTGGGAAAATTTGAAACTGAGCGTAGTAAAATTCTTTAGAGGAGATGATCGAAAAGTTCTTAAATGGGGTCTTGA
CTTATCTGGTGGGAAAACAGTCCGCATTGGTCTTTTAGATCAAAATGGTCGAACTGTGACAAATCCAGAAGATCTCAAAC
AAGCCGTCAATGAACTTTACACACGTATCAATAAAATGGGTGTAGCAGAAAGAACGATTCGAATTGAAAATTCTAATATA
TTATTAGATTTTCCAGGTTCTCAAAACTTGTCCGCTTCTGAATTAGTAAAAGCTTCTGCAATGTATTTTCATATTGTCAA
CGAAAAATTTGGGCCTTTAAATACAGCCCTTGCTGGAGCTGTCAATCAGTTTTTACAAGATATTTGGAACGAAGCCGTTG
TAACAAATCGTAGAGATATAGAAAGCATCAACGAAATTGCTTGGCAGCATTTAGGTGGAGATGAGGAATCTACTATCACT
ATGCGTCCAAGAACGGATCATGCAAAAATTCTTTATGAAAATGGATTGCGTTTAGCTAATCCCAAAAATCGCGTGGTTAC
TCAAGCCTTTGATGAGTCGCTTTCAACCCTGGCCATGTTTAGAGGTGGAGATTCTGCGGAGTGGGATAATCAAACACATC
CTTTACTAGTGGTTTTTCATAATTTTGCTTTGGAAGGATCTAACTTAGAAAACATCCAACCGGGTTATGATGCAACACAA
GGAAATATTTTAACATTTGGAATTAAACGCTCTTTCGATTCAGGTGAGCATGCAAGTGGCAGCCCTCGAGACAATTTTTT
TAATTGGACTTCACAATTTGCAGAAGATAAAATTGCAGGAACACCTAAAGAGGTTTATTCTAACGGGCGTGGTTGGAGAA
TGGCTGTTATTCTTAATGGTAGCATTATTACAGCTCCTTCATTAAATGCAGCACTTCGTGATGGAGGAACGATTAGCGGT
CGTTTTTCTCAGCGAGAAGTGACCCAACTTGCAGCAGATTTAAAAGCTGGTTCTTTAAGTTTTACGCCACGTATTTTGTC
GGAAGAAAATGTAAGCCCAGAACTTGGTCGTGAAGAAAGAGCCAAAGGGATTGTCGCTTCTTTAGTCGCTTTAGCTTTAG
TTGTGATAGCTATGATCGGCTACTATCATTTTGCAGGTTTTATTGCTTCTTGTGCAGTTTTGCTTAATATTTTTATTATG
TGGGGTGTATTGCAAAATTTAGGAGCAGCCTTGACGTTACCTGGAATTGCAGGAATTGTTTTAACAATTGGAATGGCTGT
TGATGCAAATGTTCTTGTCTTTGAAAGAATCCGAGAGGAGTTTAAAGTGACTGGTCGGATTGCTTCCGCAATTCAAGCAG
GTTACCGCAAAGCTTTTAGTGCTATCATTGACTCAAATATTACGACAATTATTGCAGCTATTATCTTAATTCAGTTCGAT
TCTGGACCAATTAAGGGCTTTGCTGTGACATTGATCATTGGTATTATTTCTTCTATGTTTACAGCCTTGTTTATGACTCG
CTACTTCTTTGCTGGGTGGGTTAAAAAGCCTGAGCATAAGCAATTATCAATGGCCCAGTTCTTGAAAGAAACACATTTTG
ACTTCTTAAAGCAAGCTAAGAAGGCTATCGTGATTTCGCTAATCGTGATGGGAATAGGCACTTATTTTCTTGTTTCTGAA
CGTAAAACTATTTTTGGAATGGATTTTACTGGAGGTTACTCTCTAACACTAGATGTTGCGGAGAAGGCAGAAAAACCTAA
TTATCGTTTAGAAGCTATCAATGCTTTCTTAGATAAGGGGGCTTCACGCAGGGATTTCGAAGTACGTGAATTAAGCAGAC
CTAATCAATTGCGCATTCAACTAGGAACGAGTATGGATGAAAAAGGGCATCCTTTTTATCAGATGCCTGAAATCAATCCA
GATAGTAAATATGCTTTTGATTATCAAAAAGATCCTCGTTTGAGCTGGGTTGTTGAAACGCTTCAATCTCATGGATTAGA
TGTTCAACAGTCTCAGTTAACGACTCTTCAGAAAAATTGGACTATCATGAGTGGACAATTTTCTGATACGATGCGAAATA
ATGCTATTATTGCACTTGGCGCAGCATTAATAGCGATCTTAATTTATATTACTTTCCGATTTGAGTTTAAGTTCGCAATT
GGAGCAGTAATTGGGCTCGTTCACGATGTGATTATTACACTTGGCATTTTAGCACTTTTCCATGCGATAGGATTTCCTGT
GCAAATTGATTTACAGGTCGTGGGAGCAATTATGACAATTATCGGCTATTCATTAAATGATACGATTATTGTATTCGATC
GAATTCGTGAAGATATGAAGACTCTTCGTCGCTTGTCATTCAGAGAAATCATTAATCATGCTTTGAATGTTACATTAAGT
CGTACGATCATGACATCTGGAACAACTTTGCTTGTGCTTTTAGCACTTGTTTTATTAGGAGGGCAATCTATTTTTGCCTT
TTCACTAGTGATGACAGTAGGTGTTTTGGTAGGAACTTTATCTTCGCTATTCATTGCTTCCCCGGTTATGCTGTACTTCC
ATAATAAAGAAGTAGAGCATCAACATACGGAGTCTTCTGTCAAACGTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGTTAATTTCATTTTGAGTTAGAGTTGAAAACCTCATTTAGGCGAGGCTTTCATAGATTTCAAAAGGAAATTCACAATC
ATAGAAGGAATCATGAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTACTAAAAAACAAAGAGGTTATTAAAGCCTCTTTGTTTTTCTTTTTAAATTCCTTTGTAAATTCCTCCGATTTTAAAA
CATCCTTCTTTAATCTTCTC

Product: putative fusion protein export proteins SecD/SecF

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1510; Mature: 1510

Protein sequence:

>1510_residues
MEKQKRWQFYLIVAVLAITLYNILPTLFFYSKPLKSSIDAPRAQHVASGIVERVNQTEVDSKEWLYSFCRLLGIKPISID
LVTTNNGLFQISFKNEQDAELFKRFLPRAGALIPFVPNQLELSSITANVDPTQVLVRRNVAVRLDASDMDKLFQFTPKYS
HDHQIADLYREVIDDRVTQVALAIAGPSKTALQMFATTSEVGNDPSYDEIIITLAKEIVDVDNILGKNNPITKRYYETFS
QLSSKEREGLNTKFIAKMETLSKKIKEKQASLYGDFSAEAAQNLAVSNNQIQALDSAVTIMRENEEFRKGKEPLTNENIQ
QLLKQNSNHEMQIVDLTGYHPFIKGLTINWESGLLLVNLYDDVQSLHFSEGKTEKDAFVKDRINQYLINDIARIARLSDE
TFKPNEESFVINFDNLTNSQSYLTLNLGYLADKIAQQVTDQIILSWSPAHADLIKDVYPIRSYNDYQTEKSEDQKLGLVV
YAPAMYLAAAPTGFRTGSIYVIAKGMDALVQKYQEAPEAEENQVLATDFNQLNTLLQQMGFIGYPGSAFNLPKEFNKDYI
FELNDYYSTLLKASREDFQAKGSKRFAVLDFSDVEQRLLTINKIDDRIQEDLLKWKESYNAAQVDLNLTSKYTVPAPTKN
VYWENLKLSVVKFFRGDDRKVLKWGLDLSGGKTVRIGLLDQNGRTVTNPEDLKQAVNELYTRINKMGVAERTIRIENSNI
LLDFPGSQNLSASELVKASAMYFHIVNEKFGPLNTALAGAVNQFLQDIWNEAVVTNRRDIESINEIAWQHLGGDEESTIT
MRPRTDHAKILYENGLRLANPKNRVVTQAFDESLSTLAMFRGGDSAEWDNQTHPLLVVFHNFALEGSNLENIQPGYDATQ
GNILTFGIKRSFDSGEHASGSPRDNFFNWTSQFAEDKIAGTPKEVYSNGRGWRMAVILNGSIITAPSLNAALRDGGTISG
RFSQREVTQLAADLKAGSLSFTPRILSEENVSPELGREERAKGIVASLVALALVVIAMIGYYHFAGFIASCAVLLNIFIM
WGVLQNLGAALTLPGIAGIVLTIGMAVDANVLVFERIREEFKVTGRIASAIQAGYRKAFSAIIDSNITTIIAAIILIQFD
SGPIKGFAVTLIIGIISSMFTALFMTRYFFAGWVKKPEHKQLSMAQFLKETHFDFLKQAKKAIVISLIVMGIGTYFLVSE
RKTIFGMDFTGGYSLTLDVAEKAEKPNYRLEAINAFLDKGASRRDFEVRELSRPNQLRIQLGTSMDEKGHPFYQMPEINP
DSKYAFDYQKDPRLSWVVETLQSHGLDVQQSQLTTLQKNWTIMSGQFSDTMRNNAIIALGAALIAILIYITFRFEFKFAI
GAVIGLVHDVIITLGILALFHAIGFPVQIDLQVVGAIMTIIGYSLNDTIIVFDRIREDMKTLRRLSFREIINHALNVTLS
RTIMTSGTTLLVLLALVLLGGQSIFAFSLVMTVGVLVGTLSSLFIASPVMLYFHNKEVEHQHTESSVKRA

Sequences:

>Translated_1510_residues
MEKQKRWQFYLIVAVLAITLYNILPTLFFYSKPLKSSIDAPRAQHVASGIVERVNQTEVDSKEWLYSFCRLLGIKPISID
LVTTNNGLFQISFKNEQDAELFKRFLPRAGALIPFVPNQLELSSITANVDPTQVLVRRNVAVRLDASDMDKLFQFTPKYS
HDHQIADLYREVIDDRVTQVALAIAGPSKTALQMFATTSEVGNDPSYDEIIITLAKEIVDVDNILGKNNPITKRYYETFS
QLSSKEREGLNTKFIAKMETLSKKIKEKQASLYGDFSAEAAQNLAVSNNQIQALDSAVTIMRENEEFRKGKEPLTNENIQ
QLLKQNSNHEMQIVDLTGYHPFIKGLTINWESGLLLVNLYDDVQSLHFSEGKTEKDAFVKDRINQYLINDIARIARLSDE
TFKPNEESFVINFDNLTNSQSYLTLNLGYLADKIAQQVTDQIILSWSPAHADLIKDVYPIRSYNDYQTEKSEDQKLGLVV
YAPAMYLAAAPTGFRTGSIYVIAKGMDALVQKYQEAPEAEENQVLATDFNQLNTLLQQMGFIGYPGSAFNLPKEFNKDYI
FELNDYYSTLLKASREDFQAKGSKRFAVLDFSDVEQRLLTINKIDDRIQEDLLKWKESYNAAQVDLNLTSKYTVPAPTKN
VYWENLKLSVVKFFRGDDRKVLKWGLDLSGGKTVRIGLLDQNGRTVTNPEDLKQAVNELYTRINKMGVAERTIRIENSNI
LLDFPGSQNLSASELVKASAMYFHIVNEKFGPLNTALAGAVNQFLQDIWNEAVVTNRRDIESINEIAWQHLGGDEESTIT
MRPRTDHAKILYENGLRLANPKNRVVTQAFDESLSTLAMFRGGDSAEWDNQTHPLLVVFHNFALEGSNLENIQPGYDATQ
GNILTFGIKRSFDSGEHASGSPRDNFFNWTSQFAEDKIAGTPKEVYSNGRGWRMAVILNGSIITAPSLNAALRDGGTISG
RFSQREVTQLAADLKAGSLSFTPRILSEENVSPELGREERAKGIVASLVALALVVIAMIGYYHFAGFIASCAVLLNIFIM
WGVLQNLGAALTLPGIAGIVLTIGMAVDANVLVFERIREEFKVTGRIASAIQAGYRKAFSAIIDSNITTIIAAIILIQFD
SGPIKGFAVTLIIGIISSMFTALFMTRYFFAGWVKKPEHKQLSMAQFLKETHFDFLKQAKKAIVISLIVMGIGTYFLVSE
RKTIFGMDFTGGYSLTLDVAEKAEKPNYRLEAINAFLDKGASRRDFEVRELSRPNQLRIQLGTSMDEKGHPFYQMPEINP
DSKYAFDYQKDPRLSWVVETLQSHGLDVQQSQLTTLQKNWTIMSGQFSDTMRNNAIIALGAALIAILIYITFRFEFKFAI
GAVIGLVHDVIITLGILALFHAIGFPVQIDLQVVGAIMTIIGYSLNDTIIVFDRIREDMKTLRRLSFREIINHALNVTLS
RTIMTSGTTLLVLLALVLLGGQSIFAFSLVMTVGVLVGTLSSLFIASPVMLYFHNKEVEHQHTESSVKRA
>Mature_1510_residues
MEKQKRWQFYLIVAVLAITLYNILPTLFFYSKPLKSSIDAPRAQHVASGIVERVNQTEVDSKEWLYSFCRLLGIKPISID
LVTTNNGLFQISFKNEQDAELFKRFLPRAGALIPFVPNQLELSSITANVDPTQVLVRRNVAVRLDASDMDKLFQFTPKYS
HDHQIADLYREVIDDRVTQVALAIAGPSKTALQMFATTSEVGNDPSYDEIIITLAKEIVDVDNILGKNNPITKRYYETFS
QLSSKEREGLNTKFIAKMETLSKKIKEKQASLYGDFSAEAAQNLAVSNNQIQALDSAVTIMRENEEFRKGKEPLTNENIQ
QLLKQNSNHEMQIVDLTGYHPFIKGLTINWESGLLLVNLYDDVQSLHFSEGKTEKDAFVKDRINQYLINDIARIARLSDE
TFKPNEESFVINFDNLTNSQSYLTLNLGYLADKIAQQVTDQIILSWSPAHADLIKDVYPIRSYNDYQTEKSEDQKLGLVV
YAPAMYLAAAPTGFRTGSIYVIAKGMDALVQKYQEAPEAEENQVLATDFNQLNTLLQQMGFIGYPGSAFNLPKEFNKDYI
FELNDYYSTLLKASREDFQAKGSKRFAVLDFSDVEQRLLTINKIDDRIQEDLLKWKESYNAAQVDLNLTSKYTVPAPTKN
VYWENLKLSVVKFFRGDDRKVLKWGLDLSGGKTVRIGLLDQNGRTVTNPEDLKQAVNELYTRINKMGVAERTIRIENSNI
LLDFPGSQNLSASELVKASAMYFHIVNEKFGPLNTALAGAVNQFLQDIWNEAVVTNRRDIESINEIAWQHLGGDEESTIT
MRPRTDHAKILYENGLRLANPKNRVVTQAFDESLSTLAMFRGGDSAEWDNQTHPLLVVFHNFALEGSNLENIQPGYDATQ
GNILTFGIKRSFDSGEHASGSPRDNFFNWTSQFAEDKIAGTPKEVYSNGRGWRMAVILNGSIITAPSLNAALRDGGTISG
RFSQREVTQLAADLKAGSLSFTPRILSEENVSPELGREERAKGIVASLVALALVVIAMIGYYHFAGFIASCAVLLNIFIM
WGVLQNLGAALTLPGIAGIVLTIGMAVDANVLVFERIREEFKVTGRIASAIQAGYRKAFSAIIDSNITTIIAAIILIQFD
SGPIKGFAVTLIIGIISSMFTALFMTRYFFAGWVKKPEHKQLSMAQFLKETHFDFLKQAKKAIVISLIVMGIGTYFLVSE
RKTIFGMDFTGGYSLTLDVAEKAEKPNYRLEAINAFLDKGASRRDFEVRELSRPNQLRIQLGTSMDEKGHPFYQMPEINP
DSKYAFDYQKDPRLSWVVETLQSHGLDVQQSQLTTLQKNWTIMSGQFSDTMRNNAIIALGAALIAILIYITFRFEFKFAI
GAVIGLVHDVIITLGILALFHAIGFPVQIDLQVVGAIMTIIGYSLNDTIIVFDRIREDMKTLRRLSFREIINHALNVTLS
RTIMTSGTTLLVLLALVLLGGQSIFAFSLVMTVGVLVGTLSSLFIASPVMLYFHNKEVEHQHTESSVKRA

Specific function: Involved in protein export [H]

COG id: COG0342

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecD

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secD/secF family. SecD subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786610, Length=164, Percent_Identity=53.0487804878049, Blast_Score=164, Evalue=4e-41,
Organism=Escherichia coli, GI1786609, Length=331, Percent_Identity=34.7432024169184, Blast_Score=160, Evalue=8e-40,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005791
- InterPro:   IPR022813
- InterPro:   IPR022646
- InterPro:   IPR022645
- InterPro:   IPR005665 [H]

Pfam domain/function: PF07549 Sec_GG; PF02355 SecD_SecF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 169263; Mature: 169263

Theoretical pI: Translated: 6.34; Mature: 6.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKQKRWQFYLIVAVLAITLYNILPTLFFYSKPLKSSIDAPRAQHVASGIVERVNQTEVD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SKEWLYSFCRLLGIKPISIDLVTTNNGLFQISFKNEQDAELFKRFLPRAGALIPFVPNQL
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
ELSSITANVDPTQVLVRRNVAVRLDASDMDKLFQFTPKYSHDHQIADLYREVIDDRVTQV
EEHHEECCCCHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHE
ALAIAGPSKTALQMFATTSEVGNDPSYDEIIITLAKEIVDVDNILGKNNPITKRYYETFS
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
QLSSKEREGLNTKFIAKMETLSKKIKEKQASLYGDFSAEAAQNLAVSNNQIQALDSAVTI
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
MRENEEFRKGKEPLTNENIQQLLKQNSNHEMQIVDLTGYHPFIKGLTINWESGLLLVNLY
HHCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHCCEEEEECCCEEEEEEH
DDVQSLHFSEGKTEKDAFVKDRINQYLINDIARIARLSDETFKPNEESFVINFDNLTNSQ
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC
SYLTLNLGYLADKIAQQVTDQIILSWSPAHADLIKDVYPIRSYNDYQTEKSEDQKLGLVV
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
YAPAMYLAAAPTGFRTGSIYVIAKGMDALVQKYQEAPEAEENQVLATDFNQLNTLLQQMG
EECHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCC
FIGYPGSAFNLPKEFNKDYIFELNDYYSTLLKASREDFQAKGSKRFAVLDFSDVEQRLLT
CCCCCCCCCCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH
INKIDDRIQEDLLKWKESYNAAQVDLNLTSKYTVPAPTKNVYWENLKLSVVKFFRGDDRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCEEECCCCCCCCCCCCHHEEEHHHHCCCCCE
VLKWGLDLSGGKTVRIGLLDQNGRTVTNPEDLKQAVNELYTRINKMGVAERTIRIENSNI
EEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEE
LLDFPGSQNLSASELVKASAMYFHIVNEKFGPLNTALAGAVNQFLQDIWNEAVVTNRRDI
EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ESINEIAWQHLGGDEESTITMRPRTDHAKILYENGLRLANPKNRVVTQAFDESLSTLAMF
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGGDSAEWDNQTHPLLVVFHNFALEGSNLENIQPGYDATQGNILTFGIKRSFDSGEHASG
CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC
SPRDNFFNWTSQFAEDKIAGTPKEVYSNGRGWRMAVILNGSIITAPSLNAALRDGGTISG
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCEEECCCCCHHHHCCCCEEC
RFSQREVTQLAADLKAGSLSFTPRILSEENVSPELGREERAKGIVASLVALALVVIAMIG
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYHFAGFIASCAVLLNIFIMWGVLQNLGAALTLPGIAGIVLTIGMAVDANVLVFERIREE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
FKVTGRIASAIQAGYRKAFSAIIDSNITTIIAAIILIQFDSGPIKGFAVTLIIGIISSMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TALFMTRYFFAGWVKKPEHKQLSMAQFLKETHFDFLKQAKKAIVISLIVMGIGTYFLVSE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEEC
RKTIFGMDFTGGYSLTLDVAEKAEKPNYRLEAINAFLDKGASRRDFEVRELSRPNQLRIQ
CCEEEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEE
LGTSMDEKGHPFYQMPEINPDSKYAFDYQKDPRLSWVVETLQSHGLDVQQSQLTTLQKNW
ECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCC
TIMSGQFSDTMRNNAIIALGAALIAILIYITFRFEFKFAIGAVIGLVHDVIITLGILALF
EEEECCCHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HAIGFPVQIDLQVVGAIMTIIGYSLNDTIIVFDRIREDMKTLRRLSFREIINHALNVTLS
HHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
RTIMTSGTTLLVLLALVLLGGQSIFAFSLVMTVGVLVGTLSSLFIASPVMLYFHNKEVEH
EHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHH
QHTESSVKRA
HHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEKQKRWQFYLIVAVLAITLYNILPTLFFYSKPLKSSIDAPRAQHVASGIVERVNQTEVD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SKEWLYSFCRLLGIKPISIDLVTTNNGLFQISFKNEQDAELFKRFLPRAGALIPFVPNQL
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
ELSSITANVDPTQVLVRRNVAVRLDASDMDKLFQFTPKYSHDHQIADLYREVIDDRVTQV
EEHHEECCCCHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHE
ALAIAGPSKTALQMFATTSEVGNDPSYDEIIITLAKEIVDVDNILGKNNPITKRYYETFS
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
QLSSKEREGLNTKFIAKMETLSKKIKEKQASLYGDFSAEAAQNLAVSNNQIQALDSAVTI
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
MRENEEFRKGKEPLTNENIQQLLKQNSNHEMQIVDLTGYHPFIKGLTINWESGLLLVNLY
HHCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHCCEEEEECCCEEEEEEH
DDVQSLHFSEGKTEKDAFVKDRINQYLINDIARIARLSDETFKPNEESFVINFDNLTNSQ
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCC
SYLTLNLGYLADKIAQQVTDQIILSWSPAHADLIKDVYPIRSYNDYQTEKSEDQKLGLVV
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
YAPAMYLAAAPTGFRTGSIYVIAKGMDALVQKYQEAPEAEENQVLATDFNQLNTLLQQMG
EECHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCC
FIGYPGSAFNLPKEFNKDYIFELNDYYSTLLKASREDFQAKGSKRFAVLDFSDVEQRLLT
CCCCCCCCCCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHH
INKIDDRIQEDLLKWKESYNAAQVDLNLTSKYTVPAPTKNVYWENLKLSVVKFFRGDDRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCEEECCCCCCCCCCCCHHEEEHHHHCCCCCE
VLKWGLDLSGGKTVRIGLLDQNGRTVTNPEDLKQAVNELYTRINKMGVAERTIRIENSNI
EEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEE
LLDFPGSQNLSASELVKASAMYFHIVNEKFGPLNTALAGAVNQFLQDIWNEAVVTNRRDI
EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
ESINEIAWQHLGGDEESTITMRPRTDHAKILYENGLRLANPKNRVVTQAFDESLSTLAMF
HHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEECCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGGDSAEWDNQTHPLLVVFHNFALEGSNLENIQPGYDATQGNILTFGIKRSFDSGEHASG
CCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCC
SPRDNFFNWTSQFAEDKIAGTPKEVYSNGRGWRMAVILNGSIITAPSLNAALRDGGTISG
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCEEEEEEECCCEEECCCCCHHHHCCCCEEC
RFSQREVTQLAADLKAGSLSFTPRILSEENVSPELGREERAKGIVASLVALALVVIAMIG
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYHFAGFIASCAVLLNIFIMWGVLQNLGAALTLPGIAGIVLTIGMAVDANVLVFERIREE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
FKVTGRIASAIQAGYRKAFSAIIDSNITTIIAAIILIQFDSGPIKGFAVTLIIGIISSMF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
TALFMTRYFFAGWVKKPEHKQLSMAQFLKETHFDFLKQAKKAIVISLIVMGIGTYFLVSE
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHEEEEC
RKTIFGMDFTGGYSLTLDVAEKAEKPNYRLEAINAFLDKGASRRDFEVRELSRPNQLRIQ
CCEEEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEEE
LGTSMDEKGHPFYQMPEINPDSKYAFDYQKDPRLSWVVETLQSHGLDVQQSQLTTLQKNW
ECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCC
TIMSGQFSDTMRNNAIIALGAALIAILIYITFRFEFKFAIGAVIGLVHDVIITLGILALF
EEEECCCHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HAIGFPVQIDLQVVGAIMTIIGYSLNDTIIVFDRIREDMKTLRRLSFREIINHALNVTLS
HHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
RTIMTSGTTLLVLLALVLLGGQSIFAFSLVMTVGVLVGTLSSLFIASPVMLYFHNKEVEH
EHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHH
QHTESSVKRA
HHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9826342 [H]